Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0896
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0896, 330 aa
1>>>pF1KE0896 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4908+/-0.00102; mu= 14.5302+/- 0.060
mean_var=125.4337+/-38.307, 0's: 0 Z-trim(105.5): 407 B-trim: 1008 in 2/47
Lambda= 0.114516
statistics sampled from 7930 (8485) to 7930 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 2191 373.8 1e-103
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1234 215.7 3.9e-56
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1186 207.8 9.7e-54
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1181 206.9 1.7e-53
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1147 201.3 8.4e-52
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1142 200.5 1.5e-51
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1137 199.7 2.6e-51
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 1134 199.2 3.7e-51
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1132 198.8 4.7e-51
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 1130 198.5 6e-51
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1124 197.5 1.2e-50
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1122 197.3 1.6e-50
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 1116 196.2 3e-50
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 1113 195.7 4.1e-50
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 1111 195.4 5.3e-50
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1105 194.4 1e-49
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 1100 193.5 1.8e-49
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 1097 193.1 2.6e-49
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1096 192.9 2.9e-49
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1096 192.9 2.9e-49
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 1095 192.7 3.2e-49
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1089 191.7 6.4e-49
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1084 190.9 1.2e-48
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1071 188.8 5e-48
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 1057 186.5 2.7e-47
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 1050 185.3 5.9e-47
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1044 184.3 1.1e-46
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1036 183.0 2.8e-46
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1034 182.6 3.5e-46
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1018 180.0 2.2e-45
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1005 177.9 9.7e-45
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1002 177.4 1.4e-44
CCDS32898.2 OR7G1 gene_id:125962|Hs108|chr19 ( 311) 994 176.0 3.4e-44
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 957 169.9 2.3e-42
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 955 169.6 3e-42
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 950 168.8 5.4e-42
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 949 168.6 5.9e-42
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 933 166.0 3.7e-41
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 929 165.3 5.8e-41
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 923 164.3 1.2e-40
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 919 163.6 1.8e-40
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 903 161.1 1.2e-39
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 900 160.5 1.6e-39
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 898 160.2 2e-39
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 896 159.8 2.6e-39
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 896 159.8 2.6e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 895 159.7 2.9e-39
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 895 159.7 2.9e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 895 159.7 3e-39
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 892 159.2 4.2e-39
>>CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 (330 aa)
initn: 2191 init1: 2191 opt: 2191 Z-score: 1975.4 bits: 373.8 E(32554): 1e-103
Smith-Waterman score: 2191; 99.4% identity (99.7% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TRVAFCAQKAIPHFYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVFVISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
310 320 330
>>CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1234 init1: 1234 opt: 1234 Z-score: 1121.2 bits: 215.7 E(32554): 3.9e-56
Smith-Waterman score: 1234; 59.8% identity (82.7% similar) in 301 aa overlap (22-322:3-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
::...:.:.: :.: ::.: :::::: :::::..:::
CCDS68 MENQSSISEFFLRGISAPPEQQQSLFGIFLCMYLVTLTGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
::::::.:: ::::::::::::::..: .::... :::.::.:. . :::.:::.:.::
CCDS68 LIILAIGSDLHLHTPMYFFLANLSFVDMGLTSSTVTKMLVNIQTRHHTISYTGCLTQMYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
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CCDS68 FLMFGDLDSFFLAAMAYDRYVAICHPLCYSTVMRPQVCALMLALCWVLTNIVALTHTFLM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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CCDS68 ARLSFCVTGEIAHFFCDITPVLKLSCSDTHINEMMVFVLGGTVLIVPFLCIVTSYIHIVP
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
:.. . . :: ::::::.::: :: .:::.:...:: ::: : :.. ::..: .. :
CCDS68 AILRVRTRGGVGKAFSTCSSHLCVVCVFYGTLFSAYLCPPSIASEEKDIAAAAMYTIVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
::::::::::.::: :: .::
CCDS68 MLNPFIYSLRNKDMKGALKRLFSHRSIVSS
290 300 310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1180 init1: 1180 opt: 1186 Z-score: 1078.3 bits: 207.8 E(32554): 9.7e-54
Smith-Waterman score: 1186; 56.2% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
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CCDS10 LIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYF
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130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
..:: .:: ::::::::..::.:.::::...:. :::::... ::..: .:.::::.
CCDS10 VFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
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CCDS10 APLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITC
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
.:. . : :::::::::::::.::::::.....::. : :..:.:... :.::: :. :
CCDS10 TVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
::::::::::: .: :: : : :.. :
CCDS10 MLNPFIYSLRNRYLKGALKK--VVGRVVFSV
290 300 310
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 1181 init1: 1181 opt: 1181 Z-score: 1073.8 bits: 206.9 E(32554): 1.7e-53
Smith-Waterman score: 1181; 56.5% identity (82.8% similar) in 308 aa overlap (22-329:5-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
:::..:::::::: ::.: : ...::.:::.:..:::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
:::. : : :::::::.::.:::..: ::.:..:::.: :...:. : :. ::.:.::
CCDS11 LIIVLIRLDSHLHTPMYLFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
.:.:: :.. ::..:::::::::: ::::.. :::.:: .... ::::. :..::::.
