Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1086
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1086, 2644 aa
1>>>pF1KE1086 2644 - 2644 aa - 2644 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64092750 residues in 91774 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1053+/-0.000608; mu= 21.6287+/- 0.038
mean_var=75.2155+/-15.185, 0's: 0 Z-trim(104.7): 104 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.147884
statistics sampled from 13350 (13450) to 13350 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.459), E-opt: 0.2 (0.147), width: 16
Scan time: 12.670
The best scores are: opt bits E(91774)
NP_001175 (OMIM: 210600,601215,614564) serine/thre (2644) 17465 3737.6 0
XP_011511226 (OMIM: 210600,601215,614564) serine/t (2646) 17451 3734.7 0
NP_001341508 (OMIM: 210600,601215,614564) serine/t (2580) 14149 3030.2 0
XP_011511227 (OMIM: 210600,601215,614564) serine/t (2582) 14135 3027.2 0
XP_006718908 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (1708) 739 169.1 5.3e-40
XP_011541147 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (2620) 739 169.1 7.8e-40
XP_011541146 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (2708) 739 169.1 8e-40
XP_011541144 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3001) 739 169.1 8.8e-40
XP_006718906 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3056) 739 169.1 8.9e-40
XP_016873278 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3056) 739 169.1 8.9e-40
NP_000042 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-prot (3056) 739 169.1 8.9e-40
NP_001338763 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3056) 739 169.1 8.9e-40
XP_005271619 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3056) 739 169.1 8.9e-40
XP_011541142 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3056) 739 169.1 8.9e-40
XP_016873279 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (3056) 739 169.1 8.9e-40
XP_016856390 (OMIM: 601231,607341,616638) serine/t (2133) 625 144.8 1.4e-32
XP_016856389 (OMIM: 601231,607341,616638) serine/t (2322) 625 144.8 1.5e-32
NP_004949 (OMIM: 601231,607341,616638) serine/thre (2549) 625 144.8 1.6e-32
XP_005263495 (OMIM: 601231,607341,616638) serine/t (2549) 625 144.8 1.6e-32
XP_024301955 (OMIM: 601231,607341,616638) serine/t (2549) 625 144.8 1.6e-32
NP_055907 (OMIM: 607032) serine/threonine-protein (3661) 485 115.0 2.2e-23
XP_011541145 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (2912) 476 113.0 6.7e-23
NP_008835 (OMIM: 600899,615966) DNA-dependent prot (4128) 306 76.8 7.6e-12
XP_011544072 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3059) 257 66.3 8.1e-09
XP_016878556 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3059) 257 66.3 8.1e-09
XP_024305967 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3611) 257 66.3 9.4e-09
XP_024305966 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3611) 257 66.3 9.4e-09
XP_005255241 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3637) 257 66.3 9.5e-09
XP_016878555 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3663) 257 66.3 9.5e-09
XP_005255240 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3663) 257 66.3 9.5e-09
XP_011544071 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3688) 257 66.3 9.6e-09
XP_005255239 (OMIM: 607032) serine/threonine-prote (3689) 257 66.3 9.6e-09
NP_003487 (OMIM: 603015,618454) transformation/tra (3830) 253 65.5 1.8e-08
NP_001231509 (OMIM: 603015,618454) transformation/ (3859) 253 65.5 1.8e-08
NP_001075109 (OMIM: 600899,615966) DNA-dependent p (4097) 247 64.2 4.6e-08
XP_016873280 (OMIM: 114480,208900,607585) serine-p (2158) 203 54.7 1.7e-05
NP_001308309 (OMIM: 603601,618440) phosphatidylino (1306) 172 48.1 0.0011
XP_011518488 (OMIM: 603601,618440) phosphatidylino (1630) 172 48.1 0.0013
NP_001308307 (OMIM: 603601,618440) phosphatidylino (1686) 172 48.1 0.0014
XP_016873413 (OMIM: 603601,618440) phosphatidylino (1686) 172 48.1 0.0014
NP_002636 (OMIM: 603601,618440) phosphatidylinosit (1686) 172 48.1 0.0014
NP_001242974 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 ( 582) 164 46.2 0.0017
XP_016862110 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 ( 657) 164 46.3 0.0019
XP_024309365 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 ( 674) 164 46.3 0.0019
XP_016874968 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4 ( 817) 164 46.3 0.0023
XP_024309364 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 ( 996) 164 46.3 0.0028
NP_006210 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4,5- (1070) 164 46.3 0.0029
XP_006713722 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 (1070) 164 46.3 0.0029
XP_011511197 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 (1070) 164 46.3 0.0029
