FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6286, 784 aa 1>>>pF1KB6286 784 - 784 aa - 784 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3055+/-0.0011; mu= 13.4147+/- 0.066 mean_var=243.9502+/-50.256, 0's: 0 Z-trim(111.4): 881 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.082115 statistics sampled from 11378 (12363) to 11378 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16 Scan time: 3.730 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32370.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 ( 784) 5160 625.4 1.1e-178 CCDS73810.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 ( 654) 4238 516.1 7.5e-146 CCDS73809.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 ( 607) 2447 303.8 5.3e-82 CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 733 101.0 8.5e-21 CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 733 101.0 8.5e-21 CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 648 90.9 9e-18 CCDS77335.1 ZNF473 gene_id:25888|Hs108|chr19 ( 859) 631 88.9 3.8e-17 CCDS33077.1 ZNF473 gene_id:25888|Hs108|chr19 ( 871) 631 88.9 3.8e-17 CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 616 87.0 1.1e-16 CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 616 87.0 1.1e-16 CCDS12266.2 ZNF441 gene_id:126068|Hs108|chr19 ( 693) 610 86.3 1.9e-16 CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 609 86.1 1.9e-16 CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 609 86.2 2.2e-16 CCDS54312.1 ZNF611 gene_id:81856|Hs108|chr19 ( 636) 603 85.4 3.1e-16 CCDS12855.1 ZNF611 gene_id:81856|Hs108|chr19 ( 705) 603 85.5 3.3e-16 CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19 ( 610) 589 83.7 9.7e-16 CCDS30773.1 GFI1 gene_id:2672|Hs108|chr1 ( 422) 577 82.1 2.1e-15 CCDS43677.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 567) 579 82.5 2.1e-15 CCDS33116.3 ZNF628 gene_id:89887|Hs108|chr19 (1059) 583 83.3 2.2e-15 CCDS47745.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 624) 579 82.6 2.2e-15 CCDS31089.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 289) 567 80.7 3.8e-15 CCDS73057.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 351) 567 80.8 4.2e-15 CCDS45460.1 ZNF771 gene_id:51333|Hs108|chr16 ( 317) 563 80.3 5.5e-15 CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 564 80.7 6.9e-15 CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 564 80.7 7e-15 CCDS59177.1 ZFP92 gene_id:139735|Hs108|chrX ( 416) 562 80.3 7.1e-15 CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 564 80.7 7.2e-15 CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 563 80.6 7.4e-15 CCDS77368.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 441) 561 80.2 7.9e-15 CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 442) 561 80.2 7.9e-15 CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 561 80.3 8.6e-15 CCDS1638.1 ZNF672 gene_id:79894|Hs108|chr1 ( 452) 560 80.1 8.7e-15 CCDS12981.1 ZNF324 gene_id:25799|Hs108|chr19 ( 553) 561 80.4 9.1e-15 CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 561 80.4 9.1e-15 CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 561 80.4 9.2e-15 CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 563 80.8 9.2e-15 CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 561 80.4 9.3e-15 CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 562 80.6 9.5e-15 CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 561 80.4 9.7e-15 CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 562 80.6 9.8e-15 CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 561 80.4 9.8e-15 CCDS55406.