Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5507
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5507, 596 aa
1>>>pF1KB5507 596 - 596 aa - 596 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1519+/-0.000385; mu= 15.4663+/- 0.024
mean_var=108.9196+/-20.610, 0's: 0 Z-trim(115.2): 364 B-trim: 33 in 1/55
Lambda= 0.122891
statistics sampled from 25068 (25511) to 25068 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 11.080
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001040625 (OMIM: 606450) neuroepithelial cell-t ( 596) 3947 711.1 2.7e-204
NP_005854 (OMIM: 606450) neuroepithelial cell-tran ( 542) 3393 612.8 9.1e-175
XP_016861991 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 538) 1957 358.2 4e-98
XP_011532066 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 544) 1957 358.2 4e-98
XP_005265244 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 558) 1957 358.2 4.1e-98
XP_005265243 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 558) 1957 358.2 4.1e-98
NP_001122087 (OMIM: 612115) rho guanine nucleotide ( 558) 1957 358.2 4.1e-98
XP_011532068 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 527) 1954 357.7 5.7e-98
XP_011532067 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 527) 1954 357.7 5.7e-98
NP_001276627 (OMIM: 612115) rho guanine nucleotide ( 532) 1936 354.5 5.2e-97
NP_062455 (OMIM: 612115) rho guanine nucleotide ex ( 526) 1873 343.3 1.2e-93
NP_001122088 (OMIM: 612115) rho guanine nucleotide ( 532) 1867 342.3 2.5e-93
XP_016861993 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 463) 1697 312.1 2.7e-84
XP_016861992 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 483) 1697 312.1 2.8e-84
XP_016861994 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 451) 1613 297.2 8e-80
XP_016861995 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 457) 1607 296.1 1.7e-79
XP_011532069 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine ( 412) 1602 295.2 2.9e-79
XP_016883926 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1185) 366 76.4 5.9e-13
XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1608) 366 76.5 7.4e-13
XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1613) 366 76.5 7.5e-13
XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1645) 366 76.5 7.6e-13
XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1650) 366 76.5 7.6e-13
XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1679) 366 76.6 7.7e-13
XP_016883918 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1684) 366 76.6 7.7e-13
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1716) 366 76.6 7.8e-13
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 366 76.6 7.8e-13
XP_016883917 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1721) 366 76.6 7.8e-13
NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [ (1670) 316 67.7 3.6e-10
NP_006268 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 1 [ (1697) 316 67.7 3.6e-10
NP_079446 (OMIM: 612139) phosphatidylinositol 3,4, ( 979) 305 65.5 9.2e-10
XP_011515914 (OMIM: 612139) PREDICTED: phosphatidy (1157) 305 65.6 1e-09
NP_079146 (OMIM: 612139) phosphatidylinositol 3,4, (1606) 305 65.7 1.3e-09
NP_945328 (OMIM: 601855) rho guanine nucleotide ex ( 879) 293 63.4 3.7e-09
NP_004697 (OMIM: 601855) rho guanine nucleotide ex ( 912) 293 63.4 3.8e-09
NP_945353 (OMIM: 601855) rho guanine nucleotide ex ( 927) 293 63.4 3.9e-09
XP_005259447 (OMIM: 601855) PREDICTED: rho guanine ( 981) 293 63.4 4e-09
XP_011525770 (OMIM: 601855) PREDICTED: rho guanine ( 985) 293 63.4 4e-09
XP_005259443 (OMIM: 601855) PREDICTED: rho guanine (1041) 293 63.4 4.2e-09
NP_065871 (OMIM: 606905) phosphatidylinositol 3,4, (1659) 291 63.3 7.7e-09
XP_011529194 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 456) 282 61.2 8.7e-09
NP_001166950 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 463) 282 61.2 8.8e-09
XP_016884857 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 282 61.2 9.3e-09
XP_016884856 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 282 61.2 9.3e-09
NP_001317424 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 495) 282 61.2 9.3e-09
XP_005262307 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 282 61.2 9.3e-09
XP_005262308 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 495) 282 61.2 9.3e-09
NP_056000 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nucleo ( 516) 282 61.2 9.6e-09
XP_016884855 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 516) 282 61.2 9.6e-09
XP_011529192 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 516) 282 61.2 9.6e-09
XP_016884854 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 516) 282 61.2 9.6e-09
>>NP_001040625 (OMIM: 606450) neuroepithelial cell-trans (596 aa)
initn: 3947 init1: 3947 opt: 3947 Z-score: 3788.9 bits: 711.1 E(85289): 2.7e-204
Smith-Waterman score: 3947; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB5 VSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPGIRRARDKALSGGKRKETLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPGIRRARDKALSGGKRKETLV
550 560 570 580 590
>>NP_005854 (OMIM: 606450) neuroepithelial cell-transfor (542 aa)
initn: 3393 init1: 3393 opt: 3393 Z-score: 3258.6 bits: 612.8 E(85289): 9.1e-175
Smith-Waterman score: 3393; 97.5% identity (98.3% similar) in 529 aa overlap (68-596:14-542)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 SELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLAR
:: . :: . : . .::::::::::::
NP_005 MVAHDETGGLLPIKRTIRVLDVNNQSFREQEEPSNKRVRPLAR
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWS
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 DQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQ
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 LLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKS
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFS
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPE
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 LHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPG
470 480 490 500 510 520
580 590
pF1KB5 IRRARDKALSGGKRKETLV
:::::::::::::::::::
NP_005 IRRARDKALSGGKRKETLV
530 540
>>XP_016861991 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine nuc (538 aa)
initn: 1918 init1: 1693 opt: 1957 Z-score: 1882.7 bits: 358.2 E(85289): 4e-98
Smith-Waterman score: 1957; 62.5% identity (87.3% similar) in 456 aa overlap (47-499:5-459)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN-WDFT-LKRKRREKDD
.: ..: . :.:. :.: :::. .:.
