Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3437
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3437, 963 aa
  1>>>pF1KE3437 963 - 963 aa - 963 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4190+/-0.000905; mu= 16.7586+/- 0.055
 mean_var=99.5737+/-19.484, 0's: 0 Z-trim(109.2): 90  B-trim: 5 in 1/50
 Lambda= 0.128529
 statistics sampled from 10650 (10743) to 10650 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.33), width:  16
 Scan time:  4.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX          ( 963) 6624 1239.2       0
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3            ( 916) 2651 502.5 1.5e-141
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3            ( 963) 2241 426.5 1.2e-118
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12          ( 952) 1461 281.9 4.2e-75
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12         ( 981) 1461 281.9 4.3e-75
CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17        (1604)  938 185.0   1e-45
CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3         (1318)  886 175.3 6.8e-43
CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3         (1372)  886 175.3 7.1e-43
CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3         (1384)  886 175.4 7.1e-43
CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3         (1419)  886 175.4 7.2e-43
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17          (1406)  860 170.5   2e-41
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15          (1012)  645 130.6 1.6e-29
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15          (1118)  645 130.6 1.7e-29
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11           ( 396)  526 108.3 3.1e-23
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11          ( 362)  518 106.8 8.2e-23
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11           ( 605)  519 107.1 1.1e-22
CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12         ( 235)  437 91.6 1.9e-18
CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3           ( 313)  431 90.6 5.2e-18
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15          ( 476)  422 89.0 2.3e-17
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15          ( 520)  422 89.1 2.5e-17
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1         ( 565)  389 83.0 1.9e-15
CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1           ( 911)  353 76.4 2.8e-13
CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1           ( 942)  353 76.4 2.9e-13
CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1           ( 828)  348 75.5   5e-13
CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9         ( 914)  344 74.7 9.1e-13


>>CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX               (963 aa)
 initn: 6624 init1: 6624 opt: 6624  Z-score: 6635.8  bits: 1239.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6624; 100.0% identity (100.0% similar) in 963 aa overlap (1-963:1-963)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAVAPRLFGGLCFRFRDQNPEVAVEGRLPISHSCVGCRRERTAMATVAANPAAAAAAVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAVAPRLFGGLCFRFRDQNPEVAVEGRLPISHSCVGCRRERTAMATVAANPAAAAAAVAA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 AAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 DQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 RKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 MVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 RDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 EEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 TVNSNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVNSNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 LQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 WHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFM
              910       920       930       940       950       960

          
pF1KE3 DVN
       :::
CCDS14 DVN
          

>>CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3                 (916 aa)
 initn: 2506 init1: 1343 opt: 2651  Z-score: 2654.6  bits: 502.5 E(32554): 1.5e-141
Smith-Waterman score: 2711; 48.1% identity (72.6% similar) in 910 aa overlap (79-952:12-901)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE3 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
                                     :.. .. : :   :   :. : .:.:....
CCDS27                    MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
                                  10        20         30        40

      110       120              130       140       150       160 
pF1KE3 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
       :.:::. :: : :.       . . ::: :.:. ::.:  .  ::: :..  ::::.:. 
CCDS27 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
                50        60        70        80        90         

             170       180          190       200       210        
pF1KE3 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
       ::. :..:::  .:: :: :::.:   . .  ::::: .:: : ...:  .  . .::..
CCDS27 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
     100       110       120       130       140       150         

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE3 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
       :.:. . .  :. : .  ...:::: :   .. ..:     :: ::.:  ::....: ..
CCDS27 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
     160       170       180       190       200       210         

      280       290            300       310       320       330   
pF1KE3 KDGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQL
       .:::::   :.  ....:     .:  . . :::.::: :::::::::::::::::.  :
CCDS27 EDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPL
     220       230       240       250       260       270         

           340       350       360       370       380       390   
pF1KE3 TEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQF
       :.:::.. :  :.:  ::::::::::::::.:.:: :::.   ..:..::..::.:: ::
CCDS27 TDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQF
     280       290       300       310       320       330         

           400       410       420       430       440       450   
pF1KE3 LGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSV
        ::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: ::::  ::.:::.::. :::::
CCDS27 SGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSV
     340       350       360       370       380       390         

           460       470       480       490       500       510   
pF1KE3 IVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHR
       ::::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:
CCDS27 IVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYR
     400       410       420       430       440       450         

