Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0886
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0886, 323 aa
1>>>pF1KE0886 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8171+/-0.00122; mu= 13.4292+/- 0.072
mean_var=178.7767+/-59.085, 0's: 0 Z-trim(103.2): 380 B-trim: 432 in 1/47
Lambda= 0.095922
statistics sampled from 6827 (7286) to 6827 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 1.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11026.1 OR1E2 gene_id:8388|Hs108|chr17 ( 323) 2148 310.4 1.2e-84
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1178 176.2 3.1e-44
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 818 126.3 3.1e-29
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 785 121.8 7.2e-28
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 773 120.1 2.4e-27
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 767 119.3 4.1e-27
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 764 118.9 5.5e-27
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 739 115.4 6e-26
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 735 114.8 8.8e-26
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 734 114.7 9.8e-26
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 733 114.6 1.1e-25
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 733 114.6 1.1e-25
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 728 113.9 1.7e-25
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 726 113.6 2.1e-25
CCDS30902.1 OR6K2 gene_id:81448|Hs108|chr1 ( 324) 722 113.1 3.1e-25
CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 ( 331) 705 110.7 1.6e-24
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 697 109.6 3.5e-24
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 694 109.2 4.5e-24
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 693 109.0 4.9e-24
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 687 108.2 8.8e-24
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 677 106.8 2.3e-23
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 674 106.4 3.1e-23
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 668 105.6 5.5e-23
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 668 105.6 5.5e-23
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 666 105.3 6.7e-23
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 664 105.0 8e-23
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 656 103.9 1.7e-22
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 656 103.9 1.7e-22
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 648 102.8 3.7e-22
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 643 102.1 6e-22
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 637 101.3 1.1e-21
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 635 101.0 1.3e-21
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 634 100.9 1.4e-21
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 634 100.9 1.4e-21
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 633 100.7 1.6e-21
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 627 99.9 2.8e-21
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 616 98.4 8e-21
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 614 98.1 9.7e-21
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 614 98.1 9.7e-21
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 607 97.1 1.9e-20
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 607 97.1 1.9e-20
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 605 96.9 2.3e-20
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 604 96.7 2.5e-20
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 601 96.4 3.5e-20
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 597 95.8 5.3e-20
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 588 94.5 1.2e-19
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 587 94.4 1.3e-19
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 587 94.4 1.3e-19
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 586 94.2 1.4e-19
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 575 92.7 4e-19
>>CCDS11026.1 OR1E2 gene_id:8388|Hs108|chr17 (323 aa)
initn: 2148 init1: 2148 opt: 2148 Z-score: 1633.0 bits: 310.4 E(32554): 1.2e-84
Smith-Waterman score: 2148; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIYS
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
:::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
310 320
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 2017 init1: 1161 opt: 1178 Z-score: 907.6 bits: 176.2 E(32554): 3.1e-44
Smith-Waterman score: 1932; 92.3% identity (95.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS11 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMAY
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::
CCDS11 LFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCAD
::::::::: :::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRYVAICFP---------LHYTAIMSPMLCLALVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCAD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NVIPHFFCDMSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIYS
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS11 KGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLNPFIYS
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 LRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
:::::::::: ::: ..:. : :
CCDS11 LRNRDMKGALSRVIHQKKTFFSL
300 310
>>CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 814 init1: 421 opt: 818 Z-score: 638.3 bits: 126.3 E(32554): 3.1e-29
Smith-Waterman score: 818; 42.7% identity (70.7% similar) in 314 aa overlap (5-317:9-313)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLH
::. ..:.. .. : : : . ::: .:: : :: :: .. : :.
CCDS31 MPVGKLVFNQSEPTEFVFRAFTTATEFQVLLFLLFLLLYLMILCGNTAIIWVVCTHSTLR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TPVYLFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLV
::.:.::::::: .::...:..: .:.:. . . : : : .::.::. ... . :::.
CCDS31 TPMYFFLSNLSFLELCYTTVVVPLMLSNILGAQKPISLAGCGAQMFFFVTLGSTDCFLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AMAYDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLC
:::::::::: : :::: ::. :: .... . :. : .. : :. :
CCDS31 IMAYDRYVAICHP---------LHYTLIMTRELCTQMLGGALGLALFPSLQLTALIFTLP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 FCADNV-IPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSIL
::. . : ::.::. .:.:::.: ::.. :..... :.:.:::::: ::. :. .::
CCDS31 FCGHHQEINHFLCDVPPVLRLACADIRVHQAVLYVVSILVLTIPFLLICVSYVFITCAIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 KVPSSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLT
.. :..: .:::::. ::.:: : :: .:: : ...: .:. .:..:: :::.:.
CCDS31 SIRSAEGRRRAFSTCSFHLTVVLLQYGCCSLVYLRPRSSTSEDEDSQIALVYTFVTPLLN
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 PFIYSLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
:..:::::.:.::::. .: ..
