Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0896
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0896, 330 aa
1>>>pF1KE0896 330 - 330 aa - 330 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2003+/-0.000433; mu= 22.5009+/- 0.027
mean_var=102.7747+/-29.344, 0's: 0 Z-trim(111.3): 356 B-trim: 1142 in 1/48
Lambda= 0.126512
statistics sampled from 19350 (19855) to 19350 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 7.020
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 1186 227.5 2.8e-59
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 1186 227.5 2.8e-59
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 1186 227.6 2.8e-59
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 1147 220.4 3.9e-57
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 1134 218.1 2e-56
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 933 181.4 2.2e-45
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 929 180.6 3.7e-45
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 919 178.8 1.3e-44
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 913 177.7 2.7e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 877 171.2 2.7e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 869 169.7 7.3e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 847 165.7 1.2e-40
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 845 165.3 1.5e-40
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 845 165.3 1.5e-40
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 845 165.3 1.5e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 842 164.7 2.2e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 841 164.6 2.5e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 821 160.9 3.2e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 805 158.0 2.5e-38
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 788 154.9 2e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 595 119.7 8.4e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 557 112.8 1e-24
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 253 57.3 5.2e-08
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 233 53.8 7.7e-07
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 233 53.9 7.9e-07
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 224 52.1 2.3e-06
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 224 52.2 2.4e-06
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 224 52.2 2.4e-06
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 224 52.2 2.4e-06
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 218 51.0 4.6e-06
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 218 51.0 4.7e-06
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 218 51.0 4.8e-06
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 218 51.0 4.8e-06
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 218 51.0 4.9e-06
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 218 51.0 4.9e-06
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 218 51.1 5e-06
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 218 51.1 5.1e-06
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 216 50.5 5.6e-06
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 216 50.5 5.6e-06
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 208 49.0 1.5e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 208 49.1 1.6e-05
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 207 49.0 2e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 206 48.7 2e-05
NP_003766 (OMIM: 603751) sphingosine 1-phosphate r ( 384) 198 47.4 6e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 195 46.7 8e-05
NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446) 195 46.9 9.5e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 46.5 0.00012
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 46.5 0.00012
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 46.5 0.00012
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 193 46.5 0.00012
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 1180 init1: 1180 opt: 1186 Z-score: 1185.3 bits: 227.5 E(85289): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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XP_011 LIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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XP_011 VFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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XP_011 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
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XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNL
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pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
::::..: : :::::::::.:::..: ::. ...:::::: ..: ::. :::.:.::
NP_036 LIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
..:: .:: ::::::::..::.:.::::...:. :::::... ::..: .:.::::.
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NP_036 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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NP_036 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
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NP_036 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
290 300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 1180 init1: 1180 opt: 1186 Z-score: 1185.1 bits: 227.6 E(85289): 2.8e-59
Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:15-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
..:: .:: ::::::::..::.:.::::...:. :::::... ::..: .:.::::.
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
. ..:::..:: :..:: . ::::.:::::.::..:.. : : . .:.: :. ::..:
XP_011 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
.:. . : :::::::::::::.::::::.....::. : :..:.:... :.::: :. :
XP_011 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
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pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
::::::::::: .: :: : : :.. :
XP_011 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 1147; 56.1% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (22-322:5-304)
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pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
::. :.:::::.:: ::.: .:: .::.:::::.:::.
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNV
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pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
::::::::: .::::.::::::::.:: :.. .:::::.:...... :::.:::.::::
NP_002 LIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
:::.::... : ...:. .::..:::. ..:. ..:. : ... .:. ....::: :.
NP_002 TRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIR
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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NP_002 AILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTP
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pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
.:::::::::.::. :::.:.
NP_002 MMNPFIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
initn: 1148 init1: 1120 opt: 1134 Z-score: 1134.0 bits: 218.1 E(85289): 2e-56
Smith-Waterman score: 1134; 55.1% identity (81.4% similar) in 301 aa overlap (22-322:5-305)
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pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
: : .: :::::::. :: ::.:::.::.:::::..:::
NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNL
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pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
:::::.::: ::::::::::.:::..: :: :...::::..:...:. ::: :::.:.::
NP_001 LIILAVSSDSHLHTPMYFFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
:.::.:.:. :::::::::.::::.::::.. :.: ::.:.. . : . .:.: ::.
NP_001 LMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLM
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pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
:..: . :::..:.:. .::.:::.: .:.... . :. . :. :.::: .:
NP_001 KRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVS
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
...:.:: :..:::::::::: :: ::::. .:::: :.:.. : :.:.: .. :
NP_001 SLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTP
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pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
::::::::::.:.: :: .:.
NP_001 MLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 942 init1: 917 opt: 933 Z-score: 935.7 bits: 181.4 E(85289): 2.2e-45
Smith-Waterman score: 933; 43.0% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (15-321:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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NP_001 FIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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NP_001 VLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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NP_001 FWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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NP_001 AILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
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NP_001 SLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
290 300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 911 init1: 813 opt: 929 Z-score: 931.8 bits: 180.6 E(85289): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 929; 46.0% identity (76.2% similar) in 302 aa overlap (20-321:3-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
..::: :..:::::::. :. . ::: ..::.::::..:::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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NP_003 LLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLF
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pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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NP_003 FLIFGCTQCALLAVMSYDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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NP_003 LRLPYRGSNSIAHFFCEAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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NP_003 TVVKMKSTVGSLKAFSTCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
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NP_003 MLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
290 300
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 944 init1: 919 opt: 919 Z-score: 921.9 bits: 178.8 E(85289): 1.3e-44
Smith-Waterman score: 919; 45.4% identity (73.8% similar) in 302 aa overlap (21-322:2-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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NP_009 LIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFI
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130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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NP_009 FLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPST
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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NP_009 LHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITW
170 180 190 200 210 220
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pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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NP_009 AVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTP
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310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
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NP_009 SLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
290 300 310
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 938 init1: 913 opt: 913 Z-score: 916.1 bits: 177.7 E(85289): 2.7e-44
Smith-Waterman score: 913; 46.1% identity (73.9% similar) in 295 aa overlap (21-315:2-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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XP_011 LIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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XP_011 FLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPST
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
.. :: .. . . :. ::..:.: :: ::... . ....:.::: ::. :: : :
XP_011 LHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITW
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
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XP_011 AVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
.:::.::.:::...:
XP_011 SLNPLIYTLRNKEQKRRGS
290 300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 870 init1: 843 opt: 877 Z-score: 880.4 bits: 171.2 E(85289): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 877; 43.2% identity (72.3% similar) in 303 aa overlap (22-324:7-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
: : :..:.:::. :: : .:: .:: .: . ..::.
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNI
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
..: : ::::.:::::::.:::..: :. : .::::.:. .... ::: :: :.::
NP_006 GLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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NP_006 FCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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NP_006 FILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
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NP_006 SVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIP
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NP_006 VLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]