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE3 LVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYE
       ..::  : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::
CCDS27 VTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYE
     460       470       480       490       500       510         

           580       590       600       610       620       630   
pF1KE3 VSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN
       : .   ...:: : ...:::.:::  .:  ..:  .  :.:.:::.:::. ..: :.::.
CCDS27 VCS--TSVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQ
     520          530       540        550        560       570    

           640       650                660       670       680    
pF1KE3 VLMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQA
       ..  :.:::: .:  :.           .:...  . ::....     :   ..   :  
CCDS27 AVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETE
          580       590       600       610       620          630 

          690       700       710       720       730              
pF1KE3 GPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHA
       : .    .  :    .    .:  :.:    :::.. ::: ::.: ..   .     ...
CCDS27 GSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNS
             640       650           660       670       680       

     740       750       760       770           780       790     
pF1KE3 QPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLE
       .  .:.::. : .. :::: :.:.: ::  :....    ::. : :..:::::::.::: 
CCDS27 RSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLG
       690       700       710         720       730       740     

         800       810       820       830       840       850     
pF1KE3 KENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFS
       ...:::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:
CCDS27 EHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMS
         750       760       770       780       790       800     

         860       870       880       890       900       910     
pF1KE3 EFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNEN
       ::: . .  . :  : :::::::::::.:  ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.
CCDS27 EFVCNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASED
         810           820       830       840       850       860 

         920       930          940       950       960       
pF1KE3 QIESKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN    
       :: .::::::::::.:        :: .::: . . :. :               
CCDS27 QIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
             870       880       890       900       910      

>>CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3                 (963 aa)
 initn: 2417 init1: 1343 opt: 2241  Z-score: 2243.4  bits: 426.5 E(32554): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2618; 46.0% identity (69.3% similar) in 957 aa overlap (79-952:12-948)

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE3 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
                                     :.. .. : :   :   :. : .:.:....
CCDS27                    MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
                                  10        20         30        40

      110       120              130       140       150       160 
pF1KE3 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
       :.:::. :: : :.       . . ::: :.:. ::.:  .  ::: :..  ::::.:. 
CCDS27 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
                50        60        70        80        90         

             170       180          190       200       210        
pF1KE3 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
       ::. :..:::  .:: :: :::.:   . .  ::::: .:: : ...:  .  . .::..
CCDS27 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
     100       110       120       130       140       150         

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE3 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
       :.:. . .  :. : .  ...:::: :   .. ..:     :: ::.:  ::....: ..
CCDS27 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
     160       170       180       190       200       210         

      280                                     290                  
pF1KE3 KDGTWP------------------------------SAQLHVMNNNMS------------
       .:::::                              ::.: . ... :            
CCDS27 EDGTWPRQTLQSKSSTAPSRNFTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRG
     220       230       240       250       260       270         

                  300       310       320       330       340      
pF1KE3 ----------EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEEL
                 .:  . . :::.::: :::::::::::::::::.  ::.:::.. :  :.
CCDS27 GSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEI
     280       290       300       310       320       330         

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE3 NFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLS
       :  ::::::::::::::.:.:: :::.   ..:..::..::.:: :: ::::.::::::.
CCDS27 NRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLA
     340       350       360       370       380       390         

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE3 FLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTL
       :::::::::::::::: :.:: :: ::::  ::.:::.::. ::::::::::::::::::
CCDS27 FLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTL
     400       410       420       430       440       450         

        470       480       490       500       510       520      
pF1KE3 VCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLC
       :::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:..::  : .::::
CCDS27 VCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLC
     460       470       480       490       500       510         

        530       540       550       560       570       580      
pF1KE3 VALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSRE
        :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::: .   ...:: :
CCDS27 EALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCS--TSVDGS-E
     520       530       540       550       560         570       

        590       600       610       620       630       640      
pF1KE3 DIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKP
        ...:::.:::  .:  ..:  .  :.:.:::.:::. ..: :.::...  :.:::: .:
CCDS27 CVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQP
        580        590        600       610       620       630    

        650                660       670       680       690       
pF1KE3 NSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFL
         :.           .:...  . ::....     :   ..   :  : .    .  :  
CCDS27 LPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETEGSGEDEPGNDPSE
          640       650       660       670          680       690 

       700       710       720       730            740       750  
pF1KE3 LDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHAQPYIAIDWEPEMK
         .    .:  :.:    :::.. ::: ::.: ..   .     ....  .:.::. : .
CCDS27 TTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETR
             700           710       720       730       740       

