Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2312
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2312, 2136 aa
  1>>>pF1KE2312 2136 - 2136 aa - 2136 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5076+/-0.00145; mu= 19.2170+/- 0.088
 mean_var=87.8162+/-17.954, 0's: 0 Z-trim(100.0): 39  B-trim: 52 in 1/48
 Lambda= 0.136863
 statistics sampled from 5901 (5928) to 5901 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.182), width:  16
 Scan time:  5.630

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2020.1 SNRNP200 gene_id:23020|Hs108|chr2       (2136) 14015 2779.1       0
CCDS5046.1 ASCC3 gene_id:10973|Hs108|chr6          (2202) 5032 1005.3       0
CCDS30769.2 HFM1 gene_id:164045|Hs108|chr1         (1435) 1119 232.7 9.2e-60
CCDS75497.1 ASCC3 gene_id:10973|Hs108|chr6         ( 731) 1043 217.5 1.7e-55


>>CCDS2020.1 SNRNP200 gene_id:23020|Hs108|chr2            (2136 aa)
 initn: 14015 init1: 14015 opt: 14015  Z-score: 14945.2  bits: 2779.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 14015; 100.0% identity (100.0% similar) in 2136 aa overlap (1-2136:1-2136)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGTRMGDKAQRTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MADVTARSLQYEYKANSNLVLQADRSLIDRTRRDEPTGEVLSLVGKLEGTRMGDKAQRTK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 PQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGIIYKPKTKETRETYEVLLSFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PQMQEERRAKRRKRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGIIYKPKTKETRETYEVLLSFI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 QAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRDKERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QAALGDQPRDILCGAADEVLAVLKNEKLRDKERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKIT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 DYGGDKEIQNMDDNIDETYGVNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 DYGGDKEIQNMDDNIDETYGVNVQFESDEEEGDEDVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SANLVASGELMSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SANLVASGELMSSKKKDLHPRDIDAFWLQRQLSRFYDDAIVSQKKADEVLEILKTASDDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 ECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEAEKERIMGKMEADPELSKFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 ECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEAEKERIMGKMEADPELSKFL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 YQLHETEKEDLIREERSRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 YQLHETEKEDLIREERSRRERVRQSRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 HFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPALKPKPFGSEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HFMANKRCQLPDGSFRRQRKGYEEVHVPALKPKPFGSEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 LNRIQSKLYRAALETDENLLLCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LNRIQSKLYRAALETDENLLLCAPTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 IAPMRSLVQEMVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 IAPMRSLVQEMVGSFGKRLATYGITVAELTGDHQLCKEEISATQIIVCTPEKWDIITRKG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 GERTYTQLVRLIILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIGLSATLPNYED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GERTYTQLVRLIILDEIHLLHDDRGPVLEALVARAIRNIEMTQEDVRLIGLSATLPNYED
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 VATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQIMNEIVYEKIMEHAGKNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VATFLRVDPAKGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQIMNEIVYEKIMEHAGKNQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 VLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VLVFVHSRKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 GFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 WTELGALDILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 WTELGALDILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 LNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPTLYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LNAEIVLGNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPTLYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 ALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 ALMLDKNNLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 SSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKESIEEPSAKINVLLQAFISQLKLEGFALMAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SSEFKNITVREEEKLELQKLLERVPIPVKESIEEPSAKINVLLQAFISQLKLEGFALMAD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 MVYVTQSAGRLMRAIFEIVLNRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 MVYVTQSAGRLMRAIFEIVLNRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 KKIEKKNFPFERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KKIEKKNFPFERLYDLNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 ELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEHLITFFVPVFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 ELTITPDFQWDEKVHGSSEAFWILVEDVDSEVILHHEYFLLKAKYAQDEHLITFFVPVFE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 PLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQPLPVSALRNSAFESL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQPLPVSALRNSAFESL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE2 YQDKFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGAPTGSGKTICAEFAILRMLLQSSEGRCVYIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 YQDKFPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGAPTGSGKTICAEFAILRMLLQSSEGRCVYIT
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 PMEALAEQVYMDWYEKFQDRLNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIIISTPEKWDILSRRWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PMEALAEQVYMDWYEKFQDRLNKKVVLLTGETSTDLKLLGKGNIIISTPEKWDILSRRWK
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 QRKNVQNINLFVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QRKNVQNINLFVVDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDV
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE2 AHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 AHWLGCSATSTFNFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVI
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE2 VFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPYLEKLSDSTLKETLLNGVGYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VFVPSRKQTRLTAIDILTTCAADIQRQRFLHCTEKDLIPYLEKLSDSTLKETLLNGVGYL
