FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3963, 468 aa 1>>>pF1KE3963 468 - 468 aa - 468 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8386+/-0.00085; mu= 7.4760+/- 0.051 mean_var=189.9757+/-39.788, 0's: 0 Z-trim(114.0): 153 B-trim: 5 in 1/52 Lambda= 0.093052 statistics sampled from 14447 (14614) to 14447 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.449), width: 16 Scan time: 2.540 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 3249 448.4 7.3e-126 CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 1320 189.5 6.8e-48 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 1315 188.8 1.1e-47 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 1231 177.5 2.6e-44 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 1156 167.5 2.9e-41 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 1112 161.5 1.7e-39 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 1092 158.8 1.1e-38 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 1020 149.2 9.3e-36 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 976 143.3 5.3e-34 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 910 134.4 2.4e-31 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 899 132.8 5.4e-31 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 901 133.2 5.5e-31 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 900 133.1 6e-31 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 844 125.6 1.2e-28 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 839 124.9 1.8e-28 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 816 121.8 1.6e-27 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 806 120.4 3.8e-27 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 805 120.3 4.2e-27 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 798 119.4 8e-27 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 786 117.8 2.4e-26 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 761 114.5 2.8e-25 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 754 113.5 5.1e-25 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 754 113.5 5.3e-25 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 735 111.0 3.1e-24 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 715 108.3 1.9e-23 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 675 102.9 8e-22 CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 673 102.6 1e-21 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 664 101.4 2.2e-21 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 652 99.6 5e-21 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 652 99.7 5.3e-21 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 642 98.5 1.7e-20 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 642 98.7 2.5e-20 CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 622 95.6 7.9e-20 CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 622 95.7 9.6e-20 CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 622 95.7 1e-19 CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 622 95.8 1.2e-19 CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 614 94.7 2.5e-19 CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 614 94.8 2.6e-19 CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 594 92.0 1.4e-18 CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 594 92.0 1.5e-18 CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 581 90.3 4.9e-18 CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 574 89.3 9.2e-18 CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 574 89.4 1e-17 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 536 84.1 2.8e-16 CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 541 85.1 2.9e-16 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 536 84.2 3.2e-16 CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 534 83.9 3.6e-16 CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 531 83.6 5.5e-16 CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 531 83.7 6.3e-16 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 525 82.7 8.3e-16 >>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa) initn: 3249 init1: 3249 opt: 3249 Z-score: 2373.1 bits: 448.4 E(32554): 7.3e-126 Smith-Waterman score: 3249; 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45.5% identity (66.9% similar) in 475 aa overlap (1-463:1-468) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC :: . :.:.: : .:::.. .:: .::::.:: .:: . : : : ::::.: CCDS16 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC : .: : ..:::: :: ..: .::: . : : : :. :: .. :: .: CCDS16 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ . . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...::: .:.. . :.:.. :: : CCDS16 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG :: :::. : .::.:::. :.::: :: .: ::::. ..: ::: : :: ::. CCDS16 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD ::: ::::::. .. .: : . : : .::::.:.: .:: : ::.:. :: ::: CCDS16 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW ::.: :.:. : :::: :. . .:..::::: ::.:: . :.:::::::: ::. . : CCDS16 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAPLR--DPPRRVGIFLDYE .::::.... :: . : :: : : .: :. : .:: . :: .::::::: CCDS16 GLGVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ ::..:::..:::: .. : .. ::: ::: : ...: : :: .:::. CCDS16 AGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTI----AGSGNWASRD 420 430 440 450 460 470 CCDS16 HLDPASDVRDDHL 480 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 1068 init1: 453 opt: 1315 Z-score: 969.8 bits: 188.8 E(32554): 1.1e-47 Smith-Waterman score: 1315; 46.8% identity (68.8% similar) in 459 aa overlap (1-442:1-456) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCW----GQP-----EGPY : : .:. .:::::::.:::::::::::: ::::::: ::. : :. .: . CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 ACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLC ::::::.:::::: ::: :.:.::::.. :: : .: :.::: :: . .: CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-HPGLQ-KQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSPIC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 AACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMV ..:..: :: ::: : ..:.. : :::...:.::.:. . .::. ... . :: : CCDS15 VVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQGKV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 ESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAE . .:. .. :::.. :.::::.::: :: :: :. ::::..: : .:. : :. . CCDS15 KERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLLLQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVP-MELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVT :: : : .:::.:. : : ..:..: :::.: . :::::::: .:.:: : ::. CCDS15 LEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLEDVV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALP-DSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEV- : .: : :.: :.:. :. .. : .:: ::..:: :.:::::::: . CCDS15 PDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEVGMN 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 --GDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAP--LRDPPRR :: . :::::::.::.::.. ::::.. . :. : :. ::.: : .:: . CCDS15 ITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEPPSH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 VGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGD .:::::.:::..::::..::: : . . : : :.:.: CCDS15 MGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMVISTVTMWVKG 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 TLAPQ >>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa) initn: 1158 init1: 894 opt: 1231 Z-score: 908.9 bits: 177.5 E(32554): 2.6e-44 Smith-Waterman score: 1232; 43.8% identity (68.6% similar) in 475 aa overlap (1-464:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS ::. : . ::.:: :::: :..:: .:::.::.::: . :. : .:: ::. CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV-GKGGGS-VCPVCRQRF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPS-PVPQGV-CPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSG .:::::: ::.:.. ... . :: : .: : : :: . . :: .: .: CCDS44 LLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVCAQSR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 EHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNV .: : . ::..::.. . ::. .: .::.... : .... . :.: ::.:.. . CCDS44 KHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQKSRI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQL .:: . . .:.::::. ::.::..: : : : : :.:.::: : :::.::. ::. CCDS44 HAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRRCHS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANP :: :::.. .:.: .. .:. ... :::.::.:::: . :: .::::::::: CCDS44 SALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPDTANP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWALGV ::::::::.:. :: .:..: . :::: : ::: ..: ::.:::::.: . .: ::: CCDS44 WLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAWDLGV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 CRENVNRKEKGELSAGNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAPL--RDPPRRVGIFLDYEAGHL ::..: :: . ::. .::: : .. . :... .:: . :: .:::::::::: . CCDS44 CRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHLQVPPCQVGIFLDYEAGMV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SFYSATD-GSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGS-GDTLAPQ :::. :: :::.. : : :.: :::.::: ... .:.:.: . :: :.: CCDS44 SFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGSTDY 420 430 440 450 460 470 >>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (488 aa) initn: 1242 init1: 484 opt: 1156 Z-score: 854.3 bits: 167.5 E(32554): 2.9e-41 Smith-Waterman score: 1308; 45.1% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (9-457:22-483) 10 20 30 40 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPV--PQGVCPAHREPLAAFCGD : . :: ::. : :.::::: :..:.:.:..:. . ...:: :.: :. :: . CCDS34 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV . . .: : : : :: : ::.::... : ::.: :: :....:. ... .. CCDS34 