            760       770           780       790       800        
pF1KE3 KRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQH
       . :::: :.:.: ::  :....    ::. : :..:::::::.::: ...:::::.::.:
CCDS27 RLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKH
       750       760         770       780       790       800     

      810       820       830       840       850       860        
pF1KE3 QLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPE
       : ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:::: . .  . : 
CCDS27 QQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLS--ARP-
         810       820       830       840       850         860   

      870       880       890       900       910       920        
pF1KE3 LYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQ
        : :::::::::::.:  ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.:: .:::::::::
CCDS27 -YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQ
             870       880       890       900       910       920 

      930          940       950       960       
pF1KE3 RQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN    
       :.:        :: .::: . . :. :               
CCDS27 RRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
             930       940       950       960   

>>CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12               (952 aa)
 initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461  Z-score: 1461.9  bits: 281.9 E(32554): 4.2e-75
Smith-Waterman score: 2743; 47.4% identity (71.0% similar) in 925 aa overlap (96-958:24-933)

          70        80        90       100       110               
pF1KE3 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
                                     :: :..:.::...:.:::. ::        
CCDS89        MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
                      10        20        30        40        50   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE3 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
       : :::.  ..:: :.:. :..:     ::: :..  ::.:::. .:. ::::: : .:: 
CCDS89 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
              60        70        80        90       100       110 

       180       190          200       210       220       230    
pF1KE3 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
       :: :::.:   . :   :::: .:: : .......  : .::..:.:  . .  :. : .
CCDS89 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
             120       130       140       150       160       170 

          240       250       260       270       280         290  
pF1KE3 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQL--HVMN
         ...:::: :   .... :     :. ::.:  ::....: ...::::: .    .: :
CCDS89 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKN
             180       190       200       210       220       230 

                  300             310       320       330       340
pF1KE3 NNM------SEEDEDFK--G----QPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNN
       .:.      . .. :..  :    :::.:::.:::::::::::.:::::.: :::::::.
CCDS89 SNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLND
             240       250       260       270       280       290 

              350       360       370       380       390       400
pF1KE3 CYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHD
        : ::::: :::::.::::..::.:.:: :::.   ..:..::..::.:: :: ::::.:
CCDS89 KYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQD
             300       310       320       330       340       350 

              410       420       430       440       450       460
pF1KE3 SQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHG
        ::::.::::::::::::..:: :..: :: ::::. ::.:::.:: .::::.::: :::
CCDS89 CQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHG
             360       370       380       390       400       410 

              470       480       490       500       510       520
pF1KE3 LFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKG
       :::::::::.:...::::::::::..:::....:.:::... :::  :: :...:::: :
CCDS89 LFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIG
             420       430       440       450       460       470 

              530       540       550       560       570       580
pF1KE3 KISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEA
       .: :::.:::  .::  ..:.:.:...:::.... ..: ::::..::::.:.:..  :. 
CCDS89 NILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INR
             480       490       500       510       520           

              590       600       610       620       630       640
pF1KE3 IEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLS
        : . : ...:: :::.    .:.. . :  :::.:.:..:::.  : . :::.:. :. 
CCDS89 TEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMC
     530        540       550        560       570        580      

              650                         660       670            
pF1KE3 RYVTKPNSDDEDDGD------------------EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---
       :::   .  .: .:.                  :. .  : . : :   .. . . :   
CCDS89 RYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSEN
        590       600       610       620       630       640      

     680       690          700       710       720       730      
pF1KE3 EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE
       :  :.  : :  :     :   :.: :  :   ...:  :::.:  : ..:.    . . 
CCDS89 ENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QLTGHKKR--LFTFQFNNLGNTDINYIKDDT
        650       660       670         680         690       700  

        740                  750       760       770        780    
pF1KE3 VHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQEC
        : .            ..:.::.:..::::.::  :: . ::. : :   : : :.:..:
CCDS89 RHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDC
            710       720       730       740       750       760  

          790       800       810       820       830       840    
pF1KE3 IELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTL
       :::::: : :  :.:::::.::.:: :::::::: :: .:..:::::::... :.:::::
CCDS89 IELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTL
            770       780       790       800       810       820  

