Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4894
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4894, 407 aa
1>>>pF1KB4894 407 - 407 aa - 407 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2516+/-0.000726; mu= 12.7456+/- 0.044
mean_var=84.3207+/-16.807, 0's: 0 Z-trim(110.8): 11 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.139671
statistics sampled from 11876 (11883) to 11876 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12370.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 ( 407) 2741 561.8 4.1e-160
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CCDS72876.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 ( 391) 891 189.0 6.5e-48
CCDS81368.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 ( 336) 776 165.8 5.4e-41
CCDS7049.1 ARRDC1 gene_id:92714|Hs108|chr9 ( 433) 346 79.2 8.2e-15
>>CCDS12370.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 (407 aa)
initn: 2741 init1: 2741 opt: 2741 Z-score: 2988.1 bits: 561.8 E(32554): 4.1e-160
Smith-Waterman score: 2741; 100.0% identity (100.0% similar) in 407 aa overlap (1-407:1-407)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLAPDTGETTTLPPGRHEFLFSFQLPPTLVTSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKVARSWYCN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGARKQKRAVV
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSKLLLELPL
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAALGQSPFP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNPLLGDMRPRCMTC
370 380 390 400
>>CCDS32956.1 ARRDC2 gene_id:27106|Hs108|chr19 (402 aa)
initn: 2315 init1: 2184 opt: 2330 Z-score: 2540.6 bits: 479.0 E(32554): 3.4e-135
Smith-Waterman score: 2330; 86.6% identity (93.3% similar) in 402 aa overlap (6-407:6-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLFDKVKAFSVQLDGATAGVEPVFSGGQAVAGRVLLELSSAARVGALRLRARGRAHVHWT
:..:...: . .:. . ::. . :::::: .. :: ::...::: : .::
CCDS32 MRSGGVRSFALELARGPGGA---YRGGERLCGRVLLEAAAPLRVRALEVKARGGAATHWL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLAPDTGETTTLPPGRHEFLFSFQLPPTLVTSF
:.::.: . : ...:. .:. .: :: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGRSVGVN-AVSSDYAA-AETYLRRRQLLLRDTGETTTLPPGRHEFLFSFQLPPTLVTSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKVARSWYCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKVARSWYCN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGARKQKRAVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGARKQKRAVV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSKLLLELPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSKLLLELPL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAALGQSPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAALGQSPFP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400
pF1KB4 LPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNPLLGDMRPRCMTC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNPLLGDMRPRCMTC
360 370 380 390 400
>>CCDS34202.1 ARRDC3 gene_id:57561|Hs108|chr5 (414 aa)
initn: 1434 init1: 951 opt: 1449 Z-score: 1580.9 bits: 301.5 E(32554): 9.7e-82
Smith-Waterman score: 1449; 53.6% identity (78.9% similar) in 412 aa overlap (1-404:1-411)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLFDKVKAFSVQLDGATAGVEPVFSGGQAVAGRVLLELSSAARVGALRLRARGRAHVHWT
:.. :::......: . . ::.:.:..:.::: ::... :: .:...:::.:.:.::
CCDS34 MVLGKVKSLTISFDCLNDSNVPVYSSGDTVSGRVNLEVTGEIRVKSLKIHARGHAKVRWT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB4 ESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLA----PDTGETT--TLPPGRHEFLFSFQLPP
:::.:::.:::::.:.:.:: .:. :.. :..: :. ::::. :::.::
CCDS34 ESRNAGSNTAYTQNYTEEVEYFNHKDILIGHERDDDNSEEGFHTIHSGRHEYAFSFELPQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 T-LVTSFEGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKV
: :.:::::.:::::: .:: :::::. . .: :::.: .:::::.::.::::..::.
CCDS34 TPLATSFEGRHGSVRYWVKAELHRPWLLPVKLKKEFTVFEHIDINTPSLLSPQAGTKEKT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ARSWYCNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGAR
:.:. : .::::::.:::::::: : .::::.: :.: :.:.::. :::.:.:.:
CCDS34 LCCWFCTSGPISLSAKIERKGYTPGESIQIFAEIENCSSRMVVPKAAIYQTQAFYAKGKM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KQKRAVVASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSK
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CCDS34 KEVKQLVANLRGESLSSGKTETWNGKLLKIPPVSPSILDCSIIRVEYSLMVYVDIPGAMD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LLLELPLVIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAA
:.:.::::::::::::::::.:::.:. :. ..: .::::::::: :.:::.. :.