XP_005247587 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 (1070) 164 46.3 0.0029
>>NP_001175 (OMIM: 210600,601215,614564) serine/threonin (2644 aa)
initn: 17465 init1: 17465 opt: 17465 Z-score: 20122.5 bits: 3737.6 E(91774): 0
Smith-Waterman score: 17465; 100.0% identity (100.0% similar) in 2644 aa overlap (1-2644:1-2644)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QLDEHMGYLQSAPLQLMSMQNLEFIEVTLLTVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYG
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLDEHMGYLQSAPLQLMSMQNLEFIEVTLLMVLTRIIAIVFFRRQELLLWQIGCVLLEYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SPKIKSLAISFLTELFQLGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPKIKSLAISFLTELFQLGGLPAQPASTFFSSFLELLKHLVEMDTDQLKLYEEPLSKLIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLLEKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAG
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NP_001 TLFPFEAEAYRNIEPVYLNMLLEKLCVMFEDGVLMRLKSDLLKAALCHLLQYFLKFVPAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEVDAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENL
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NP_001 YESALQVRKVYVRNICKALLDVLGIEVDAEYLLGPLYAALKMESMEIIEEIQCQTQQENL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIKHVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSNSDGISPKRRRLSSSLNPSKRAPKQTEEIKHVDMNQKSILWSALKQKAESLQISLEYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 GLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLKNPVIEMLEGIAVVLQLTALCTVHCSHQNMNCRTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSFEDHILEDLCGMLSLPWIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKVLKSCRSLLESVQKLDLEATIDKVVKIYDALIYMQVNSSFEDHILEDLCGMLSLPWIY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 SHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRIFLEWRTAVYNWAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHSDDGCLKLTTFAANLLTLSCRISDSYSPQAQSRCVFLLTLFPRRIFLEWRTAVYNWAL
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSSHEVIRASCVSGFFILLQQQNSCNRVPKILIDKVKDDSDIVKKEFASILGQLVCTLHG
670 680 690 700 710 720
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pF1KE1 MFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSPVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFYLTSSLTEPFSEHGHVDLFCRNLKATSQHECSSSQLKASVCKPFLFLLKKKIPSPVKL
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pF1KE1 AFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFIDNLHHLCKHLDFREDETDVKAVLGTLLNLMEDPDKDVRVAFSGNIKHILESLDSEDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIKELFVLRMKEAYTHAQISRNNELKDTLILTTGDIGRAAKGDLVPFALLHLLHCLLSKS
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pF1KE1 ASVSGAAYTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASVSGAAYTEIRALVAAKSVKLQSFFSQYKKPICQFLVESLHSSQMTALPNTPCQNADVR
910 920 930 940 950 960
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pF1KE1 KQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQDVAHQREMALNTLSEIANVFDFPDLNRFLTRTLQVLLPDLAAKASPAASALIRTLGKQ
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 LNVNRREILINNFKYIFSHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNVNRREILINNFKYIFSHLVCSCSKDELERALHYLKNETEIELGSLLRQDFQGLHNELL
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pF1KE1 LRIGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRIGEHYQQVFNGLSILASFASSDDPYQGPRDIISPELMADYLQPKLLGILAFFNMQLLS
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pF1KE1 SSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHVSSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSVGIEDKKMALNSLMSLMKLMGPKHVSSVRVKMMTTLRTGLRFKDDFPELCCRAWDCFV
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 RCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAAIFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCLDHACLGSLLSHVIVALLPLIHIQPKETAAIFHYLIIENRDAVQDFLHEIYFLPDHPE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KE1 LKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENVDVRIHALTSLKETLYKNQEKLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKKIKAVLQEYRKETSESTDLQTTLQLSMKAIQHENVDVRIHALTSLKETLYKNQEKLIK
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pF1KE1 YATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YATDSETVEPIISQLVTVLLKGCQDANSQARLLCGECLGELGAIDPGRLDFSTTETQGKD
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pF1KE1 FTFVTGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDCREMETNGPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTFVTGVEDSSFAYGLLMELTRAYLAYADNSRAQDSAAYAIQELLSIYDCREMETNGPGH
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE1 QLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLWRRFPEHVREILEPHLNTRYKSSQKSTDWSGVKKPIYLSKLGSNFAEWSASWAGYLIT
