Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3552
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3552, 1958 aa
  1>>>pF1KE3552     1958 - 1958 aa - 1958 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8570+/-0.00121; mu= 3.1217+/- 0.073
 mean_var=203.7141+/-40.873, 0's: 0 Z-trim(108.5): 135  B-trim: 133 in 1/50
 Lambda= 0.089859
 statistics sampled from 10274 (10409) to 10274 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.311), width:  16
 Scan time:  3.240

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs109|chr10      (1958) 12840 1678.9       0
CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs109|chr17     (1491) 1488 207.2 4.3e-52
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 794)  501 79.1   8e-14
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 799)  501 79.1 8.1e-14
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 816)  501 79.1 8.2e-14
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10     ( 841)  501 79.1 8.5e-14
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10      ( 846)  501 79.1 8.5e-14
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2       ( 475)  488 77.3 1.6e-13
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2           ( 334)  453 72.7 2.8e-12
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2           ( 433)  453 72.8 3.5e-12
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2           ( 459)  453 72.8 3.7e-12
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7           ( 332)  446 71.8 5.2e-12
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7            ( 468)  446 71.9 7.1e-12
CCDS87488.1 CHN2 gene_id:1124|Hs109|chr7           ( 543)  446 71.9   8e-12
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17    ( 548)  427 69.4 4.5e-11
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs109|chr17    ( 889)  427 69.5 6.9e-11


>>CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs109|chr10           (1958 aa)
 initn: 12840 init1: 12840 opt: 12840  Z-score: 9000.7  bits: 1678.9 E(33420):    0
Smith-Waterman score: 12840; 100.0% identity (100.0% similar) in 1958 aa overlap (1-1958:1-1958)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MMATRRTGLSEGDGDKLKACEVSKNKDGKEQSETVSLSEDETFSWPGPKTVTLKRTSQGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MMATRRTGLSEGDGDKLKACEVSKNKDGKEQSETVSLSEDETFSWPGPKTVTLKRTSQGF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 GFTLRHFIVYPPESAIQFSYKDEENGNRGGKQRNRLEPMDTIFVKQVKEGGPAFEAGLCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GFTLRHFIVYPPESAIQFSYKDEENGNRGGKQRNRLEPMDTIFVKQVKEGGPAFEAGLCT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 GDRIIKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVLQFTKDVTALAYSQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GDRIIKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVLQFTKDVTALAYSQD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 AYLKGNEAYSGNARNIPEPPPICYPWLPSAPSAMAQPVEISPPDSSLSKQQTSTPVLTQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AYLKGNEAYSGNARNIPEPPPICYPWLPSAPSAMAQPVEISPPDSSLSKQQTSTPVLTQP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 GRAYRMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDLLSNRNNHTGPSHRTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GRAYRMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDLLSNRNNHTGPSHRTEE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 VRYGVSEQTSLKTVSRTTSPPLSIPTTHLIHQPAGSRSLEPSGILLKSGNYSGHSDGISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VRYGVSEQTSLKTVSRTTSPPLSIPTTHLIHQPAGSRSLEPSGILLKSGNYSGHSDGISS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 SRSQAVEAPSVSVNHYSPNSHQHIDWKNYKTYKEYIDNRRLHIGCRTIQERLDSLRAASQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SRSQAVEAPSVSVNHYSPNSHQHIDWKNYKTYKEYIDNRRLHIGCRTIQERLDSLRAASQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 STTDYNQVVPNRTTLQGRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPRSASQGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 STTDYNQVVPNRTTLQGRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPRSASQGA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPPDLKTLQSNRNFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPPDLKTLQSNRNFQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 TTCGMSLPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQRPVNHLHQNSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 TTCGMSLPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQRPVNHLHQNSL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 LNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAPQSSENAGTSDLELPVSQRNQDLSLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAPQSSENAGTSDLELPVSQRNQDLSLQE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 AETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTPQPLRHQSYILAVNDQETGSDTTCWLPNDARRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTPQPLRHQSYILAVNDQETGSDTTCWLPNDARRE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 VHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHDIAHIPASAVISASTSQVPSIAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHDIAHIPASAVISASTSQVPSIAT
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 VPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNSKTERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNSKTERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 SSLKGIKIADSQKSSEDSGSRKDSSSEVFSDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SSLKGIKIADSQKSSEDSGSRKDSSSEVFSDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 MYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEEEQPISVNACLIDISYSETKRKNVFRLTTSDCECLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEEEQPISVNACLIDISYSETKRKNVFRLTTSDCECLF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 QAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 IRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 IRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 ATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 ATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 KGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLK
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 RLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 RLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTH
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 MPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 DVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNV
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 FFKKENVEQCHNDTKEESKKESETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKISLGKESTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 FFKKENVEQCHNDTKEESKKESETLGRKQKIIIAKENSTRKDPSTTKDEKISLGKESTPS
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 EEPSPPHNSKHNKSPTLSCRFAILKESPRSLLAQKSSHLEETGSDSGTLLSTSSQASLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 EEPSPPHNSKHNKSPTLSCRFAILKESPRSLLAQKSSHLEETGSDSGTLLSTSSQASLAR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 FSMKKSTSPETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSATYLTSLDSSRLSPEVQSVAESKGDEAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 FSMKKSTSPETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSATYLTSLDSSRLSPEVQSVAESKGDEAD
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 DERSELISEGRPVETDSESEFPVFPTALTSERLFRGKLQEVTKSSRRNSEGSELSCTEGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DERSELISEGRPVETDSESEFPVFPTALTSERLFRGKLQEVTKSSRRNSEGSELSCTEGS
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 LTSSLDSRRQLFSSHKLIECDTLSRKKSARFKSDSGSLGDAKNEKEAPSLTKVFDVMKKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LTSSLDSRRQLFSSHKLIECDTLSRKKSARFKSDSGSLGDAKNEKEAPSLTKVFDVMKKG
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 KSTGSLLTPTRGESEKQEPTWKTKIADRLKLRPRAPADDMFGVGNHKVNAETAKRKSIRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 KSTGSLLTPTRGESEKQEPTWKTKIADRLKLRPRAPADDMFGVGNHKVNAETAKRKSIRR
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE3 RHTLGGHRDATEISVLNFWKVHEQSGERESELSAVNRLKPKCSAQDLSISDWLARERLRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 RHTLGGHRDATEISVLNFWKVHEQSGERESELSAVNRLKPKCSAQDLSISDWLARERLRT
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE3 STSDLSRGEIGDPQTENPSTREIATTDTPLSLHCNTGSSSSTLASTNRPLLSIPPQSPDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 STSDLSRGEIGDPQTENPSTREIATTDTPLSLHCNTGSSSSTLASTNRPLLSIPPQSPDQ
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950        
pF1KE3 INGESFQNVSKNASSAANAQPHKLSETPGSKAEFHPCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 INGESFQNVSKNASSAANAQPHKLSETPGSKAEFHPCL
             1930      1940      1950        

