Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0870
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0870, 313 aa
1>>>pF1KE0870 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3770+/-0.00112; mu= 15.6606+/- 0.066
mean_var=150.5222+/-50.567, 0's: 0 Z-trim(103.5): 368 B-trim: 423 in 1/48
Lambda= 0.104538
statistics sampled from 7002 (7440) to 7002 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 2048 321.4 5.7e-88
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 1089 176.8 2e-44
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 1088 176.7 2.3e-44
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 1087 176.5 2.4e-44
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 1052 171.2 9.4e-43
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 1032 168.2 7.6e-42
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 1025 167.1 1.6e-41
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 1023 166.8 2e-41
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 1009 164.7 8.4e-41
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 997 162.9 3e-40
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 994 162.5 4.1e-40
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 987 161.4 8.4e-40
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 975 159.6 3e-39
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 959 157.2 1.6e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 957 156.9 2e-38
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 956 156.7 2.2e-38
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 950 155.9 4.4e-38
CCDS30909.1 OR10J3 gene_id:441911|Hs108|chr1 ( 329) 948 155.5 5.1e-38
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 946 155.2 6.1e-38
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 944 154.9 7.7e-38
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 942 154.6 9.3e-38
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 941 154.4 1e-37
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 939 154.1 1.3e-37
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 938 154.0 1.4e-37
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 936 153.7 1.7e-37
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 935 153.5 1.9e-37
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 933 153.2 2.4e-37
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 928 152.5 4e-37
CCDS32941.1 OR10H4 gene_id:126541|Hs108|chr19 ( 316) 928 152.5 4e-37
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 925 152.0 5.5e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 922 151.6 7.5e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 922 151.6 7.5e-37
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 922 151.6 7.6e-37
CCDS12334.1 OR10H3 gene_id:26532|Hs108|chr19 ( 316) 921 151.4 8.4e-37
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 920 151.3 9.2e-37
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 917 150.8 1.3e-36
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 916 150.7 1.5e-36
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 914 150.4 1.7e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 913 150.2 1.9e-36
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 913 150.2 1.9e-36
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 911 149.9 2.4e-36
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 907 149.3 3.7e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 906 149.2 4e-36
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 903 148.7 5.5e-36
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 903 148.7 5.6e-36
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 901 148.4 6.7e-36
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 899 148.1 8.2e-36
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 898 147.9 9.2e-36
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 898 148.0 9.2e-36
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 897 147.9 1.1e-35
>>CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 (313 aa)
initn: 2048 init1: 2048 opt: 2048 Z-score: 1692.8 bits: 321.4 E(32554): 5.7e-88
Smith-Waterman score: 2048; 99.7% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRTRAIQTA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS30 CASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRNRAIQTA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LRNAFRGRLLGKG
:::::::::::::
CCDS30 LRNAFRGRLLGKG
310
>>CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 (320 aa)
initn: 583 init1: 583 opt: 1089 Z-score: 911.1 bits: 176.8 E(32554): 2e-44
Smith-Waterman score: 1089; 53.7% identity (79.6% similar) in 309 aa overlap (1-309:12-319)
10 20 30 40
pF1KE0 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAI
: . : : :::: :::: : :. ::..::.::..::..:..:. :
CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFHEQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTII
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RLDSHLHTPMYLFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWAC
:.: :::::::.:::.:: ::: ::: :.:::::.:.: .: :: .:::.:::: ....
CCDS11 RMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFGI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 TNCFLLAAMGFDRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFC
::::::.:::.::::::: ::.: :: : :::. . : . .. .. .:.: ::
CCDS11 TNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPFC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SSHEIQHFFCDTPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIP
. ... ::::: ::..:.: :: .:. .:.:.:::.: . .. :::. :...::.:
CCDS11 A-RKVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKIA
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SAEGQKKAFSTCASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIV
:.::.::::.::::::::::.::.:::..::.::. . :.::::..::::.::::::.:
CCDS11 SVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPVV
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KE0 YSLRTRAIQTALRNAFRGRLLGKG
:.::.. .. :: : :..
CCDS11 YTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
300 310 320
>>CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 (335 aa)
initn: 1087 init1: 1067 opt: 1088 Z-score: 910.1 bits: 176.7 E(32554): 2.3e-44
Smith-Waterman score: 1088; 53.9% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (5-312:25-327)
10 20 30 40
pF1KE0 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLT
:.: .:..::::: ::.:: ::..:: :::: :.
CCDS30 MPQILIFTYLNMFYFFPPLQILAENLTMVTEFLLLGFSSLGEIQLALFVVFLFLYLVILS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SNVFIIIAIRLDSHLHTPMYLFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQ
.:: :: .:.::. ::::::.::..:: ::: ::. :.:.:: .: . ..::. :: :
CCDS30 GNVTIISVIHLDKSLHTPMYFFLGILSTSETFYTFVILPKMLINLLSVARTISFNCCALQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 MFFSASWACTNCFLLAAMGFDRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMT
::: ..: :::.::..::.:::.::: :::: . :. .:..:. . . :.: .: ..