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE2 HEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSLCWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HEGLSPMERRLVEQLFSSGAIQVVVASRSLCWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYP
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE2 IYDVLQMVGHANRPLQDDEGRCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCMHDHFNAEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 IYDVLQMVGHANRPLQDDEGRCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCMHDHFNAEI
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE2 VTKTIENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VTKTIENKQDAVDYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSK
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE2 CISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 CISIEDEMDVAPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPI
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE2 RHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 RHHEDNLLRQLAQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSAELQSDTEEILSKAI
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
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CCDS20 RLIQACVDVLSSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHIKRCTDKGVE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 SVFDIMEMEDEERNALLQLTDSQIADVARFCNRYPNIELSYEVVDKDSIRSGGPVVVLVQ
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       .      .. :... : :. :  : .. :.     . ::...  : :         .  :
CCDS50 LVQMTEKEHGDRVFFGKNLAFSFDMHDLDHFDELPINGETQKTISLD--------YKKFL
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       . .:    :  . . : ..  . . .:  ... :.    .     .  :    . ..: .
CCDS50 NEHL---QEACTPELKPVEKTNGSFLWCEVEKYLNSTLKEMTEVPRVEDLCCTLYDMLAS
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CCDS50 IKSGDELQDELFELLGPEGLELIEKLLQNRITIVDRFLNSSNDHRFQALQDNCKKILGE-
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       .: :. .  .    : ::. :... : ...:.  :...   :::.    : .:      :
CCDS50 NAKPNYGCQVTIQSEQEKQ-LMKQYRREEKRIARREKKAGEDLEVSEGLMCFDPKELRIQ
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         .::     .:   ::   :.: . .     .:.     : :.:. .  ::.:  :.. 
CCDS50 REQALLNARSVPILSRQRDADVEKIHYPHVYDSQAEAMKTSAFIAGAKMILPEGIQRENN
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CCDS50 KLYEEVRIPYSEPMPLSFEEKPVYIQDLDEIGQLAFKGMKRLNRIQSIVFETAYNTNENM
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       :.::::::::::.:.. .:.:: .:... :.:. ..:::.:.:::..:. ::.  :..::
CCDS50 LICAPTGAGKTNIAMLTVLHEIRQHFQQ-GVIKKNEFKIVYVAPMKALAAEMTDYFSRRL
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CCDS50 EPLGIIVKELTGDMQLSKSEILRTQMLVTTPEKWDVVTRKSVGDVALSQIVRLLILDEVH
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       :::.:::::::..:::..:..: ::  .:..::::::::: ::::::.:.:  :::.::.
CCDS50 LLHEDRGPVLESIVARTLRQVESTQSMIRILGLSATLPNYLDVATFLHVNPYIGLFFFDG
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CCDS50 RFRPVPLGQTFLGIKCANKMQQLNNMDEVCYENVLKQVKAG-HQVMVFVHARNATVRTAM
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CCDS50 SLIERAKNCGHIPFFFPTQGHDYVLAEKQVQRSRNKQVRELFPDGFSIHHAGMLRQDRNL
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       ::.::.. ::.::: :::::::::::::.:::::::.:. ..: ...:: ::..:..:::
CCDS50 VENLFSNGHIKVLVCTATLAWGVNLPAHAVIIKGTQIYAAKRGSFVDLGILDVMQIFGRA
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CCDS50 GRPQFDKFGEGIIITTHDKLSHYLTLLTQRNPIESQFLESLADNLNAEIALGTVTNVEEA
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CCDS50 VKWISYTYLYVRMRANPLAYGISHKAYQIDPTLRKHREQLVIEVGRKLDKAQMIRFEERT
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pF1KE2 GNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFRVFSLSSEFKNITVREEEKLE
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CCDS50 GYFSSTDLGRTASHYYIKYNTIETFNELFDAHKTEGDIFAIVSKAEEFDQIKVREEEIEE
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CCDS50 LDTLLSNFCELSTPGGVENSYGKINILLQTYISRGEMDSFSLISDSAYVAQNAARIVRAL
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pF1KE2 FEIVLNRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQSMCPLRQFRKLPEEVVKKIEKKNFPFERLYD
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CCDS50 FEIALRKRWPTMTYRLLNLSKVIDKRLWGWASPLRQFSILPPHILTRLEEKKLTVDKLKD
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pF1KE2 LNHNEIGELIRMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITRSTLKVELTITPDFQWDEKVH
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CCDS50 MRKDEIGHILHHVNIGLKVKQCVHQIPSVMMEASIQPITRTVLRVTLSIYADFTWNDQVH
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CCDS50 GTVGEPWWIWVEDPTNDHIYHSEYFLALKKQVISKEAQLLVFTIPIFEPLPSQYYIRAVS
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CCDS50 DRWLGAEAVCIINFQHLILPERHPPHTELLDLQPLPITALGCKAYEALY--NFSHFNPVQ
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CCDS50 TQIFHTLYHTDCNVLLGAPTGSGKTVAAELAIFRVFNKYPTSKAVYIAPLKALVRERMDD
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CCDS50 WKVRIEEKLGKKVIELTGDVTPDMKSIAKADLIVTTPEKWDGVSRSWQNRNYVQQVTILI
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pF1KE2 VDEVHLIGGENGPVLEVICSRMRYISSQIERPIRIVALSSSLSNAKDVAHWLGCSATSTF
       .::.::.: : ::::::: ::  .:::. :.:.:::.::..:.::.:.: ::. .  . :
CCDS50 IDEIHLLGEERGPVLEVIVSRTNFISSHTEKPVRIVGLSTALANARDLADWLNIKQMGLF
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pF1KE2 NFHPNVRPVPLELHIQGFNISHTQTRLLSMAKPVYHAITKHSPKKPVIVFVPSRKQTRLT
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CCDS50 NFRPSVRPVPLEVHIQGFPGQHYCPRMASMNKPAFQAIRSHSPAKPVLIFVSSRRQTRLT
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CCDS50 ALELIAFLATEEDPKQWLNMDEREMENIIATVRDSNLKLTLAFGIGMHHAGLHERDRKTV
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pF1KE2 EQLFSSGAIQVVVASRSLCWGMNVAAHLVIIMDTQYYNGKIHAYVDYPIYDVLQMVGHAN
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CCDS50 EELFVNCKVQVLIATSTLAWGVNFPAHLVIIKGTEYYDGKTRRYVDFPITDVLQMMGRAG
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pF1KE2 RPLQDDEGRCVIMCQGSKKDFFKKFLYEPLPVESHLDHCMHDHFNAEIVTKTIENKQDAV
       ::  ::.:. ::. .  ::::.:::::::.:::: :   . ::.::::.  :: .::::.
CCDS50 RPQFDDQGKAVILVHDIKKDFYKKFLYEPFPVESSLLGVLSDHLNAEIAGGTITSKQDAL
            1700      1710      1720      1730      1740      1750 

