FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9439, 549 aa 1>>>pF1KE9439 549 - 549 aa - 549 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1759+/-0.000871; mu= 19.6400+/- 0.052 mean_var=72.2857+/-15.045, 0's: 0 Z-trim(106.7): 88 B-trim: 9 in 1/48 Lambda= 0.150851 statistics sampled from 9038 (9129) to 9038 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16 Scan time: 2.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 549) 3667 807.5 0 CCDS76879.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 ( 429) 2860 631.8 4.8e-181 CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 966) 804 184.6 4.5e-46 CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 987) 804 184.6 4.6e-46 CCDS55376.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 993) 804 184.7 4.6e-46 CCDS43921.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX ( 995) 804 184.7 4.6e-46 CCDS55378.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1001) 804 184.7 4.6e-46 CCDS43922.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1003) 804 184.7 4.6e-46 CCDS14191.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1014) 804 184.7 4.7e-46 CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017) 804 184.7 4.7e-46 CCDS32460.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 693) 784 180.2 7.1e-45 CCDS32461.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 687) 783 180.0 8.2e-45 CCDS73893.1 ADGRG1 gene_id:9289|Hs108|chr16 ( 692) 783 180.0 8.3e-45 CCDS47491.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1193) 747 172.3 2.9e-42 CCDS47490.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1221) 747 172.3 2.9e-42 CCDS55064.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1222) 747 172.3 2.9e-42 CCDS47489.1 ADGRG6 gene_id:57211|Hs108|chr6 (1250) 747 172.3 3e-42 CCDS10785.1 ADGRG5 gene_id:221188|Hs108|chr16 ( 528) 740 170.5 4.4e-42 CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080) 724 167.6 1.9e-40 CCDS82926.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1240) 459 109.6 2.2e-23 CCDS54768.1 ADGRL3 gene_id:23284|Hs108|chr4 (1469) 459 109.7 2.5e-23 CCDS74296.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 526) 423 101.5 2.6e-21 CCDS74297.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 600) 423 101.6 2.8e-21 CCDS12315.1 ADGRE3 gene_id:84658|Hs108|chr19 ( 652) 423 101.6 3e-21 CCDS12307.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1469) 411 99.2 3.5e-20 CCDS32928.1 ADGRL1 gene_id:22859|Hs108|chr19 (1474) 411 99.2 3.5e-20 CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8 (1584) 407 98.4 6.8e-20 CCDS32935.1 ADGRE2 gene_id:30817|Hs108|chr19 ( 823) 396 95.8 2.1e-19 CCDS41352.1 ADGRL4 gene_id:64123|Hs108|chr1 ( 690) 385 93.3 9.8e-19 CCDS33159.2 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 873) 383 93.0 1.6e-18 CCDS46238.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 ( 997) 383 93.0 1.8e-18 CCDS46239.1 ADGRF3 gene_id:165082|Hs108|chr2 (1079) 383 93.1 1.9e-18 CCDS76174.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1123) 370 90.2 1.4e-17 CCDS72811.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1177) 370 90.3 1.4e-17 CCDS689.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1403) 370 90.3 1.6e-17 CCDS81345.1 ADGRL2 gene_id:23266|Hs108|chr1 (1416) 370 90.3 1.6e-17 CCDS4919.1 ADGRF5 gene_id:221395|Hs108|chr6 (1346) 369 90.1 1.8e-17 CCDS34471.1 ADGRF1 gene_id:266977|Hs108|chr6 ( 910) 360 88.0 5.3e-17 CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1551) 362 88.6 5.9e-17 CCDS58643.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 709) 333 82.0 2.5e-15 CCDS58646.