          850       860       870       880       890       900    
pF1KE3 VEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYF
       :.::: :::.:::.:.:  ...:   .:.:::::::::::  ::::.:: :::.:.:.::
CCDS89 VDFPINDLDMSEFLINP--NAGPC--RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYF
            830         840         850       860       870        

          910       920       930        940       950       960   
pF1KE3 DDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
       ::.::: ..:.:: :::::::::::::. .   . :       :: : . :  :.     
CCDS89 DDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSND
      880       890       900       910       920       930        

CCDS89 NDNDIENENCMHTN
      940       950  

>>CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12              (981 aa)
 initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461  Z-score: 1461.7  bits: 281.9 E(32554): 4.3e-75
Smith-Waterman score: 2692; 46.1% identity (69.1% similar) in 954 aa overlap (96-958:24-962)

          70        80        90       100       110               
pF1KE3 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
                                     :: :..:.::...:.:::. ::        
CCDS58        MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
                      10        20        30        40        50   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE3 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
       : :::.  ..:: :.:. :..:     ::: :..  ::.:::. .:. ::::: : .:: 
CCDS58 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
              60        70        80        90       100       110 

       180       190          200       210       220       230    
pF1KE3 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
       :: :::.:   . :   :::: .:: : .......  : .::..:.:  . .  :. : .
CCDS58 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
             120       130       140       150       160       170 

          240       250       260       270       280              
pF1KE3 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWP----------
         ...:::: :   .... :     :. ::.:  ::....: ...:::::          
CCDS58 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPG
             180       190       200       210       220       230 

                         290                   300             310 
pF1KE3 ---------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK--G----QPGICGL
                      : . . ::: :...           .. :..  :    :::.:::
CCDS58 ASNFSTLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGL
             240       250       260       270       280       290 

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
       .:::::::::::.:::::.: :::::::. : ::::: :::::.::::..::.:.:: ::
CCDS58 SNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWS
             300       310       320       330       340       350 

             380       390       400       410       420       430 
pF1KE3 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
       :.   ..:..::..::.:: :: ::::.: ::::.::::::::::::..:: :..: :: 
CCDS58 GKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDAD
             360       370       380       390       400       410 

             440       450       460       470       480       490 
pF1KE3 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
       ::::. ::.:::.:: .::::.::: ::::::::::::.:...::::::::::..:::..
CCDS58 GRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMK
             420       430       440       450       460       470 

             500       510       520       530       540       550 
pF1KE3 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFY
       ..:.:::... :::  :: :...:::: :.: :::.:::  .::  ..:.:.:...:::.
CCDS58 KERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFH
             480       490       500       510       520       530 

             560       570       580       590       600       610 
pF1KE3 KLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLM
       ... ..: ::::..::::.:.:..  :.  : . : ...:: :::.    .:.. . :  
CCDS58 RIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INRTEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSS
             540       550         560        570       580        

             620       630       640       650                     
pF1KE3 LFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGD----------------
       :::.:.:..:::.  : . :::.:. :. :::   .  .: .:.                
CCDS58 LFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNG
       590       600        610       620       630       640      

           660       670          680       690          700       
pF1KE3 --EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQW
         :. .  : . : :   .. . . :   :  :.  : :  :     :   :.: :  : 
CCDS58 IHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QL
        650       660       670       680       690       700      

       710       720       730       740                  750      
pF1KE3 PPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEEVHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYY
         ...:  :::.:  : ..:.    . .  : .            ..:.::.:..::::.
CCDS58 TGHKKR--LFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYF
          710         720       730       740       750       760  

        760       770        780       790       800       810     
pF1KE3 DEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKL
       ::  :: . ::. : :   : : :.:..::::::: : :  :.:::::.::.:: :::::
CCDS58 DENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKL
            770       780       790       800       810       820  

         820       830       840       850       860       870     
pF1KE3 DLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLI
       ::: :: .:..:::::::... :.::::::.::: :::.:::.:.:  ...:   .:.::
CCDS58 DLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINP--NAGPC--RYNLI
            830       840       850       860         870          

         880       890       900       910       920       930     
pF1KE3 AVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-AR
       :::::::::  ::::.:: :::.:.:.::::.::: ..:.:: :::::::::::::. . 
CCDS58 AVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSG
      880       890       900       910       920       930        

          940       950       960                 
pF1KE3 RLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN              
         . :       :: : . :  :.                   
CCDS58 TGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
      940       950       960       970       980 

