FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3333, 967 aa 1>>>pF1KE3333 967 - 967 aa - 967 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6231+/-0.00134; mu= 17.7097+/- 0.081 mean_var=242.3495+/-44.787, 0's: 0 Z-trim(110.2): 935 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.082386 statistics sampled from 10418 (11439) to 10418 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16 Scan time: 4.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16 ( 967) 6685 809.2 0 CCDS10095.2 ZSCAN29 gene_id:146050|Hs108|chr15 ( 852) 2380 297.5 7.7e-80 CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 893 120.6 1.1e-26 CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 893 120.6 1.1e-26 CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 893 120.7 1.2e-26 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 887 119.6 1.4e-26 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 886 119.7 1.8e-26 CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 886 119.7 1.9e-26 CCDS66920.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16 ( 408) 882 118.9 2e-26 CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 ( 458) 882 119.0 2.2e-26 CCDS10503.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16 ( 485) 882 119.0 2.2e-26 CCDS66921.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16 ( 697) 882 119.3 2.7e-26 CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 867 117.3 7.7e-26 CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 865 117.2 1.1e-25 CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 865 117.3 1.1e-25 CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 865 117.4 1.3e-25 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 862 116.8 1.3e-25 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 862 116.9 1.4e-25 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 862 116.9 1.4e-25 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 862 116.9 1.4e-25 CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 350) 857 115.9 1.5e-25 CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 859 116.4 1.6e-25 CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 859 116.5 1.7e-25 CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 858 116.2 1.7e-25 CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 859 116.5 1.7e-25 CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 858 116.3 1.8e-25 CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 855 115.8 2e-25 CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 856 116.0 2e-25 CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 856 116.1 2.1e-25 CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 855 115.9 2.2e-25 CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 854 115.7 2.3e-25 CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 854 115.8 2.4e-25 CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 854 115.8 2.4e-25 CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 855 116.0 2.4e-25 CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 854 115.8 2.5e-25 CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 854 115.9 2.6e-25 CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 854 115.9 2.6e-25 CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 855 116.1 2.6e-25 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 854 115.9 2.7e-25 CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 852 115.5 2.8e-25 CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 852 115.6 2.9e-25 CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 848 115.0 3.7e-25 CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 848 115.1 3.9e-25 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 848 115.1 4.1e-25 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 848 115.2 4.3e-25 CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 848 115.2 4.4e-25 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 851 115.9 4.6e-25 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 851 115.9 4.7e-25 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 847 115.1 4.8e-25 CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 848 115.3 4.9e-25 >>CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16 (967 aa) initn: 6685 init1: 6685 opt: 6685 Z-score: 4311.7 bits: 809.