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       :::::::::.. : :.::::.:::  . : :::::::::::.::: ::: .::: ::::.
CCDS56 FIVYPPESAVHCSLKEEENGGRGGGPSPRYRLEPMDTIFVKNVKEDGPAHRAGLRTGDRL
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pF1KE3 IKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVLQFTKDVTALAYSQDAYLK
       .::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::::          ::::::::::
CCDS56 VKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDDTLELSIMPKDEDILQ----------LAYSQDAYLK
              130       140       150       160                 170

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       ::: :::.::.::::::::::    ::                            :.:: 
CCDS56 GNEPYSGEARSIPEPPPICYPRKTYAP----------------------------PARAS
              180       190                                   200  

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pF1KE3 RMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDLLSNRNNHTGPSHRTEEVRYG
           .::  ::..                  .::.              :          
CCDS56 TRATMVPE-PTSA------------------LPSD--------------P----------
            210                                                    

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE3 VSEQTSLKTVSRTTSPPLSIPTTHLIHQPAGSRSLEPSGILLKSGNYSGHSDGISSSRSQ
              .. .  ..: : .:       ::.   :. :..            :.:. :  
CCDS56 -------RSPAAWSDPGLRVP-------PAARAHLDNSSL------------GMSQPR--
            220       230              240                   250   

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pF1KE3 AVEAPSVSVNHYSPNSHQHIDWKNYKTYKEYIDNRRLHIGCRTIQERLDSLRAASQSTTD
           ::       :..  :.. .. .: . . .      : :.   ::.  .: :.  . 
CCDS56 ----PS-------PGAFPHLS-SEPRTPRAFPEP-----GSRVPPSRLECQQALSHWLS-
                        260        270            280       290    

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pF1KE3 YNQVVPNRTTLQGRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPRSASQGALTSP
        ::: : :.   :.::  .   .:     : ::.::.:::. .  .  : :.:: ::.. 
CCDS56 -NQV-PRRA---GERRCPAM--AP-----RARSASQDRLEEVAAPRPWPCSTSQDALSQL
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pF1KE3 SVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGICERP
       . . . ::.:: ::.    .. : .. :. .       .  ..  :.. :          
CCDS56 G-QEGWHRARSDDYLSRATRSAEALGPGALV-------SPRFERCGWASQ----------
              350       360       370              380             

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pF1KE3 RQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPPDLKTLQSNRNFQTTCG
                :.:  : :       .: . :          . ::                
CCDS56 ---------RSSARTPA-----CPTRDLPG---------PQAPP----------------
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pF1KE3 MSLPRGISQ-DRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQRPVNHLHQNSLLNQ
          : :..  :    .  :: :          :::          :: .. ::  :.   
CCDS56 ---PSGLQGLDDLGYIGYRSYS----------PSF----------QRRTGLLHALSF---
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pF1KE3 QTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAPQSSENAGTSDLELPVSQRNQDLSLQEAET
             :: :      :  :... :.. ::    : .     : :   : .  : .  : 
CCDS56 -----RDS-P-----FGGLPTFNLAQS-PASFPPEAS-----EPPRVVRPEP-STRALEP
           440             450        460            470        480

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pF1KE3 EQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTP-QPLRHQSYILAVNDQETGSDTTCWLPNDARREVH
          :  :.   :.::.:::.::..   : :...  :. .:.    ...      .: :  
CCDS56 PAEDRGDE---VVLRQKPPTGRKVQLTPARQMN--LGFGDESPEPEAS------GRGE--
                 490       500       510         520               

            790       800       810       820       830       840  
pF1KE3 IKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHDIAHIPASAVISASTSQVPSIATVP
         :.  ::..  .   :::::::::::::::::: .  :.:::::.:.. ...: ..: :
CCDS56 --RLG-RKVAPLATTEDSLASIPFIDEPTSPSIDLQAKHVPASAVVSSAMNSAPVLGTSP
         530        540       550       560       570       580    

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pF1KE3 PCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNS-KTERSKSYDEGLDDYREDAKLSFK---
          : .  :  :. :.:  :.     ..   .  :::::: :.::. .:.....  .   
CCDS56 SSPTFTFTL-GRHYSQDCSSIKAGRRSSYLLAITTERSKSCDDGLNTFRDEGRVLRRLPN
          590        600       610       620       630       640   

