Result of FASTA (omim) for pFN21AB5139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5139, 567 aa
  1>>>pF1KB5139 567 - 567 aa - 567 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0023+/-0.000423; mu= 0.8156+/- 0.027
 mean_var=404.2775+/-81.434, 0's: 0 Z-trim(123.8): 1913  B-trim: 0 in 0/60
 Lambda= 0.063787
 statistics sampled from 42195 (44320) to 42195 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.52), width:  16
 Scan time: 12.750

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1158 121.1 1.9e-26
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1158 121.1 1.9e-26
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1158 121.1 1.9e-26
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1158 121.1 1.9e-26
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1158 121.1 1.9e-26
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1155 120.6 1.9e-26
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1155 120.7 1.9e-26
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1148 120.0 3.1e-26
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1148 120.1 3.3e-26
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1148 120.1 3.3e-26
NP_001007089 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 620) 1107 116.1 3.4e-25
NP_001171570 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 639) 1107 116.1 3.5e-25
NP_008893 (OMIM: 314993) zinc finger protein 182 i ( 639) 1107 116.1 3.5e-25
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1088 114.3 1.1e-24
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1087 114.5 1.8e-24
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1087 114.5 1.8e-24
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 1087 114.5 1.8e-24
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1080 113.5 1.8e-24
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1087 114.6 1.8e-24
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1087 114.6 1.8e-24
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1087 114.6 1.8e-24
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1087 114.6 1.9e-24
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1080 113.6 1.9e-24
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1080 113.6 1.9e-24
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1080 113.6 1.9e-24
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1081 113.8   2e-24
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1081 113.8   2e-24
NP_003399 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ho ( 630) 1079 113.5 2.1e-24
NP_001269447 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 631) 1079 113.5 2.1e-24
NP_001269444 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 645) 1079 113.5 2.1e-24
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1081 113.8 2.1e-24
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1081 113.8 2.1e-24


>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (782 aa)
 initn: 4174 init1: 730 opt: 1155  Z-score: 596.0  bits: 120.6 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1287; 35.5% identity (60.7% similar) in 547 aa overlap (23-565:183-691)

                       10        20        30            40        
pF1KB5         MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTL----GKESRGLRQQGTSVAQS
                                     : :. :...    .:. . : . .  . . 
NP_001 LPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRR
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       50        60        70        80        90       100        
pF1KB5 GAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHA
        :.. :. ..: .: . :     :  : :  ... :  : :::. :     :..:. .:.
NP_001 KANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHT
            220       230       240       250       260       270  

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pF1KB5 AATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCH
       .  :   . :: ::. ::    :. : : :.. : :  : .: . :  ...: .: .  :
NP_001 GEKP---YKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEK-PYKCNECGKAFRGHSNLTTH-QLIH
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pF1KB5 PPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPG
             .:: :..::. :.: ..:..: :.:..:   .    . .   :.  :.      
NP_001 TGE---KPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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pF1KB5 GDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTG
       :.   .:..:  ::: ::..  :  ::::::::.:..: :::: :. .  :..:. ::::
NP_001 GE---KPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTG
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      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 EKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVP
        ::. :.::.. : .. .: .: .::              . . :   .: .   .    
NP_001 TKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIH--------------TGEKPYKCNECGKAFSVRSS
             450       460                     470       480       

