FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3437, 963 aa 1>>>pF1KE3437 963 - 963 aa - 963 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4190+/-0.000905; mu= 16.7586+/- 0.055 mean_var=99.5737+/-19.484, 0's: 0 Z-trim(109.2): 90 B-trim: 5 in 1/50 Lambda= 0.128529 statistics sampled from 10650 (10743) to 10650 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16 Scan time: 4.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 6624 1239.2 0 CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 2651 502.5 1.5e-141 CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 963) 2241 426.5 1.2e-118 CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 1461 281.9 4.2e-75 CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 1461 281.9 4.3e-75 CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 938 185.0 1e-45 CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318) 886 175.3 6.8e-43 CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372) 886 175.3 7.1e-43 CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384) 886 175.4 7.1e-43 CCDS56254.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1419) 886 175.4 7.2e-43 CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 860 170.5 2e-41 CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 645 130.6 1.6e-29 CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 645 130.6 1.7e-29 CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 526 108.3 3.1e-23 CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 518 106.8 8.2e-23 CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 519 107.1 1.1e-22 CCDS58250.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 235) 437 91.6 1.9e-18 CCDS58832.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 313) 431 90.6 5.2e-18 CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 422 89.0 2.3e-17 CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 422 89.1 2.5e-17 CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1 ( 565) 389 83.0 1.9e-15 CCDS679.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 911) 353 76.4 2.8e-13 CCDS678.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 942) 353 76.4 2.9e-13 CCDS680.1 USP33 gene_id:23032|Hs108|chr1 ( 828) 348 75.5 5e-13 CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 344 74.7 9.1e-13 >>CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX (963 aa) initn: 6624 init1: 6624 opt: 6624 Z-score: 6635.8 bits: 1239.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6624; 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CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA :.:::. :: : :. . . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:. CCDS27 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 pF1KE3 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT ::. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::.. CCDS27 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK :.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: .. CCDS27 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 KDGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQL .::::: :. ....: .: . . :::.::: :::::::::::::::::. : CCDS27 EDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPL 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 TEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQF :.:::.. : :.: ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: CCDS27 TDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQF 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 LGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSV ::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. ::::: CCDS27 SGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSV 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 IVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHR ::::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.: CCDS27 IVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYR 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 LVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYE ..:: : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. :::::::: CCDS27 VTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYE 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 VSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN : . ...:: : ...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::. CCDS27 VCS--TSVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQ 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 pF1KE3 VLMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQA .. :.:::: .: :. .:... . ::.... : .. : CCDS27 AVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETE 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 pF1KE3 GPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHA : . . : . .: :.: :::.. ::: ::.: .. . ... CCDS27 GSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNS 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 QPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLE . .:.::. : .. :::: :.:.: :: :.... ::. : :..:::::::.::: CCDS27 RSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLG 690 700 710 720 730 740 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 KENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFS ...:::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..: