FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6729, 1085 aa 1>>>pF1KE6729 1085 - 1085 aa - 1085 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6298+/-0.00113; mu= 19.8640+/- 0.067 mean_var=69.2106+/-14.276, 0's: 0 Z-trim(103.0): 40 B-trim: 9 in 1/48 Lambda= 0.154166 statistics sampled from 7176 (7207) to 7176 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16 Scan time: 3.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10855.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1085) 7215 1614.7 0 CCDS54030.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1079) 6952 1556.2 0 CCDS54031.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1054) 6944 1554.4 0 CCDS54032.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1087) 6720 1504.6 0 CCDS42012.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1091) 5563 1247.3 0 CCDS42011.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1141) 5563 1247.3 0 CCDS58352.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1150) 5563 1247.3 0 CCDS10036.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1099) 5556 1245.7 0 CCDS42010.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1135) 5544 1243.1 0 CCDS34129.1 SLC12A7 gene_id:10723|Hs108|chr5 (1083) 5057 1134.8 0 CCDS46610.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1139) 4642 1042.5 0 CCDS13391.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1116) 4627 1039.1 0 CCDS58965.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1196) 628 149.7 3.6e-35 CCDS59069.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 538) 613 146.2 1.8e-34 CCDS45491.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1029) 577 138.3 8.3e-32 CCDS10770.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1030) 577 138.3 8.3e-32 CCDS58464.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1021) 545 131.2 1.1e-29 CCDS4144.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1212) 405 100.1 3.1e-20 CCDS53940.1 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099) 389 96.5 3.4e-19 CCDS10129.2 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099) 384 95.4 7.3e-19 CCDS59068.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 631) 379 94.2 9.8e-19 CCDS5707.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 914) 379 94.3 1.4e-18 CCDS43143.1 SLC12A8 gene_id:84561|Hs108|chr3 ( 714) 281 72.4 4e-12 >>CCDS10855.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16 (1085 aa) initn: 7215 init1: 7215 opt: 7215 Z-score: 8663.2 bits: 1614.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7215; 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100.0% identity (100.0% similar) in 1015 aa overlap (71-1085:73-1087) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 GNHRESSPFLSPLEASRGIDYYDRNLALFEEELDIRPKVSSLLGKLVSYTNLTQGAKEHE :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 WTGRGAATMTTSRGSVGWTTGSAPSWMTRTEELDIRPKVSSLLGKLVSYTNLTQGAKEHE 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 EAESGEGTRRRAAEAPSMGTLMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWMVGTAGVLQALLIVLIC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 EAESGEGTRRRAAEAPSMGTLMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWMVGTAGVLQALLIVLIC 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 CCCTLLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRSLGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 CCCTLLTAISMSAIATNGVVPAGGSYFMISRSLGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGA 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 IEILLTYIAPPAAIFYPSGAHDTSNATLNNMRVYGTIFLTFMTLVVFVGVKYVNKFASLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 IEILLTYIAPPAAIFYPSGAHDTSNATLNNMRVYGTIFLTFMTLVVFVGVKYVNKFASLF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 LACVIISILSIYAGGIKSIFDPPVFPVCMLGNRTLSRDQFDICAKTAVVDNETVATQLWS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 LACVIISILSIYAGGIKSIFDPPVFPVCMLGNRTLSRDQFDICAKTAVVDNETVATQLWS 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 FFCHSPNLTTDSCDPYFMLNNVTEIPGIPGAAAGVLQENLWSAYLEKGDIVEKHGLPSAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FFCHSPNLTTDSCDPYFMLNNVTEIPGIPGAAAGVLQENLWSAYLEKGDIVEKHGLPSAD 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE6 APSLKESLPLYVVADIATSFTVLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIPVGTILAII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 APSLKESLPLYVVADIATSFTVLVGIFFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIPVGTILAII 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE6 TTSLVYFSSVVLFGACIEGVVLRDKYGDGVSRNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCGAGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 TTSLVYFSSVVLFGACIEGVVLRDKYGDGVSRNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCGAGL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE6 QSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHGKVNGEPTWALLLTALIAELGILIASLDMVAPI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 QSLTGAPRLLQAIAKDNIIPFLRVFGHGKVNGEPTWALLLTALIAELGILIASLDMVAPI 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE6 LSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKYYHWALSFLGMSLCLALMFVSSWYYALV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 LSMFFLMCYLFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFKYYHWALSFLGMSLCLALMFVSSWYYALV 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE6 AMLIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 AMLIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLLKL 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE6 DEDLHVKYPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIQGSFLESYGEAQAAEQTIKNMMEIEKVKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 DEDLHVKYPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIQGSFLESYGEAQAAEQTIKNMMEIEKVKG 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KE6 FCQVVVASKVREGLAHLIQSCGLGGMRHNSVVLGWPYGWRQSEDPRAWKTFIDTVRCTTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FCQVVVASKVREGLAHLIQSCGLGGMRHNSVVLGWPYGWRQSEDPRAWKTFIDTVRCTTA 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE6 AHLALLVPKNIAFYPSNHERYLEGHIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 AHLALLVPKNIAFYPSNHERYLEGHIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRQHKVWRKCRMRIFT 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KE6 VAQMDDNSIQMKKDLAVFLYHLRLEAEVEVVEMHNSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 VAQMDDNSIQMKKDLAVFLYHLRLEAEVEVVEMHNSDISAYTYERTLMMEQRSQMLRQMR 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 pF1KE6 LTKTEREREAQLVKDRHSALRLESLYSDEEDESAVGADKIQMTWTRDKYMTETWDPSHAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 LTKTEREREAQLVKDRHSALRLESLYSDEEDESAVGADKIQMTWTRDKYMTETWDPSHAP 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE6 DNFRELVHIKPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVTRSHDARLVLLNMPGPPRNSEGDENYMEFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 DNFRELVHIKPDQSNVRRMHTAVKLNEVIVTRSHDARLVLLNMPGPPRNSEGDENYMEFL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE6 EVLTEGLERVLLVRGGGREVITIYS ::::::::::::::::::::::::: CCDS54 EVLTEGLERVLLVRGGGREVITIYS 1070 1080 >>CCDS42012.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15 (1091 aa) initn: 5528 init1: 3874 opt: 5563 Z-score: 6677.4 bits: 1247.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5563; 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CCDS42 MSEMSGATTSLATVALDPPSDRTSHPQDVIEDLSQNSITGEHSQLLD-DGHKKARNA--Y 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 LSPLEASRGIDYYDRNLALFEEELDIRPKVSSLLGKLVSYTNLTQGAKEHEEAESGEGTR :. . .: .:.:.::::::::.: ::::::::.....:::::::::::::::. . CCDS42 LNNSNYEEGDEYFDKNLALFEEEMDTRPKVSSLLNRMANYTNLTQGAKEHEEAENITEGK 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 RRAAEAPSMGTLMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWMVGTAGVLQALLIVLICCCCTLLTAI .. ...:.:::.::::::::::::::::::::::.:::::::::. :::::::::.:::: CCDS42 KKPTKTPQMGTFMGVYLPCLQNIFGVILFLRLTWVVGTAGVLQAFAIVLICCCCTMLTAI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 SMSAIATNGVVPAGGSYFMISRSLGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEILLTYIA ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:.::. CCDS42 SMSAIATNGVVPAGGSYFMISRALGPEFGGAVGLCFYLGTTFAAAMYILGAIEIFLVYIV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 PPAAIFYPSGAHDTSNATLNNMRVYGTIFLTFMTLVVFVGVKYVNKFASLFLACVIISIL : ::::. . : : : ::::::::: ::..:.::::.::.::::::::::::::.::: CCDS42 PRAAIFHSDDALKESAAMLNNMRVYGTAFLVLMVLVVFIGVRYVNKFASLFLACVIVSIL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 SIYAGGIKSIFDPPVFPVCMLGNRTLSRDQFDICAKTAVVDNETVATQLWSFFCHSPNLT .::::.::: : :: :::::::::::: ..:.:.:: ..: :: ..::.:::.: .. 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CCDS34 DLQMFLYHLRISAEVEVVEMVENDISAFTYERTLMMEQRSQMLKQMQLSKNEQEREAQLI 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE6 KDRHSALRLESLYSDEEDESAVGADKIQMTWTRDKYMTETWDPSHAP-DNFRELVHIKPD .::..: . . . . ::.::::::.: ..: . . ..:..: .::: CCDS34 HDRNTASHTAAAARTQAPPTP---DKVQMTWTREKLIAEKYRSRDTSLSGFKDLFSMKPD 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE6 QSNVRRMHTAVKLNEVIVTRSHDARLVLLNMPGPPRNSEGDENYMEFLEVLTEGLERVLL :::::::::::::: :....:.::.::::::::::.: .::::::::::::::::.:::: CCDS34 QSNVRRMHTAVKLNGVVLNKSQDAQLVLLNMPGPPKNRQGDENYMEFLEVLTEGLNRVLL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE6 VRGGGREVITIYS ::::::::::::: CCDS34 VRGGGREVITIYS 1080 1085 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:47:01 2016 done: Tue Nov 8 15:47:02 2016 Total Scan time: 3.480 Total Display time: 0.470 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]