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 745) 333 82.1 2.6e-15 CCDS12175.1 ADGRE1 gene_id:2015|Hs108|chr19 ( 886) 333 82.1 3e-15 CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1 (1584) 332 82.1 5.5e-15 CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 326 80.6 8.6e-15 CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 326 80.6 8.9e-15 CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 742) 320 79.2 1.9e-14 CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 786) 320 79.2 2e-14 CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs108|chr19 ( 835) 320 79.3 2.1e-14 CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 326 81.0 2.2e-14 CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6 (1522) 322 79.9 2.4e-14 >>CCDS10786.1 ADGRG3 gene_id:222487|Hs108|chr16 (549 aa) initn: 3667 init1: 3667 opt: 3667 Z-score: 4311.5 bits: 807.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3667; 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100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (121-549:1-429) 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 FLKALVQNLSTNTAEDFYFSLEPSQVPRQVMKDEDKPPDRVRLPKSLFRSLPGNRSVVRL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 MKDEDKPPDRVRLPKSLFRSLPGNRSVVRL 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 AVTILDIGPGTLFKGPRLGLGDGSGVLNNRLVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 AVTILDIGPGTLFKGPRLGLGDGSGVLNNRLVGLSVGQMHVTKLAEPLEIVFSHQRPPPN 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 MTLTCVFWDVTKGTTGDWSSEGCSTEVRPEGTVCCCDHLTFFALLLRPTLDQSTVHILTR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 MTLTCVFWDVTKGTTGDWSSEGCSTEVRPEGTVCCCDHLTFFALLLRPTLDQSTVHILTR 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 ISQAGCGVSMIFLAFTIILYAFLRLSRERFKSEDAPKIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 ISQAGCGVSMIFLAFTIILYAFLRLSRERFKSEDAPKIHVALGGSLFLLNLAFLVNVGSG 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 SKGSDAACWARGAVFHYFLLCAFTWMGLEAFHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SKGSDAACWARGAVFHYFLLCAFTWMGLEAFHLYLLAVRVFNTYFGHYFLKLSLVGWGLP 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 ALMVIGTGSANSYGLYTIRDRENRTSLELCWFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 ALMVIGTGSANSYGLYTIRDRENRTSLELCWFREGTTMYALYITVHGYFLITFLFGMVVL 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 ALVVWKIFTLSRATAVKERGKNRKKVLTLLGLSSLVGVTWGLAIFTPLGLSTVYIFALFN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 ALVVWKIFTLSRATAVKERGKNRKKVLTLLGLSSLVGVTWGLAIFTPLGLSTVYIFALFN 340 350 360 370 380 390 520 530 540 pF1KE9 SLQGVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARLDQAHSASQE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SLQGVFICCWFTILYLPSQSTTVSSSTARLDQAHSASQE 400 410 420 >>CCDS55379.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (966 aa) initn: 516 init1: 298 opt: 804 Z-score: 940.6 bits: 184.6 E(32554): 4.5e-46 Smith-Waterman score: 804; 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CCDS55 GFFIFIFYCVAKENVRKQWRRYLCCGKLRLAENSGNASTERNGVSFSVQNGDVCLHDFTG 880 890 900 910 920 930 >>CCDS55377.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (987 aa) initn: 516 init1: 298 opt: 804 Z-score: 940.5 bits: 184.6 E(32554): 4.6e-46 Smith-Waterman score: 804; 33.9% identity (64.1% similar) in 460 aa overlap (84-523:410-851) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 CRQSGSDSCNVENLQRYWLNYEAHLMKEGLTQKVNTPFLK-ALVQNLSTNTAEDFYFSLE : ....: : :... ... . . . 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CCDS14 GFFIFIFYCVAKENVRKQWRRYLCCGKLRLAENSDWSKTATNGLKKQTVNQGVSSSSNSL 870 880 890 900 910 920 >>CCDS43923.1 ADGRG2 gene_id:10149|Hs108|chrX (1017 aa) initn: 516 init1: 298 opt: 804 Z-score: 940.3 bits: 184.7 E(32554): 4.7e-46 Smith-Waterman score: 804; 33.9% identity (64.1% similar) in 460 aa overlap (84-523:440-881) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 CRQSGSDSCNVENLQRYWLNYEAHLMKEGLTQKVNTPFLK-ALVQNLSTNTAEDFYFSLE : ....: : :... ... . . . 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