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 575) 559 80.1 1.1e-14 CCDS48099.1 ZNF674 gene_id:641339|Hs108|chrX ( 581) 559 80.2 1.1e-14 CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 557 79.8 1.1e-14 CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 557 79.8 1.2e-14 CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 557 79.8 1.2e-14 CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 557 79.8 1.2e-14 CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 557 79.8 1.2e-14 CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 557 79.8 1.2e-14 CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 561 80.6 1.2e-14 >>CCDS32370.1 E4F1 gene_id:1877|Hs108|chr16 (784 aa) initn: 5160 init1: 5160 opt: 5160 Z-score: 3321.5 bits: 625.4 E(32554): 1.1e-178 Smith-Waterman score: 5160; 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CCDS62 RSSDLHIHQRVHTGEKPYKCSECGKGFRRNSDLHSH--QRVHTGERPYVCDVCGKGFIYS 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 ATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKKHQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVR . : :.: ::: .:. ::.:::.: . : ::.::. :. .:: .::: .. . .. 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CCDS42 TGEKSVKSLERGRGVRQNTHIRNHPRAPVGDMPYRCDVCGKGFRYKSVLLIHQGVHTGRR 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KB6 DHECKLCGASFRTKGSLIRHHRRHTDERPYKCSKCGKSFRESGALTRHLKSLT---P--C ..:. :: .: ...:. :.: :: :.:::::.:::.: :..: : . : : : CCDS42 PYKCEECGKAFGRSSNLLVHQRVHTGEKPYKCSECGKGFSYSSVLQVHQRLHTGEKPYTC 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 pF1KB6 TEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGS---GAGAAGLGTATSS--VTGEPIETSPVIHLVTDAK .: . .:... ... . : . : : : . :: . . .:. . CCDS42 SECGKGFCAKSALHKHQHIHPGEKPYSCGECGKGFSCSSHLSSHQKTHTGERPYQCDKCG 440 450 460 470 480 490 330 340 350 360 370 380 pF1KB6 GTVIHEVHVQM-QELSLGMKALAPEPPVSQELPCSSEGSRENLLHQAMQNSGIVLERAAG :. ..: :.. .:.. : .. . :: .. :: . . .. : CCDS42 KGFSHNSYLQAHQRVHMGQH-LYKCNVCGKSFSYSSGLLMHQRLHTGEKPYKCECGKSFG 500 510 520 530 540 550 390 400 410 420 430 440 pF1KB6 EEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEVQPLETQVASEASAVPRTHPCPQCSETFPTA . . :. . .. .: . . . :... ... . : . : :.. : . CCDS42 RSSDLHIHQRVHTGEKPYKCSECGKGFRRNSDLHSH--QRVHTGERPYVCDVCGKGFIYS 560 570 580 590 600 610 450 460 470 480 490 500 pF1KB6 ATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKKHQEVHVRERRFRCGDCGKLYKTIAHVR . : :.: ::: .:. ::.:::.: . : ::.::. :. .:: .::: .. . .. 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CCDS42 YLCNKCGKAFSQSTDLIIHHRIHTGEKPYECYDCGQMFSQSSHL---VPHQRIHTGEKPL 240 250 260 270 280 290 150 160 170 180 190 pF1KB6 K----EVIVAAEAELGDGEMAEAPGSPHQ-QGLGLAGEGEQAQVKLLVNKDGRYVCALCH : : ...: . . .. .:.. . : . :. : .: . :. . :. CCDS42 KCNECEKAFRQHSHLTEHQRLHSGEKPYECHRCGKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEE-CE 300 310 320 330 340 350 200 210 220 230 240 250 pF1KB6 KTFKTGSILKAHMVTHSSRKDHECKLCGASFRTKGSLIRHHRRHTDERPYKCSKCGKSFR :::. :. .. :. .: . :. :: .:. ..::::. :: :.::.:..:::.: CCDS42 KTFSKDEELREEQRIHQEEKAYWCNQCGRNFQGTSDLIRHQVTHTGEKPYECKECGKTFN 360 370 380 390 400 410 260 270 280 290 300 310 pF1KB6 ESGALTRHLKSLTPCTEKIRFSVSKDVVVSKEDARAGSGAGAAGLGTATSSVTGE-PIET .:. : :: ..:. : : : :: . : :.. : ::: : : CCDS42 QSSDLLRH--------HRIH-SGEKPCVCSKC---GKSFRGSSDLIRHHRVHTGEKPYEC 420 430 440 450 460 320 330 340 350 360 370 pF1KB6 SPVIHLVTDAKGTVIHEVHVQMQELSLGMKALAPEPPVSQELPCSSEGSRENLLHQAMQN : . .. . : : :.. : : : : :.. :..:: : . CCDS42 SECGKAFSQRSHLVTH------QKIHTG------EKPY-QCTECGKAFRRRSLLIQHRRI 470 480 490 500 380 390 400 410 420 430 pF1KB6 SGIVLERAAGEEGALEPAPAAGSSPQPLAVAAPQLPVLEV--QPLETQVASEASAVPRTH . : : : .: . : : .. .: .. : : . .. ... CCDS42 HSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKHQSLHTGE-KLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKAY 510 520 530 540 550 560 440 450 460 470 480 490 pF1KB6 PCPQCSETFPTAATLEAHKRGHTGPRPFACAQCGKAFPKAYLLKKHQEVHVRERRFRCGD : ::...: .. : :. :: .:. : .:::.: .. : .:...: :. . :. CCDS42 WCNQCGRAFQGSSDLIRHQVTHTREKPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIHSGEKPYVCNK 570 580 590 600 610 620 500 510 520 530 540 550 pF1KB6 CGKLYKTIAHVRGHRRVHSDERPYPCPKCGKRYKTKNAQQVHFRTHLEEKPHVCQFCSRG ::: .. . . :.:.:. :.:: : .::: .. .. .: . : :::. :. :. . 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