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pF1KB5 LKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAEC
       :   :    :  :             :.: .::.::  .  ::.:.  :.::.:. : ::
NP_001 LTTHQAIHSGEKP-------------YKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNEC
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pF1KB5 GKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAF
       :: :.. ..:. : :::.::.:. :..::: ::. : :. :.  :. ..:. : .:::.:
NP_001 GKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVF
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pF1KB5 RHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKS
       ::. :::.::::::::::: : .::::::..:::..:. :::::.:: : .: . :.:.:
NP_001 RHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNS
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pF1KB5 NLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV                     
       .: .:...:  .  . :  ::..:. .  : .::  :                       
NP_001 HLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLAN
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NP_001 HRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRM
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>--
 initn: 613 init1: 403 opt: 403  Z-score: 222.0  bits: 51.4 E(85289): 1.3e-05
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pF1KB5 QHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAP
                                     .:..:. :.:::. :.:..::: ::: :. 
NP_001 THTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTG
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pF1KB5 DRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPY
       ..:. : .:::::: .  :..:  :::::: : : .:::.: :.:::.::.:.::::.::
NP_001 EKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPY
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pF1KB5 ACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
                                                           
NP_001 K                                                   
                                                           

>>NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (782 aa)
 initn: 4174 init1: 730 opt: 1155  Z-score: 596.0  bits: 120.6 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1287; 35.5% identity (60.7% similar) in 547 aa overlap (23-565:183-691)

                       10        20        30            40        
pF1KB5         MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTL----GKESRGLRQQGTSVAQS
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NP_001 LPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRR
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pF1KB5 GAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHA
        :.. :. ..: .: . :     :  : :  ... :  : :::. :     :..:. .:.
NP_001 KANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHT
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NP_001 GEKP---YKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEK-PYKCNECGKAFRGHSNLTTH-QLIH
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NP_001 TGE---KPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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      230       240       250       260       270       280        
pF1KB5 GDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTG
       :.   .:..:  ::: ::..  :  ::::::::.:..: :::: :. .  :..:. ::::
NP_001 GE---KPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTG
             390       400       410       420       430       440 

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 EKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVP
        ::. :.::.. : .. .: .: .::              . . :   .: .   .    
NP_001 TKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIH--------------TGEKPYKCNECGKAFSVRSS
             450       460                     470       480       

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pF1KB5 LKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAEC
       :   :    :  :             :.: .::.::  .  ::.:.  :.::.:. : ::
NP_001 LTTHQAIHSGEKP-------------YKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNEC
       490       500                    510       520       530    

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pF1KB5 GKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAF
       :: :.. ..:. : :::.::.:. :..::: ::. : :. :.  :. ..:. : .:::.:
NP_001 GKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVF
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pF1KB5 RHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKS
       ::. :::.::::::::::: : .::::::..:::..:. :::::.:: : .: . :.:.:
NP_001 RHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNS
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pF1KB5 NLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV                     
       .: .:...:  .  . :  ::..:. .  : .::  :                       
NP_001 HLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLAN
          660       670       680       690       700       710    

NP_001 HRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRM
          720       730       740       750       760       770    

>--
 initn: 613 init1: 403 opt: 403  Z-score: 222.0  bits: 51.4 E(85289): 1.3e-05
Smith-Waterman score: 403; 55.6% identity (82.2% similar) in 90 aa overlap (426-515:692-781)

         400       410       420       430       440       450     
pF1KB5 QHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAP
                                     .:..:. :.:::. :.:..::: ::: :. 
NP_001 THTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTG
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pF1KB5 DRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPY
       ..:. : .:::::: .  :..:  :::::: : : .:::.: :.:::.::.:.::::.::
NP_001 EKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPY
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pF1KB5 ACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
                                                           
NP_001 K                                                   
                                                           

>>NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (782 aa)
 initn: 4174 init1: 730 opt: 1155  Z-score: 596.0  bits: 120.6 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1287; 35.5% identity (60.7% similar) in 547 aa overlap (23-565:183-691)

                       10        20        30            40        
pF1KB5         MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTL----GKESRGLRQQGTSVAQS
                                     : :. :...    .:. . : . .  . . 
NP_001 LPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRR
            160       170       180       190       200       210  

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pF1KB5 GAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHA
        :.. :. ..: .: . :     :  : :  ... :  : :::. :     :..:. .:.
NP_001 KANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHT
            220       230       240       250       260       270  