CCDS27 EHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMS 750 760 770 780 790 800 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 EFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNEN ::: . . . : : :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:. CCDS27 EFVCNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASED 810 820 830 840 850 860 920 930 940 950 960 pF1KE3 QIESKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN :: .::::::::::.: :: .::: . . :. : CCDS27 QIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN 870 880 890 900 910 >>CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (963 aa) initn: 2417 init1: 1343 opt: 2241 Z-score: 2243.4 bits: 426.5 E(32554): 1.2e-118 Smith-Waterman score: 2618; 46.0% identity (69.3% similar) in 957 aa overlap (79-952:12-948) 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH :.. .. : : : :. : .:.:.... CCDS27 MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA :.:::. :: : :. . . ::: :.:. ::.: . ::: :.. ::::.:. CCDS27 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 pF1KE3 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT ::. :..::: .:: :: :::.: . . ::::: .:: : ...: . . .::.. CCDS27 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK :.:. . . :. : . ...:::: : .. ..: :: ::.: ::....: .. CCDS27 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN 160 170 180 190 200 210 280 290 pF1KE3 KDGTWP------------------------------SAQLHVMNNNMS------------ .::::: ::.: . ... : CCDS27 EDGTWPRQTLQSKSSTAPSRNFTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRG 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE3 ----------EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEEL .: . . :::.::: :::::::::::::::::. ::.:::.. : :. CCDS27 GSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEI 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 NFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLS : ::::::::::::::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.::::::. CCDS27 NRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLA 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 FLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTL :::::::::::::::: :.:: :: :::: ::.:::.::. :::::::::::::::::: CCDS27 FLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTL 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 VCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLC :::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:..:: : .:::: CCDS27 VCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLC 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 VALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSRE :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::: . ...:: : CCDS27 EALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCS--TSVDGS-E 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 DIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKP ...:::.::: .: ..: . :.:.:::.:::. ..: :.::... :.:::: .: CCDS27 CVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQP 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 pF1KE3 NSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFL :. .:... . ::.... : .. : : . . : CCDS27 LPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETEGSGEDEPGNDPSE 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 LDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHAQPYIAIDWEPEMK . .: :.: :::.. ::: ::.: .. . .... .:.::. : . CCDS27 TTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETR 700 710 720 730 740 760 770 780 790 800 pF1KE3 KRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQH . :::: :.:.: :: :.... ::. : :..:::::::.::: ...:::::.::.: CCDS27 RLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKH 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 pF1KE3 QLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPE : ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:::: . . . : CCDS27 QQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLS--ARP- 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 LYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQ : :::::::::::.: ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.:: .::::::::: CCDS27 -YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQ 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 RQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN :.: :: .::: . . :. : CCDS27 RRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN 930 940 950 960 >>CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (952 aa) initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461 Z-score: 1461.9 bits: 281.9 E(32554): 4.2e-75 Smith-Waterman score: 2743; 47.4% identity (71.0% similar) in 925 aa overlap (96-958:24-933) 70 80 90 100 110 pF1KE3 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV-------- :: :..:.::...:.:::. :: CCDS89 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP : :::. ..:: :.:. :..: ::: :.. ::.:::. .:. ::::: : .:: CCDS89 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV :: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : . CCDS89 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQL--HVMN ...:::: : .... : :. ::.: ::....: ...::::: . .: : CCDS89 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKN 180 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 pF1KE3 NNM------SEEDEDFK--G----QPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNN .:. . .. :.. : :::.:::.:::::::::::.:::::.: :::::::. CCDS89 SNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLND 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 CYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHD : ::::: :::::.::::..::.:.:: :::. ..:..::..::.:: :: ::::.: CCDS89 KYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQD 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHG ::::.::::::::::::..:: :..: :: ::::. ::.:::.:: .::::.::: ::: CCDS89 CQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHG 360 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 LFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKG :::::::::.:...::::::::::..:::....:.:::... ::: :: :...:::: : CCDS89 LFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIG 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 KISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEA .: :::.::: .:: ..:.:.:...:::.... ..: ::::..::::.:.:.. :. CCDS89 NILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INR 480 490 500 510 520 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 IEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLS : . : ...:: :::. .:.. . : :::.:.:..:::. : . :::.:. :. CCDS89 TEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMC 530 540 550 560 570 580 650 660 670 pF1KE3 RYVTKPNSDDEDDGD------------------EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP--- ::: . .: .:. :. . : . : : .. . . : CCDS89 RYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSEN 590 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 pF1KE3 EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE : :. : : : : :.: : : ...: :::.: : ..:. . . CCDS89 ENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QLTGHKKR--LFTFQFNNLGNTDINYIKDDT 650 660 670 680 690 700 740 750 760 770 780 pF1KE3 VHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQEC : . ..:.::.:..::::.:: :: . ::. : : : : :.:..: CCDS89 RHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDC 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 IELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTL :::::: : : :.:::::.::.:: :::::::: :: .:..:::::::... :.::::: CCDS89 IELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTL 770 780 790 800 810 820 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 VEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYF :.::: :::.:::.:.: ...: .:.::::::::::: ::::.:: :::.:.:.:: CCDS89 VDFPINDLDMSEFLINP--NAGPC--RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYF 830 840 850 860 870 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 DDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN ::.::: ..:.:: :::::::::::::. . . : :: : . : :. CCDS89 DDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSND 880 890 900 910 920 930 CCDS89 NDNDIENENCMHTN 940 950 >>CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (981 aa) initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461 Z-score: 1461.7 bits: 281.9 E(32554): 4.3e-75 Smith-Waterman score: 2692; 46.1% identity (69.1% similar) in 954 aa overlap (96-958:24-962) 70 80 90 100 110 pF1KE3 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV-------- :: :..:.::...:.:::. :: CCDS58 MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP : :::. ..:: :.:. :..: ::: :.. ::.:::. .:. ::::: : .:: CCDS58 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV :: :::.: . : :::: .:: : ....... : .::..:.: . . :. : . CCDS58 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 pF1KE3 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWP---------- ...:::: : .... : :. ::.: ::....: ...::::: CCDS58 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPG 180 190 200 210 220 230 290 300 310 pF1KE3 ---------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK--G----QPGICGL : . . ::: :... .. :.. : :::.::: CCDS58 ASNFSTLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGL 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS .:::::::::::.:::::.: :::::::. : ::::: :::::.::::..::.:.:: :: CCDS58 SNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWS 300 310 320 330 340 350 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA :. ..:..::..::.:: :: ::::.: ::::.::::::::::::..:: :..: :: CCDS58 GKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDAD 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS ::::. ::.:::.:: .::::.::: ::::::::::::.:...::::::::::..:::.. CCDS58 GRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMK 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFY ..:.:::... ::: :: :...:::: :.: :::.::: .:: ..:.:.:...:::. CCDS58 KERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFH 480 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 KLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLM ... ..: ::::..::::.:.:.. :. : . : ...:: :::. .:.. . : CCDS58 RIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INRTEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSS 540 550 560 570 580 620 630 640 650 pF1KE3 LFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGD---------------- :::.:.:..:::. : . :::.:. :. ::: . .: .:. CCDS58 LFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNG 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 pF1KE3 --EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQW :. . : . : : .. . . : : :. : : : : :.: : : CCDS58 IHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QL 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 PPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEEVHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYY ...: :::.: : ..:. . . : . ..:.::.:..::::. CCDS58 TGHKKR--LFTFQFNNLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYF 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 DEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKL :: :: . ::. : : : : :.:..::::::: : : :.:::::.::.:: ::::: CCDS58 DENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKL 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 DLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLI ::: :: .:..:::::::... :.::::::.::: :::.:::.:.: ...: .:.:: CCDS58 DLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINP--NAGPC--RYNLI 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 AVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-AR ::::::::: ::::.:: :::.:.:.::::.::: ..:.:: :::::::::::::. . CCDS58 AVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSG 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 RLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN . : :: : . : :. CCDS58 TGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN 940 950 960 970 980 >>CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604 aa) initn: 1311 init1: 789 opt: 938 Z-score: 934.4 bits: 185.0 E(32554): 1e-45 Smith-Waterman score: 1234; 31.9% identity (57.0% similar) in 821 aa overlap (128-863:521-1316) 100 110 120 130 140 pF1KE3 AGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEI---------NWRLKEG :: :.: : .: . :::. CCDS32 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT 500 510 520 530 540 550 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 --LVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE--LPNIQKVEVYPVELLLVRH :..:.:: ..: .:. : ::: . . : : ::. .: ..:..: ::..:. CCDS32 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALP---RPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQ 560 570 580 590 600 210 220 230 240 pF1KE3 N------------DLGK------------SHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT . ..:. ..: ::. ..: . . .:. .. .:: CCDS32 QPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDM 610 620 630 640 650 660 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE ::: :::. : : : . .. : ...:.:.:: .:: .. . :. . . . CCDS32 RLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPE-EMSFIANSSKIDRH 670 680 690 700 710 720 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE . : ::.::::::::::..::.::. ::.::... .: ::: ::.::::..:. CCDS32 KVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAK 730 740 750 760 770 780 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK :.:::.. ::: .....: .. ....: .: :.::.::::::.:::::::::::::. CCDS32 CYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVH 790 800 810 820 830 840 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP .: :::: :. :::: ::: :::.:: ::: :..:: ::: ..: . : ::..:: ::: CCDS32 EKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDP 850 860 870 880 890 900 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM : .::.:::.. ::. : .: : .. : . : . : :: :.. :.. CCDS32 FNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQI 910 920 930 940 950 960 550 560 570 pF1KE3 MVADVFSHR-----------------FYKLYQLEEPLSSIL----DRDDIFVYEVSGRIE ..:.: . : ... :.: : . :. .... CCDS32 LLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMF 970 980 990 1000 1010 1020 580 590 600 610 620 pF1KE3 AIEGSREDIVVPVYLRERTPAR----DYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTW------E .. . :. :... . : .... . :. :: . :.: . :: . CCDS32 TLT-TNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGH--MPSLPDSPFTGYIIAVHR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 GLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGS-LRDPEPEQAGPSS .. . .: :: ..:. . :: . : : .: : : .: CCDS32 KMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQE--AS 1090 1100 1110 1120 1130 690 700 710 720 730 pF1KE3 GVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTS------DRTTSPEEVH---- . .. : :. .: :.: :::..:...:.: : .. CCDS32 NHAQDC----DDSMGY-QYP--------FTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGED 1140 1150 1160 1170 1180 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 ----AQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCV--GYVMKKAPVRLQECIELFTTVE .. :::.::.: . :. . . .:. : . . :. :. :.. ::. : CCDS32 RAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEE 1190 1200 1210 1220 1230 1240 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 TLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDL : ... .:: .:: : ::::::::: :: :::::::::.... : . .:.:: ... CCDS32 ELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESF 1250 1260 1270 1280 1290 1300 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 DFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPV : : :.. :.. CCDS32 DPSAFLV-PRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSL 1310 1320 1330 1340 1350 1360 >>CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318 aa) initn: 1300 init1: 800 opt: 886 Z-score: 883.5 bits: 175.3 E(32554): 6.8e-43 Smith-Waterman score: 1246; 35.2% identity (59.7% similar) in 708 aa overlap (284-896:470-1171) 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKG--QPGICGL : . : .... ::.:. : ::. :: CCDS43 DSVATRTPMEHVTPKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGL 440 450 460 470 480 490 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS .::::::::::..: :::. .: ..: . . :.:. :::: :..: ..: :.. :. 