Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3963
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3963, 468 aa
  1>>>pF1KE3963 468 - 468 aa - 468 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8386+/-0.00085; mu= 7.4760+/- 0.051
 mean_var=189.9757+/-39.788, 0's: 0 Z-trim(114.0): 153  B-trim: 5 in 1/52
 Lambda= 0.093052
 statistics sampled from 14447 (14614) to 14447 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.449), width:  16
 Scan time:  2.540

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1        ( 468) 3249 448.4 7.3e-126
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1         ( 486) 1320 189.5 6.8e-48
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1         ( 477) 1315 188.8 1.1e-47
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11        ( 475) 1231 177.5 2.6e-44
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 488) 1156 167.5 2.9e-41
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4        ( 468) 1112 161.5 1.7e-39
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6         ( 465) 1092 158.8 1.1e-38
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6        ( 503) 1020 149.2 9.3e-36
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4        ( 471)  976 143.3 5.3e-34
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11     ( 449)  910 134.4 2.4e-31
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1        ( 343)  899 132.8 5.4e-31
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11      ( 449)  901 133.2 5.5e-31
CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2        ( 446)  900 133.1   6e-31
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11       ( 485)  844 125.6 1.2e-28
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11     ( 450)  839 124.9 1.8e-28
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7          ( 474)  816 121.8 1.6e-27
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11     ( 452)  806 120.4 3.8e-27
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11        ( 452)  805 120.3 4.2e-27
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11     ( 452)  798 119.4   8e-27
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11    ( 452)  786 117.8 2.4e-26
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 518)  761 114.5 2.8e-25
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 488)  754 113.5 5.1e-25
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 516)  754 113.5 5.3e-25
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6          ( 513)  735 111.0 3.1e-24
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11       ( 488)  715 108.3 1.9e-23
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11       ( 498)  675 102.9   8e-22
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6           ( 526)  673 102.6   1e-21
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 493)  664 101.4 2.2e-21
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 326)  652 99.6   5e-21
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 347)  652 99.7 5.3e-21
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8         ( 493)  642 98.5 1.7e-20
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11      ( 842)  642 98.7 2.5e-20
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6        ( 313)  622 95.6 7.9e-20
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6         ( 407)  622 95.7 9.6e-20
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11      ( 450)  622 95.7   1e-19
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6         ( 523)  622 95.8 1.2e-19
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 535)  614 94.7 2.5e-19
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 584)  614 94.8 2.6e-19
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6        ( 461)  594 92.0 1.4e-18
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6         ( 513)  594 92.0 1.5e-18
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1          ( 475)  581 90.3 4.9e-18
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6        ( 466)  574 89.3 9.2e-18
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6         ( 527)  574 89.4   1e-17
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6         ( 395)  536 84.1 2.8e-16
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16          ( 781)  541 85.1 2.9e-16
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6        ( 481)  536 84.2 3.2e-16
CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4        ( 437)  534 83.9 3.6e-16
CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5         ( 518)  531 83.6 5.5e-16
CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5         ( 630)  531 83.7 6.3e-16
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6        ( 425)  525 82.7 8.3e-16


>>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1             (468 aa)
 initn: 3249 init1: 3249 opt: 3249  Z-score: 2373.1  bits: 448.4 E(32554): 7.3e-126
Smith-Waterman score: 3249; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:1-468)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSGEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSGEH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 WAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNVLG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 EFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQLPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQLPA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 LGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANPEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANPEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 ILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWALGVCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWALGVCR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 ENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460        
pF1KE3 TDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ
              430       440       450       460        

>>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1              (486 aa)
 initn: 1305 init1: 1000 opt: 1320  Z-score: 973.3  bits: 189.5 E(32554): 6.8e-48
Smith-Waterman score: 1320; 45.5% identity (66.9% similar) in 475 aa overlap (1-463:1-468)

