FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2203, 875 aa 1>>>pF1KE2203 875 - 875 aa - 875 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0830+/-0.00129; mu= -0.2852+/- 0.078 mean_var=276.6923+/-55.625, 0's: 0 Z-trim(108.9): 74 B-trim: 81 in 1/51 Lambda= 0.077104 statistics sampled from 10430 (10491) to 10430 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 2.850 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 5688 647.2 3.8e-185 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 1277 156.4 1.6e-37 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 774 100.3 8.1e-21 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 774 100.4 1e-20 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 745 97.3 1.2e-19 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 701 92.2 2.4e-18 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 667 88.5 3.3e-17 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 642 85.9 3.6e-16 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 642 85.9 3.6e-16 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 632 84.6 5.9e-16 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 636 85.2 5.9e-16 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 632 84.7 6.6e-16 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 632 84.7 7e-16 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 631 84.6 7.2e-16 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 631 84.6 7.2e-16 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 619 83.2 1.7e-15 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 616 82.9 2.3e-15 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 612 82.4 2.7e-15 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 612 82.4 2.7e-15 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 617 83.1 2.8e-15 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 617 83.1 2.8e-15 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 596 80.6 8.9e-15 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 596 80.7 1e-14 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 596 80.7 1e-14 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 596 80.7 1.1e-14 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 567 77.4 8.8e-14 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 565 77.2 1e-13 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 552 75.6 2e-13 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 548 75.2 2.7e-13 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 551 75.6 2.9e-13 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 537 74.0 6.7e-13 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 531 73.3 1e-12 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 526 72.7 1.6e-12 CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 517 71.7 3e-12 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 487 68.6 5.2e-11 >>CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 (875 aa) initn: 5688 init1: 5688 opt: 5688 Z-score: 3437.4 bits: 647.2 E(32554): 3.8e-185 Smith-Waterman score: 5688; 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CCDS21 TVLTNGEAAMQSSNSESKKKKKKKRKMVNDAEPDTKKAKTENKGKSEEESAETTKETENN 100 110 120 130 140 150 50 60 70 80 90 pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFP--LSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQ ..::. . .. . : . .. : : :... ....:::...: . .::::.. CCDS21 VEKPDNDEDESEVPSLPLGLT--GAFEDTSFASLCNLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQHK 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 TIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRELAYQTF .: :.:.:.:.:::::::::::::.:..: . .:.. .: ::::.:::::::.::: CCDS21 SIRPLLEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLRFMPRNGTGVLILSPTRELAMQTF 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 EVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERINN-INILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQ ::... .: . :::.::.. . ::....: :::.: ::::::.::..: .: .:: CCDS21 GVLKELMTHHVHTYGLIMGGSNRSAEAQKLGNGINIIVATPGRLLDHMQNTPGFMYKNLQ 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 MLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKN-PEYVWV ::.::::::::.:: . .. .:. :: .:::.:::::::..:.::::.:::. : :: : CCDS21 CLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTMLFSATQTRKVEDLARISLKKEPLYVGV 330 340 350 360 370 380 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 HEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYRVFCRL . .: :::.:.:: .... .:..::... ::: .:::::: :.: :... . CCDS21 