FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1151, 486 aa 1>>>pF1KE1151 486 - 486 aa - 486 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8819+/-0.000441; mu= 7.2122+/- 0.027 mean_var=225.2093+/-46.754, 0's: 0 Z-trim(118.9): 261 B-trim: 1545 in 1/55 Lambda= 0.085464 statistics sampled from 32124 (32415) to 32124 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16 Scan time: 11.010 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 1349 179.5 1.8e-44 NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 1319 175.8 2.3e-43 XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 1306 174.2 7.1e-43 NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 1159 156.1 2.1e-37 NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 1084 146.8 1.3e-34 XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1084 146.8 1.3e-34 XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1084 146.8 1.3e-34 XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1084 146.8 1.3e-34 NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 1084 146.8 1.3e-34 XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 1003 136.8 1.2e-31 NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 851 118.1 5.7e-26 NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 851 118.1 5.9e-26 NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 771 108.2 5.3e-23 NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 771 108.2 5.3e-23 NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 759 106.8 1.5e-22 NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494) 755 106.3 2.1e-22 NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 744 104.9 5.3e-22 XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 744 104.9 5.3e-22 XP_016873951 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 300) 736 103.7 7.6e-22 NP_149084 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 326) 736 103.7 8e-22 XP_005253241 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 326) 736 103.7 8e-22 NP_149083 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 347) 736 103.8 8.3e-22 NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 726 102.7 2.3e-21 NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262) 721 101.8 2.5e-21 NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498) 717 101.6 5.4e-21 XP_016873952 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 702 99.4 1.3e-20 XP_006718421 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 702 99.4 1.3e-20 XP_011518728 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 702 99.5 1.4e-20 XP_016873950 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 702 99.5 1.4e-20 XP_011518729 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 271) 673 95.9 1.5e-19 XP_016873949 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 314) 668 95.3 2.6e-19 NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 665 95.2 4.7e-19 NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270) 656 93.8 6.6e-19 XP_011542587 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 391) 656 94.0 8.4e-19 NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 630 90.7 7.1e-18 NP_001017922 (OMIM: 111620,111750,609017) erythroi ( 475) 622 89.9 1.8e-17 XP_011538872 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 475) 622 89.9 1.8e-17 XP_006710376 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 475) 622 89.9 1.8e-17 NP_061008 (OMIM: 111620,111750,609017) erythroid m ( 475) 622 89.9 1.8e-17 NP_835226 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein liga ( 487) 613 88.8 3.9e-17 NP_001268380 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 487) 613 88.8 3.9e-17 XP_011514091 (OMIM: 612548) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 486) 608 88.1 5.9e-17 NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486) 608 88.1 5.9e-17 XP_011538873 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 468) 606 87.9 6.8e-17 NP_006501 (OMIM: 602165) zinc finger protein RFP [ ( 513) 592 86.2 2.4e-16 XP_011512533 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 313) 584 85.0 3.4e-16 NP_001184168 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily ( 313) 584 85.0 3.4e-16 XP_016865656 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 407) 584 85.1 4.1e-16 XP_005248855 (OMIM: 613591) PREDICTED: butyrophili ( 407) 584 85.1 4.1e-16 NP_853509 (OMIM: 613591) butyrophilin subfamily 2 ( 407) 584 85.1 4.1e-16 >>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa) initn: 1300 init1: 1026 opt: 1349 Z-score: 919.3 bits: 179.5 E(85289): 1.8e-44 Smith-Waterman score: 1349; 44.5% identity (71.2% similar) in 479 aa overlap (1-468:1-472) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC :: : . :.. ::.::: . ::::..:::::: .:::. ..:: .:: : NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV------GKGGGSVCPVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGAR--RCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC : : ...:::::::..:....... : :.. ::: ::: : :::.: :::::: NP_003 RQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ . .:: : .::.::: :: :::.:: .:.. : : :.... : . ::. :: : NP_003 AQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE ..:.. :: ....::..::::::..:: .:: :. : :....:.:::.::.:: .::.. NP_003 KSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA ::. :: ::. : :: ::.. . . . ::...: .:: ...:: : . ::: NP_003 RCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW ::.: :.:. : :.:. :. ...:.: ::::..: .:: : : ::.::::: : : NP_003 TANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-IGIFLDY ::::.:.. :::. . : ..: :..:: . ..: . . :..:: .:. : : .:::::: NP_003 DLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPL-HLQVPPCQVGIFLDY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 EAGEISFYNVTD-GSYIYTFNQL-FSGLLRPYF---FI---CDATPLILPPTTIAGSGNW ::: .::::.:: :: ::.:.. :.: :::.: : ...:: : : .:...:. NP_003 EAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGST 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 ASRDHLDPASDVRDDHL NP_003 DY >>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa) initn: 1304 init1: 999 opt: 1319 Z-score: 899.4 bits: 175.8 E(85289): 2.3e-43 Smith-Waterman score: 1319; 45.5% identity (66.9% similar) in 475 aa overlap (1-468:1-463) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC :: . :.:.: : .:::.. .:: .::::.:: .:: . : : : ::::.: NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC : .: : ..:::: :: ..: .::: . : : : :. :: .. :: .: NP_660 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ . . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...::: .:.. . :.:.. :: : NP_660 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE :: :::. : .::.:::. :.::: :: .: ::::. ..: ::: : :: ::. 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NP_660 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 480 pF1KE1 HLDPASDVRDDHL >>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa) initn: 1267 init1: 696 opt: 1306 Z-score: 890.7 bits: 174.2 E(85289): 7.1e-43 Smith-Waterman score: 1306; 45.5% identity (66.7% similar) in 475 aa overlap (1-468:1-462) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC :: . :.:.: : .:::.. .:: .::::.:: .:: . : : : ::::.: XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC : .: : ..:::: :: ..: .::: . : : : :. :: .. :: .: XP_016 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ . . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...::: .:.. . :.:. :: : XP_016 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQM-VESQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE :: :::. : .::.:::. :.::: :: .: ::::. ..: ::: : :: ::. XP_016 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA ::: ::::::. .. .: : . : : .::::.:.: .:: : ::.:. :: ::: XP_016 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW ::.: :.:. : :::: :. . .:..::::: ::.:: . :.:::::::: ::. . : XP_016 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYE .::::.... :: . : :: : : .: :. : .:: . :: .::::::: XP_016 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAPLR--DPPRRVGIFLDYE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 AGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTI----AGSGNWASRD ::..:::..:::: .. : .. ::: ::: : ...: : :: .:::. XP_016 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 480 pF1KE1 HLDPASDVRDDHL >>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa) initn: 1131 init1: 480 opt: 1159 Z-score: 792.5 bits: 156.1 E(85289): 2.1e-37 Smith-Waterman score: 1159; 40.4% identity (68.1% similar) in 470 aa overlap (8-461:21-485) 10 20 30 40 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKS : :. .: : :::..:.::: ..:::.:: ::... : NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE-- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 DGAQGGVYACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLS : . . :: :: : ..::::::...:: ...: .. : : .: : :: NP_742 DLERD--FPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ-AVKRKIRDESLCPQHHEALS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 RFCEEDEAALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANV :: ::. :.: .: . ::.: ..::..:. :. ::: :: ....:.. ... NP_742 LFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 GKKTVIWKEKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQ :: :. :: .::.. :::. . : .:.: : ::: ::. ::::::. ..: . NP_742 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 QSKALKELADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMEL-KTACCIPGR- . . : .:: :.. .: . .. .:. :...: . . : .:. .. .:: :. .: . NP_742 KRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQY 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE1 ---RELLRKFQVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEP-WRDVPNNPERFDTWPCILGL :..:... .:: ::: ::::.:.:. : .::. : ::.:..:.:: .::.:. NP_742 FALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLAT 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 QSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASP ..:.:::::::: ::. ..:..:::.:.. :::: : ::.: : . : .:..: . ..: NP_742 EGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTP 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 SVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFIC------D .:: .:. .::::::::: .::::::: :.::::.. :. : : :. . NP_742 FTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKN 420 430 440 450 460 470 460 470 480 pF1KE1 ATPL-ILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASDVRDDHL :.:: : ::: NP_742 AAPLTIRPPTDWE 480 >>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa) initn: 982 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 742.7 bits: 146.8 E(85289): 1.3e-34 Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY .:.:.: : .:::.. .:: . :::.:: ::. ::. : .: : . NP_057 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA ::.:: .. ::: :. ..: ... :: .. : .: : :. ::..:.. NP_057 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK .: :: . ::: ::. : .::. .:..::. .: .:... . . .: .. . :. NP_057 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKEL ::. .:.:. ::::: .:..:::: :. ::.::. : .::::: . : .:...:. : NP_057 