>>CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17             (1604 aa)
 initn: 1311 init1: 789 opt: 938  Z-score: 934.4  bits: 185.0 E(32554): 1e-45
Smith-Waterman score: 1234; 31.9% identity (57.0% similar) in 821 aa overlap (128-863:521-1316)

       100       110       120       130       140                 
pF1KE3 AGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEI---------NWRLKEG
                                     :: :.:  :  .:          . :::. 
CCDS32 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT
              500       510       520       530       540       550

        150       160       170       180         190       200    
pF1KE3 --LVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE--LPNIQKVEVYPVELLLVRH
         :..:.:: ..:  .:. :  ::: . . :   : ::.    .: ..:..:  ::..:.
CCDS32 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALP---RPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQ
              560       570       580          590       600       

                                  210       220       230       240
pF1KE3 N------------DLGK------------SHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT
       .            ..:.            ..:  ::. ..:  . .   .:. .. .:: 
CCDS32 QPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDM
       610       620       630       640       650       660       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE
       :::  :::. :  : :    .    ..  : ...:.:.:: .::  ..  . :. . . .
CCDS32 RLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPE-EMSFIANSSKIDRH
        670       680       690       700       710        720     

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE
           . :  ::.::::::::::..::.::.  ::.::... .: :::  ::.::::..:.
CCDS32 KVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAK
         730       740       750       760       770       780     

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK
        :.:::.. ::: .....:  ..  ....: .: :.::.::::::.:::::::::::::.
CCDS32 CYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVH
         790       800       810       820       830       840     

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP
       .: :::: :. :::: ::: :::.:: ::: :..:: ::: ..: . :  ::..:: :::
CCDS32 EKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDP
         850       860       870       880       890       900     

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM
       : .::.:::..    ::.  : .:    : .. : .    : . :   ::   :.. :..
CCDS32 FNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQI
         910       920       930        940       950       960    

                               550       560           570         
pF1KE3 MVADVFSHR-----------------FYKLYQLEEPLSSIL----DRDDIFVYEVSGRIE
       ..:.: .                   :   ...  :.: :      . :.     .... 
CCDS32 LLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMF
          970       980       990      1000      1010      1020    

     580       590       600           610       620               
pF1KE3 AIEGSREDIVVPVYLRERTPAR----DYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTW------E
       ..  .  :.  :... .  :        .... . :. ::  . :.: . ::       .
CCDS32 TLT-TNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGH--MPSLPDSPFTGYIIAVHR
          1030      1040      1050      1060        1070      1080 

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pF1KE3 GLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGS-LRDPEPEQAGPSS
        .. . .: ::   ..:.              . ::   .     : : .: : :   .:
CCDS32 KMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQE--AS
            1090      1100      1110      1120      1130           

      690       700       710       720             730            
pF1KE3 GVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTS------DRTTSPEEVH----
       . .. :    :. .:  :.:        :::..:...:.:       :     ..     
CCDS32 NHAQDC----DDSMGY-QYP--------FTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGED
    1140          1150               1160      1170      1180      

          740       750       760       770         780       790  
pF1KE3 ----AQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCV--GYVMKKAPVRLQECIELFTTVE
           .. :::.::.:   .  :.  . .   .:. :  .   .  :. :. :.. ::. :
CCDS32 RAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEE
       1190      1200      1210      1220      1230      1240      

            800       810       820       830       840       850  
pF1KE3 TLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDL
        : ... .:: .:: : ::::::::: :: :::::::::....    : . .:.:: ...
CCDS32 ELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESF
       1250      1260      1270      1280      1290      1300      

            860       870       880       890       900       910  
pF1KE3 DFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPV
       : : :.. :..                                                 
CCDS32 DPSAFLV-PRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSL
       1310       1320      1330      1340      1350      1360     

>>CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3              (1318 aa)
 initn: 1300 init1: 800 opt: 886  Z-score: 883.5  bits: 175.3 E(32554): 6.8e-43
Smith-Waterman score: 1246; 35.2% identity (59.7% similar) in 708 aa overlap (284-896:470-1171)