           1760      1770      1780      1790      1800       1810 
pF1KE2 DYLTWTFLYRRMTQNPNYYNLQGISHRHLSDHLSELVEQTLSDLEQSKCISI-EDEMDVA
       ::.:::...::. .::.::::  .::  ..  ::.:.:..: .:: : :: : ::. .. 
CCDS50 DYITWTYFFRRLIMNPSYYNLGDVSHDSVNKFLSHLIEKSLIELELSYCIEIGEDNRSIE
            1760      1770      1780      1790      1800      1810 

            1820      1830      1840      1850      1860      1870 
pF1KE2 PLNLGMIAAYYYINYTTIELFSMSLNAKTKVRGLIEIISNAAEYENIPIRHHEDNLLRQL
       ::. : ::.:::... :...:.  :. . ... :. :.:.: :: ..:.::.::..  .:
CCDS50 PLTYGRIASYYYLKHQTVKMFKDRLKPECSTEELLSILSDAEEYTDLPVRHNEDHMNSEL
            1820      1830      1840      1850      1860      1870 

            1880      1890      1900       1910      1920      1930
pF1KE2 AQKVPHKLNNPKFNDPHVKTNLLLQAHLSRMQLSA-ELQSDTEEILSKAIRLIQACVDVL
       :. .: . :  .:..::.:..::::::::: .:   . ..::. .:..:.:. :: .:: 
CCDS50 AKCLPIESNPHSFDSPHTKAHLLLQAHLSRAMLPCPDYDTDTKTVLDQALRVCQAMLDVA
            1880      1890      1900      1910      1920      1930 