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB5 AATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCH
       .  :   . :: ::. ::    :. : : :.. : :  : .: . :  ...: .: .  :
NP_001 GEKP---YKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEK-PYKCNECGKAFRGHSNLTTH-QLIH
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pF1KB5 PPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPG
             .:: :..::. :.: ..:..: :.:..:   .    . .   :.  :.      
NP_001 TGE---KPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
       330          340       350       360       370       380    

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pF1KB5 GDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTG
       :.   .:..:  ::: ::..  :  ::::::::.:..: :::: :. .  :..:. ::::
NP_001 GE---KPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTG
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pF1KB5 EKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVP
        ::. :.::.. : .. .: .: .::              . . :   .: .   .    
NP_001 TKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIH--------------TGEKPYKCNECGKAFSVRSS
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pF1KB5 LKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAEC
       :   :    :  :             :.: .::.::  .  ::.:.  :.::.:. : ::
NP_001 LTTHQAIHSGEKP-------------YKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNEC
       490       500                    510       520       530    

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pF1KB5 GKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAF
       :: :.. ..:. : :::.::.:. :..::: ::. : :. :.  :. ..:. : .:::.:
NP_001 GKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVF
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pF1KB5 RHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKS
       ::. :::.::::::::::: : .::::::..:::..:. :::::.:: : .: . :.:.:
NP_001 RHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNS
          600       610       620       630       640       650    

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pF1KB5 NLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV                     
       .: .:...:  .  . :  ::..:. .  : .::  :                       
NP_001 HLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLAN
          660       670       680       690       700       710    

NP_001 HRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRM
          720       730       740       750       760       770    

>--
 initn: 613 init1: 403 opt: 403  Z-score: 222.0  bits: 51.4 E(85289): 1.3e-05
Smith-Waterman score: 403; 55.6% identity (82.2% similar) in 90 aa overlap (426-515:692-781)

         400       410       420       430       440       450     
pF1KB5 QHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAP
                                     .:..:. :.:::. :.:..::: ::: :. 
NP_001 THTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTG
             670       680       690       700       710       720 

         460       470       480       490       500       510     
pF1KB5 DRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPY
       ..:. : .:::::: .  :..:  :::::: : : .:::.: :.:::.::.:.::::.::
NP_001 EKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPY
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pF1KB5 ACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
                                                           
NP_001 K                                                   
                                                           

>>NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [H  (1059 aa)
 initn: 6195 init1: 729 opt: 1158  Z-score: 596.0  bits: 121.1 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1292; 37.9% identity (61.3% similar) in 514 aa overlap (55-565:516-1016)

           30        40        50        60        70        80    
pF1KB5 QESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLP
                                     . ..: .: . :     :  : :   .. :
NP_001 KTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKP
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pF1KB5 LPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRP
         : :: . : :   :..:..::..  :   . :. ::.::    ::  : : :.. : :
NP_001 YECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP---YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEK-P
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pF1KB5 IACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEAL
         :  ::. : . . :::: .: :      .:. :..::::::. . : ::.:.:..:  
NP_001 YECSDCEKTFAHNSALRAH-HRIHTG---EKPYECNECGRSFAHISVLKAHQRIHTGEKP
             610       620           630       640       650       

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pF1KB5 EEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPH
        :   .  :       :. : .    .  .:..:. : : : :.  :  :.:.::::.:.
NP_001 YEC--NECGRSFTYNSALRAHQRIHTG-RKPYECSDCEKTFAHNSALKIHQRIHTGEKPY
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pF1KB5 QCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIH---KRSEGSA
       .: :: : :...  : .:. :::::: : :.:::. : .:  : .: .::   :  : : 
NP_001 ECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQKTRLSTHRRIHTGEKPYECSK
          720       730       740       750       760       770    

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pF1KB5 QAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCG
        .     .  : .  .  ..:      .        .:   : .  :..  . : :..::
NP_001 CGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAALIVHQR--IHTGEKPYECNQCG
          780       790       800       810         820       830  