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::.. : CCDS34 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE :.: ::.::.: .. .:.:.:..:.. . :: . : .:: .. : .: . CCDS34 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE3 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS :... .::::::.::.:.:.:::::.::. . : . :::.:.:: ::::. : ::: CCDS34 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP :::::::::::.: ::.::::..:.:: :::. .:.: . .. :. : .. ..: CCDS34 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT : . :.::::::::::: ::::..:: : .. : . :. : ::: : .. . CCDS34 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA 420 430 440 450 460 470 460 pF1KE3 PMTICRPKGGSGDTLAPQ :.:: :: CCDS34 PLTI-RPPTDWE 480 >>CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 (468 aa) initn: 1066 init1: 483 opt: 1112 Z-score: 822.6 bits: 161.5 E(32554): 1.7e-39 Smith-Waterman score: 1112; 40.3% identity (66.6% similar) in 467 aa overlap (1-455:1-462) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS :.. :: ::.:: :: ::::::..:: :.:::.:: :. : : . . : .:::: . CCDS38 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTPLSCPECWRTL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPP---SPVPQGVCPAHREPLAAFC-GDELRLLCAACER ... :. :...: .::.:. : :: : : .: .:. . : . CCDS38 EGPHFQSNERLGRLASIARQLRSQVLQSEDEQG--SYGRMPTTAKALSDDEQGGSAFVAQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQ : : :.::. ..: : . ::.. :. :: . ..: .. : : :. ... .: CCDS38 S--HGANRVHLSSEAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEKERVKLCQEETKTCKQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 NVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRC :..:. .....: :::: :: ::.:: : . .::.. .: :: :...::..:. CCDS38 VVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMIAQIESSS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 QLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTA : :. :.... ::.: . . :: ::.. :: ..::. :. : ::.: ..:::: :: CCDS38 QSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEITLDPATA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 NPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWAL : :.:::: .::. : :: :::.::::: . ::: . :::::::::::::..: : . CCDS38 NAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVGNKTEWEV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 GVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVF-LGSYYN---SSERALAPLRDPPRRVGIFLDYEA :.:...:.:: . :. : .. . .:. :. :: .:.: .::.:::::. CCDS38 GICKDSVSRKGNLPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKVGVFLDYES 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 GHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ ::..::..:: ::.. ::. :. .:::.::: ... :.::: CCDS38 GHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSHV 420 430 440 450 460 >>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 (465 aa) initn: 1119 init1: 392 opt: 1092 Z-score: 808.2 bits: 158.8 E(32554): 1.1e-38 Smith-Waterman score: 1092; 40.8% identity (63.1% similar) in 463 aa overlap (1-449:1-457) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP------EGPYACP ::. . ...:::::.:::. .:.:: .:::..:. :: . .: . . :: CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 ECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC .:: . .::::. :... : .. . : : : . :: :: .:.: : CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQ-----EMSCEEHGEQFHLFCEDEGQLICWRC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVL-WQKMVES ::. .: .: . ..:. . : ::.:.. .: ::..: : . . :.. :. CCDS45 ERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKL-KQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 QRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELE :::.. ..:. :. .: :::.. : :::.:: ..: :::. : :: .: .: : ::: CCDS45 QRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHILELE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 GRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLV----ETLRRFRGDV .:: : :::...:.: : :::. :.: .::.:.: : : . :: . .: CCDS45 EKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDVKKMLRSHQVSV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 TLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVG :::::::. :::::::::.: :: .. : .:: ::::: : :::::.:.::.:: CCDS45 TLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFTSGRRYFEVDVG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 DRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL---GSYYNSSERALAPLRDPPRRVGI . :.: :::: :::.: . .::: : . : .: . :.. : ::: CCDS45 EGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPPTSLHLHEQPLLVGI 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 FLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLA ::::::: .:::... : .: ::. :: :::: :. . :: CCDS45 FLDYEAGVVSFYNGNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPGD 420 430 440 450 460 pF1KE3 PQ >>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 (503 aa) initn: 1028 init1: 484 opt: 1020 Z-score: 755.5 bits: 149.2 E(32554): 9.3e-36 Smith-Waterman score: 1020; 45.2% identity (72.3% similar) in 347 aa overlap (9-347:22-368) 10 20 30 40 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPV--PQGVCPAHREPLAAFCGD : . :: ::. : :.::::: :..:.:.:..:. . ...:: :.: :. :: . CCDS78 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV . . .: : : : :: : ::.::... : ::.: :: :....:. ... .. CCDS78 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::.. : CCDS78 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE :.: ::.::.: .. .:.:.:..:.. . :: . : .:: .. : .: . CCDS78 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 pF1KE3 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS :... .::::::.::.:.:.:::::.::. . : . :::.:.:: ::::. : ::: CCDS78 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD :::::::: CCDS78 GRHYWEVEAAHCVLAQDPENQALARFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVP 370 380 390 400 410 420 >>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa) initn: 918 init1: 322 opt: 976 Z-score: 723.9 bits: 143.3 E(32554): 5.3e-34 Smith-Waterman score: 976; 35.6% identity (63.3% similar) in 463 aa overlap (9-455:9-464) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS :::::..: :::.:. ::: .::::::: :. : . . . :: :: CCDS38 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDTFPCPVCRFCF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMA-----RRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACE : ...: : : ...:.: :: . ...: : . :. :: .:..::. : CCDS38 PYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQCS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 RSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQR : .: : . :.. :: . :: ::: ::.... . : .: :: .: CCDS38 FSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEYKR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 QNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGR ... .:::..: .: .:....:.....::...: .: :. ..:.. . : .:. :.::. CCDS38 EEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLREVEGK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 CQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTV-CRVP----GLVETLRRFRGDVT : :: . :. .. :..: ::. ..: .: :: . .. :. :: CCDS38 SVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKC--PELFSFRLTKYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQVDVI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGD :: .::.:.:..::::..:. .. . .:.:: : :::..::.:::::::::::. CCDS38 LDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVEVGN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD---P---PRRV . .: ::::.. . :. . . :. .::: . : :..:. : .: : : .. CCDS38 KPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAI---GRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 GIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDT ::::::: : ::::. .: :.:. : . :. .. : : ..: :. :: CCDS38 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDC-FTEAVWPYFYTGTDSE-PLKICSVSDSER 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 LAPQ >>CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 (449 aa) initn: 815 init1: 301 opt: 910 Z-score: 676.3 bits: 134.4 E(32554): 2.4e-31 Smith-Waterman score: 910; 34.0% identity (61.3% similar) in 447 aa overlap (1-442:1-444) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS : . ::.. .:.: : ::..:: ::: ::::.::: :. : . ..:. :: ::. : CCDS53 MDSDDLQV-FQNELICCICVNYFIDPVTIDCGHSFCRPCLCLCSEEGRAPMRCPSCRKTS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE3 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPS-PVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERSGE . :. : : :.. .::. .: . ...: :.: :: . ::::. : .: : CCDS53 EKPNFNTNLVLKKLSSLARQTRPQNINSSDNICVLHEETKELFCEADKRLLCGPCSESPE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQRQNVL : :: :. :::. . :: : ...: . :.. : : . .: ... . CCDS53 HMAHSHSPIGWAAEECREKLIKEMDYLWEINQETRNNLNQETSTFHSLKDYVSVRKRIIT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEGRCQLP ..... .: ::::. :: ::.: :.. .:... ... :. .. .. :: :..: CCDS53 IQYQKMPIFLDEEEQRHLQALEREAEELFQQLQDSQVRMTQHLERMKDMYRELWETCHMP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPDTANPE . ::::.... :.. ...: :. : :: . : . :... : :: : .:. . CCDS53 DVVLLQDVRNVSARTDLAQMQKPQPVNPELTSWC-ITGVLDMLNNFRVDSALSTEMIPCY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 LILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSWALGVC . :::: : : :: . . : .:. : . : : . ::::.:::::.: ..: :::: CCDS53 ISLSEDVRYVIFGDDHLSAPTDPQGVD-SFAVWGAQAFTSGKHYWEVDVTLSSNWILGVC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 RENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPL----RDPPRRVGIFLDYEAGHL :.. . . ... . :... : . : :: . : :::.::::. : . CCDS53 RDSRTADANFVIDSDERFFLISSKRSNHYSLSTNSPPLIQYVQRPLGRVGVFLDYDNGSV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTLAPQ ::.... :::.. :: ::. :::.: CCDS53 SFFDVSKGSLIYGFPPSSFSSPLRPFFCFGCT 420 430 440 468 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 08:31:20 2016 done: Sun Nov 6 08:31:21 2016 Total Scan time: 2.540 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]