             1940      1950      1960      1970                1980
pF1KE2 SSNGWLSPALAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFTSEHI----------KRCTDKGVE
       ...:::  .:   .: ::: :. : ::: :  ::.. ..:.          :    .:  
CCDS50 ANQGWLVTVLNITNLIQMVIQGRWLKDSSLLTLPNIENHHLHLFKKWKPIMKGPHARGRT
            1940      1950      1960      1970      1980      1990 

                   1990        2000      2010                      
pF1KE2 SVFDIMEM------EDEERNALLQ--LTDSQIADVARFCNRYPNI---------------
       :. .. :.      .:.  .....  :  ..  ..  : .. : :               
CCDS50 SIESLPELIHACGGKDHVFSSMVESELHAAKTKQAWNFLSHLPVINVGISVKGSWDDLVE
            2000      2010      2020      2030      2040      2050 

         2020              2030      2040            2050      2060
pF1KE2 ---ELSYEVVDKDS--------IRSGGPVVVLVQLER------EEEVTGPVIAPLFPQKR
          :::  ..  :.        ...    :. :.:.:      . .  . ...: ::...
CCDS50 GHNELSVSTLTADKRDDNKWIKLHADQEYVLQVSLQRVHFGFHKGKPESCAVTPRFPKSK
            2060      2070      2080      2090      2100      2110 

             2070      2080      2090        2100      2110        
pF1KE2 EEGWWVVIGDAKSNSLISIKRLTLQQKAKV-KLDFVAPAT-GAHNYTLYFMSDAYMGCDQ
       .:::....:.. .  ::..::.   .. .: .:.: .:   : . :::::::: :.    
CCDS50 DEGWFLILGEVDKRELIALKRVGYIRNHHVASLSFYTPEIPGRYIYTLYFMSDCYLGLDQ
            2120      2130      2140      2150      2160      2170 

     2120      2130                   
pF1KE2 EYKFSVDVKEAETDSDSD             
                                      
CCDS50 QYDIYLNVTQASLSAQVNTKVSDSLTDLALK
            2180      2190      2200  

>>CCDS30769.2 HFM1 gene_id:164045|Hs108|chr1              (1435 aa)
 initn: 706 init1: 247 opt: 1119  Z-score: 1186.4  bits: 232.7 E(32554): 9.2e-60
Smith-Waterman score: 1181; 31.5% identity (61.9% similar) in 867 aa overlap (415-1243:219-1054)

          390       400       410       420       430         440  
pF1KE2 SRMDTDLETMDLDQGGEALAPRQVLDLEDLVFTQGSHFMANKRCQLPDGSFRRQR--KGY
                                     ::: .. : :.   .. .: :.      ..
CCDS30 GSVKIVQTEMNKGKSRNYSNSKQKFQYSANVFTANNAFSAS---EIGEGMFKAPSFSVAF
      190       200       210       220          230       240     

            450       460       470       480       490       500  
pF1KE2 EEVHVPALKPKPFGSEEQLLPVEKLPKYAQAGFEGFKTLNRIQSKLYRAALETDENLLLC
       .   .  .  . .::   :  : ..:   .. :. :  .: :::: .   : ::.:...:
CCDS30 QPHDIQEVTENGLGS---LKAVTEIPAKFRSIFKEFPYFNYIQSKAFDDLLYTDRNFVIC
         250       260          270       280       290       300  

            510       520       530       540       550       560  
pF1KE2 APTGAGKTNVALMCMLREIGKHINMDGTINVDDFKIIYIAPMRSLVQEMVGSFGKRLATY
       ::::.::: :  . . : .     :.  .   ..::.:.::...: ..   .. ....  
CCDS30 APTGSGKTVVFELAITRLL-----MEVPLPWLNIKIVYMAPIKALCSQRFDDWKEKFGPI
            310       320            330       340       350       

            570        580       590       600       610       620 
pF1KE2 GITVAELTGDHQLCKE-EISATQIIVCTPEKWDIITRKGGERTYTQLVRLIILDEIHLLH
       :..  :::::  .    ::. ..::. :::::: .:::  . . .:::::...::.:...
CCDS30 GLNCKELTGDTVMDDLFEIQHAHIIMTTPEKWDSMTRKWRDNSLVQLVRLFLIDEVHIVK
       360       370       380       390       400       410       

