FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3219, 495 aa 1>>>pF1KE3219 495 - 495 aa - 495 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0573+/-0.000416; mu= 2.7326+/- 0.026 mean_var=309.9554+/-63.527, 0's: 0 Z-trim(120.8): 1920 B-trim: 153 in 1/57 Lambda= 0.072849 statistics sampled from 34144 (36433) to 34144 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16 Scan time: 10.990 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005262526 (OMIM: 314997) PREDICTED: zinc finger ( 510) 709 88.3 5.7e-17 NP_009062 (OMIM: 314997) zinc finger protein 75D i ( 510) 709 88.3 5.7e-17 XP_011529693 (OMIM: 314997) PREDICTED: zinc finger ( 510) 709 88.3 5.7e-17 XP_011520948 (OMIM: 601473) PREDICTED: zinc finger ( 500) 687 86.0 2.8e-16 XP_011529616 (OMIM: 300627) PREDICTED: zinc finger ( 398) 564 72.9 1.9e-12 XP_016884840 (OMIM: 300627) PREDICTED: zinc finger ( 403) 564 72.9 1.9e-12 XP_016884839 (OMIM: 300627) PREDICTED: zinc finger ( 403) 564 72.9 1.9e-12 XP_011529615 (OMIM: 300627) PREDICTED: zinc finger ( 403) 564 72.9 1.9e-12 NP_689908 (OMIM: 300627) zinc finger protein 449 [ ( 518) 564 73.1 2.2e-12 XP_011529614 (OMIM: 300627) PREDICTED: zinc finger ( 518) 564 73.1 2.2e-12 XP_006718372 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 565 73.2 2.2e-12 XP_016873758 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 565 73.2 2.2e-12 XP_011518659 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 565 73.2 2.2e-12 XP_005253186 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 592) 565 73.2 2.2e-12 XP_005253185 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 606) 565 73.2 2.3e-12 NP_037381 (OMIM: 605015) zinc finger protein 214 [ ( 606) 565 73.2 2.3e-12 XP_006718371 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 606) 565 73.2 2.3e-12 XP_011518657 (OMIM: 605015) PREDICTED: zinc finger ( 617) 565 73.3 2.3e-12 XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 562 72.8 2.5e-12 NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 562 72.8 2.5e-12 XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 562 72.9 2.7e-12 XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 562 72.9 2.7e-12 XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 562 72.9 2.7e-12 XP_011524764 (OMIM: 616798) PREDICTED: zinc finger ( 771) 565 73.4 2.7e-12 XP_011524765 (OMIM: 616798) PREDICTED: zinc finger ( 859) 565 73.4 2.9e-12 NP_065879 (OMIM: 616798) zinc finger protein 28 ho ( 868) 565 73.4 2.9e-12 NP_001035893 (OMIM: 603436) zinc finger protein 20 ( 554) 557 72.4 3.8e-12 NP_003447 (OMIM: 603436) zinc finger protein 205 [ ( 554) 557 72.4 3.8e-12 NP_001265087 (OMIM: 603436) zinc finger protein 20 ( 554) 557 72.4 3.8e-12 XP_005255615 (OMIM: 603436) PREDICTED: zinc finger ( 554) 557 72.4 3.8e-12 NP_001007089 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 620) 556 72.3 4.5e-12 NP_008893 (OMIM: 314993) zinc finger protein 182 i ( 639) 556 72.3 4.5e-12 NP_001171570 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 639) 556 72.3 4.5e-12 XP_005259469 (OMIM: 604749) PREDICTED: zinc finger ( 734) 554 72.2 5.8e-12 NP_004225 (OMIM: 604749) zinc finger protein 235 [ ( 738) 554 72.2 5.8e-12 NP_078915 (OMIM: 610847) zinc finger protein 322 [ ( 402) 546 71.1 6.9e-12 NP_001229727 (OMIM: 610847) zinc finger protein 32 ( 402) 546 71.1 6.9e-12 NP_001229728 (OMIM: 610847) zinc finger protein 32 ( 402) 546 71.1 6.9e-12 NP_001229726 (OMIM: 610847) zinc finger protein 32 ( 402) 546 71.1 6.9e-12 XP_005259272 (OMIM: 604086) PREDICTED: zinc finger ( 538) 548 71.4 7.3e-12 NP_001247416 (OMIM: 604086) zinc finger protein 15 ( 538) 548 71.4 7.3e-12 NP_003436 (OMIM: 604086) zinc finger protein 155 i ( 538) 548 71.4 7.3e-12 NP_001247415 (OMIM: 604086) zinc finger protein 15 ( 538) 548 71.4 7.3e-12 NP_932355 (OMIM: 604086) zinc finger protein 155 i ( 538) 548 71.4 7.3e-12 XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 546 71.1 7.3e-12 XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 546 71.1 7.3e-12 XP_011525580 (OMIM: 604086) PREDICTED: zinc finger ( 549) 548 71.4 7.4e-12 XP_016882737 (OMIM: 604086) PREDICTED: zinc finger ( 549) 548 71.4 7.4e-12 NP_001247417 (OMIM: 604086) zinc finger protein 15 ( 549) 548 71.4 7.4e-12 XP_011525581 (OMIM: 604086) PREDICTED: zinc finger ( 549) 548 71.4 7.4e-12 >>XP_005262526 (OMIM: 314997) PREDICTED: zinc finger pro (510 aa) initn: 700 init1: 512 opt: 709 Z-score: 425.7 bits: 88.3 E(85289): 5.7e-17 Smith-Waterman score: 709; 30.3% identity (55.1% similar) in 492 aa overlap (17-490:22-500) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MAANWTLSWGQGGPCNSPGSDTPRSVASPETQLGNHDRNPETWHMNFRMFSCPEE . :: : : . . .. .::. .: : : XP_005 MAMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKIENLGPESACRHFWSFRYHEA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 SDPIQALRKLTELCHLWLRPDLHTKEQILDMLVMEQFMISMPQELQVLVKVNGVQSCKD- . :.... .: .::: ::::..:.:::::.:::.:::. .:.: : :. . :. :. 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