FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2397, 969 aa 1>>>pF1KE2397 969 - 969 aa - 969 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9930+/-0.00155; mu= 5.2145+/- 0.093 mean_var=279.7261+/-56.862, 0's: 0 Z-trim(107.7): 158 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.076685 statistics sampled from 9577 (9728) to 9577 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16 Scan time: 4.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 ( 969) 6406 723.7 4.2e-208 CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 ( 968) 6389 721.8 1.6e-207 CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 899) 923 117.1 1.6e-25 CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 900) 923 117.1 1.6e-25 CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 ( 579) 529 73.3 1.6e-12 >>CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 (969 aa) initn: 6406 init1: 6406 opt: 6406 Z-score: 3849.5 bits: 723.7 E(32554): 4.2e-208 Smith-Waterman score: 6406; 99.9% identity (100.0% similar) in 969 aa overlap (1-969:1-969) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTADGPYLQILEQPKQRGFRFRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTADGPYLQILEQPKQRGFRFRY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 VCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGHNPGLLVHPDLAYLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS36 DGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 AEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 AEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 YDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 FSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 FSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 QRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 QRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 HPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 HPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQ 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 DENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDVVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 DENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDVVE 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 DLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKVLSILLKHKKAALLLDHPNGDGLNAIHLAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 DLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKVLSILLKHKKAALLLDHPNGDGLNAIHLAM 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 MSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTYDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 MSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTYDG 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 TTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWENAGEDEGVVPGTTPLDMA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 TTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWENAGEDEGVVPGTTPLDMA 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 TSWQVFDILNGKPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 TSWQVFDILNGKPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKL 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 GLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGYTEAIEVIQAASSPVKTTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 GLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGYTEAIEVIQAASSPVKTTS 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 QAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTESLTSGASLLTLNKMPHDYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 QAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTESLTSGASLLTLNKMPHDYG 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 QEGPLEGKI ::::::::: CCDS36 QEGPLEGKI >>CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 (968 aa) initn: 6387 init1: 6123 opt: 6389 Z-score: 3839.4 bits: 721.8 E(32554): 1.6e-207 Smith-Waterman score: 6389; 99.8% identity (99.9% similar) in 969 aa overlap (1-969:1-968) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTADGPYLQILEQPKQRGFRFRY ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: CCDS54 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPT-DGPYLQILEQPKQRGFRFRY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 VCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 DGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGHNPGLLVHPDLAYLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: CCDS54 DGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 AEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 AEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 YDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 YDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGD 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 FSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEV 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 QRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 QRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITF 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 HPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 HPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQ 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 DENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDVVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 DENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDVVE 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 DLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKVLSILLKHKKAALLLDHPNGDGLNAIHLAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 DLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKVLSILLKHKKAALLLDHPNGDGLNAIHLAM 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 MSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTYDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 MSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTYDG 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 TTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWENAGEDEGVVPGTTPLDMA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 TTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWENAGEDEGVVPGTTPLDMA 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 TSWQVFDILNGKPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 TSWQVFDILNGKPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYKLLEIPDPDKNWATLAQKL 780 790 800 810 820 830 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 GLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGYTEAIEVIQAASSPVKTTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 GLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGYTEAIEVIQAASSPVKTTS 840 850 860 870 880 890 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 QAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTESLTSGASLLTLNKMPHDYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 QAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTESLTSGASLLTLNKMPHDYG 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 QEGPLEGKI ::::::::: CCDS54 QEGPLEGKI 960 >>CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 (899 aa) initn: 1769 init1: 463 opt: 923 Z-score: 571.6 bits: 117.1 E(32554): 1.6e-25 Smith-Waterman score: 2250; 44.9% identity (68.8% similar) in 893 aa overlap (26-900:20-858) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALP-TADGPYLQILEQPKQRGFRFR .: . .:. : ::::::: :.::::::::::: CCDS41 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YVCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHC : ::::::::::::::::..:.:: :::::: ::::. :.:::.. . ::::::::.: CCDS41 YGCEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 -EDGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGHNPGLLVHPDLAY : :::.:..:::::.. : :::.::::::... :. .. . .:.. :: CCDS41 SELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLT------- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LQAEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSD .:: .:.: .. ::: : ::::.::: :.::: : :::. :.::.:. CCDS41 -EAE---QRELEQEAKEL--------KKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQ 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 AIYDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGF :.:::.:.:::::: :::.::: : ::.:.::::::::::::..::::..::: :..: CCDS41 PIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENG--WQAF 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 GDFSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKE :::::::::.:.::::.:: :. ..: .:..::.::.:: ..:. : : ::: ..::: CCDS41 GDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKE 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EVQRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGI ::::::.: .:.::. ::::: :.:.:: :. ::.:: :: : : ::. .. CCDS41 EVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLG----F----FPS--SL 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 TFHPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVG .. : .:.:: : :: . .. .. .. . .. .: .: .. CCDS41 AYSP--YQSGAG-------------PMGCYPGGGGGA--QMAATVPSRDSGEEAAEPSAP 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 NGEVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTA . : . . . . . ::.: : ::.::.::.:.. ::: :::: . CCDS41 ----SRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLT 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 VQDENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDV .::::::. ::::::: ......... : . ..:. : :.:::::::::: : .: CCDS41 AQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSV 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 VEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLA--AKEGHDKVLSILLKHKKAAL--LLDHPNGDGLN : :::.::: .:::: :.:..::: : : ..: ::. :. :: :. .:: CCDS41 VSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLY 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 AIHLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVD .:::. . : :: ::: .::.:.: :...::::::::.: ....:. :. . :.:. CCDS41 PVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVN 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 pF1KE2 STTYDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDL------DDSWENAGEDE . :. :.::::.::: : :. :: :::: .:: ::: : :.. .. : .. CCDS41 ARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEK 670 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 GVVP---GTTPLDMATSWQVFDIL-NG--KPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYK . : ::::.. : .: .: :. . .:: .: . : .:.. . .: . CCDS41 DTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPS--PAGPGLSLGDTALQNLEQ 730 740 750 760 770 780 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 LLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGY ::. :. . .:: ::..::: : ...: . .:: .:. .::..:: . :.::: .:: CCDS41 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL 790 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 TEAIEVIQAASSPVKTTSQAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTES :....... . : : CCDS41 EEGVRLLRGPETRDKLPSTEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH 850 860 870 880 890 >>CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 (900 aa) initn: 1724 init1: 463 opt: 923 Z-score: 571.6 bits: 117.1 E(32554): 1.6e-25 Smith-Waterman score: 2254; 44.9% identity (68.7% similar) in 895 aa overlap (26-902:20-860) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALP-TADGPYLQILEQPKQRGFRFR .: . .:. : ::::::: :.::::::::::: CCDS41 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 YVCEGPSHGGLPGASSEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHC : ::::::::::::::::..:.:: :::::: ::::. :.:::.. . ::::::::.: CCDS41 YGCEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 -EDGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGHNPGLLVHPDLAY : :::.:..:::::.. : :::.::::::... :. .. . .:.. :: CCDS41 SELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLT------- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LQAEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSD .:: .:.: .. ::: : ::::.::: :.::: : :::. :.::.:. CCDS41 -EAE---QRELEQEAKEL--------KKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQ 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 AIYDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGF :.:::.:.:::::: :::.::: : ::.:.::::::::::::..::::..::: :..: CCDS41 PIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENG--WQAF 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 GDFSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKE :::::::::.:.::::.:: :. ..: .:..::.::.:: ..:. : : ::: ..::: CCDS41 GDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKE 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 EVQRKRQKLMPNFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGI ::::::.: .:.::. ::::: :.:.:: :. ::.:: :: : : ::. .. CCDS41 EVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLG----F----FPS--SL 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 TFHPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVG .. : .:.:: : :: . .. .. .. . .. .: .: .. CCDS41 AYSP--YQSGAG-------------PMGCYPGGGGGA--QMAATVPSRDSGEEAAEPSAP 390 400 410 420 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 NGEVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAMQLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTA . : . . . . . ::.: : ::.::.::.:.. ::: :::: . CCDS41 ----SRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLT 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 VQDENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRNDLYQTPLHLAVITKQEDV .::::::. ::::::: ......... : . ..:. : :.:::::::::: : .: CCDS41 AQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSV 490 500 510 520 530 540 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 VEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLA--AKEGHDKVLSILLKHKKAAL--LLDHPNGDGLN : :::.::: .:::: :.:..::: : : ..: ::. :. :: :. .:: CCDS41 VSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLY 550 560 570 580 590 600 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 AIHLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVD .:::. . : :: ::: .::.:.: :...::::::::.: ....:. :. . :.:. CCDS41 PVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVN 610 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 pF1KE2 STTYDGTTPLHIAAGRGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDL------DDSWENAGEDE . :. :.::::.::: : :. :: :::: .:: ::: : :.. .. : .. CCDS41 ARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEK 670 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 GVVP---GTTPLDMATSWQVFDIL-NG--KPYEPEFTSDDLLAQGDMKQLAEDVKLQLYK . : ::::.. : .: .: :. . .:: .: . : .:.. . .: . CCDS41 DTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPS--PAGPGLSLGDTALQNLEQ 730 740 750 760 770 780 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 LLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTVRELVEALRQMGY ::. :. . .:: ::..::: : ...: . .:: .:. .::..:: . :.::: .:: CCDS41 LLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGL 790 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 TEAIEVIQAASSPVKTTSQAHSLPLSPASTRQQIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTES :....... . : : : CCDS41 EEGVRLLRGPETRDKLPSTAEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH 850 860 870 880 890 900 >>CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 (579 aa) initn: 756 init1: 269 opt: 529 Z-score: 338.4 bits: 73.3 E(32554): 1.6e-12 Smith-Waterman score: 755; 38.1% identity (60.4% similar) in 391 aa overlap (43-423:125-475) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 QMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTADGPYLQILEQPKQRGFRFRYVCEGPSHGGLPG :.: : :::::::.:::: ::: : :.. : CCDS46 LGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEGRSAGSILG 100 110 120 130 140 150 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 ASSEKNKKSYPQVKI--CNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGICTVTAGP :: . .:. : ... :. . ..: . :: . ..: :::::: : :::: : : CCDS46 ESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTDGICRVRLRP 160 170 180 190 200 210 140 150 160 170 180 pF1KE2 K-DMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGHNPGLLVHPDLAYLQAEGGGDRQL . . .: :::: : ::.. ..: : . : .: : CCDS46 HVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIE-RKIQLGIDPYNAG-------------------- 220 230 240 250 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 GDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSKAPNAS .:.. .:.:..:::. : : :. :.. ::..::.:. .::.:. :.: CCDS46 -----------SLKNHQEVDMNVVRICFQASYRDQQGQM-RRMDPVLSEPVYDKKSTNTS 260 270 280 290 300 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 NLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDVHRQ .:.: :... .: :::::.:::::::::.::.. : . . ::: .::: .::::: CCDS46 ELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVF-----SRASWEGRADFSQADVHRQ 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 FAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQKLMP .::::::: :.:..:..:..: : :.: .: ::: :: : :. .:. :..::.. :: CCDS46 IAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMP 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 ------NFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGS-TGPGYSFPHYGFPTYGGITFHP : :: : : ... . :.: :. .: : ..: . : CCDS46 DVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPFLPPSALLPDPDF--FSGTVSLP 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 GTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNGEV : CCDS46 GLEPPGGPDLLDDGFAYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPL 480 490 500 510 520 530 969 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:22:09 2016 done: Sun Nov 6 09:22:09 2016 Total Scan time: 4.870 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]