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pF1KB5 RSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFS
       ..:  .  : :::: ::::.:. : ::::.:. .. : :: :.:.::.:. :..::. ::
NP_001 KTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTFS
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pF1KB5 QGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSN
       . ::: :: : .. ..:. : .:::.: .: :..::.:.::::::: :  ::: :...:.
NP_001 KTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHTGEKPYECNVCGKPFAHNST
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pF1KB5 LVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAH
       :  :.::::::. : : :: ..:::::.: .:.. :  .  . :  ::..: ..  : .:
NP_001 LRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRVH
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pF1KB5 QKKHDV                                         
       :. :                                           
NP_001 QRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLACNGFGKS
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NP_149 KTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKP
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         : :: . : :   :..:..::..  :   . :. ::.::    ::  : : :.. : :
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         :  ::. : . . :::: .: :      .:. :..::::::. . : ::.:.:..:  
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        :   .  :       :. : .    .  .:..:. : : : :.  :  :.:.::::.:.
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       .: :: : :...  : .:. :::::: : :.:::. : .:  : .: .::   :  : : 
NP_149 ECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQKTRLSTHRRIHTGEKPYECSK
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        .     .  : .  .  ..:      .        .:   : .  :..  . : :..::
NP_149 CGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAALIVHQR--IHTGEKPYECNQCG
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       ..:  .  : :::: ::::.:. : ::::.:. .. : :: :.:.::.:. :..::. ::
NP_149 KTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTFS
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pF1KB5 QGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSN
       . ::: :: : .. ..:. : .:::.: .: :..::.:.::::::: :  ::: :...:.
NP_149 KTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHTGEKPYECNVCGKPFAHNST
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pF1KB5 LVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAH
       :  :.::::::. : : :: ..:::::.: .:.. :  .  . :  ::..: ..  : .:
NP_149 LRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRVH
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pF1KB5 QKKHDV                                         
       :. :                                           
NP_149 QRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLACNGFGKS
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         : :: . : :   :..:..::..  :   . :. ::.::    ::  : : :.. : :
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pF1KB5 IACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEAL
         :  ::. : . . :::: .: :      .:. :..::::::. . : ::.:.:..:  
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pF1KB5 EEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPH
        :   .  :       :. : .    .  .:..:. : : : :.  :  :.:.::::.:.
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pF1KB5 QCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIH---KRSEGSA
       .: :: : :...  : .:. :::::: : :.:::. : .:  : .: .::   :  : : 
XP_016 ECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQKTRLSTHRRIHTGEKPYECSK
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pF1KB5 QAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCG
        .     .  : .  .  ..:      .        .:   : .  :..  . : :..::
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pF1KB5 RSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFS
       ..:  .  : :::: ::::.:. : ::::.:. .. : :: :.:.::.:. :..::. ::
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pF1KB5 QGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSN
       . ::: :: : .. ..:. : .:::.: .: :..::.:.::::::: :  ::: :...:.
XP_016 KTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHTGEKPYECNVCGKPFAHNST
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pF1KB5 LVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAH
       :  :.::::::. : : :: ..:::::.: .:.. :  .  . :  ::..: ..  : .:
XP_016 LRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRVH
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pF1KB5 QKKHDV                                         
       :. :                                           
XP_016 QRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLACNGFGKS
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>>XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger pro  (1059 aa)
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pF1KB5 QESPQTLGKESRGLRQQGTSVAQSGAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLP
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XP_011 KTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKP
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pF1KB5 LPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRP
         : :: . : :   :..:..::..  :   . :. ::.::    ::  : : :.. : :
XP_011 YECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP---YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEK-P
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pF1KB5 IACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEAL
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pF1KB5 QCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIH---KRSEGSA
       .: :: : :...  : .:. :::::: : :.:::. : .:  : .: .::   :  : : 
XP_011 ECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQKTRLSTHRRIHTGEKPYECSK
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pF1KB5 QAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCG
        .     .  : .  .  ..:      .        .:   : .  :..  . : :..::
XP_011 CGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAALIVHQR--IHTGEKPYECNQCG
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pF1KB5 RSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFS
       ..:  .  : :::: ::::.:. : ::::.:. .. : :: :.:.::.:. :..::. ::
XP_011 KTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTFS
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pF1KB5 QGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSN
       . ::: :: : .. ..:. : .:::.: .: :..::.:.::::::: :  ::: :...:.
XP_011 KTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHTGEKPYECNVCGKPFAHNST
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pF1KB5 LVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAH
       :  :.::::::. : : :: ..:::::.: .:.. :  .  . :  ::..: ..  : .:
XP_011 LRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRVH
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pF1KB5 QKKHDV                                         
       :. :                                           
XP_011 QRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLACNGFGKS
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>>XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger pro  (1059 aa)
 initn: 6195 init1: 729 opt: 1158  Z-score: 596.0  bits: 121.1 E(85289): 1.9e-26
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           30        40        50        60        70        80    
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                                     . ..: .: . :     :  : :   .. :
XP_005 KTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTGEKP
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pF1KB5 LPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHAAATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRP
         : :: . : :   :..:..::..  :   . :. ::.::    ::  : : :.. : :
XP_005 YECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKP---YECNDCGKSFTYNSALRAHQRIHTGEK-P
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pF1KB5 IACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCHPPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEAL
         :  ::. : . . :::: .: :      .:. :..::::::. . : ::.:.:..:  
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pF1KB5 EEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPGGDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPH
        :   .  :       :. : .    .  .:..:. : : : :.  :  :.:.::::.:.
XP_005 YEC--NECGRSFTYNSALRAHQRIHTG-RKPYECSDCEKTFAHNSALKIHQRIHTGEKPY
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pF1KB5 QCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTGEKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIH---KRSEGSA
       .: :: : :...  : .:. :::::: : :.:::. : .:  : .: .::   :  : : 
XP_005 ECNECEKTFAHNSALRAHQNIHTGEKLYECSECGKTFFQKTRLSTHRRIHTGEKPYECSK
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pF1KB5 QAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVPLKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCG
        .     .  : .  .  ..:      .        .:   : .  :..  . : :..::
XP_005 CGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAALIVHQR--IHTGEKPYECNQCG
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pF1KB5 RSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFS
       ..:  .  : :::: ::::.:. : ::::.:. .. : :: :.:.::.:. :..::. ::
XP_005 KTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTFS
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pF1KB5 QGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSN
       . ::: :: : .. ..:. : .:::.: .: :..::.:.::::::: :  ::: :...:.
XP_005 KTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHTGEKPYECNVCGKPFAHNST
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pF1KB5 LVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAH
       :  :.::::::. : : :: ..:::::.: .:.. :  .  . :  ::..: ..  : .:
XP_005 LRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRVH
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pF1KB5 QKKHDV                                         
       :. :                                           
XP_005 QRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLACNGFGKS
           1020      1030      1040      1050         