CCDS34 LFLNLPLVIGTIPLHPFGSRTSSVSSQCSMNMNWLSLSLPERPEAPPSYAEVVTE-EQRR
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB4 LGQSPFPLPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNP-LLGDMRPRCMTC
. .: .: . .:.::.::::::::. ::::::: :::: .: :: :
CCDS34 NNLAPVSACDDFERALQGPLFAYIQEFRFLPPPLYSEIDPNPDQSADDRPSCPSR
360 370 380 390 400 410
>>CCDS10377.1 ARRDC4 gene_id:91947|Hs108|chr15 (418 aa)
initn: 1140 init1: 843 opt: 1200 Z-score: 1309.7 bits: 251.3 E(32554): 1.2e-66
Smith-Waterman score: 1200; 48.1% identity (73.4% similar) in 395 aa overlap (5-395:16-405)
10 20 30 40
pF1KB4 MLFDKVKAFSVQLDGATAGVEPVFSGGQAVAGRVLLELSSAARVGALRL
.::.... .. : .:.:..:::.:::: : . . ::::
CCDS10 MGGEAGCAAAVGAEGRVKSLGLVFEDERKG---CYSSGETVAGHVLLEASEPVALRALRL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 RARGRAHVHWTESRS--AGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLAPDTGE-TTTLPPGRHEF
.:.::: . : : :..::: .:: :: .. : .: : .:: : ::.:::
CCDS10 EAQGRATAAWGPSTCPRASASTAALAVFSE-VEYLNVRLSLREPPAGEGIILLQPGKHEF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LFSFQLPPT-LVTSFEGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAP
: :::: ::::: ::.::..::..:.:.:: :: . ... . :. ::.::::::.:
CCDS10 PFRFQLPSEPLVTSFTGKYGSIQYCVRAVLERPKVPDQSVKRELQVVSHVDVNTPALLTP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 QAGAREKVARSWYCNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQ
..::.. :. . : :::::::.:::: ::.::..:::.: :.: ..:.::. :::
CCDS10 VLKTQEKMVGCWFFTSGPVSLSAKIERKGYCNGEAIPIYAEIENCSSRLIVPKAAIFQTQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TFMARGARKQKRAVVASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVC
:..: : : : .::.. :. .. :. :.:..:.:::: :::: : ...:::.: :
CCDS10 TYLASGKTKTIRHMVANVRGNHIASGSTDTWNGKTLKIPPVTPSILDCCIIRVDYSLAVY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 VDIPGTSKLLLELPLVIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEV
. :::..::.::::::::::: . ::::.::..:. :. ..: .:::.:::::.:..:
CCDS10 IHIPGAKKLMLELPLVIGTIPYNGFGSRNSSIASQFSMDMSWLTLTLPEQPEAPPNYADV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 VADTEEAALGQSPFPLPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNPLLGDMRPRCM
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CCDS10 VSE-EEFSRHIPPYPQPPNCEGEVCCPVFACIQEFRFQPPPLYSEVDPHPSDVEESQPVS
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 TC
CCDS10 FIL
>>CCDS72876.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 (391 aa)
initn: 808 init1: 529 opt: 891 Z-score: 973.7 bits: 189.0 E(32554): 6.5e-48
Smith-Waterman score: 891; 38.6% identity (66.2% similar) in 399 aa overlap (1-393:2-383)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MLFDKVKAFSVQLDGATAGVEPVFSGGQAVAGRVLLELSSAARVGALRLRARGRAHVHW
..: :.:.: : .. : :...:. :::::..:. ..:: :.:. : : :.: :
CCDS72 MVMFKKIKSFEVVFNDP----EKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRILACGVAKVLW
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLAPD--TGETTTL---PPGRHEFLFSFQLPP
. :: :. .. : . .. ::: : :::. . : ...:. :.:.::
CCDS72 MQ----GS-----QQCKQTSEYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQ
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 -TLVTSFEGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEPVDINTPALLAPQAGAREKV
: :::.::.: : : .:: : :: :.....: : :.. ::.::: :.:: .. .::
CCDS72 GPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVVDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ARSWYCNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPRAAVVQTQTFMARGAR
. . : ::.::.:::::. :. : . :...: .: :.:.::.: .:..: :
CCDS72 VSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KQKRAVVASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCRVLHVDYALKVCVDIPGTSK
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CCDS72 KVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYSLLIYVSVPGSKK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB4 LLLELPLVIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPERPEAPPEYSEVVADTEEAA
..:.::::::. ..::.::..:..: ..: .:. ::::: : .:. :.