XP_016 MPKRQRQNNFP-MFPSPKAWNFRGRKRKQSTQDE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 DVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPA
:.::: :::..:::::::.::.::::::::: ::. ..::.::.: :...:.. :
XP_016 DAVSLCSLDISEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDI
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 SAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDL
: . ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.::::::
XP_016 LAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHIL
:::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: ::
XP_016 KLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPIL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRS
:.::: :..: .:::::.:::::::.:::: :::::::::::::::::::::.:::::::
XP_016 VGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRS
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 RLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLD
:::::::::.:::.:::...:: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.
XP_016 RLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 EKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPV
: :.: :..:.:: :::::... : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::
XP_016 EGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPV
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 QELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWF
..:.:::::::.::.:::.::::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.
XP_016 KDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWL
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 NCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENA
:::: :
XP_016 NCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSE
460 470 480 490 500 510
>>XP_011532066 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine nuc (544 aa)
initn: 1918 init1: 1693 opt: 1957 Z-score: 1882.6 bits: 358.2 E(85289): 4e-98
Smith-Waterman score: 1957; 62.5% identity (87.3% similar) in 456 aa overlap (47-499:11-465)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 SRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN-WDFT-LKRKRREKDD
.: ..: . :.:. :.: :::. .:.
XP_011 MFDRNIWPKRQRQNNFP-MFPSPKAWNFRGRKRKQSTQDE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 DVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPA
:.::: :::..:::::::.::.::::::::: ::. ..::.::.: :...:.. :
XP_011 DAVSLCSLDISEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDI
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 SAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDL
: . ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.::::::
XP_011 LAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 KLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHIL
:::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: ::
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: :.: :..:.:: :::::... : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::
XP_011 EGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPV
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:::: :
XP_011 NCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSE
460 470 480 490 500 510
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.: ..: . :.:. :.: :::. .:.
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:::: :
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>>XP_005265243 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine nuc (558 aa)
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.: ..: . :.:. :.: :::. .:.
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pF1KB5 KLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHIL
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XP_005 KLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPIL
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pF1KB5 VSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRS
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XP_005 EGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPV
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pF1KB5 QELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWF
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:::: :
XP_005 NCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSE
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>>NP_001122087 (OMIM: 612115) rho guanine nucleotide exc (558 aa)
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pF1KB5 SRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN-WDFT-LKRKRREKDD
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NP_001 DAVSLCSLDISEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDI
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pF1KB5 SAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDL
: . ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.::::::
NP_001 LAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDL
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pF1KB5 KLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHIL
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NP_001 KLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPIL
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260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRS
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NP_001 VGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRS
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pF1KB5 RLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLD
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NP_001 RLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLE
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pF1KB5 EKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPV
: :.: :..:.:: :::::... : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::
NP_001 EGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPV
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NP_001 KDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWL
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pF1KB5 NCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENA
:::: :
NP_001 NCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSE
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>>XP_011532068 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine nuc (527 aa)
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>>XP_011532067 (OMIM: 612115) PREDICTED: rho guanine nuc (527 aa)
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Smith-Waterman score: 1954; 63.2% identity (87.7% similar) in 448 aa overlap (55-499:1-448)
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pF1KB5 TEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN-WDFT-LKRKRREKDDDVVSLSSL
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pF1KB5 DPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLN
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XP_011 DPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLS
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pF1KB5 AYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLL
.: .:::::.:::::::.:::: :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
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pF1KB5 LKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRI
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