      900             910         920           930       940      
pF1KE3 HVSSLKGIKI------ADSQKSSEDSG--SRKDSSSEV----FSDAAKEGWLHFRPLVTD
       .. ::. ..        ::  .:::.   :.. :.:..    :::  .::::... ..: 
CCDS56 RIPSLRMLRSFFTDGSLDSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTK
           650       660       670       680       690       700   

        950       960       970       980                 990      
pF1KE3 KGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPS----------EEEQPISVNACLI
       :::..:...: ::..:..::..:: : :..::    .          .:  :. ...::.
CCDS56 KGKKAGSGLRQWKRVYAALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLV
           710       720       730       740       750       760   

       1000      1010       1020      1030      1040      1050     
pF1KE3 DISYSETKRKNVFRLTTSD-CECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLIS
       :::::::::..::::::.: :: :::::::::::.::..:.:.:  . :: : .:. :::
CCDS56 DISYSETKRRHVFRLTTADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALIS
           770       780       790       800       810       820   

        1060       1070      1080      1090      1100      1110    
pF1KE3 RRIKEYNNL-MSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDT
       .....: ..  :.. .  ..:. :    . : : :::   ::     . ..    :::: 
CCDS56 KKLNDYRKVSHSSGPKADSSPKGS----RGLGGLKSEFLKQSAARGLRTQDLPAGSKDD-
           830       840           850       860       870         

         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KE3 SPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEE
       :    :  :  :: .:..:. .  : :   :::::..: ::  :. .::::  ::..:: 
CCDS56 SAAAPKTPW--GI-NIIKKNKKAAPRA---FGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEA
      880          890       900          910       920       930  

         1180      1190      1200      1210      1220      1230    
pF1KE3 RGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPL
       :::: :::::::::::..::.::.::.: .::..::..:.::::::::::::::::::::
CCDS56 RGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPL
            940       950       960       970       980       990  

         1240      1250      1260      1270      1280      1290    
pF1KE3 FTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKME
       ::.::: ::::::: ::  .:..::..::.::: :.::::::: .::::.:..:::::::
CCDS56 FTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKME
           1000      1010      1020      1030      1040      1050  

         1300      1310      1320      1330      1340      1350    
pF1KE3 PRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEE
       :::::.::::::::::::::: :::::::.:::::::::: ::::..:  .   : : ..
CCDS56 PRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDK
           1060      1070      1080      1090      1100      1110  

         1360      1370      1380       1390      1400      1410   
pF1KE3 STVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDV-SDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSI
          . : ::::..:: ::::: : :::  :::.: .:.::::::.  :. :.::.:. :.
CCDS56 ---EPQAVPNIEYLLPNIGRT-VPPGDPGSDSTTCSSAKSKGSWAPKKEPYAREMLAISF
              1120      1130       1140      1150      1160        

          1420      1430      1440      1450      1460      1470   
pF1KE3 FAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENVEQCHNDTKEESKKESETLGRKQKIII
       ..:..::::: .:    .:: :.                :...:..:             
CCDS56 ISAVNRKRKKRREARGLGSSTDD----------------DSEQEAHK-------------
     1170      1180      1190                                      

          1480      1490      1500      1510      1520      1530   
pF1KE3 AKENSTRKDPSTTKDEKISLGKESTPSEEPSPPHNSKHNKSPTLSCRFAILKESPRSLLA
                                :.   . : .... ..:  .   :.  :.:     
CCDS56 -------------------------PGAGATAPGTQERPQGPLPG---AVAPEAP-----
                             1200      1210         1220           

          1540      1550      1560      1570      1580      1590   
pF1KE3 QKSSHLEETGSDSGTLLSTSSQASLARFSMKKSTSPETKHSEFLANVSTITSDYSTTSSA
                                .:.:    ..:: . .   :.. .:.: :::    
CCDS56 -------------------------GRLS--PPAAPEERPA---ADTRSIVSGYST----
                                1230        1240         1250      

          1600      1610      1620      1630      1640      1650   
pF1KE3 TYLTSLDSSRLSPEVQSVAESKGDEADDERSELISEGRPVETDSESEFPVFPTALTSERL
         :...: :  :      : . :::::::::::      ::::.:.   . :        
CCDS56 --LSTMDRSVCSGASGRRA-GAGDEADDERSEL----SHVETDTEGAAGAGPG-------
             1260       1270      1280          1290               

          1660      1670      1680      1690      1700      1710   
pF1KE3 FRGKLQEVTKSSRRNSEGSELSCTEGSLTSSLDSRRQLFSSHKLIECDTLSRKKSARFKS
         :.:                            .::  ::::.:. ::::.:.. :: . 
CCDS56 --GRL----------------------------TRRPSFSSHHLMPCDTLARRRLARGRP
       1300                                  1310      1320        

          1720      1730      1740      1750      1760      1770   
pF1KE3 DSGSLGDAKNEKEAPSLTKVFDVMKKGKSTGSLLTPTRGESEKQEPTWKTKIADRLKLRP
       :. . : .  .   :  .       ...:  ::  :. . . .  :.      . :.:: 
CCDS56 DGEGAGRGGPRAPEPPGSA------SSSSQESLRPPAAALASR--PSR----MEALRLRL
     1330      1340            1350      1360            1370      

          1780       1790      1800      1810      1820      1830  
pF1KE3 RAPADDMFGVGNHK-VNAETAKRKSIRRRHTLGGHRDATEISVLNFWKVHEQSGERESEL
       :. ::::..:  .. .. :: .:.:  ::::.  .   :... .: ::  : .:    : 
CCDS56 RGTADDMLAVRLRRPLSPETRRRRSSWRRHTVVVQSPLTDLN-FNEWK--ELGGGGPPEP
       1380      1390      1400      1410       1420        1430   