CCDS30 MFFFLGFAITNCLLLGVMGYDRYAAICHPLHYPTLMSWQVCGKLAAACAIGGFLASLTVV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LVIFHLSFCSSHEIQHFFCDTPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAY
..: : :::.....:.::: :. ::: .: .:. ::: ..:::.: :.:: .::
CCDS30 NLVFSLPFCSANKVNHYFCDISAVILLACTNTDVNEFVIFICGVLVLVVPFLFICVSYLC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ILAAILRIPSAEGQKKAFSTCASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTV
:: .::.::::::..::::::::::.:::.:::::::.:::: :.: ..:.:...:::.
CCDS30 ILRTILKIPSAEGRRKAFSTCASHLSVVIVHYGCASFIYLRPTANYVSNKDRLVTVTYTI
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 VTPLLNPIVYSLRTRAIQTALRNAFRGRLLGKG
:::::::.:::::.. .: :.: ..:::
CCDS30 VTPLLNPMVYSLRNKDVQLAIR-----KVLGKKGSLKLYN
310 320 330
>>CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 (314 aa)
initn: 1102 init1: 755 opt: 1087 Z-score: 909.5 bits: 176.5 E(32554): 2.4e-44
Smith-Waterman score: 1087; 53.9% identity (81.0% similar) in 310 aa overlap (2-311:3-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPM
: ...: .:...:::: ::::::::..:: :::. :..:: :. .::.. :::::
CCDS30 MRGFNKTTVVTQFILVGFSSLGELQLLLFVIFLLLYLTILVANVTIMAVIRFSWTLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMG
: :: .:::::.:::. :::..: : . ..::...::.:.:: ..:::::.:.:.::
CCDS30 YGFLFILSFSESCYTFVIIPQLLVHLLSDTKTISFMACATQLFFFLGFACTNCLLIAVMG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FDRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFC
.::::::: ::.:. .: : .:. : ::....: : .: . ::. ....:.::
CCDS30 YDRYVAICHPLRYTLIINKRLGLELISLSGATGFFIALVATNLICDMRFCGPNRVNHYFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DTPPVLSLACGDTGPSELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFS
: ::..::: :: .:: .: ::.::..: :..: :::..:. .::.:::::: ::::
CCDS30 DMAPVIKLACTDTHVKELALFSLSILVIMVPFLLILISYGFIVNTILKIPSAEG-KKAFV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRTRAIQT
:::::::::..::::::..:::::.. . ..:::.:.:::::::::::.:::::.. ..:
CCDS30 TCASHLTVVFVHYGCASIIYLRPKSKSASDKDQLVAVTYTVVTPLLNPLVYSLRNKEVKT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 ALRNAFRGRLLGKG
::. :.::
CCDS30 ALK-----RVLGMPVATKMS
300 310
>>CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 (315 aa)
initn: 1083 init1: 656 opt: 1052 Z-score: 881.0 bits: 171.2 E(32554): 9.4e-43
Smith-Waterman score: 1052; 51.3% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (5-313:5-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
: :: .:...:::. .:::.:: ::: .:: :: .:..:. .. . ::::::
CCDS12 MLGLNHTSMSEFILVGFSAFPHLQLMLFLLFLLMYLFTLLGNLLIMATVWSERSLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSFLSFSETCYTLGIIPRMLSGLAGGDQAISYVGCAAQMFFSASWACTNCFLLAAMGF
::: :: :: ::..::::::. : . ...:....::.::::: :.. :. :::..::.
CCDS12 LFLCVLSVSEILYTVAIIPRMLADLLSTQRSIAFLACASQMFFSFSFGFTHSFLLTVMGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICAPLHYASHMNPTLCAQLVITSFLTGYLFGLGMTLVIFHLSFCSSHEIQHFFCD
::::::: ::.: :.: :: :: :. : ..:. .: .::.:.::.:::::::.:
CCDS12 DRYVAICHPLRYNVLMSPRGCACLVGCSWAGGSVMGMVVTSAIFQLTFCGSHEIQHFLCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 TPPVLSLACGDTGPS-ELRIFILSLLVLLVSFFFITISYAYILAAILRIPSAEGQKKAFS
.::.:.::::.. :. : . .. ...:: :..: .:::.:.: ::.::::::..::::
CCDS12 VPPLLKLACGNNVPAVALGVGLVCIMALLGCFLLILLSYAFIVADILKIPSAEGRNKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTVVIIHYGCASFVYLRPKASYSLERDQLIAMTYTVVTPLLNPIVYSLRTRAIQT
:::::: :::.::: :: .::.::. .: : : :.: ::.:.::.:.::..:::.. ...
CCDS12 TCASHLIVVIVHYGFASVIYLKPKGPHSQEGDTLMATTYAVLTPFLSPIIFSLRNKELKV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 ALRNAFRGRLLGKG
:.. .: . : ..:
CCDS12 AMKRTFLSTLYSSGT
310
>>CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 (309 aa)
initn: 1034 init1: 554 opt: 1032 Z-score: 864.8 bits: 168.2 E(32554): 7.6e-42
Smith-Waterman score: 1032; 51.5% identity (79.1% similar) in 301 aa overlap (1-301:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGQTNVTSWRDFVFLGFSSSGELQLLLFALFLSLYLVTLTSNVFIIIAIRLDSHLHTPMY
: . : : .:.:::::: :. :. ::..::..:..::..:..:. : .: :::::::
CCDS30 MKRKNFTEVSEFIFLGFSSFGKHQITLFVVFLTVYILTLVANIIIVTIICIDHHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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