               10        20        30        40            50      
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC
       ::    .  :.:.: : .:::.. .:: .::::.:: .:: . :    :   : ::::.:
CCDS16 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
               10        20        30        40        50        60

         60          70        80        90       100       110    
pF1KE3 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC
       :  .: :  ..:::: :: ..: .:::   .      :  : : :. :: ..   :: .:
CCDS16 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
                 70        80        90       100       110        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE3 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ
       . . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...:::  .:.. .  :.:.. :: :
CCDS16 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE3 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG
       ::    :::. : .::.:::. :.::: ::  .: ::::. ..: :::  : ::  ::. 
CCDS16 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE
      180       190       200       210       220       230        

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE3 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD
       ::: ::::::. .. .: : . :     : .::::.:.: .::  : ::.:. :: ::: 
CCDS16 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA
      240       250       260       270       280       290        

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE3 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW
       ::.: :.:. : :::: :.  . .:..:::::  ::.:: . :.:::::::: ::. . :
CCDS16 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW
      300       310       320       330       340       350        

          360       370       380        390         400       410 
pF1KE3 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAPLR--DPPRRVGIFLDYE
       .::::.... :: .   :  :: : : .: :. :       .::   . :: .:::::::
CCDS16 GLGVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYE
      360       370       380       390       400       410        

             420       430       440       450          460        
pF1KE3 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ
       ::..:::..:::: .. : .. ::: ::: :   ...:    : ::    .:::.     
CCDS16 AGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTI----AGSGNWASRD
      420       430        440       450       460           470   

CCDS16 HLDPASDVRDDHL
           480      

>>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1              (477 aa)
 initn: 1068 init1: 453 opt: 1315  Z-score: 969.8  bits: 188.8 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 1315; 46.8% identity (68.8% similar) in 459 aa overlap (1-442:1-456)

               10        20        30        40                 50 
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCW----GQP-----EGPY
       : : .:. .:::::::.:::::::::::: ::::::: ::.  :    :.      .: .
CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE3 ACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLC
        ::::::.:::::: ::: :.:.::::.. ::     : .:  :.:::  ::  .   .:
CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-HPGLQ-KQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSPIC
               70        80         90        100       110        

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE3 AACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMV
       ..:..: ::  ::: : ..:..  : :::...:.::.:.  .  .::. ... . ::  :
CCDS15 VVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQGKV
      120       130       140       150       160       170        

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE3 ESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAE
       . .:. .. :::..   :.::::.::: :: :: :.  ::::..: : .:.  :  :. .
CCDS15 KERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLLLQ
      180       190       200       210       220       230        

             240       250       260        270       280       290
pF1KE3 LEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVP-MELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVT
       :: :     : .:::.:. : : ..:..: :::.:  . :::::::: .:.:: :  ::.
CCDS15 LEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLEDVV
      240       250       260       270       280       290        

              300       310        320       330       340         
pF1KE3 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALP-DSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEV-
        :  .: : :.: :.:.    :.  ..    : .::   ::..::  :.:::::::: . 
CCDS15 PDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEVGMN
      300       310       320       330       340       350        

        350       360       370       380        390         400   
pF1KE3 --GDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAP--LRDPPRR
         :: . :::::::.::.::..      ::::.. .  :. : :.  ::.:  : .:: .
CCDS15 ITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEPPSH
      360        370       380       390       400       410       

           410       420       430       440       450       460   
pF1KE3 VGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGD
       .:::::.:::..::::..::: :  . .  : : :.:.:                     
CCDS15 MGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMVISTVTMWVKG
       420       430       440       450       460       470       

            
pF1KE3 TLAPQ

>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11             (475 aa)
 initn: 1158 init1: 894 opt: 1231  Z-score: 908.9  bits: 177.5 E(32554): 2.6e-44
Smith-Waterman score: 1232; 43.8% identity (68.6% similar) in 475 aa overlap (1-464:1-473)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
       ::.    : . ::.:: :::: :..::  .:::.::.::: .  :.  :  .:: ::.  
CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV-GKGGGS-VCPVCRQRF
               10        20        30        40          50        