           1840      1850      1860          1870      1880        
pF1KE3 SAVNRLKPKCSAQDLSISDWLARERLRTSTSDLSR----GEIGDPQTENPSTREIATTDT
       ...   . . . .: ..:. :   . :. .:  :.    :. :. :.. :          
CCDS56 AGA---RAHSDNKDSGLSS-LESTKARAPSSAASQPPAPGDTGSLQSQPPRRSAASRLHQ
             1440       1450      1460      1470      1480         

     1890      1900      1910      1920      1930      1940        
pF1KE3 PLSLHCNTGSSSSTLASTNRPLLSIPPQSPDQINGESFQNVSKNASSAANAQPHKLSETP
                                                                   
CCDS56 CL                                                          
    1490                                                           

>>CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (794 aa)
 initn: 376 init1: 158 opt: 501  Z-score: 361.8  bits: 79.1 E(33420): 8e-14
Smith-Waterman score: 596; 25.1% identity (54.1% similar) in 857 aa overlap (511-1332:7-785)

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
                                     ::  ::   :.     ...   :  ::. .
CCDS59                         MKMADRSGKIIP---GQVYIEVEYDYEYEAKDRKIV
                                       10           20        30   

              550       560       570       580                 590
pF1KE3 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPP----------DL
        .. ..  . :.   . . : :.  ::    . .. :  :..   .::          . 
CCDS59 IKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDE-NSKAFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNST
            40        50         60        70        80        90  

              600        610       620       630       640         
pF1KE3 KTLQSNRNFQTTCGMS-LPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQ
       : .:: .  ..: ... ::. .:.  .:  .:....:   ...   ::..: . :...  
CCDS59 KIMQSLHLQRSTENVNKLPE-LSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLS--
            100       110        120       130       140           

     650       660       670       680       690       700         
pF1KE3 RPVNHLHQNSLLNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAPQSSENAGTSDLELPV
         ..  :.:. .:...     :. ..    :. :.    ... .  :.:..  :  :   
CCDS59 --LDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGE--G
       150       160       170       180       190       200       

     710        720       730       740       750       760        
pF1KE3 SQR-NQDLSLQEAETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTPQPLRHQSYILAVNDQETGSD
       :.: .::       .:..: :... .  .:   :     :.  : .: . : : ::   .
CCDS59 SERIHQD-------SESGDELSSSSTEQIRATTP-----PNQGRPDSPVYA-NLQELKIS
         210              220       230            240        250  

      770       780        790       800       810       820       
pF1KE3 TTCWLPNDARREVHIK-RMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHDIAHIPASAV
        .   :  .   ..:. . : .: ::      . ..     .:  :   .:       : 
CCDS59 QSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKP--PRWTRD-------AS
            260       270       280       290         300          

       830       840       850       860       870         880     
pF1KE3 ISASTSQVPSIATVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNSKTE--RSKSYDEG
       :: .  : :.       .  ..     . . ..     :. .:. ... :  .:.: :. 
CCDS59 ISKGDFQNPGDQEWLKHVDDQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRR
           310       320       330       340       350       360   

         890        900       910           920       930       940
pF1KE3 LDDYREDAKLS-FKHVSSLKGIKIADSQKSSE----DSGSRKDSSSEVFSDAAKEGWLHF
       :   .:   :. ..: . .   .  .:  .:.    .. :  .: ..  .:  : : :. 
CCDS59 L---QEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNV
              370       380       390       400       410       420

              950       960       970       980            990     
pF1KE3 RPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTT--PSEEEQP---ISVNACL
          ....::.:    . : . ..::.: :: . : .  .:.   :.. .:   .....  
CCDS59 TK-IAENGKKVR---KNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGAT
               430          440       450       460       470      

         1000      1010      1020      1030       1040             
pF1KE3 IDI-SYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLA-WIKTIQESSNLN----EEDTGVT
       :.. : .....::::.: : .   :.   : : ..  :.:..  ::..:    : : :. 
CCDS59 IEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVL--SSTINNQAVETDEGIE
        480       490       500       510         520       530    

    1050      1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KE3 NRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLL
                          :..: .:           : ... : .  ..::.    :. 
CCDS59 -------------------EEIPDSP-----------GIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVS
                             540                  550       560    

    1110      1120         1130      1140      1150       1160     
pF1KE3 SKDDTSPPKDKGTWRKGI---PSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDD-CPPAHTNRYIPLIV
       : :..   : : . .: .   :. .. . ::      .::  : . :   . :  .: .:
CCDS59 SIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPT-LQAVREKGYIKDQVFGSNLANLC--QRENGTVPKFV
          570       580        590       600       610         620 

        1170      1180      1190      1200      1210      1220     
pF1KE3 DICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKS
        .: . :::.::.  ::::: :: :.:....  .:.    .:..:.::.:..::.. :: 
CCDS59 KLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHD-EKLDLNDSKWEDIHVITGALKM
             630       640       650        660       670       680

        1230      1240      1250      1260      1270      1280     
pF1KE3 FFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVA
       :::.::::::: ... ::..: ..: : .:. ..: ::..::. . .:...:  ::. : 
CCDS59 FFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQE-PRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVI
              690       700        710       720       730         

        1290      1300      1310      1320      1330      1340     
pF1KE3 ENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAE
       ::.:::.:  ...::::::::..  : .  ....:   : .::: ..             
CCDS59 ENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKP-EKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR    
     740       750       760        770       780       790        

        1350      1360      1370      1380      1390      1400     
pF1KE3 EPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYS

>>CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (799 aa)
 initn: 418 init1: 158 opt: 501  Z-score: 361.8  bits: 79.1 E(33420): 8.1e-14
Smith-Waterman score: 594; 25.2% identity (53.8% similar) in 861 aa overlap (511-1332:7-790)

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
                                     ::  ::   :.     ...   :  ::. .
CCDS73                         MKMADRSGKIIP---GQVYIEVEYDYEYEAKDRKIV
                                       10           20        30   

              550       560       570       580                 590
pF1KE3 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPP----------DL
        .. ..  . :.   . . : :.  ::    . .. :  :..   .::          . 
CCDS73 IKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDE-NSKAFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNST
            40        50         60        70        80        90  

              600        610       620       630       640         
pF1KE3 KTLQSNRNFQTTCGMS-LPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQ
       : .:: .  ..: ... ::. .:.  .:  .:....:   ...   ::..: . :...  
CCDS73 KIMQSLHLQRSTENVNKLPE-LSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLS--
            100       110        120       130       140           

     650       660       670       680       690           700     
pF1KE3 RPVNHLHQNSLLNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAP----QSSENAGTSDL
         ..  :.:. .:...     :. ..    :. :.    ... .     :: ..:: .. 
CCDS73 --LDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSE
       150       160       170       180       190       200       

          710       720       730             740       750        
pF1KE3 ELPV-SQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNK---EAVI---LREKPPSGRQTPQPLRHQSYIL
       ..   :. ...:: . .:  .. :  :.   .. .   :.:   :    : ::  .  : 
CCDS73 RIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALP-PLPGSPAIQ
       210       220       230       240       250        260      

      760       770         780       790       800       810      
pF1KE3 AVNDQETGSDTT--CWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSID
         .. :: .:..  :.  : . .:   :  .  . .: :  ::   . :  :.     .:
CCDS73 INGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISK-GD--FQNPG-DQEWLKHVD
        270       280       290       300          310        320  

        820       830       840       850       860       870      
pF1KE3 HDIAHIPASAVISASTSQVPSIATVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNSKT
        .  .   ::  : :  ..:.  .     . .   : .. : :..   :  :    .:  
CCDS73 DQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNAS----SQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTI
            330       340           350       360       370        

        880       890       900       910       920       930      
pF1KE3 ERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHVSSLKGIKIADSQKSSEDSGSRKDSSSEVFSDAAKEG
                ::   ...  . :             ..:: .: ...:..:   .:  : :
CCDS73 V--------LDTNDKESPTASKPC--------FPENESSPSSPKHQDTASSP-KDQEKYG
              380       390               400       410        420 

        940       950       960       970       980            990 
pF1KE3 WLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTT--PSEEEQP---ISV
        :.    ....::.:    . : . ..::.: :: . : .  .:.   :.. .:   ...
CCDS73 LLNVTK-IAENGKKVR---KNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDL
              430          440       450       460       470       

             1000      1010      1020      1030       1040         
pF1KE3 NACLIDI-SYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLA-WIKTIQESSNLN----EED
       ..  :.. : .....::::.: : .   :.   : : ..  :.:..  ::..:    : :
CCDS73 KGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVL--SSTINNQAVETD
       480       490       500       510       520         530     

        1050      1060      1070      1080      1090      1100     
pF1KE3 TGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESE
        :.                    :..: .:           : ... : .  ..::.   
CCDS73 EGIE-------------------EEIPDSP-----------GIEKHDKEKEQKDPKKLRS
                            540                  550       560     

        1110      1120         1130      1140      1150       1160 
pF1KE3 RKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGI---PSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDD-CPPAHTNRYI
        :. : :..   : : . .: .   :. .. . ::      .::  : . :   . :  .
CCDS73 FKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPT-LQAVREKGYIKDQVFGSNLANLC--QRENGTV
         570       580       590        600       610         620  

            1170      1180      1190      1200      1210      1220 
pF1KE3 PLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISS
       : .: .: . :::.::.  ::::: :: :.:....  .:.    .:..:.::.:..::..
CCDS73 PKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHD-EKLDLNDSKWEDIHVITG
            630       640       650       660        670       680 

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KE3 LLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHL
        :: :::.::::::: ... ::..: ..: : .:. ..: ::..::. . .:...:  ::
CCDS73 ALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQE-PRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHL
             690       700       710        720       730       740

            1290      1300      1310      1320      1330      1340 
pF1KE3 KTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTE
       . : ::.:::.:  ...::::::::..  : .  ....:   : .::: ..         
CCDS73 RRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKP-EKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR
              750       760        770       780       790         

            1350      1360      1370      1380      1390      1400 
pF1KE3 EGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGK

>>CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (816 aa)
 initn: 376 init1: 158 opt: 501  Z-score: 361.6  bits: 79.1 E(33420): 8.2e-14
Smith-Waterman score: 596; 25.2% identity (53.7% similar) in 866 aa overlap (511-1332:7-807)

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
                                     ::  ::   :.     ...   :  ::. .
CCDS59                         MKMADRSGKIIP---GQVYIEVEYDYEYEAKDRKIV
                                       10           20        30   

              550       560       570       580                 590
pF1KE3 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPP----------DL
        .. ..  . :.   . . : :.  ::    . .. :  :..   .::          . 
CCDS59 IKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDE-NSKAFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNST
            40        50         60        70        80        90  

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pF1KE3 KTLQSNRNFQTTCGMS-LPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQ
       : .:: .  ..: ... ::. .:.  .:  .:....:   ...   ::..: . :...  
CCDS59 KIMQSLHLQRSTENVNKLPE-LSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLS--
            100       110        120       130       140           