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIP-MELKTACCIPGRRELLRKFQV .:.:: . : .:. .. :::.. :. : : . .:.: .::. :.:: : NP_057 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLL-TADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEV :: : ..:.: ::: . : . : . . .:: ..:: .: .:::::::::: NP_057 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ---LVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLES ..:. : :.::::.:.. :: .. :::: :.. : ::..:. : .:.. .: NP_057 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQ-LFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGS : .:::::.::::.:::.:.:::...:..: : : :.:.: : ..: NP_057 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTVT 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 GNWASRDHLDPASDVRDDHL NP_057 MWVKG >>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 982 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 742.7 bits: 146.8 E(85289): 1.3e-34 Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY .:.:.: : .:::.. .:: . :::.:: ::. ::. : .: : . XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA ::.:: .. ::: :. ..: ... :: .. : .: : :. ::..:.. XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK .: :: . ::: ::. : .::. .:..::. .: .:... . . .: .. . :. XP_011 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKEL ::. .:.:. ::::: .:..:::: :. ::.::. : .::::: . : .:...:. : XP_011 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIP-MELKTACCIPGRRELLRKFQV .:.:: . : .:. .. :::.. :. : : . .:.: .::. :.:: : XP_011 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLL-TADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEV :: : ..:.: ::: . : . : . . .:: ..:: .: .:::::::::: XP_011 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ---LVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLES ..:. : :.::::.:.. :: .. :::: :.. : ::..:. : .:.. .: XP_011 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQ-LFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGS : .:::::.::::.:::.:.:::...:..: : : :.:.: : ..: XP_011 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTVT 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 GNWASRDHLDPASDVRDDHL XP_011 MWVKG >>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 982 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 742.7 bits: 146.8 E(85289): 1.3e-34 Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY .:.:.: : .:::.. .:: . :::.:: ::. ::. : .: : . XP_006 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA ::.:: .. ::: :. ..: ... :: .. : .: : :. ::..:.. XP_006 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK .: :: . ::: ::. : .::. .:..::. .: .:... . . .: .. . :. XP_006 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKEL ::. .:.:. ::::: .:..:::: :. ::.::. : .::::: . : .:...:. : XP_006 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIP-MELKTACCIPGRRELLRKFQV .:.:: . : .:. .. :::.. :. : : . .:.: .::. :.:: : XP_006 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLL-TADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEV :: : ..:.: ::: . : . : . . .:: ..:: .: .:::::::::: XP_006 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ---LVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLES ..:. : :.::::.:.. :: .. :::: :.. : ::..:. : .:.. .: XP_006 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQ-LFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGS : .:::::.::::.:::.:.:::...:..: : : :.:.: : ..: XP_006 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTVT 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 GNWASRDHLDPASDVRDDHL XP_006 MWVKG >>XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 982 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 742.7 bits: 146.8 E(85289): 1.3e-34 Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY .:.:.: : .:::.. .:: . :::.:: ::. ::. : .: : . XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA ::.:: .. ::: :. ..: ... :: .. : .: : :. ::..:.. XP_011 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK .: :: . ::: ::. : .::. .:..::. .: .:... . . .: .. . :. XP_011 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKEL ::. .:.:. ::::: .:..:::: :. ::.::. : .::::: . : .:...:. : XP_011 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIP-MELKTACCIPGRRELLRKFQV .:.:: . : .:. .. :::.. :. : : . .:.: .::. :.:: : XP_011 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLL-TADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEV :: : ..:.: ::: . : . : . . .:: ..:: .: .:::::::::: XP_011 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ---LVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLES ..:. : :.::::.:.. :: .. :::: :.. : ::..:. : .:.. .: XP_011 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQ-LFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGS : .:::::.::::.:::.:.:::...:..: : : :.:.: : ..: XP_011 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTVT 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 GNWASRDHLDPASDVRDDHL XP_011 MWVKG >>NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas (477 aa) initn: 982 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 742.7 bits: 146.8 E(85289): 1.3e-34 Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY .:.:.: : .:::.. .:: . :::.:: ::. ::. : .: : . NP_001 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA ::.:: .. ::: :. ..: ... :: .. : .: : :. ::..:.. NP_001 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK .: :: . ::: ::. : .::. .:..::. .: .:... . . .: .. . :. 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