               70        80         90        100       110        
pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPS-PVPQGV-CPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSG
         .:::::: ::.:..  ...   .    ::  : .: : :  ::  . . :: .: .: 
CCDS44 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCAQSR
       60        70        80        90       100       110        

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE3 EHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNV
       .:  : . ::..::.. . ::. .: .::.... :  ....     . :.: ::.:.. .
CCDS44 KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQKSRI
      120       130       140       150       160       170        

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE3 LGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQL
        .:: . . .:.::::. ::.::..: : :  : :  :.:.:::  : :::.::. ::. 
CCDS44 HAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRRCHS
      180       190       200       210       220       230        

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE3 PALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANP
        :: :::..  .:.: .. .:.  ...  :::.::.:::: . ::     .:::::::::
CCDS44 SALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPDTANP
      240       250       260       270       280       290        

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE3 ELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWALGV
        ::::::::.:. :: .:..: . ::::  : ::: ..: ::.:::::.:  . .: :::
CCDS44 WLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAWDLGV
      300       310       320       330       340       350        

      360       370        380       390         400       410     
pF1KE3 CRENVNRKEKGELSAGNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAPL--RDPPRRVGIFLDYEAGHL
       ::..: :: .  ::. .::: : ..  . :...    .::  . :: .:::::::::: .
CCDS44 CRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPPCQVGIFLDYEAGMV
      360       370       380       390       400       410        

         420        430       440           450       460         
pF1KE3 SFYSATD-GSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGS-GDTLAPQ
       :::. :: :::.. : :  :.: :::.:::     ... .:.:.:  . :: :.:    
CCDS44 SFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGSTDY  
      420       430       440       450       460       470       

>>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6             (488 aa)
 initn: 1242 init1: 484 opt: 1156  Z-score: 854.3  bits: 167.5 E(32554): 2.9e-41
Smith-Waterman score: 1308; 45.1% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (9-457:22-483)

                            10        20        30        40       
pF1KE3              MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP
                            ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . 
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80          90       100     
pF1KE3 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPV--PQGVCPAHREPLAAFCGD
       :  . :: ::. :  :.::::: :..:.:.:..:.  .     ...:: :.: :. :: .
CCDS34 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE3 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV
       . . .:  :  :  : :: : ::.::... : ::.: :: :....:.    ... ..   
CCDS34 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE3 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL
         ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::..   :
CCDS34 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

         230       240       250       260        270           280
pF1KE3 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE
       :.: ::.::.:   .. .:.:.:..:.. . :: .    : .:: ..    :    .: .
CCDS34 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
              250       260       270       280       290       300

              290       300       310        320       330         
pF1KE3 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS
        :... .::::::.::.:.:.:::::.::.  . : . :::.:.::   ::::. : :::
CCDS34 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
              310       320       330       340       350       360

     340       350       360       370          380       390      
pF1KE3 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP
       :::::::::::.: ::.::::..:.::  :::.    .:.: . .. :. : ..   ..:
CCDS34 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP
              370       380         390       400       410        

          400       410       420       430       440           450
pF1KE3 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT
       :  .  :.::::::::::: ::::..:: : .. : .  :.  : ::: :      .. .
CCDS34 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
      420       430       440       450        460       470       

              460        
pF1KE3 PMTICRPKGGSGDTLAPQ
       :.:: ::           
CCDS34 PLTI-RPPTDWE      
       480               

>>CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4             (468 aa)
 initn: 1066 init1: 483 opt: 1112  Z-score: 822.6  bits: 161.5 E(32554): 1.7e-39
Smith-Waterman score: 1112; 40.3% identity (66.6% similar) in 467 aa overlap (1-455:1-462)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
       :.. ::  ::.:: :: ::::::..:: :.:::.::  :. : : . . : .:::: .  
CCDS38 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80           90       100        110      
pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPP---SPVPQGVCPAHREPLAAFC-GDELRLLCAACER
          ... :. :...: .::.:.     :   ::     : : .:   .:. .   :   .
CCDS38 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ
               70        80        90         100       110        