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pF1KE3 RPVNHLHQNSLLNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAP----QSSENAGTSDL
         ..  :.:. .:...     :. ..    :. :.    ... .     :: ..:: .. 
CCDS59 --LDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSE
       150       160       170       180       190       200       

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pF1KE3 ELPV-SQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNK---EAVI---LREKPPSGRQTPQPLRHQSYIL
       ..   :. ...:: . .:  .. :  :.   .. .   :.:   :    : ::  .  : 
CCDS59 RIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALP-PLPGSPAIQ
       210       220       230       240       250        260      

      760       770         780       790       800       810      
pF1KE3 AVNDQETGSDTT--CWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSID
         .. :: .:..  :.  : . .:   :  .  . .: :  ::      :     .:. :
CCDS59 INGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISK-GD------F----QNPG-D
        270       280       290       300                  310     

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pF1KE3 HDIAHIPASAVISASTSQVPSIATVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNSKT
       ...         :.: ::  :    ::    :  : .:  .:   . .  . .   .   
CCDS59 QELLS-SEENYYSTSYSQSDSQCGSPP-RGWSEELDER--GHTLYT-SDYTNEKWLKHVD
           320       330       340        350          360         

        880       890       900       910           920       930  
pF1KE3 ERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHVSSLKGIKIADSQ----KSSEDSGSRKDSSSEVFSDA
       .....:  . :  : . .:   ..:: .  .:  :.    . .:     :   : .  :.
CCDS59 DQGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDT
     370       380       390       400       410       420         

            940       950        960       970       980           
pF1KE3 AKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRP-WKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTT--PSEEEQP-
         .   ..  : . :  . : ..:  : . ..::.: :: . : .  .:.   :.. .: 
CCDS59 NDKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPE
     430       440       450       460       470       480         

        990       1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE3 --ISVNACLIDI-SYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLA-WIKTIQESSNLN--
         .....  :.. : .....::::.: : .   :.   : : ..  :.:..  ::..:  
CCDS59 FTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVL--SSTINNQ
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             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KE3 --EEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSP
         : : :.                    :..: .:           : ... : .  ..:
CCDS59 AVETDEGIE-------------------EEIPDSP-----------GIEKHDKEKEQKDP
       550                          560                  570       

             1110      1120         1130      1140      1150       
pF1KE3 KEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGI---PSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDD-CPPAH
       :.    :. : :..   : : . .: .   :. .. . ::      .::  : . :   .
CCDS59 KKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPT-LQAVREKGYIKDQVFGSNLANLC--QR
       580       590       600        610       620       630      

       1160      1170      1180      1190      1200      1210      
pF1KE3 TNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDL
        :  .: .: .: . :::.::.  ::::: :: :.:....  .:.    .:..:.::.:.
CCDS59 ENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHD-EKLDLNDSKWEDI
          640       650       660       670       680        690   

       1220      1230      1240      1250      1260      1270      
pF1KE3 NVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKF
       .::.. :: :::.::::::: ... ::..: ..: : .:. ..: ::..::. . .:...
CCDS59 HVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIKQE-PRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQI
           700       710       720        730       740       750  

       1280      1290      1300      1310      1320      1330      
pF1KE3 LSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHD
       :  ::. : ::.:::.:  ...::::::::..  : .  ....:   : .::: ..    
CCDS59 LFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKP-EKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELS
            760       770       780        790       800       810 

       1340      1350      1360      1370      1380      1390      
pF1KE3 WFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGS
                                                                   
CCDS59 SIFGR                                                       
                                                                   

>>CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10          (841 aa)
 initn: 376 init1: 158 opt: 501  Z-score: 361.4  bits: 79.1 E(33420): 8.5e-14
Smith-Waterman score: 597; 25.3% identity (53.6% similar) in 894 aa overlap (511-1332:7-832)

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
                                     ::  ::   :.     ...   :  ::. .
CCDS59                         MKMADRSGKIIP---GQVYIEVEYDYEYEAKDRKIV
                                       10           20        30   

              550       560       570       580                 590
pF1KE3 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPP----------DL
        .. ..  . :.   . . : :.  ::    . .. :  :..   .::          . 
CCDS59 IKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDE-NSKAFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNST
            40        50         60        70        80        90  

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pF1KE3 KTLQSNRNFQTTCGMS-LPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQ
       : .:: .  ..: ... ::. .:.  .:  .:....:   ...   ::..: . :...  
CCDS59 KIMQSLHLQRSTENVNKLPE-LSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLS--
            100       110        120       130       140           

     650       660       670       680       690           700     
pF1KE3 RPVNHLHQNSLLNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAP----QSSENAGTSDL
         ..  :.:. .:...     :. ..    :. :.    ... .     :: ..:: .. 
CCDS59 --LDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSE
       150       160       170       180       190       200       

          710       720       730             740       750        
pF1KE3 ELPV-SQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNK---EAVI---LREKPPSGRQTPQPLRHQSYIL
       ..   :. ...:: . .:  .. :  :.   .. .   :.:   :    : ::  .  : 
CCDS59 RIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALP-PLPGSPAIQ
       210       220       230       240       250        260      

      760       770         780       790       800       810      
pF1KE3 AVNDQETGSDTT--CWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSID
         .. :: .:..  :.  : . .:   :  .  . .: :  ::      :     .:. :
CCDS59 INGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISK-GD------F----QNPG-D
        270       280       290       300                  310     

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pF1KE3 HDIAHIPASAVISASTSQVPSIATVPP------------CLTTSAPLIRRQLSH-DHESV
       ...         :.: ::  :    ::             : ::    .. :.: : .. 
CCDS59 QELLS-SEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDDQGR
           320       330       340       350       360       370   

