Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0873
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0873, 322 aa
1>>>pF1KE0873 322 - 322 aa - 322 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6990+/-0.00116; mu= 14.0238+/- 0.068
mean_var=182.6029+/-58.770, 0's: 0 Z-trim(104.7): 415 B-trim: 471 in 1/47
Lambda= 0.094912
statistics sampled from 7524 (8050) to 7524 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 2.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 2130 304.7 6.2e-83
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 1040 155.5 5.5e-38
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 1010 151.4 8.9e-37
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 1007 151.0 1.2e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1006 150.8 1.3e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 997 149.6 3.1e-36
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 986 148.1 8.8e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 984 147.8 1.1e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 981 147.4 1.4e-35
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 978 147.0 1.9e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 969 145.8 4.4e-35
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 966 145.3 5.8e-35
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 956 144.0 1.5e-34
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 953 143.6 2e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 949 143.0 3e-34
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 948 142.9 3.2e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 941 141.9 6.3e-34
CCDS31541.1 OR6Q1 gene_id:219952|Hs108|chr11 ( 317) 941 141.9 6.3e-34
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 938 141.5 8.5e-34
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 935 141.1 1.1e-33
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 934 141.0 1.2e-33
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 933 140.8 1.3e-33
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 932 140.7 1.5e-33
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 930 140.4 1.8e-33
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 930 140.4 1.8e-33
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 929 140.3 2e-33
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 926 139.9 2.6e-33
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 923 139.5 3.5e-33
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 922 139.3 3.8e-33
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 921 139.2 4.3e-33
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 919 138.9 5e-33
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 919 138.9 5.1e-33
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 918 138.8 5.7e-33
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 917 138.6 6.1e-33
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 917 138.6 6.1e-33
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 917 138.6 6.1e-33
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 916 138.5 6.7e-33
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 916 138.5 6.7e-33
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 915 138.4 7.3e-33
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 914 138.2 8.1e-33
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 914 138.3 8.3e-33
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 913 138.1 8.9e-33
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 913 138.1 8.9e-33
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 912 137.9 9.8e-33
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 912 138.0 1e-32
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 911 137.8 1.1e-32
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 908 137.4 1.5e-32
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 907 137.2 1.6e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 907 137.3 1.7e-32
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 905 137.0 1.9e-32
>>CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 (322 aa)
initn: 2130 init1: 2130 opt: 2130 Z-score: 1602.4 bits: 304.7 E(32554): 6.2e-83
Smith-Waterman score: 2130; 98.8% identity (99.7% similar) in 322 aa overlap (1-322:1-322)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::
CCDS31 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLGATECFLLAFMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS31 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCARLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGRNQINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
::::::::::::::::::::::
CCDS31 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
310 320
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 1042 init1: 1021 opt: 1040 Z-score: 795.5 bits: 155.5 E(32554): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 1040; 51.2% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (3-303:41-341)
10 20 30
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFL
:.:.:: :.: :::: : : ::::.:
CCDS32 INLIPHLCLHRHSVIAGAFTIHRHMKIFNSPSNSSTFTGFILLGFPCPREGQILLFVLFT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 LIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAI
..: ::..:: :: .: :::.:::..: ..::::. :...::: .:::.:: . :
CCDS32 VVYLLTLMGNGSIICAVHWDQRLHAPMYILLANFSFLEICYVTSTVPSMLANFLSDTKII
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTG
:::.:. :.::: :..::::.::.::.::::::: ::::: .: : ::: ::: : :
CCDS32 SFSGCFLQFYFFFSLGSTECFFLAVMAFDRYLAICRPLRYPTIMTRRLCTNLVVNCWVLG
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFF
..: . ::...::: :.::.:: ::. :.:.. . :... .:: . . :.