DDDKANATVDGLEQGYVVCPSEKRFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFSSCMSVKYHYELLNYI 390 400 410 420 430 440 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 RPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDA . .::.::.:.: .: .. .: ...:. ::.::::::.: :.:..:.: :.: CCDS21 --DLPVLAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCTDVAARGLDIPEVDWIVQYDPPDDP 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 NTYIHRAGRTAR-YKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQKKVPVKEIKINPEKLIDVQKKLE . ::::.::::: . :.::::: : : .... : :.:::..:. .. :. :.:..:: CCDS21 KEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEELGFLRYLKQSKVPLSEFDFSWSKISDIQSQLE 510 520 530 540 550 560 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 SILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAPRVRFLQK ... .. :.. ::. . ::.:. . :..:.:..: .:. :::.:. : : : CCDS21 KLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHSLKQIFNVNNLNLPQVALSFGFKVPPFVDLNVN 570 580 590 600 610 620 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 MQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDN CCDS21 SNEGKQKKRGGGGGFGYQKTKKVEKSKIFKHISKKSSDSRQFSH 630 640 650 660 670 >>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa) initn: 715 init1: 264 opt: 774 Z-score: 487.2 bits: 100.3 E(32554): 8.1e-21 Smith-Waterman score: 774; 34.1% identity (66.1% similar) in 416 aa overlap (63-469:18-425) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 KKKQLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLV .. .: :.:. .. .. .. . CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKP 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 TEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIISPTRE :.:: ..: :::::.:..: :.:::::: :: .:.:.:: . . . : .:...:::: CCDS86 TKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNALLE----TPQRLFALVLTPTRE 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKD-LKHEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSF ::.: : .. .:.. ....:.:: : ... .. .:.. :::::..:...: .: CCDS86 LAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLALAKKPHIIIATPGRLIDHLENTKGF 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 HATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNP . :..::.:::::::.: : .. ... .:. :.:.:::::.::.:. : : .:::: CCDS86 NLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNP 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 EYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLYR : ..::.: :.: :: . : . : .: .. ..: :.:...: CCDS86 --VKCAVSSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTAL 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 VFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFD .. : : . . :::...: .:. :.: : ..:.:::.:.::::.: :. :..:: CCDS86 LLRNL--GFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFD 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 pF1KE2 CPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQ---LLQKKVPV-----KEIKIN : .. ::::.::::: ..:.:. .. . . :. :. ::.: :. . CCDS86 IPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMML 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 PEKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLG :.. ..:. . : . . :.:.. CCDS86 TERVAEAQRFARMELREHGEKKKRSREDAGDNDDTEGAIGVRNKVAGGKMKKRKGR 400 410 420 430 440 450 >>CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 (600 aa) initn: 877 init1: 321 opt: 774 Z-score: 485.5 bits: 100.4 E(32554): 1e-20 Smith-Waterman score: 1054; 36.3% identity (67.8% similar) in 559 aa overlap (75-600:15-568) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 EWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLAL :: ..: .:.: . .: .:. :: : . CCDS92 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFM 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWT-STDGLGVLIISPTRELAYQTFEVLRK ..::: . : :::::::::..:.:: : : . . . .:..::.:::::: : ::: . CCDS92 RNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSH 50 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 pF1KE2 VGKNH-DFSAGLIIGGKDLKHEAERINNI--NILVCTPGRL---LQHMDETVSFHAT--D :. .:: : :::.. ...::... ::.: ::::: ... : ... . . CCDS92 FTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRS 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVW :..::::::::.::::: ..:...: :::.:.: :::::::. :..:.: .:.:: : CCDS92 LDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVS 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VHEK-----AKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY :.:: . .::. ::. :.::. ..:.. : :::.: ..: .::::.: :.: CCDS92 VKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYG 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 RVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQF ... : ::.:. .::... ..: ... :: . ....: ::. :::.:.: ::::::. CCDS92 KALEVLVKGVKIMCIHGKMK-YKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQY 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 pF1KE2 DCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL-LQKKVPVKEIKINPEK-LI : : .:....:: ::::: . : ::..::: :..... : ...: :..:.: :.. CCDS92 DPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMK--PQRNTA 350 360 370 380 390 400 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP :. ::.:. :. . :.... :::::.. . . .: .. : . : ...: : CCDS92 DLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLRMP 410 420 430 440 450 460 510 520 530 540 550 pF1KE2 RVRFLQKMQ------------KQPTKELVR-SQADKVIEP-RAPSLTNDEVEEF---RAY .. :. : : :. .: .: .:..: : . :. ..: .:. CCDS92 KMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGRRKFIKNKAW 470 480 490 500 510 520 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 FNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTS ..: . .: :... ..:.... ..:. :: .. .. .:: :.: CCDS92 SKQKAKKEKK--KKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEEEFEKGLL 530 540 550 560 570 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 EAQKIKEVPTQFLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKV CCDS92 TTGKRTIKTVDLGISDLEDDC 580 590 600 >>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa) initn: 592 init1: 382 opt: 745 Z-score: 466.4 bits: 97.3 E(32554): 1.2e-19 Smith-Waterman score: 754; 29.7% identity (59.2% similar) in 622 aa overlap (66-667:215-795) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 QLRKQLKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEI .: :.:. ::. ::.. .. : : CCDS13 KADTLKVKDRKKKKKKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPI 190 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 QKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEAL-YRLQWTSTDGLGVLIISPTRELA :: : ..: :::. . : ::.::: :: .:::: : :. . . . ::.. :::::. CCDS13 QKACIPVGLLGKDICACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVT--RVLVLVPTRELG 250 260 270 280 290 300 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 YQTFEVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLK-HEAERINNINILVCTPGRLLQHMDETVSFHA :. : :.... .... : .:: :.: .:: .::. :::::..:. . ::: CCDS13 IQVHSVTRQLAQFCNITTCLAVGGLDVKSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLHNCPSFHL 310 320 330 340 350 360 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 TDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEY .....:.::::::.:: : . :. .:. ..:::.:::::.: ::::: .::::: CCDS13 SSIEVLILDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVR 370 380 390 400 410 420 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQ---KISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY ..:. .. . : :.:..: . .. . ... ..: . . ..: .. :... .. CCDS13 IFVNSNTDVA-P-FLRQEFIRIRPNREGDREAIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMH 430 440 450 460 470 480 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 RVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQF .. . :... ::: .: .:.:. .: .. .: :::.::::::. .:. :..: CCDS13 ILLGLM--GLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINF 490 500 510 520 530 400 410 420 430 440 pF1KE2 DCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQK-KVPVKEIKINPEKLID :. . :.::.::::: . :... .. .:. :...... :.::: CCDS13 TMPNTIKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKA---------- 540 550 560 570 580 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 VQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLA-VAP :: :: :: : . . : .:.:. : .: : .. . : . CCDS13 ------RILPQDVILKFRDK---------IEKM-EKDVYAVLQLEAEEKEMQQSEAQINT 590 600 610 620 630 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RVRFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRLEG :.:.: .. ..: :: .. : : ..:: . : : :.. CCDS13 AKRLLEKGKEAVVQEPERSWF-QTKEERKKEKIAKALQEFDLALRGK-----KKRKKFMK 640 650 660 670 680 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 TEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKA--KGSQAPSLPNT----SEAQKIKEVPTQ ... . :..:... : . . :.::: ....: ..:. . :.: :. . CCDS13 DAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFAERLAKRNRRAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKS 690 700 710 720 730 740 630 640 650 660 670 pF1KE2 FLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTL----QKKE---PSKSSIKKKMTKVAEAK .:.. . . :: : : .....: : :.. ::: :.. CCDS13 VFDEELTNTSKKALKQYRA---GPSFEERKQLGLPHQRRGGNFKSKSRYKRRK 750 760 770 780 790 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 KVMKRNFKVNKKITFTDEGELVQQWPQMQKSAIKDAEEDDDTGGINLHKAKERLQEEDKF >>CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 (483 aa) initn: 447 init1: 223 opt: 701 Z-score: 443.0 bits: 92.2 E(32554): 2.4e-18 Smith-Waterman score: 701; 30.0% identity (61.5% similar) in 483 aa overlap (71-539:4-470) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI :... ::. .. .. . : .: : CCDS12 MAGFAELGLSSWLVEQCRQLGLKQPTPVQLGCI 10 20 30 110 120 130 140 150 pF1KE2 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGV--LIISPTRELAYQTF :.:.: :: :::::::: ::..:.:. : : : :. :...:::::::: CCDS12 PAILEGRDCLGCAKTGSGKTAAFVLPILQKL------SEDPYGIFCLVLTPTRELAYQIA 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 EVLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQ : .: .:: .. .:.:: :. .: ... . .... ::::: .:. . .: .. CCDS12 EQFRVLGKPLGLKDCIIVGGMDMVAQALELSRKPHVVIATPGRLADHLRSSNTFSIKKIR 90 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 MLVLDEADRILDMGFAD---TMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYV .::.:::::.:..: .: ..:.. .: .::::::::: : ....: :. ..: . CCDS12 FLVMDEADRLLEQGCTDFTVDLEAILAAVPARRQTLLFSATLTDTLRELQGLATNQP-FF 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 WVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQK----ISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY : . .: :: :.: :.. . : . .. : : . :.: ..:: : : CCDS12 W-EAQAPVSTVEQLDQRYLLVPEKVKDAYLVHLIQRFQDEHEDWSIIIFTNTCKTCQILC 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 pF1KE2 RVFCRLR-PGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQ .. .. : : :::. ..: .:. . .: . .:.:::.:.::::.:.:. :.. CCDS12 MMLRKFSFPTV---ALHSMMKQKERFAALAKFKSSIYRILIATDVASRGLDIPTVQVVIN 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 FDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQK-KVPVKEIKINPEKLI . : . ::::.::::: ..:.:. .. . .:. . .. : ..:.... ... CCDS12 HNTPGLPKIYIHRVGRTARAGRQGQAITLVTQYDIHLVHAIEEQIKKKLEEFSVEEAEVL 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP .. .. ... .. ..: .: . . .. . : :... .: : : . :: CCDS12 QILTQV-NVVRRECEIKLEA----AHFDEKKEINKRKQLILEGKDPDLEAKRKAELAKIK 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RV--RFLQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPSLTNDEVEEFRAYFNEKMSILQKGGKRL . :: .:... .. . . : ::.:: CCDS12 QKNRRFKEKVEETLKRQKAGRAGHKGRPPRTPSGSHSGPVPSQGLV 440 450 460 470 480 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 EGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTSEAQKIKEVPTQFLDR >>CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 469 init1: 162 opt: 667 Z-score: 422.5 bits: 88.5 E(32554): 3.3e-17 Smith-Waterman score: 667; 29.7% identity (64.9% similar) in 461 aa overlap (3-450:26-470) 10 20 30 pF1KE2 MGKTANSPGSGARPDPVRSFNRWKKKHSHRQNKKKQL : ...::.:. ...:. :. .. .. ..: CCDS44 MSTARTENPVIMGLSSQNGQLRGPVKPTGGPGGGGTQTQ-QQMNQLKNTNTINNGTQQQA 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KE2 RKQLK--KP--EWQVERESISRLMQNYEKINVNEIT-----RFSDFPLSKKTLKGLQEAQ ... :: .:. . .: . .:.....: .: :. :... : :. : CCDS44 QSMTTTIKPGDDWK----KTLKLPPKDLRIKTSDVTSTKGNEFEDYCLKRELLMGIFEMG 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 YRLVTEIQKQTIGLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTDGLGVLIIS .. . ::...: .::.:.:.:. ::.:.::. :.:.:.:: ::. . :.. ...: CCDS44 WEKPSPIQEESIPIALSGRDILARAKNGTGKSGAYLIPLLE---RLD-LKKDNIQAMVIV 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 PTRELAYQTFEVLRKVGKNHDFSAGLII--GGKDLKHEAERINN-INILVCTPGRLLQHM :::::: :. .. .:.: : .: .. :: .:. . :... ..... ::::.:. . CCDS44 PTRELALQVSQICIQVSK-HMGGAKVMATTGGTNLRDDIMRLDDTVHVVIATPGRILDLI 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 DETVSFHATDLQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLAR . :. .. .::.::::::..:.. :.. :. .: .:::.:: ::.::: ::. . CCDS44 KKGVA-KVDHVQMIVLDEADKLLSQDFVQIMEDIILTLPKNRQILLYSATFPLSVQKFMN 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 LSLKNPEYVWVHEKAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKE :..: . . :. : . : : .::. : ... ..::.: .: .. CCDS44 SHLQKPYEINLMEEL---TLKGVTQYYAYVTERQKVHCLNTLFSRLQINQSIIFCNSSQR 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 VQYLYRVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVN :. : . . .: : : . .:....: .: .:...: : ::. .::.:. ::: CCDS44 VELLAKKISQL--GYSCFYIHAKMRQEHRNRVFHDFRNGLCRNLVCTDLFTRGIDIQAVN 