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pF1KE3 -------GP------PSLDAQPNSKTE--RSKSYDEGLDDYREDAKLS-FKHVSSLKGIK
              :       :. .:. ... :  .:.: :. :   .:   :. ..: . .   .
CCDS59 QYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRL---QEPIVLTKWRHSTIVLDTN
           380       390       400       410          420       430

       910           920       930       940       950       960   
pF1KE3 IADSQKSSE----DSGSRKDSSSEVFSDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYV
         .:  .:.    .. :  .: ..  .:  : : :.    ....::.:    . : . ..
CCDS59 DKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTK-IAENGKKVR---KNWLSSWA
              440       450       460        470          480      

           970       980            990       1000      1010       
pF1KE3 VLRGHSLYLYKDKREQTT--PSEEEQP---ISVNACLIDI-SYSETKRKNVFRLTTSDCE
       ::.: :: . : .  .:.   :.. .:   .....  :.. : .....::::.: : .  
CCDS59 VLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGT
        490       500       510       520       530       540      

      1020      1030       1040          1050      1060      1070  
pF1KE3 CLFQAEDRDDMLA-WIKTIQESSNLN----EEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLP
        :.   : : ..  :.:..  ::..:    : : :.                    :..:
CCDS59 ELLIQSDNDTVINDWFKVL--SSTINNQAVETDEGIE-------------------EEIP
        550       560         570       580                        

           1080      1090      1100      1110      1120            
pF1KE3 KTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGI---PS
        .:           : ... : .  ..::.    :. : :..   : : . .: .   :.
CCDS59 DSP-----------GIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPT
                    590       600       610       620       630    

    1130      1140      1150       1160      1170      1180        
pF1KE3 IMRKTFEKKPTATGTFGVRLDD-CPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGN
        .. . ::      .::  : . :   . :  .: .: .: . :::.::.  ::::: ::
CCDS59 -LQAVREKGYIKDQVFGSNLANLC--QRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGN
           640       650         660       670       680       690 

     1190      1200      1210      1220      1230      1240        
pF1KE3 NAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANR
        :.:....  .:.    .:..:.::.:..::.. :: :::.::::::: ... ::..: .
CCDS59 LAVIQKLRFAVNHD-EKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFNDFVNAIK
             700        710       720       730       740       750

     1250      1260      1270      1280      1290      1300        
pF1KE3 KEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVR
       .: : .:. ..: ::..::. . .:...:  ::. : ::.:::.:  ...::::::::..
CCDS59 QE-PRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK
               760       770       780       790       800         

     1310      1320      1330      1340      1350      1360        
pF1KE3 TSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHL
         : .  ....:   : .::: ..                                    
CCDS59 P-EKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR                           
     810        820       830       840                            

>>CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs109|chr10           (846 aa)
 initn: 418 init1: 158 opt: 501  Z-score: 361.4  bits: 79.1 E(33420): 8.5e-14
Smith-Waterman score: 594; 25.3% identity (53.6% similar) in 900 aa overlap (511-1332:7-837)

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 LTSPSVSFSNHRTRSWDYIEGQDETLENVNSGTPIPDSNGEKKQTYKWSGFTEQDDRRGI
                                     ::  ::   :.     ...   :  ::. .
CCDS71                         MKMADRSGKIIP---GQVYIEVEYDYEYEAKDRKIV
                                       10           20        30   

              550       560       570       580                 590
pF1KE3 CERPRQQEIHKSFRGSNFTVAPSVVNSDNRRMSGRGVGSVSQFKKIPP----------DL
        .. ..  . :.   . . : :.  ::    . .. :  :..   .::          . 
CCDS71 IKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDE-NSKAFYVPAQYVKEVTRKALMPPVKQVAGLPNNST
            40        50         60        70        80        90  

              600        610       620       630       640         
pF1KE3 KTLQSNRNFQTTCGMS-LPRGISQDRSPLVKVRSNSLKAPSTHVTKPSFSQKSFVSIKDQ
       : .:: .  ..: ... ::. .:.  .:  .:....:   ...   ::..: . :...  
CCDS71 KIMQSLHLQRSTENVNKLPE-LSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNLS--
            100       110        120       130       140           

     650       660       670       680       690           700     
pF1KE3 RPVNHLHQNSLLNQQTWVRTDSAPDQQVETGKSPSLSGASAKPAP----QSSENAGTSDL
         ..  :.:. .:...     :. ..    :. :.    ... .     :: ..:: .. 
CCDS71 --LDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSE
       150       160       170       180       190       200       

          710       720       730             740       750        
pF1KE3 ELPV-SQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNK---EAVI---LREKPPSGRQTPQPLRHQSYIL
       ..   :. ...:: . .:  .. :  :.   .. .   :.:   :    : ::  .  : 
CCDS71 RIHQDSESGDELSSSSTEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALP-PLPGSPAIQ
       210       220       230       240       250        260      

      760       770         780       790       800       810      
pF1KE3 AVNDQETGSDTT--CWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSID
         .. :: .:..  :.  : . .:   :  .  . .: :  ::      :     .:. :
CCDS71 INGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPPRWTRDASISK-GD------F----QNPG-D
        270       280       290       300                  310     

        820       830       840                   850        860   
pF1KE3 HDIAHIPASAVISASTSQVPSIATVPP------------CLTTSAPLIRRQLSH-DHESV
       ...         :.: ::  :    ::             : ::    .. :.: : .. 
CCDS71 QELLS-SEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDDQGR
           320       330       340       350       360       370   