           260       270       280       290       300         310 
pF1KE3 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKG--QPGICGL
                                     :  .  : .... ::.:. :    ::. ::
CCDS43 DSVATRTPMEHVTPKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGL
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pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
       .::::::::::..: :::. .: ..: .  .  :.:. ::::  :..: ..: :..  :.
CCDS43 VNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWK
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pF1KE3 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
       : :... :  .:  :.  :::: :: :::.::...::::::::::::...: :.:  :. 
CCDS43 GTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTGYAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSD
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pF1KE3 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
       ::::. ::.:::: :: :::: ::: :.: .:: :::: :..::.::::: :: :::: .
CCDS43 GRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIVDLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-Q
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             500       510       520        530       540       550
pF1KE3 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKI-SDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRF
       ...:: ::..  .:. :: .  . : :...  :..  .::. . ..:: . .:.:...::
CCDS43 KQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVSVSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRF
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pF1KE3 YKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSG------RIEAIEGSREDIV--VPVY----LRERT
       ....   . :...   : .. .:. .      :. ..: ...  :  ::.      ... 
CCDS43 HRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFELLSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQ
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pF1KE3 PARD-------------YNNS---------YYGLML---FGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN
        ..:             : :.         . ::     .:.:.::::: .:.:.  : .
CCDS43 QSEDEKLKRCTRCYRVGYCNQLCQKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASRLTYARLAQ
      800       810       820       830       840       850        

             640              650                660            670
pF1KE3 VL--MYRLSRYVTKP-------NSDDEDDGD---------EKEDDEEDKDDVP-----GP
       .:  . : :  : .:         .... :          :  :.:.:  . :      :
CCDS43 LLEGYARYSVSVFQPPFQPGRMALESQSPGCTTLLSTGSLEAGDSERDPIQPPELQLVTP
      860       870       880       890       900       910        

                        680       690                   700        
pF1KE3 STGGSL----------RDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLL------------DNCLGTSQWP
        . :.           : : :  .: :: .    :. .            .  .   : :
CCDS43 MAEGDTGLPRVWAAPDRGPVPSTSGISSEMLASGPIEVGSLPAGERVSRPEAAVPGYQHP
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      710          720          730       740       750            
pF1KE3 PRR---RRKQLFTLQTVNSNGTS---DRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEV---
        .    .  :.:  .  .::  .   :.  .: :.  .  .:. :. . . . .  :   
CCDS43 SEAMNAHTPQFFIYKIDSSNREQRLEDKGDTPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASK
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pF1KE3 EAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWM
       : :       .: . . .   :..:..:::  :.:  :. ::::.::::. :.:.: :: 
CCDS43 ELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWR
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pF1KE3 LPEILIIHLKRFSYTKFS-REKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVS
       ::..::..:::::. .:  :.:.. :::::.:.::.:.: :  ..:. :   .::: :: 
CCDS43 LPNVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLP---SYDLYAVI
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pF1KE3 NHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLS
       ::::::  ::::  :: .                                          
CCDS43 NHYGGMIGGHYT--ACARLPNDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRR
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>>CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3              (1372 aa)
 initn: 1300 init1: 800 opt: 886  Z-score: 883.3  bits: 175.3 E(32554): 7.1e-43
Smith-Waterman score: 1246; 35.2% identity (59.7% similar) in 708 aa overlap (284-896:561-1262)

           260       270       280       290       300         310 
pF1KE3 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKG--QPGICGL
                                     :  .  : .... ::.:. :    ::. ::
CCDS56 DSVATRTPMEHVTPKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGL
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pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
       .::::::::::..: :::. .: ..: .  .  :.:. ::::  :..: ..: :..  :.
CCDS56 VNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWK
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pF1KE3 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
       : :... :  .:  :.  :::: :: :::.::...::::::::::::...: :.:  :. 
CCDS56 GTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTGYAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSD
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pF1KE3 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
       ::::. ::.:::: :: :::: ::: :.: .:: :::: :..::.::::: :: :::: .
CCDS56 GRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIVDLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-Q
              720       730       740       750       760          

             500       510       520        530       540       550
pF1KE3 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKI-SDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRF
       ...:: ::..  .:. :: .  . : :...  :..  .::. . ..:: . .:.:...::
CCDS56 KQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVSVSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRF
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pF1KE3 YKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSG------RIEAIEGSREDIV--VPVY----LRERT
       ....   . :...   : .. .:. .      :. ..: ...  :  ::.      ... 
CCDS56 HRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFELLSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQ
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pF1KE3 PARD-------------YNNS---------YYGLML---FGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN
        ..:             : :.         . ::     .:.:.::::: .:.:.  : .
CCDS56 QSEDEKLKRCTRCYRVGYCNQLCQKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASRLTYARLAQ
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