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6685; 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CCDS10 MMAKSALRENGTNSETFRQRFRRFHYQEVAGPR 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 EAFSKLWELCCRWLKPEMRSKEQILELLVIEQFLTILPEKIQAWAQKQCPQSGEEAVALV ::::.:::::::::.::.:.::::.::::.:::::.:: .:: :.:.:::..:::::.:: CCDS10 EAFSQLWELCCRWLRPEVRTKEQIVELLVLEQFLTVLPGEIQNWVQEQCPENGEEAVTLV 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KE3 VHLEKETGRLRQQVS-----SPVHREKHSPLGAAWEVADFQPEQVETQPRAVSREEPG-S ::.: :: :..:. . :. :: .: .. :. . . :.:: :::.: ..: . : CCDS10 EDLEREPGRPRSSVTVSVKGQEVRLEKMTPPKSSQELLSVRQESVEPQPRGVPKKERARS 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LHSGHQEQLNRKRERRPLPKNARPSPWVPALADEWNTLDQEVTTTRLPAGSQEPVKDVHV : :::.: :.. .:. ... : : CCDS10 PDLGPQEQMNPKEKLKPFQRSGLPFP---------------------------------- 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ARGFSYRKSVHQIPAQRDLYRDFRKENVGNVVSLGSAVSTSNKITRLEQRKEPWTLGLHS :. ..:::: ::: : . CCDS10 ---------------------------------------KSGVVSRLEQ-GEPWIPDLLG 180 190 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 SNKRSILRSNYVKEKSVHAIQVPARSAGKTWREQQQWGLEDEKIAGVHWSYEETKTFLAI :... . .... .. ::: .:... ..: ::..:..::::.:::::.::::.:.::: CCDS10 SKEKELPSGSHIGDRRVHADLLPSKKDRRSWVEQDHWSFEDEKVAGVHWGYEETRTLLAI 200 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 LKESRFYETLQACPRNSQVYGAVAEWLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVRNGHMLE :....:::.:. : ::::::::::: ::: ::::: ::::::::.::::::::..:: : CCDS10 LSQTEFYEALRNCHRNSQVYGAVAERLREYGFLRTLEQCRTKFKGLQKSYRKVKSGHPPE 260 270 280 290 300 310 420 430 440 450 460 pF1KE3 PCAFFEDMDALLNPAARA-PSTDKPKEMIPVPRLKRIAISAKEHISLVEEEEAAED---- : :::.:.::.. . : ::. . : . . ..::.::. CCDS10 TCPFFEEMEALMSAQVIALPSNGLEAAASHSGLVGSDAETEEPGQRGWQHEEGAEEAVAQ 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 -SDDDEIGIEFIRKSEIHGAPVLFQNLSGVHWGYEETKTFLDILRETRFYEALQACHRKS ::.:.. .: .. .:::.:.. .:::::::::::.: :: ::.:::::. :::.: CCDS10 ESDSDDMDLEATPQDPNSAAPVVFRSPGGVHWGYEETKTYLAILSETQFYEALRNCHRNS 380 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 KLYGAVAEQLRECGFLRTPEQCRTKFKSLQKSYRKVKNGHVLESCAFYKEMDALINSRAS .:::::::.: : ::::::::::::::::: ::::::::.. :.: :..:::::.. :.. CCDS10 QLYGAVAERLWEYGFLRTPEQCRTKFKSLQTSYRKVKNGQAPETCPFFEEMDALVSVRVA 440 450 460 470 480 490 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 APSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTGWEPEETSQEAVIEDSCSERMSEEEIVQEPE :: . ::. : : : :.: : . : ..::. ::: .. . :: CCDS10 APPNDGQEETASCPVQ--GTSEAEAQ-----KQAEEADEATEEDS-DDDEEDTEIPPGAV 500 510 520 530 540 550 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 FQGPPGLLQSPNDFEIGSSIKEDPTQIVYKDMEQHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKREC . : :.::: :: : ... . . .... ::.:. .:.: . . .: . .: CCDS10 ITRAPVLFQSPRGFEAGFENEDNSKRDISEEVQLHRTLLARSERKIPRYLHQGKGNESDC 560 570 580 590 600 610 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 ISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMT ::::: . .: ..:: ..:.... .::: .:.:::. :::..::: .. :: ... CCDS10 RSGRQWAKTSGEKRGKLTLPEKSLSEVLSQQRPCLGERPYKYLKYSKSFGPNSLLMHQVS 620 630 640 650 660 670 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 HHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGE :. ::::::. ::: :.:: ::::.::::::::.::::::::: ::::: .:.:::::: CCDS10 HQVENPYKCADCGKSFSRSARLIRHRRIHTGEKPYKCLDCGKSFRDSSNFITHRRIHTGE 680 690 700 710 720 730 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 KPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYK :::.::::::::.:::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::.:::: :. CCDS10 KPYQCGECGKCFNQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCEECGKSFNNSSHFSAHRRIHTGERPHV 740 750 760 770 780 790 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 CVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPS : :: :::.. . .: :.: ::::::::: .::: :::::.:.:: :.:.::: : CCDS10 CPDCGKSFSKSSDLRAHHRTHTGEKPYGCHDCGKCFSKSSALNKHGEIHAREKLLTQSAP 800 810 820 830 840 850 950 960 pF1KE3 LYCPENPHKGKTDEFRKTF CCDS10 K >>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (667 aa) initn: 2942 init1: 810 opt: 893 Z-score: 592.7 bits: 120.6 E(32554): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 893; 56.3% identity (79.3% similar) in 222 aa overlap (723-943:390-608) 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 VVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLK :: .:: : ::::: .:..::. . CCDS62 ECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVL---VVHQRTHTGEKPYECNQ 360 370 380 390 400 410 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 YGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKS :.:: .: .:. .. :: :.::.:. ::: : .: .:: ::::::::::..: .:::: CCDS62 CGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKS 420 430 440 450 460 470 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 FNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNS :..: .. :::: ::::::..:..::: :: ::.:. :::::::::::.:.::::::. : CCDS62 FSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRS 480 490 500 510 520 530 