                        870         880       890        900       
pF1KE3 -------GP------PSLDAQPNSKTE--RSKSYDEGLDDYREDAKLS-FKHVSSLKGIK
              :       :. .:. ... :  .:.: :. :   .:   :. ..: . .   .
CCDS71 QYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRL---QEPIVLTKWRHSTIVLDTN
           380       390       400       410          420       430

       910                 920       930       940       950       
pF1KE3 IADS----------QKSSEDSGSRKDSSSEVFSDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRP
         .:          ..:: .: ...:..:   .:  : : :.    ....::.:    . 
CCDS71 DKESPTASKPCFPENESSPSSPKHQDTASSP-KDQEKYGLLNVTK-IAENGKKVR---KN
              440       450       460        470        480        

       960       970       980            990       1000      1010 
pF1KE3 WKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTT--PSEEEQP---ISVNACLIDI-SYSETKRKNVFRL
       : . ..::.: :: . : .  .:.   :.. .:   .....  :.. : .....::::.:
CCDS71 WLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFEL
         490       500       510       520       530       540     

            1020      1030       1040          1050      1060      
pF1KE3 TTSDCECLFQAEDRDDMLA-WIKTIQESSNLN----EEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMS
        : .   :.   : : ..  :.:..  ::..:    : : :.                  
CCDS71 KTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVL--SSTINNQAVETDEGIE-----------------
         550       560       570         580                       

       1070      1080      1090      1100      1110      1120      
pF1KE3 KAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKG
         :..: .:           : ... : .  ..::.    :. : :..   : : . .: 
CCDS71 --EEIPDSP-----------GIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKF
          590                  600       610       620       630   

          1130      1140      1150       1160      1170      1180  
pF1KE3 I---PSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLDD-CPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGI
       .   :. .. . ::      .::  : . :   . :  .: .: .: . :::.::.  ::
CCDS71 LTRRPT-LQAVREKGYIKDQVFGSNLANLC--QRENGTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGI
            640       650       660         670       680       690

           1190      1200      1210      1220      1230      1240  
pF1KE3 YRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYAD
       ::: :: :.:....  .:.    .:..:.::.:..::.. :: :::.::::::: ... :
CCDS71 YRVSGNLAVIQKLRFAVNHD-EKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFNHFND
              700       710        720       730       740         

           1250      1260      1270      1280      1290      1300  
pF1KE3 FIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVF
       :..: ..: : .:. ..: ::..::. . .:...:  ::. : ::.:::.:  ...::::
CCDS71 FVNAIKQE-PRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVF
     750        760       770       780       790       800        

           1310      1320      1330      1340      1350      1360  
pF1KE3 GPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPV
       ::::..  : .  ....:   : .::: ..                              
CCDS71 GPTLLKP-EKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR                     
      810        820       830       840                           

>>CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs109|chr2            (475 aa)
 initn: 444 init1: 304 opt: 488  Z-score: 356.3  bits: 77.3 E(33420): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 631; 29.9% identity (60.4% similar) in 502 aa overlap (867-1346:4-474)

        840       850       860       870       880       890      
pF1KE3 SIATVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNSKTERSKSYDEGLDDYR-EDAKL
                                     : ... . .:  :     :  ..: ..:. 
CCDS21                            MQKSTNSDTSVETLNSTRQGTGAVQMRIKNANS
                                          10        20        30   

         900       910        920       930                940     
pF1KE3 SFKHVSSLKGIKIADSQKSSED-SGSRKDSSSEVFSDAA---------KEGWLHFRPLVT
          ..:. :.. ..:  : .:  :  :.. :.....:.          :::.:. .  ..
CCDS21 HHDRLSQSKSMILTDVGKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQ-KAKIA
            40        50        60        70        80         90  

         950       960       970       980         990      1000   
pF1KE3 DKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEE--EQPISVNACLIDISYSET
       : ::..    . :.  ..:: .. . .::....:.  . .  ..: ::. :   : ... 
CCDS21 DGGKKLR---KNWSTSWIVLSSRRIEFYKESKQQALSNMKTGHKPESVDLCGAHIEWAKE
               100       110       120       130       140         

            1010       1020      1030      1040      1050      1060
pF1KE3 K--RKNVFRLTT-SDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKE
       :  :::::..:: :  : :.:..    .: :...:... .   .:..  .:.:       
CCDS21 KSSRKNVFQITTVSGNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNL-------
     150       160       170       180       190       200         

             1070      1080      1090      1100      1110          
pF1KE3 YNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPP-KD
                .: :  :.: .  . :    :. : :.:.  :    :   : .:::   . 
CCDS21 ---------ELFKIQRSSST--ELLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRV
                     210         220       230       240       250 

    1120         1130      1140       1150       1160      1170    
pF1KE3 KGTWRKGI---PSIMRKTFEKKPTATGT-FGVRLDD-CPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEE
       :.  .: :   ::.  ::...:       :: .:   :   . :  .: .:  : . ::.
CCDS21 KSRLKKFITRRPSL--KTLQEKGLIKDQIFGSHLHKVC--ERENSTVPWFVKQCIEAVEK
             260         270       280         290       300       

         1180      1190      1200      1210      1220      1230    
pF1KE3 RGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPL
       :::.  ::::: :: :.:....  .:.    ....:..:.:..:... :: :::.:::::
CCDS21 RGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFIVNQ-EEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPL
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>>CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs109|chr2                (433 aa)
 initn: 426 init1: 426 opt: 453  Z-score: 332.4  bits: 72.8 E(33420): 3.5e-12
Smith-Waterman score: 453; 39.5% identity (69.2% similar) in 185 aa overlap (1155-1339:250-433)

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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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