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE3 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQ
       :  : :.::.  ..: :  . ::.. :. :: . ..:    ..  :   : :. ... .:
CCDS38 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQ
        120       130       140       150       160       170      

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE3 NVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRC
        :..:. .....: ::::  :: ::.:: : . .::..  .: ::   :...::..:.  
CCDS38 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS
        180       190       200       210       220       230      

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE3 QLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTA
       :  :.  :.... ::.: . . :: ::..  :: ..::. :. : ::.:  ..:::: ::
CCDS38 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATA
        240       250       260        270       280       290     

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE3 NPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL
       :  :.:::: .::. :  :: :::.::::: .  ::: . :::::::::::::..: : .
CCDS38 NAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEV
         300       310       320       330       340       350     

        360       370       380           390       400       410  
pF1KE3 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEA
       :.:...:.:: .     :. : .. . .:. :.   ::      .:.:  .::.:::::.
CCDS38 GICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYES
         360       370       380       390       400       410     

            420       430       440           450       460        
pF1KE3 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ
       ::..::..:: ::.. ::.  :. .:::.:::     ...  :.:::             
CCDS38 GHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV       
         420       430       440       450       460               

>>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6              (465 aa)
 initn: 1119 init1: 392 opt: 1092  Z-score: 808.2  bits: 158.8 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1092; 40.8% identity (63.1% similar) in 463 aa overlap (1-449:1-457)

               10        20        30        40              50    
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP------EGPYACP
       ::.   . ...:::::.:::. .:.::  .:::..:. ::   . .:      .  . ::
CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE3 ECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC
       .::    . .::::. :... :  ..        .  :  : : .  :: :: .:.:  :
CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQ-----EMSCEEHGEQFHLFCEDEGQLICWRC
               70        80             90       100       110     

          120       130       140       150       160        170   
pF1KE3 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVL-WQKMVES
       ::. .: .: .  ..:. .  : ::.:.. .: ::..:    :  .    .  :.. :. 
CCDS45 ERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKL-KQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQI
         120       130       140        150       160       170    

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE3 QRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELE
       :::.. ..:. :. .: :::.. : :::.:: ..: :::.  : :: .: .:   : :::
CCDS45 QRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHILELE
          180       190       200       210       220       230    

           240       250       260       270           280         
pF1KE3 GRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLV----ETLRRFRGDV
        .::  :  :::...:.: :   :::.  :.: .::.:.: :  :     . ::  . .:
CCDS45 EKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDVKKMLRSHQVSV
          240       250       260       270       280       290    

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE3 TLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVG
       :::::::. :::::::::.: ::  ..    : .::   ::::: : :::::.:.::.::
CCDS45 TLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFTSGRRYFEVDVG
          300       310       320       330       340       350    

     350       360       370       380          390       400      
pF1KE3 DRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL---GSYYNSSERALAPLRDPPRRVGI
       . :.: :::: :::.:    .    .::: : .    :    .:  .   :.. :  :::
CCDS45 EGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPPTSLHLHEQPLLVGI
          360       370       380       390       400       410    

        410       420       430       440       450       460      
pF1KE3 FLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLA
       ::::::: .:::... :  .: ::.  :: :::: :.  . ::                 
CCDS45 FLDYEAGVVSFYNGNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPGD         
          420       430       440       450       460              

         
pF1KE3 PQ

>>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6             (503 aa)
 initn: 1028 init1: 484 opt: 1020  Z-score: 755.5  bits: 149.2 E(32554): 9.3e-36
Smith-Waterman score: 1020; 45.2% identity (72.3% similar) in 347 aa overlap (9-347:22-368)