              630         640             650       660         670
pF1KE2 DD-RGPVLEALVAR--AIRNIEMTQED------VRLIGLSATLPNYEDVATFLRVD--PA
       :. :::.::..:.:  ..... .: ..      .:....:::.:: ::.: .:     ::
CCDS30 DENRGPTLEVVVSRMKTVQSVSQTLKNTSTAIPMRFVAVSATIPNAEDIAEWLSDGERPA
       420       430       440       450       460       470       

              680       690       700          710       720       
pF1KE2 KGLFYFDNSFRPVPLEQTYVGITEKKAIKRFQI---MNEIVYEKIMEHAGKNQVLVFVHS
         :  .:.: ::: :... .:.  ..   .:..   .:  .   :. .. .. .:::  .
CCDS30 VCL-KMDESHRPVKLQKVVLGFPCSSNQTEFKFDLTLNYKIASVIQMYSDQKPTLVFCAT
       480        490       500       510       520       530      

       730       740       750       760       770       780       
pF1KE2 RKETGKTARAIRDMCLEKDTLGLFLREGSASTEVLRTEAEQCKNLELKDLLPYGFAIHHA
       :: . ..: .     : ::.  ..  :   . . :.  : . .. .:.:.:  : : :::
CCDS30 RKGVQQAASV-----LVKDAKFIMTVE---QKQRLQKYAYSVRDSKLRDILKDGAAYHHA
        540            550          560       570       580        

       790       800       810       820       830       840       
pF1KE2 GMTRVDRTLVEDLFADKHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGRWTELGAL
       ::   :: .::  :.   . :: .:.::: ::::::: :.::.:. :.   : . : .  
CCDS30 GMELSDRKVVEGAFTVGDLPVLFTTSTLAMGVNLPAHLVVIKSTMHYA--GGLFEEYSET
      590       600       610       620       630         640      

       850       860       870       880       890       900       
pF1KE2 DILQMLGRAGRPQYDTKGEGILITSHGELQYYLSLLNQQLPIESQMVSKLPDMLNAEIVL
       :::::.:::::::.:: . ....:  .  . :...:  .  .::..  .: . :::::::
CCDS30 DILQMIGRAGRPQFDTTATAVIMTRLSTRDKYIQMLACRDTVESSLHRHLIEHLNAEIVL
        650       660       670       680       690       700      

       910       920       930       940       950       960       
pF1KE2 GNVQNAKDAVNWLGYAYLYIRMLRSPTLYGISHDDLKGDPLLDQRRLDLVHTAALMLDKN
        .. ... ::.:.  . :::: :..:. ::.. . :. : . . .  .:       :.. 
CCDS30 HTITDVNIAVEWIRSTLLYIRALKNPSHYGFA-SGLNKDGI-EAKLQELCLKNLNDLSSL
        710       720       730        740        750       760    

       970       980       990      1000       1010      1020      
pF1KE2 NLVKYDKKTGNFQVTELGRIASHYYITNDTVQTYNQLL-KPTLSEIELFRVFSLSSEFKN
       .:.:.:. . ::. :: ::. . :::: .::. .  .  : :::  .:  ...  .:: .
CCDS30 DLIKMDEGV-NFKPTEAGRLMAWYYITFETVKKFYTISGKETLS--DLVTLIAGCKEFLD
          770        780       790       800         810       820 

       1030      1040           1050      1060      1070      1080 
pF1KE2 ITVREEEKLELQKLLE---RVPI--PVKESIEEPSAKINVLLQAFISQLKLEGFALMADM
       : .: .::  :. : .   :. :  :..  :.    :.: :.:: .. . .. :::  : 
CCDS30 IQLRINEKKTLNTLNKDPNRITIRFPMEGRIKTREMKVNCLIQAQLGCIPIQDFALTQDT
             830       840       850       860       870       880 

            1090      1100        1110      1120       1130        
pF1KE2 VYVTQSAGRLMRAIFEIVL--NRGWAQLTDKTLNLCKMIDKRMWQ-SMCPLRQFRKLPEE
       . . . ..:. : . ..:   .. .: : . .: : : .  ..:. :.   .:..:.   
CCDS30 AKIFRHGSRITRWLSDFVAAQEKKFAVLLN-SLILAKCFRCKLWENSLHVSKQLEKIGIT
             890       900       910        920       930       940

     1140       1150      1160        1170      1180      1190     
pF1KE2 VVKKIEKKNFP-FERLYDLNHNEIGELI--RMPKMGKTIHKYVHLFPKLELSVHLQPITR
       . . : . ..  :... . .  :. :::  : : .:  :.. :  .:: ::.:  . :::
CCDS30 LSNAIVNAGLTSFKKIEETDAREL-ELILNRHPPFGTQIKETVMYLPKYELKV--EQITR
              950       960        970       980       990         