>>NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (818 aa)
 initn: 4174 init1: 730 opt: 1155  Z-score: 595.8  bits: 120.6 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1287; 35.5% identity (60.7% similar) in 547 aa overlap (23-565:219-727)

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pF1KB5         MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTL----GKESRGLRQQGTSVAQS
                                     : :. :...    .:. . : . .  . . 
NP_001 LPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRR
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pF1KB5 GAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHA
        :.. :. ..: .: . :     :  : :  ... :  : :::. :     :..:. .:.
NP_001 KANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHT
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pF1KB5 AATPDLGFACHLCGQSFRGWVALVLHLRAHSAAKRPIACPKCERRFWRRKQLRAHLRRCH
       .  :   . :: ::. ::    :. : : :.. : :  : .: . :  ...: .: .  :
NP_001 GEKP---YKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEK-PYKCNECGKAFRGHSNLTTH-QLIH
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pF1KB5 PPAPEARPFICGNCGRSFAQWDQLVAHKRVHVAEALEEAAAKALGPRPRGRPAVTAPRPG
             .:: :..::. :.: ..:..: :.:..:   .    . .   :.  :.      
NP_001 TGE---KPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHT
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pF1KB5 GDAVDRPFQCACCGKRFRHKPNLIAHRRVHTGERPHQCPECGKRFTNKPYLTSHRRIHTG
       :.   .:..:  ::: ::..  :  ::::::::.:..: :::: :. .  :..:. ::::
NP_001 GE---KPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTG
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pF1KB5 EKPYPCKECGRRFRHKPNLLSHSKIHKRSEGSAQAAPGPGSPQLPAGPQESAAEPTPAVP
        ::. :.::.. : .. .: .: .::              . . :   .: .   .    
NP_001 TKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIH--------------TGEKPYKCNECGKAFSVRSS
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pF1KB5 LKPAQEPPPGAPPEHPQDPIEAPPSLYSCDDCGRSFRLERFLRAHQRQHTGERPFTCAEC
       :   :    :  :             :.: .::.::  .  ::.:.  :.::.:. : ::
NP_001 LTTHQAIHSGEKP-------------YKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNEC
           530                    540       550       560       570

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pF1KB5 GKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAPDRPFVCPDCGKAF
       :: :.. ..:. : :::.::.:. :..::: ::. : :. :.  :. ..:. : .:::.:
NP_001 GKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVF
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pF1KB5 RHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPYACPDCDRSFSQKS
       ::. :::.::::::::::: : .::::::..:::..:. :::::.:: : .: . :.:.:
NP_001 RHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNS
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pF1KB5 NLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV                     
       .: .:...:  .  . :  ::..:. .  : .::  :                       
NP_001 HLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLAN
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NP_001 HRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRM
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>--
 initn: 613 init1: 403 opt: 403  Z-score: 221.8  bits: 51.4 E(85289): 1.3e-05
Smith-Waterman score: 403; 55.6% identity (82.2% similar) in 90 aa overlap (426-515:728-817)

         400       410       420       430       440       450     
pF1KB5 QHTGERPFTCAECGKNFGKKTHLVAHSRVHSGERPFACEECGRRFSQGSHLAAHRRDHAP
                                     .:..:. :.:::. :.:..::: ::: :. 
NP_001 THTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTG
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pF1KB5 DRPFVCPDCGKAFRHKPYLAAHRRIHTGEKPYVCPDCGKAFSQKSNLVSHRRIHTGERPY
       ..:. : .:::::: .  :..:  :::::: : : .:::.: :.:::.::.:.::::.::
NP_001 EKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPY
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pF1KB5 ACPDCDRSFSQKSNLITHRKSHIRDGAFCCAICGQTFDDEERLLAHQKKHDV
                                                           
NP_001 K                                                   
                                                           

>>NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is  (818 aa)
 initn: 4174 init1: 730 opt: 1155  Z-score: 595.8  bits: 120.6 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1287; 35.5% identity (60.7% similar) in 547 aa overlap (23-565:219-727)

                       10        20        30            40        
pF1KB5         MLERRCRGPLAMGLAQPRLLSGPSQESPQTL----GKESRGLRQQGTSVAQS
                                     : :. :...    .:. . : . .  . . 
NP_001 LPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRR
      190       200       210       220       230       240        

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pF1KB5 GAQAPGRAHRCAHCRRHFPGWVALWLHTRRCQARLPLPCPECGRRFRHAPFLALHRQVHA
        :.. :. ..: .: . :     :  : :  ... :  : :::. :     :..:. .:.
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>--
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NP_001 K                                                   
                                                           




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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