CCDS72 VILDLPLVIGS--RSGLSSRTSSMASRTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDVIP--EDHR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB4 LGQSPFPLPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPNPLLGDMRPRCMTC
: . :: .: : : ..:.: : ::.. ::: :.: ::
CCDS72 LESPTTPLLDDMDGSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCILNNNVQ
350 360 370 380 390
>>CCDS81368.1 TXNIP gene_id:10628|Hs108|chr1 (336 aa)
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Smith-Waterman score: 776; 39.5% identity (67.5% similar) in 329 aa overlap (73-393:5-328)
50 60 70 80 90
pF1KB4 RVGALRLRARGRAHVHWTESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLAP----DTGET--
.: :.: ..: :.:.: .::.
CCDS81 MPPKHSLSHRC-ILSVTASLMATRFSFPSGENEM
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 TTLPPG-RHEFLFSFQLPP-TLVTSFEGKHGSVRYCIKATLHRPWVPARRARKVFTVIEP
. . :: ..:. :.:.:: : :::.::.: : : .:: : :: :.....: : :..
CCDS81 VIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVVDL
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 VDINTPALLAPQAGAREKVARSWYCNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRP
::.::: :.:: .. .:: . . : ::.::.:::::. :. : . :...: .:
CCDS81 VDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRI
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 VLPRAAVVQTQTFMARGARKQKRAVVASLAGEPVGPGQRALWQGRALRIPPVGPSILHCR
:.:.::.: .:..: : : ..:. :. . : : :.:..::. . :::: :
CCDS81 VVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCN
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 VLHVDYALKVCVDIPGTSKLLLELPLVIGTIPLHPFGSRSSSVGSHASFLLDWRLGALPE
.:.:.:.: . :..::..:..:.::::::. ..::.::..:..: ..: .:.
CCDS81 ILRVEYSLLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGS--RSGLSSRTSSMASRTSSEMSWVDLNIPD
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 RPEAPPEYSEVVADTEEAALGQSPFPLPQDPDMSLEGPFFAYIQEFRYRPPPLYSEEDPN
::::: : .:. :. : . :: .: : : ..:.: : ::.. ::: :.: ::
CCDS81 TPEAPPCYMDVIP--EDHRLESPTTPLLDDMDGSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPC
280 290 300 310 320
400
pF1KB4 PLLGDMRPRCMTC
CCDS81 ILNNNVQ
330
>>CCDS7049.1 ARRDC1 gene_id:92714|Hs108|chr9 (433 aa)
initn: 161 init1: 136 opt: 346 Z-score: 379.4 bits: 79.2 E(32554): 8.2e-15
Smith-Waterman score: 390; 27.1% identity (53.0% similar) in 413 aa overlap (5-406:3-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLFDKVKAFSVQLDGATAGVEPVFSGGQAVAGRVLLELSSAARVGALRLRARGRAHVHWT
.:. : ..:. . . :.: :. .:: : ..:.. :.:. : :
CCDS70 MGRVQLFEISLSHGRV----VYSPGEPLAGTVRVRLGAPLPFRAIRVTCIGSCGVS--
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ESRSAGSSTAYTQSYSERVEVVSHRATLLAPDTGETTTLPPGRHEFLFSFQLPPTLVTSF
. ...::.. :: ..: : : .:: :.: : :.: :: : :::
CCDS70 ---NKANDTAWV------VEEGYFNSSLSLADKG---SLPAGEHSFPFQFLLPATAPTSF
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB4 EGKHGSVRYCIKATLHRP-WVPARRARKVFTVIEPVDINT-PALLAPQAGAREKVARSWY
:: :.. . ..:..: : . .. :: .. :...:. : . :.... :
CCDS70 EGPFGKIVHQVRAAIHTPRFSKDHKCSLVFYILSPLNLNSIPDIEQPNVASATKKFSYKL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 CNRGLVSLSAKIDRKGYTPGEVIPVFAEIDNGSTRPVLPR-AAVVQTQTFMARGARKQKR
. : : :.:. : .::. :... . :...: : . . : :...: .. :. .. :
CCDS70 VKTGSVVLTASTDLRGYVVGQALQLHADVENQSGKDTSPVVASLLQKVSYKAKRWIHDVR
170 180 190 200 210 220
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