         1200         1210      1220        1230         1240      
pF1KE2 -STLKVELTITP---DFQWDEKVHGSSEAFWI--LVEDVDSEVILHHEY---FLLKAKYA
        :   .:. .:    .:.  .  . .:.. ..  .. :.:..:.  :.     ::::   
CCDS30 YSDTTAEILVTVILRNFEQLQTKRTASDSHYVTLIIGDADNQVVYLHKITDSVLLKAGSW
      1000      1010      1020      1030      1040      1050       

       1250      1260      1270      1280      1290      1300      
pF1KE2 QDEHLITFFVPVFEPLPPQYFIRVVSDRWLSCETQLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQP
                                                                   
CCDS30 AKKIAVKRALKSEDLSINLISSEFVGLDIQQKLTVFYLEPKRFGNQITMQRKSETQISHS
      1060      1070      1080      1090      1100      1110       

>>CCDS75497.1 ASCC3 gene_id:10973|Hs108|chr6              (731 aa)
 initn: 937 init1: 677 opt: 1043  Z-score: 1110.0  bits: 217.5 E(32554): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1070; 33.8% identity (62.5% similar) in 678 aa overlap (103-724:60-721)

             80        90       100       110       120        130 
pF1KE2 KRDEDRHDINKMKGYTLLSEGIDEMVGIIYKPKTKETRETYEVLLSFIQAALG-DQPRD-
                                     : : .   :  . .:   .  .: :. :. 
CCDS75 KIKRSKLHEQVLDLGLTWKKIIKFLNEKLEKSKMQSINEDLKDILHAAKQIVGTDNGREA
      30        40        50        60        70        80         

              140       150       160       170       180       190
pF1KE2 ILCGAADEVLAVLKNEKLRDKERRKEIDLLLGQTDDTRYHVLVNLGKKITDYGGDKEIQN
       :  :::   ..   ....  ::  : :  ..:   ..   .  :  ..: .. .. ..  
CCDS75 IESGAAFLFMTFHLKDSVGHKET-KAIKQMFGPFPSSSATAACNATNRIISHFSQDDLTA
      90       100       110        120       130       140        

                    200       210           220       230       240
pF1KE2 M-----DDNIDETY-GVNVQFESDEEEGDE----DVYGEVREEASDDDMEGDEAVVRCTL
       .      .. :... : :. :  : .. :.     . ::...  : :         .  :
CCDS75 LVQMTEKEHGDRVFFGKNLAFSFDMHDLDHFDELPINGETQKTISLD--------YKKFL
      150       160       170       180       190               200

              250       260         270       280          290     
pF1KE2 SANLVASGELMSSKKKDLHPRDIDAFW--LQRQLSRFYDDAIVSQKKAD---EVLEILKT
       . .:    :  . . : ..  . . .:  ... :.    .     .  :    . ..: .
CCDS75 NEHL---QEACTPELKPVEKTNGSFLWCEVEKYLNSTLKEMTEVPRVEDLCCTLYDMLAS
                 210       220       230       240       250       

         300       310       320       330       340            350
pF1KE2 ASDDRECENQLVLLLGFNTFDFIKVLRQHRMMILYCTLLASAQSEAEK-----ERIMGKM
        ..  : ...:  ::: . ...:. : :.:. :.   : .: . . .      ..:.:. 
CCDS75 IKSGDELQDELFELLGPEGLELIEKLLQNRITIVDRFLNSSNDHRFQALQDNCKKILGE-
       260       270       280       290       300       310       

              360       370       380         390                  
pF1KE2 EADPELSKFLYQLHETEKEDLIREERSRRERV--RQSRMDTDLET----MDLD------Q
       .: :. .  .    : ::. :... : ...:.  :...   :::.    : .:      :
CCDS75 NAKPNYGCQVTIQSEQEKQ-LMKQYRREEKRIARREKKAGEDLEVSEGLMCFDPKELRIQ
        320       330        340       350       360       370     

      400                410                 420       430         
pF1KE2 GGEAL-----AP---RQV-LDLEDLVFT----------QGSHFMANKRCQLPDGSFRRQR
         .::     .:   ::   :.: . .           . : :.:. .  ::.:  :.. 
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