CCDS11 FLLFGDLESFLLVAMAYDRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
.:. :::...:::..:: ::::::: :::.::: .:. :: :.:..:.:::. ::.::
CCDS11 ARLCFCADNVIPHFFCDMSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
... . : : ::::::::::.:: ::::...:.:: .. :: ... :..: :. :
CCDS11 SILKVPSSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
:::::::::::::: ::.... . ::::
CCDS11 MLNPFIYSLRNRDMKGALSRVIHQKKTFFSL
290 300 310
>>CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 (312 aa)
initn: 1122 init1: 1009 opt: 1147 Z-score: 1043.5 bits: 201.3 E(32554): 8.4e-52
Smith-Waterman score: 1147; 56.1% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (22-322:5-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
::. :.:::::.:: ::.: .:: .::.:::::.:::.
CCDS11 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIILAISSDPHLHTPMYFFLANLSLTDACFTSASIPKMLANIHTQSQIISYSGCLAQLYF
::::::::: .::::.::::::::.:: :.. .:::::.:...... :::.:::.::::
CCDS11 LIILAISSDSRLHTPVYFFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LLMFGGLDNCLLAVMAYDRYVAICQPLHYSTSMSPQLCALMLGVCWVLTNCPALMHTLLL
:. . .::: .::::::::::::: ::::.:.:::.:: :.:..::::. .:.::::.
CCDS11 LVSLVALDNLILAVMAYDRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TRVAFCAQKAIPHLYCDPSALLKLACSDTHVNELMIITMGLLFLTVPLLLIVFSYVRIFW
:::.::... : ...:. .::..:::. ..:. ..:. : ... .:. ....::: :.
CCDS11 TRVTFCGSRKIHYIFCEMYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AVFGISSPGGRWKAFSTCGSHLTVVLLFYGSLMGVYLLPPSTYSTERESRAAVLYMVIIP
:.. : : . ..::::::.::: .: ::::.: ::: : :::. ..: :.:.: :. :
CCDS11 AILRIPSVSKKYKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSV-KDSVATVMYAVVTP
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KE0 TLNPFIYSLRNRDMKEALGKLFVSGKTFFL
.:::::::::.::. :::.:.
CCDS11 MMNPFIYSLRNKDMHGALGRLLDKHFKRLT
290 300 310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1142 init1: 1142 opt: 1142 Z-score: 1039.0 bits: 200.5 E(32554): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1142; 55.1% identity (81.5% similar) in 303 aa overlap (20-322:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGFYLRRSHELQGMGKPGRVNQTTVSDFLLLGLSEWPEEQPLLFGIFLGMYLVTMVGNL
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70 80 90 100 110 120
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...: ::: ::. ::::::::::.::.:.: :. :: :.. : :.:. :: :::::
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CCDS35 LLNPFIYSLRNRDIKGALERLFNRATVLSQ
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10 20 30 40 50 60
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CCDS35 TILRVPSTKGIHKALSTCGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTP
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CCDS35 MLNPFIYSLRNRDMKEALGKLF-SRATFFSW
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CCDS32 LMMFAGMDTFLLAVMAYDRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLM
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CCDS32 KRLTFSTGTEIPHFFCEPAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVS
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CCDS32 SLMGMSSTKGKYKAFSTCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTP
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CCDS32 MLNPFIYSLRNKDVKGALERLLSRADSCP
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CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNL
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CCDS32 FHFFGIVDSVIIAMMAYDRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLM
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CCDS32 ARLVFCGSHEVPHYFCDLTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILV
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CCDS32 AIMKVPSAGGRKKAFSTCSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTP
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CCDS32 MLNPFIYSLRNRDLKGALRKLVNRKITSSS
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CCDS12 MERGNQTEVGNFLLLGFAEDSDMQLLLHGLFLSMYLVTIIGNL
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CCDS12 LIILTISSDSHLHTPMYFFLSNLSFADICFTSTTVPKMLVNIQTQSKMITFAGCLTQIFF
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CCDS12 FIAFGCLDNLLLTMTAYDRFVAICYPLHYTVIMNPRLCGLLVLGSWCISVMGSLLETLTI
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CCDS12 LRLSFCTNMEIPHFFCDPSEVLKLACSDTFINNIVMYFVTIVLGVFPLCGILFSYSQIFS
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CCDS12 SVLRVSARG-QHKAFSTCGSHLSVVSLFYGTGLGVYLSSAVTPPSRTSLAASVMYTMVTP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]