CCDS31 PLLYSLRNKDVKGALRSAIIRKAASDAN
300 310
>>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 897 init1: 552 opt: 785 Z-score: 613.8 bits: 121.8 E(32554): 7.2e-28
Smith-Waterman score: 888; 42.6% identity (74.9% similar) in 319 aa overlap (2-319:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
: .::: ...:.:::.:.. . : : .:: .:. ::::: :. :: :::.::::.:
CCDS43 MTKNQTWVTEFILLGFPLSLRIQMLLSGLFSLLYVFTLLGNGAILGLIWLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 LFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQ-NQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAMA
.:::.:.. :. ..: ..::.: :. :. .: .. : : .... :. : ..:: :.
CCDS43 FFLSHLAIIDISYASNNVPKMLTNLGLNKRKTISFVPCTMQTFLYMAFAHTECLILVMMS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFCA
::::.::: : :.:..:: .: ... ::. .. :..:..:. :: ::.
CCDS43 YDRYMAICHP---------LQYSVIMRWGVCTVLAVTSWACGSLLALVHVVLILRLPFCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DNVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPS
. : ::::.. ..:::::.:: .:. ::: . .::: :. :.: ::.::...::.. :
CCDS43 PHEINHFFCEILSVLKLACADTWLNQVVIFAASVFILVGPLCLVLVSYSRILAAILRIQS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPFIY
..: ::::::.::: .:.::.:..: .:. :.. .. :....:.. .:::.:.::
CCDS43 GEGRRKAFSTCSSHLCMVGLFFGSAIVMYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIY
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 SLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
:::: ..::::.::. :...
CCDS43 SLRNAEVKGALKRVLWKQRSK
300 310
>>CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 (331 aa)
initn: 731 init1: 385 opt: 773 Z-score: 604.5 bits: 120.1 E(32554): 2.4e-27
Smith-Waterman score: 773; 39.7% identity (72.7% similar) in 315 aa overlap (3-316:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTP
:..... ..:.: ::: . ...:: .:: .: ::.::. ..: :..:.::
CCDS32 MSPDGNHSSDPTEFVLAGLPNLNSARVELFSVFLLVYLLNLTGNVLIVGVVRADTRLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VYLFLSNLSFSDLCFSSVTMPKLLQNMQNQDPSIPYADCLTQMYFFLYFSDLESFLLVAM
.:.::.::: .. ..:: .::.:.:. ... .: .: :.::.::..... : .::..:
CCDS32 MYFFLGNLSCLEILLTSVIIPKMLSNFLSRQHTISFAACITQFYFYFFLGASEFLLLAVM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRYVAICFPMHYTAICFLLHYTAIMSPMLCLSVVALSWVLTTFHAMLHTLLMARLCFC
. :::.::: : :.: .:: .:. :. :: .. :. .: : ::
CCDS32 SADRYLAICHP---------LRYPLLMSGAVCFRVALACWVGGLVPVLGPTVAVALLPFC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ADN-VIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKV
.. :. ::::: . ::.:::..:. : . :....:..: .:. ::. :: ..:..
CCDS32 KQGAVVQHFFCDSGPLLRLACTNTKKLEETDFVLASLVIVSSLLITAVSYGLIVLAVLSI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PSSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCPSANSSTLKDTVMAMMYTVVTPMLTPF
::..: :::::: ::: ::.::::..: ::. :: ..:. . ..... : :::.:.::
CCDS32 PSASGRQKAFSTCTSHLIVVTLFYGSAIFLYVRPSQSGSVDTNWAVTVITTFVTPLLNPF
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 IYSLRNRDMKGALERVICKRKNPFLL
::.:::...: ::. .. :
CCDS32 IYALRNEQVKEALKDMFRKVVAGVLGNLLLDKCLSEKAVK
300 310 320 330
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1352 init1: 757 opt: 767 Z-score: 600.3 bits: 119.3 E(32554): 4.1e-27
Smith-Waterman score: 1301; 60.8% identity (85.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMGQNQTSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPVY
: .::.:.:.:::: ::: :::: . ..:::.::: :.:::::::.:::::::::::..
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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CCDS35 DRYVAICHP---------LRYTTIMKEGLCNLLVTVSWILSCTNALSHTLLLAQLSFCAD
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CCDS35 LRNRDIKGALERLFNRATVLSQ
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CCDS35 LRNRDMKEALGKLFSRATFFSW
300 310
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CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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CCDS10 NAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPST
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CCDS10 LRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310
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CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMY
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CCDS32 FFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAY
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CCDS32 DRFVAICHP---------LHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGS
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CCDS32 HEVPHYFCDLTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSA
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CCDS32 LRNRDLKGALRKLVNRKITSSS
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CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMNMQTQHLAVFYKGCISQTYFFIFFADLDSFLITSMAY
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CCDS35 DRYVAICHP---------LHYATIMTQSQCVMLVAGSWVIACACALLHTLLLAQLSFCAD
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pF1KE0 NVIPHFFCDMSALLKLACSDTRVNEWVIFIMGGLILVIPFLLILGSYARIVSSILKVPSS
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CCDS35 HIIPHYFCDLGALLKLSCSDTSLNQLAIFTAALTAIMLPFLCILVSYGHIGVTILQIPST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]