                            10        20        30        40       
pF1KE3              MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP
                            ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . 
CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80          90       100     
pF1KE3 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPV--PQGVCPAHREPLAAFCGD
       :  . :: ::. :  :.::::: :..:.:.:..:.  .     ...:: :.: :. :: .
CCDS78 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

         110       120       130       140       150       160     
pF1KE3 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV
       . . .:  :  :  : :: : ::.::... : ::.: :: :....:.    ... ..   
CCDS78 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
              130       140       150       160       170       180

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE3 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL
         ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::..   :
CCDS78 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

         230       240       250       260        270           280
pF1KE3 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE
       :.: ::.::.:   .. .:.:.:..:.. . :: .    : .:: ..    :    .: .
CCDS78 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
              250       260       270       280       290       300

              290       300       310        320       330         
pF1KE3 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS
        :... .::::::.::.:.:.:::::.::.  . : . :::.:.::   ::::. : :::
CCDS78 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
              310       320       330       340       350       360

     340       350       360       370       380       390         
pF1KE3 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD
       ::::::::                                                    
CCDS78 GRHYWEVEAAHCVLAQDPENQALARFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVP
              370       380       390       400       410       420

>>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4             (471 aa)
 initn: 918 init1: 322 opt: 976  Z-score: 723.9  bits: 143.3 E(32554): 5.3e-34
Smith-Waterman score: 976; 35.6% identity (63.3% similar) in 463 aa overlap (9-455:9-464)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
               :::::..: :::.:. :::  .::::::: :.   : . .  . :: ::   
CCDS38 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF
               10        20        30        40        50        60

               70             80        90       100       110     
pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMA-----RRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACE
       : ...: :  : ...:.:     :: .      ...:  : . :. ::  .:..::. : 
CCDS38 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE3 RSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQR
        : .:  : . :.. ::   .  :: ::: ::.... .           :  .: :: .:
CCDS38 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE3 QNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGR
       ... .:::..: .: .:....:.....::...: .: :. ..:..  . : .:. :.::.
CCDS38 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270            280       290
pF1KE3 CQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTV-CRVP----GLVETLRRFRGDVT
            : :: . :.  .. :..:   ::.  ..:      .:    :: . .. :. :: 
CCDS38 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKC--PELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI
              250       260         270       280       290        

              300       310       320       330       340       350
pF1KE3 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGD
       :: .::.:.:..::::..:.    .. .  .:.::   : :::..::.:::::::::::.
CCDS38 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN
      300       310       320       330       340       350        

              360       370       380       390          400       
pF1KE3 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD---P---PRRV
       . .: ::::.. . :. . . :. .::: .   : :..:.  : .:      :   : ..
CCDS38 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAI---GRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI
      360       370       380          390       400       410     

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE3 GIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDT
       ::::::: : ::::. .: :.:. : .  :. .. : :   ..:  :. ::         
CCDS38 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTDSE-PLKICSVSDSER  
         420       430       440        450        460       470   

           
pF1KE3 LAPQ

>>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11          (449 aa)
 initn: 815 init1: 301 opt: 910  Z-score: 676.3  bits: 134.4 E(32554): 2.4e-31
Smith-Waterman score: 910; 34.0% identity (61.3% similar) in 447 aa overlap (1-442:1-444)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
       : . ::.. .:.:  : ::..:: :::  ::::.::: :.  :  . ..:. :: ::. :
CCDS53 MDSDDLQV-FQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTS
                10        20        30        40        50         

               70        80         90       100       110         
pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPS-PVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSGE
        . :.  :  : :.. .::. .: .    ...:  :.:    ::  . ::::. : .: :
CCDS53 EKPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE3 HWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNVL
       : ::   :.  :::. . :: : ...: .  :..     :   :    . .:  ... . 
CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 GEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQLP
        .....  .: ::::. :: ::.:  :.. .:... ... :.  .. ..  ::   :..:
CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 ALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANPE
        . ::::....  :.. ...: :. :  :: . : . :... :  :: : .:. .     
CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWC-ITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCY
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