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CCDS43 HRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFELLSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQ 740 750 760 770 780 790 600 610 620 630 pF1KE3 PARD-------------YNNS---------YYGLML---FGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN ..: : :. . :: .:.:.::::: .:.:. : . CCDS43 QSEDEKLKRCTRCYRVGYCNQLCQKTHWPDHKGLCRPENIGYPFLVSVPASRLTYARLAQ 800 810 820 830 840 850 640 650 660 670 pF1KE3 VL--MYRLSRYVTKP-------NSDDEDDGD---------EKEDDEEDKDDVP-----GP .: . : : : .: .... : : :.:.: . : : CCDS43 LLEGYARYSVSVFQPPFQPGRMALESQSPGCTTLLSTGSLEAGDSERDPIQPPELQLVTP 860 870 880 890 900 910 680 690 700 pF1KE3 STGGSL----------RDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLL------------DNCLGTSQWP . :. : : : .: :: . :. . . . : : CCDS43 MAEGDTGLPRVWAAPDRGPVPSTSGISSEMLASGPIEVGSLPAGERVSRPEAAVPGYQHP 920 930 940 950 960 970 710 720 730 740 750 pF1KE3 PRR---RRKQLFTLQTVNSNGTS---DRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEV--- . . :.: . .:: . :. .: :. . .:. :. . . . . : CCDS43 SEAMNAHTPQFFIYKIDSSNREQRLEDKGDTPLELGDDCSLALVWRNNERLQEFVLVASK 980 990 1000 1010 1020 1030 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 EAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWM : : .: . . . :..:..::: :.: :. ::::.::::. :.:.: :: CCDS43 ELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCLNLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWR 1040 1050 1060 1070 1080 1090 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 LPEILIIHLKRFSYTKFS-REKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVS ::..::..:::::. .: :.:.. :::::.:.::.:.: : ..:. : .::: :: CCDS43 LPNVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDLVEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLP---SYDLYAVI 1100 1110 1120 1130 1140 1150 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 NHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLS :::::: :::: :: . CCDS43 NHYGGMIGGHYT--ACARLPNDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRR 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372 aa) initn: 1300 init1: 800 opt: 886 Z-score: 883.3 bits: 175.3 E(32554): 7.1e-43 Smith-Waterman score: 1246; 35.2% identity (59.7% similar) in 708 aa overlap (284-896:561-1262) 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKG--QPGICGL : . : .... ::.:. : ::. :: CCDS56 DSVATRTPMEHVTPKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGL 540 550 560 570 580 590 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS .::::::::::..: :::. .: ..: . . :.:. :::: :..: ..: :.. :. CCDS56 VNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWK 600 610 620 630 640 650 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA : :... : .: :. :::: :: :::.::...::::::::::::...: :.: :. 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CCDS56 NHYGGMIGGHYT--ACARLPNDRSSQRSDVGWRLFDDSTVTTVDESQVVTRYAYVLFYRR 1250 1260 1270 1280 1290 1300 >>CCDS56255.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1384 aa) initn: 1300 init1: 800 opt: 886 Z-score: 883.2 bits: 175.4 E(32554): 7.1e-43 Smith-Waterman score: 1246; 35.2% identity (59.7% similar) in 708 aa overlap (284-896:573-1274) 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKG--QPGICGL : . : .... ::.:. : ::. :: CCDS56 DSVATRTPMEHVTPKPETHLASPKPTCMVPPMPHSPVSGDSVEEEEEEEKKVCLPGFTGL 550 560 570 580 590 600 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS .::::::::::..: :::. .: ..: . . :.:. :::: :..: ..: :.. :. CCDS56 VNLGNTCFMNSVIQSLSNTRELRDFFHDRSFEAEINYNNPLGTGGRLAIGFAVLLRALWK 610 620 630 640 650 660 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA : :... : .: :. :::: :: :::.::...::::::::::::...: :.: :. CCDS56 GTHHAFQPSKLKAIVASKASQFTGYAQHDAQEFMAFLLDGLHEDLNRIQNKPYTETVDSD 670 680 690 700 710 720 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS ::::. ::.:::: :: :::: ::: :.: .:: :::: :..::.::::: :: :::: . CCDS56 GRPDEVVAEEAWQRHKMRNDSFIVDLFQGQYKSKLVCPVCAKVSITFDPFLYLPVPLP-Q 730 740 750 760 770 780 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKI-SDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRF ...:: ::.. .:. :: . . : :... :.. .::. . ..:: . .:.:...:: CCDS56 KQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVSVSKENSTASEVLDSLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRF 790 800 810 820 830 840 560 570 580 590 pF1KE3 YKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSG------RIEAIEGSREDIV--VPVY----LRERT .... . :... : .. .:. . :. ..: ... : ::. ... CCDS56 HRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFELLSSELAKERVVVLEVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQ 850 860 870 880 890 900 600 610 620 630 pF1KE3 PARD-------------YNNS---------YYGLML---FGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN ..: : :. . :: .:.:.::::: .:.:. : . 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