FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9542, 757 aa 1>>>pF1KE9542 757 - 757 aa - 757 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5790+/-0.00173; mu= 10.2571+/- 0.101 mean_var=304.5722+/-79.342, 0's: 0 Z-trim(103.3): 235 B-trim: 389 in 1/49 Lambda= 0.073490 statistics sampled from 7115 (7352) to 7115 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 3.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 757) 5149 561.6 1.6e-159 CCDS58930.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 724) 4460 488.5 1.5e-137 CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 4441 486.6 6.5e-137 CCDS75205.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 626) 4194 460.2 4.4e-129 CCDS75206.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 601) 3303 365.7 1.2e-100 CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 709) 3033 337.2 5.4e-92 CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 2689 300.8 5.3e-81 CCDS53862.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 730) 1943 221.7 3.3e-57 >>CCDS43276.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (757 aa) initn: 5149 init1: 5149 opt: 5149 Z-score: 2977.3 bits: 561.6 E(32554): 1.6e-159 Smith-Waterman score: 5149; 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95.2% identity (95.6% similar) in 609 aa overlap (149-757:17-601) 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 RAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTK ::. . ::::::::::::::::::::::: CCDS75 MVTCTQNMKAALKSLLYHSRNLGYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTK 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 LYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLP 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 DKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLD :::::::::::::: :::::::::::::::::::::: CCDS75 DKPLCQHMPRLHWL------------------------VMRKNKINHLNENTFAPLQKLD 110 120 130 140 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 ELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 ELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNI 150 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 QQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 QQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAV 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 TCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 TCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQL 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 WMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 WMESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWIT 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 GFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 GFIVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFS 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 YGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 YGSMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIP 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 GTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 GTITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFI 510 520 530 540 550 560 720 730 740 750 pF1KE9 WVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 WVEMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS 570 580 590 600 >>CCDS58929.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 (709 aa) initn: 2841 init1: 2841 opt: 3033 Z-score: 1765.1 bits: 337.2 E(32554): 5.4e-92 Smith-Waterman score: 4734; 93.5% identity (93.7% similar) in 757 aa overlap (1-757:1-709) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDVKCSLGYFPCGNITKCLPQLLHCNGVDDCGNQADED 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 NCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPVQCLCQGLELDCDETNLRA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 VPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIYAFRGLNSLTKLY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLVLMNNVLTRLPDK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS58 PLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHLNENTFAPLQKLDEF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 DLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQ :::::::::::: CCDS58 ------------------------------------------------SLEGIEISNIQQ 310 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 RMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASIIQRVFVWVVSAVTC 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 FGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIYLFVIGGFDLKFRGEYNKHAQLWM 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ESTHCQLVGSLAILSTEVSVLLLTFLTLEKYICIVYPFRCVRPGKCRTITVLILIWITGF 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 IVAFIPLSNKEFFKNYYGTNGVCFPLHSEDTESIGAQIYSVAIFLGINLAAFIIIVFSYG 500 510 520 530 540 550 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 SMFYSVHQSAITATEIRNQVKKEMILAKRFFFIVFTDALCWIPIFVVKFLSLLQVEIPGT 560 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ITSWVVIFILPINSALNPILYTLTTRPFKEMIHRFWYNYRQRKSMDSKGQKTYAPSFIWV 620 630 640 650 660 670 730 740 750 pF1KE9 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 EMWPLQEMPPELMKPDLFTYPCEMSLISQSTRLNSYS 680 690 700 >>CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 (754 aa) initn: 2629 init1: 1919 opt: 2689 Z-score: 1567.7 bits: 300.8 E(32554): 5.3e-81 Smith-Waterman score: 2689; 55.0% identity (79.9% similar) in 716 aa overlap (8-721:24-730) 10 20 30 40 pF1KE9 MTSGSVFFYILIFGKYFSHGGGQDV--KCSLGYFPCGNITKCLP : .:: : :. :. . .:. :::::::.::::: CCDS93 MIVFLVFKHLFSLRLITMFFLLHFIVLINVKDFALTQGSMITPSCQKGYFPCGNLTKCLP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 QLLHCNGVDDCGNQADEDNCGDNNGWSLQFDKYFASYYKMTSQYPFEAETPECLVGSVPV . .::.: ::::: :::.::::..::. : .. .. : : ::.. . : CCDS93 RAFHCDGKDDCGNGADEENCGDTSGWATIFGTVHGNANSV-------ALTQECFLKQYPQ 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 QCLCQGLELDCDETNLRAVPSVSSNVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKI : :. ::.: . .:..:: .:.::: .::. : :..:: : .: :.:..::.: : CCDS93 CCDCKETELECVNGDLKSVPMISNNVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 TSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLN :: :: :: .: :::.:: :: :.::.:.:::.: :::..:: ..::: : ::: CCDS93 RHISRKAFFGLCNLQILYLNHNCITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLN 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 SLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNK ::..: ..:: : :: : .: .::.:.:.:::::.:. : : ::.::..:::: . .:. 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