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 SHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLT ::. :.:.::::.::.: .: :::.. . :.: ::::::: :.:::: : .:: :: CCDS62 SHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLT 540 550 560 570 580 590 940 950 960 pF1KE3 KHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF .:...:. :::. CCDS62 QHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQCGKAFINSYKLIRHQA 600 610 620 630 640 650 >>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (692 aa) initn: 2942 init1: 810 opt: 893 Z-score: 592.6 bits: 120.6 E(32554): 1.1e-26 Smith-Waterman score: 893; 56.3% identity (79.3% similar) in 222 aa overlap (723-943:415-633) 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 VVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLK :: .:: : ::::: .:..::. . CCDS12 ECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVL---VVHQRTHTGEKPYECNQ 390 400 410 420 430 440 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 YGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKS :.:: .: .:. .. :: :.::.:. ::: : .: .:: ::::::::::..: .:::: CCDS12 CGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKS 450 460 470 480 490 500 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 FNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNS :..: .. :::: ::::::..:..::: :: ::.:. :::::::::::.:.::::::. : CCDS12 FSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRS 510 520 530 540 550 560 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 SHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLT ::. :.:.::::.::.: .: :::.. . :.: ::::::: :.:::: : .:: :: CCDS12 SHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLT 570 580 590 600 610 620 940 950 960 pF1KE3 KHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF .:...:. :::. CCDS12 QHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQCGKAFINSYKLIRHQA 630 640 650 660 670 680 >>CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 (869 aa) initn: 2275 init1: 789 opt: 893 Z-score: 591.6 bits: 120.7 E(32554): 1.2e-26 Smith-Waterman score: 897; 41.4% identity (64.4% similar) in 382 aa overlap (590-946:10-377) 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 SYRKVKNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGG-IEVEPQDPTG :. . ::. ::. .::. : : ..: CCDS45 MEPETALWGPDLQGPEQ--SPNDAHRGAESENEEESPR- 10 20 30 620 630 640 650 660 pF1KE3 WEPEETSQEAVI--------EDSCSERMSEEEIVQEPEF-QGPPGLLQSPNDFEIGSSIK .:.: : .: :.. : .:: :. :.: :.:: : : .. .: CCDS45 ---QESSGEEIIMGDPAQSPESKDSTEMSLERSSQDPSVPQNPPTPLGHSNPLD--HQIP 40 50 60 70 80 90 670 680 690 700 710 pF1KE3 EDPT--QIV------YKDME---QHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQ :: ..: : : : :: .. : ...:: :: ..:: . CCDS45 LDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSL---RELVQGRPAGAEK 100 110 120 130 140 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 GI---RQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRM-THHKENP . :: .:: .: . ::: .:.:: . :.:: .:..:. .. :: :.: CCDS45 PYICNECGKSFSQ---WSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKP 150 160 170 180 190 200 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 YKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCG ::: :::::. : .:..::: ::::::.:: .: :.:..:.:. ::: :::::::.:: CCDS45 YKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCG 210 220 230 240 250 260 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 ECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEK :: . : .::.:: :: ::::::::.: :::: : .. .. :...:.::.::.:..: : CCDS45 ECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGK 270 280 290 300 310 320 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 SFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPEN :: . ... .:.: ::::::: : .::: :..::.: ::...:.:: :. : CCDS45 SFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTL 330 340 350 360 370 380 960 pF1KE3 PHKGKTDEFRKTF CCDS45 SATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTL 390 400 410 420 430 440 >-- initn: 1288 init1: 691 opt: 691 Z-score: 461.9 bits: 96.7 E(32554): 2.1e-19 Smith-Waterman score: 691; 57.1% identity (76.1% similar) in 163 aa overlap (779-941:378-540) 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 RLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDC :::: : : .:.:::: ::::.:.:: .: CCDS45 CLECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPEC 350 360 370 380 390 400 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 GKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSF ::::. :::. ::::: ::.:: :..::: : .::.:: ::: :::::::.:..::::: CCDS45 GKSFSVSSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSF 410 420 430 440 450 460 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 TNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSS :::. :::.::::.:::: .: :::.. . . : : : :. . :..::: : .. CCDS45 IRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAH 470 480 490 500 510 520 930 940 950 960 pF1KE3 VLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF : .:: .: : : CCDS45 ELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQH 530 540 550 560 570 580 >>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 (461 aa) initn: 1564 init1: 822 opt: 887 Z-score: 590.5 bits: 119.6 E(32554): 1.4e-26 Smith-Waterman score: 892; 40.1% identity (68.6% similar) in 344 aa overlap (612-942:13-353) 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 LINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTGW-EPEETSQEAVIEDSCSERMSE : .:..: : .. :. . . . .: ..: CCDS44 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFTE 10 20 30 40 650 660 670 680 690 pF1KE3 EEIVQEPEFQ---GPPGLLQSPNDFEIGSSIKEDPTQIVY-KDMEQHRALIEKSKRVVSQ .. ::. . ..:.. ... . .:. . . .: :. ::. .. :.. CCDS44 MRVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPM---VKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGK 50 60 70 80 90 700 710 720 730 740 pF1KE3 STDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKA-------VVHQRPFVGKRPYR . . .. .. . . : :. :. . :: .:::: .:..::. CCDS44 KIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYK 100 110 120 130 140 150 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 LLKYGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDC . :..:..: : .. :: :.::.: ::: : .. :::.:.::::::::.:: .: CCDS44 CNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNEC 160 170 180 190 200 210 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 GKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSF ::.:..: :. .::: :::::::.:.:::: :::: ::.:::.:::::::.:..:::.: CCDS44 GKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAF 220 230 240 250 260 270 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 TNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSS ..:: .. :.: ::::.:::: : :::.. : . ::.:.:.: ::. : .::: :::.: CCDS44 SKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNS 280 290 300 310 320 330 930 940 950 960 pF1KE3 VLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF ::.::..:. ::: CCDS44 SLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIE 340 350 360 370 380 390 >-- initn: 507 init1: 507 opt: 510 Z-score: 348.3 bits: 74.8 E(32554): 4.4e-13 Smith-Waterman score: 510; 63.3% identity (84.4% similar) in 109 aa overlap (775-882:354-461) 750 760 770 780 790 800 pF1KE3 KRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMTHHKENPYKCGVCGKCF-GRSRSLIRHQRIHTGEKPF :.: :::: : ::: :: :: :::::::. CCDS44 KPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRS-SLTVHQVIHTGEKPY 330 340 350 360 370 380 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 KCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGE .: .:::.:..:. . :::::::::::.: .::: : ..::: .:::::::::::::.: CCDS44 ECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNE 390 400 410 420 430 440 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 CGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKR :::.:. :.... :.:.:: CCDS44 CGKAFSRSTNLTRHQRTHT 450 460 >>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 (614 aa) initn: 812 init1: 812 opt: 886 Z-score: 588.6 bits: 119.7 E(32554): 1.8e-26 Smith-Waterman score: 928; 41.4% identity (65.5% similar) in 374 aa overlap (595-942:51-417) 570 580 590 600 610 pF1KE3 KNGHVLESCAFYKEMDALINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVE----PQDPTG-- :: : :. .:: . : :: : CCDS10 QEEDRQEEEVTTMILEDDSWVQEAVLQEDGPESEPFPQSAGKGGPQEEVTRGPQGALGRL 30 40 50 60 70 80 620 630 640 650 pF1KE3 ------W-EPEETSQEAVIEDSCSERMSEEEI---VQE--PEFQGPPG-----LLQS--P : .:: ..: .. : .:: .:: :: . . : :. CCDS10 RELCRRWLRPEVHTKEQMLT------MLPKEIQAWLQEHRPESSEEAAALVEDLTQTLQD 90 100 110 120 130 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 NDFEIGSSIKEDPTQIVYKDMEQHRALIEKSKRVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQG .:::: : :. .: .... :... . : . .: .: . .:. : . : CCDS10 SDFEIQSENGENCNQDMFEN-ESRKIFSEMPEGESAQHSDGESDFERDAGIQRLQGHSPG 140 150 160 170 180 190 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 IRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCG .:. .:: :..:. . : ..:..::. . :..:.:...:. . :: :. ::: CCDS10 EDHGEVVSQDREVGQLIGLQGTYLGEKPYECPQCGKTFSRKSHLITHERTHTGEKYYKCD 200 210 220 230 240 250 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 VCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGK ::: :. . .. ::: ::::::.:: ::::::. :.:. .::::::::::..:.:::: CCDS10 ECGKSFSDGSNFSRHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRIHTGEKPFQCAECGK 260 270 280 290 300 310 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 CFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNN ::.: .:: :::::::::::.: :::::: : : ...:. .::::.::.: .: .::. CCDS10 SFSRSPNLIAHQRTHTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSY 320 330 340 350 360 370 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 CTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKG . . .:.::::::::: :..::.:::.::.: ::..:. ::: CCDS10 NSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNL 380 390 400 410 420 430 960 pF1KE3 KTDEFRKTF CCDS10 ATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQ 440 450 460 470 480 490 >-- initn: 1404 init1: 812 opt: 840 Z-score: 559.0 bits: 114.2 E(32554): 8.1e-25 Smith-Waterman score: 840; 58.5% identity (80.0% similar) in 195 aa overlap (748-941:418-612) 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 QGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMC-RMTHHKENPYK :. . :.::.::. : : :: :.::: CCDS10 KPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYK 390 400 410 420 430 440 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 CGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKSFNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGEC :::::: :..: ::: :: .::::::..:: ::.::. :::. :::::::::::.:.:: CCDS10 CGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSEC 450 460 470 480 490 500 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 GKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNSSHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSF :::::: :.:..:::::::::::.: :::::. .: . :.:.: :..::.: .: :.: CCDS10 GKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKGF 510 520 530 540 550 560 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 NNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLTKHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPH . . . :.::::::::: : .::: ::.:: . :...:..:: CCDS10 SWNSVLIIHQRIHTGEKPYKCPECGKGFSNSSNFITHQRTHMKEKLY 570 580 590 600 610 960 pF1KE3 KGKTDEFRKTF >>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 (665 aa) initn: 2942 init1: 810 opt: 886 Z-score: 588.3 bits: 119.7 E(32554): 1.9e-26 Smith-Waterman score: 893; 56.3% identity (79.3% similar) in 222 aa overlap (723-943:388-606) 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 VVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVVHQRPFVGKRPYRLLK :: .:: : ::::: .:..::. . CCDS62 ECGKSFSRSSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVL---VVHQRTHTGEKPYECNQ 360 370 380 390 400 410 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 YGESFGRSTRLMCRM-THHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRIHTGEKPFKCLDCGKS :.:: .: .:. .. :: :.::.:. ::: : .: .:: ::::::::::..: .:::: CCDS62 CGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKS 420 430 440 450 460 470 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 FNDSSNFGAHQRIHTGEKPYRCGECGKCFSQSSSLIIHQRTHTGEKPYQCGECGKSFTNS :..: .. :::: ::::::..:..::: :: ::.:. :::::::::::.:.::::::. : CCDS62 FSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFNRS 480 490 500 510 520 530 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 SHFSAHRRVHTGENPYKCVDCEKSFNNCTRFREHRRIHTGEKPYGCAQCGKRFSKSSVLT ::. :.:.::::.::.: .: :::.. . :.: ::::::: :.:::: : .:: :: CCDS62 SHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECSQCGKSFRQSSCLT 540 550 560 570 580 590 940 950 960 pF1KE3 KHREVHVREKPLPHPPSLYCPENPHKGKTDEFRKTF .:...:. :::. 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CCDS66 GFTKNSALTRHQTVHMKAVLSSQEGRDAL 380 390 400 >>CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 (458 aa) initn: 1371 init1: 803 opt: 882 Z-score: 587.3 bits: 119.0 E(32554): 2.2e-26 Smith-Waterman score: 921; 43.0% identity (67.1% similar) in 356 aa overlap (612-942:85-430) 590 600 610 620 630 pF1KE3 LINSRASAPSPSTPEEVPSPSRQERGGIEVEPQDPTG----WEPEETSQEAVIE-DSCSE :::: . ::.... ::. .:::: CCDS41 FENIESETYLPLKVSSQIDTQDSSVKFCKNEPQDHQESRRLFVMEESTERKVIKGESCSE 60 70 80 90 100 110 640 650 660 670 680 pF1KE3 RMSEEEIVQEPEFQGPPGLLQSPNDFEIGSSIKE--DPTQIVYKDME----------QHR .. . . . :. .: ::.. . :. .:: :: . ::.. :.: CCDS41 NLQVKLVSDGQELASP--LLNGEATCQNGQ-LKESLDPIDCNCKDIHGWKSQVVSCSQQR 120 130 140 150 160 170 690 700 710 720 730 pF1KE3 ALIEKSK-------RVVSQSTDPSKYRKRECISGRQWENLQGIRQGKPMSQPRDLGKAVV : :.. .... : : :.: . .:.: : :: .:: .: .. CCDS41 AHTEEKPCDHNNCGKILNTSPDGHPYEKIHTAE-KQYECSQC---GKNFSQSSEL---LL 180 190 200 210 220 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 HQRPFVGKRPYRLLKYGESFGRSTRLMCRMT-HHKENPYKCGVCGKCFGRSRSLIRHQRI ::: . ..::. . :..: ::. :. ... : :.:::: ::: : :: ::. :. . 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