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pF1KE1 KVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAVLKHDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVRHDLASKIFTCCSIMMKHDFKVTIYLLPHILVYVLLGCNQEDQQEVYAEIMAVLKHDD
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE1 QHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHTINTQDIASDLCQLSTQTVFSMLDHLTQWARHKFQALKAEKCPHSKSNRNKVDSMVST
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KE1 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQKLY
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pF1KE1 AAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHGVV
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE1 KSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKSTTW
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1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE1 SVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLCEL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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pF1KE1 EHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNEMV
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE1 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
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NP_001 ELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHF
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NP_001 TPYM
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XP_011 STVDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFLQK
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XP_011 LYAAMHEPDGVAGVSAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIHYHG
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XP_011 VVKSMLGLGQLSTVITQVNGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAADGKST
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XP_011 TWSVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRGYEYIVRLHMLC
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XP_011 ELEHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRALLSLNKRPDYNE
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pF1KE1 MVGECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQK
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XP_011 MVGECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQK
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pF1KE1 GVELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDG
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XP_011 GVELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDG
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XP_011 HFYLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYG
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XP_011 VLMEIIAKVFLAYPQQAMWMMTAVSKSSYPMRVNRCKEILNKAIHMKKSLEKFVGDATRL
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XP_011 TDKLLELCNKPVDGSSSTLSMSTHFKMLKKLVEEATFSEILIPLQSVMIPTLPSILGTHA
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XP_011 NHASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQKPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRL
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pF1KE1 GWTPYM
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XP_011 GWTPYM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 GECWLQSARVARKAGHHQTAYNALLNAGESRLAELYVERAKWLWSKGDVHQALIVLQKGV
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NP_001 ELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGRFMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPEWEDGHF
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NP_001 YLAKYYDKLMPMVTDNKMEKQGDLIRYIVLHFGRSLQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYGTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 NGMGPMGTEGLFRRACEVTMRLMRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEWSKPVKGHSKAPLNET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEVVNEKAKTHVLDIEQRLQGVIKTRNRVTGLPLSIEGHVHYLIQEATDENLLCQMYLGW
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pF1KE1 TPYM
::::
NP_001 TPYM
2580
>>XP_011511227 (OMIM: 210600,601215,614564) serine/threo (2582 aa)
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pF1KE1 MGEHGLELASMIPALRELGSATPEEYNTVVQKPRQILCQFIDRILTDVNVVAVELVKKTD
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pF1KE1 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
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XP_011 SQPTSVMLLDFIQHIMKSSPLMFVNVSGSHEAKGSCIEFSNWIITRLLRIAATPSCHLLH
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XP_011 KKICEVICSLLFLFKSKSPAIFGVLTKELLQLFEDLVYLHRRNVMGHAVEWPVVMSRFLS
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XP_011 ----------------------------------RTFKDCQHKSKKKPSVVITWMSLDFY
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