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 WVLQFDCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQLLQK-KVPVKEIKINP :..:: :. :.::.:: ::..:. . : :. .. ... .... .. . .: : : CCDS44 VVINFDFPKLAETYLHRIGRSGRFGHLGLAINLITYDDRFNLKSIEEQLGTEIKPIPSNI 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 EKLIDVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGL .: . : CCDS44 DKSLYVAEYHSEPVEDEKP 470 480 >>CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (881 aa) initn: 586 init1: 267 opt: 642 Z-score: 403.9 bits: 85.9 E(32554): 3.6e-16 Smith-Waterman score: 716; 27.2% identity (59.6% similar) in 718 aa overlap (71-728:98-795) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI :... :: ..::... :.. : ::..:: CCDS31 FPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KE2 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTD-GLGVLIISPTRELAYQTFE . :.::::.. :.:::::: ::.:..: ::. :.. : .::.::::::: ::.. CCDS31 PVILDGKDVVAMARTGSGKTACFLLPMFE---RLKTHSAQTGARALILSPTRELALQTLK 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 VLRKVGKNHDFSAGLIIGGKDLKHEAERIN-NINILVCTPGRLLQHMDETVSFHATDLQM ...:: ....::.:: .. . .. : .:.. :::::. :. .:.. .... CCDS31 FTKELGKFTGLKTALILGGDRMEDQFAALHENPDIIIATPGRLV-HVAVEMSLKLQSVEY 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVWVHE .:.:::::...::::. .. .: :: .::.::::: : . ..:: .: .: . . CCDS31 VVFDEADRLFEMGFAEQLQEIIARLPGGHQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLDV 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 KAKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKK--SIVFFSSCKEVQYLYRVFCRL .: . :. .... . . : .:: .:.. .. . ..:: .. ....:: ... CCDS31 DTKLNEQ--LKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVRPQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQ 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 RPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQFDCPEDA : :: ... . : .:. . ..:..::.::::::.: .. :.... : . CCDS31 R--VSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKG 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KE2 NTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL---LQKKV----PVKEIK----IN-- . ..::.::.:: ..: : .. :.: .. .: : ... :.:: . .. CCDS31 KLFLHRVGRVARAGRSGTAYSLVAPDEIPYLLDLHLFLGRSLTLARPLKEPSGVAGVDGM 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 pF1KE2 ----PEKLIDVQKK-LESILAQDQDLK---ERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPI :....: . . :.: : . .:. . :. .:::: . . . .... . CCDS31 LGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAKEMDL 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 pF1KE2 PEYALSLGLAVAPRVRF----LQKMQKQPTKELVRSQADKVIEPRAPS--LTNDEVEEFR ..::: :: ::... . . ::.: ..: : : : .. .. : CCDS31 ----VGLGLHPLFSSRFEEEELQRLRLVDSIKNYRSRAT-IFEINASSRDLCSQVMRAKR 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 pF1KE2 AYFNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTG-----------NEEQEEEEDDEEEMEEKLAK . .. .:.: . : ...:.. .: . :.::::. : .:. ... CCDS31 QKDRKAIARFQQGQQ---GRQEQQEGPVGPAPSRPALQEKQPEKEEEEEAGESVEDIFSE 600 610 620 630 640 650 600 610 620 630 640 pF1KE2 AKGSQAP-SLPNTSEAQKIKE---------VPTQFLDRDEEE------EDADFLKVKRHN . : . : :: . .. .: .: . : : :. : . : . CCDS31 VVGRKRQRSGPNRGAKRRREEARQRDQEFYIPYRPKDFDSERGLSISGEGGAFEQQAAGA 660 670 680 690 700 710 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 VFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKVAEAKKVMKRNFKVN--KKITFTDEGELVQQW :. : . ..: . . . . .:: :... . :...:.. . :. . . .: :.: CCDS31 VLDLMGDEAQNLTRGRQQLKWDRKKKRFVGQSGQEDKKKIKTESGRYISSSYKRDLYQKW 720 730 740 750 760 770 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 PQMQKSAIKDAEEDDDTGGINLHKAKERLQEEDKFDKEEYRKKIKAKHREKRLKEREARR : :: : : .:.: : . ... :: CCDS31 KQKQK--IDD--RDSDEEGASDRRGPERRGGKRDRGQGASRPHAPGTPAGRVRPELKTKQ 780 790 800 810 820 >>CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (882 aa) initn: 586 init1: 267 opt: 642 Z-score: 403.8 bits: 85.9 E(32554): 3.6e-16 Smith-Waterman score: 716; 27.2% identity (59.6% similar) in 718 aa overlap (71-728:98-795) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 LKKPEWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTI :... :: ..::... :.. : ::..:: CCDS44 FPTSECTSDVEPDTREMVRAQNKKKKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKVPTPIQRKTI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KE2 GLALQGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWTSTD-GLGVLIISPTRELAYQTFE . :.::::.. :.:::::: ::.:..: ::. :.. : .::.::::::: ::.. 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