CCDS32 FIWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVIELVFSVLSPLPVFMLFL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFSTCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINK
. .: :...: ..::.::..::::.:::::::::::.:.::... :: : . .:
CCDS32 FIVGSYALVVRAVLRVPSAAGRRKAFSTCGSHLAVVSLFYGSVLVMYGSPPSKNEAGKQK
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320
pF1KE0 IISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
...::.:::::::::::::::::...:..:
CCDS32 TVTLFYSVVTPLLNPVIYSLRNKDMRKALKKFWGT
320 330 340
>>CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 (311 aa)
initn: 1034 init1: 763 opt: 1010 Z-score: 773.7 bits: 151.4 E(32554): 8.9e-37
Smith-Waterman score: 1010; 51.0% identity (77.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
:: .: . ::.: :.:: . : .: .:.:::. : ::. ::.:: .: :. ::.:::
CCDS43 MELENQTRVTKFILVGFPGSLSMRAAMFLIFLVAYILTVAENVIIILLVLQNRPLHKPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
.:: .:::::.:: :.::: :: .. : ...:::. :: :::::. : ::: ::: :::
CCDS43 FFLANLSFLETWYISVTVPKLLFSFWSVNNSISFTLCMIQLYFFIALMCTECVLLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
:::.::: ::.:: .: .::: ::.. :: : . .. .:: :.::::: :::::::
CCDS43 DRYVAICRPLHYPTIMSHGLCFRLALGSWAIGFGISLAKIYFISCLSFCGPNVINHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFST
. :...:::. . :::.. :::..... . .:.:. : :...:: .:. :..:.:::
CCDS43 ISPVLNLSCTDMSITELVDFILALVIFLFPLFITVLSYGCILATILCMPT--GKQKAFST
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKEA
:.:::.:::..:...: ::. : ..:::::.::..::: ::: :: :::.. :::
CCDS43 CASHLVVVTIFYSAIIFMYARPRVIHAFNMNKIISIFYAIVTPSLNPFIYCLRNREVKEA
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE0 VRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
..:.
CCDS43 LKKLAYCQASRSD
300 310
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
initn: 1025 init1: 999 opt: 1007 Z-score: 771.3 bits: 151.0 E(32554): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 1007; 48.7% identity (77.3% similar) in 308 aa overlap (1-305:8-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEPQNTST---VTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVS
..:.: :. ::.: :::: . . : .:: .::.:: ::..:: .:: .:
CCDS32 MSFFFVDLRPMNRSATHIVTEFILLGFPGCWKIQIFLFSLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QGLRLHSPMYMFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSAT
. ::.:::..: ...:::.::.:.:.: .:.:.:: .:::::.:. :.::: :..:
CCDS32 CNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSKTKAISFSGCFLQFYFFFSLGTT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 ECFLLALMAYDRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCG
::..::.:::::::::: ::.:: .: .: .:: : : .: ..::.: :::
CCDS32 ECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFCWLIGFLGYPIPIFYISQLPFCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PNQINHFFCDLPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFFLTLGPYVFIVSSILRIPS
:: :.::.::. ::: :::. . ::: .. : :: . . : :..........::
CCDS32 PNIIDHFLCDMDPLMALSCAPAPITECIFYTQSSLVLFFTSMYILRSYILLLTAVFQVPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TSGRRKTFSTCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIY
..::::.::::::::.::.:.:::.. ::: :. . ..::... :.:.:::.::.::
CCDS32 AAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIPTLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIY
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 SLRNKDFKEAVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
.:::::.: :.:.:.
CCDS32 TLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
310 320
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1011 init1: 990 opt: 1006 Z-score: 770.8 bits: 150.8 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 1006; 50.7% identity (76.3% similar) in 304 aa overlap (5-307:4-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
::: ::.: ::::..: . :.::: .:: :: ::. :: .:...:: :.::::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MFLQHLSFLEVWYTSTTVPLLLANLLSWGQAISFSACMAQLYFFVFLSATECFLLALMAY
.::. :: ::. :::.:::::: .::. . :: :.: :..::.:..:::: ::: :::
CCDS34 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYLAICSPLRYPFLMHRGLCTRLVVVSWCTGVSTGFLPSLMISRLDFCGPNQINHFFCD
::: ::: :::::.:. . .: .:. .: :: .:. . .: : ::::: : .:::.
CCDS34 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 LPPLMQLSCSRVYITEVTIFILSIAVLCICFF-LTLGPYVFIVSSILRIPSTSGRRKTFS
. :..:: :. . ..:. : ::. :.: .: : : :: : :. .:.::::..::::.::
CCDS34 IQPVLQLVCGDTSLNELQI-ILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCGSHLAVVTLYYGTMISMYVCPSPHLLPEINKIISVFYTVVTPLLNPVIYSLRNKDFKE
::.::: .:.:.::: . .:. :. : . ..:.::.::::.:::.:::::: . :
CCDS34 TCSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKA
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE0 AVRKVMRRKCGILWSTSKRKFLY
:.......
CCDS34 ALKRTIQKTVPMEI
300 310
>>CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 998 init1: 967 opt: 997 Z-score: 764.1 bits: 149.6 E(32554): 3.1e-36
Smith-Waterman score: 997; 48.1% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEPQNTSTVTNFQLLGFQNLLEWQALLFVIFLLIYCLTIIGNVVIITVVSQGLRLHSPMY
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CCDS30 MDTGNWSQVAEFIILGFPHLQGVQIYLFLLLLLIYLMTVLGNLLIFLVVCLDSRLHTPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]