Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0856, 316 aa
1>>>pF1KE0856 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1080+/-0.000498; mu= 16.9425+/- 0.031
mean_var=97.7789+/-24.764, 0's: 0 Z-trim(108.6): 349 B-trim: 923 in 1/48
Lambda= 0.129704
statistics sampled from 16205 (16703) to 16205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 6.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 884 176.5 6.1e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 855 171.1 2.6e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 855 171.1 2.6e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 855 171.1 2.7e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 794 159.7 7.2e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 783 157.6 3e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 783 157.7 3.1e-38
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 781 157.3 3.9e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 781 157.3 3.9e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 781 157.3 3.9e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 780 157.1 4.4e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 758 152.9 7.5e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 758 153.0 7.6e-37
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 746 150.7 3.6e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 740 149.6 7.9e-36
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 737 149.0 1.2e-35
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 728 147.3 3.7e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 726 146.9 4.7e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 722 146.2 8.1e-35
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 717 145.3 1.5e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 557 115.4 1.6e-25
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 554 114.8 2.4e-25
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 220 52.4 1.8e-06
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 220 52.4 1.8e-06
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 203 49.3 1.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 201 48.7 1.9e-05
NP_071429 (OMIM: 607448) neuropeptide FF receptor ( 430) 202 49.1 2e-05
NP_001138757 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 389) 201 48.8 2.1e-05
NP_001008504 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 392) 201 48.8 2.1e-05
NP_001138755 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 397) 201 48.8 2.1e-05
NP_000905 (OMIM: 600018) mu-type opioid receptor i ( 400) 201 48.8 2.1e-05
NP_001138756 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 403) 201 48.9 2.1e-05
NP_001138754 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 406) 201 48.9 2.2e-05
NP_001272452 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 414) 201 48.9 2.2e-05
NP_001008503 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 418) 201 48.9 2.2e-05
NP_001138758 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 420) 201 48.9 2.2e-05
NP_001008505 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 446) 201 48.9 2.3e-05
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 200 48.6 2.3e-05
NP_001272453 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 201 48.9 2.4e-05
NP_001138751 (OMIM: 600018) mu-type opioid recepto ( 493) 201 48.9 2.4e-05
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 199 48.4 2.6e-05
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 199 48.4 2.6e-05
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 199 48.4 2.6e-05
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 199 48.4 2.6e-05
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 199 48.5 2.7e-05
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 199 48.5 2.7e-05
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 199 48.5 2.7e-05
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 199 48.5 2.8e-05
NP_001305783 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 365) 197 48.1 3.4e-05
XP_016883344 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 365) 197 48.1 3.4e-05
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 877 init1: 568 opt: 884 Z-score: 909.8 bits: 176.5 E(85289): 6.1e-44
Smith-Waterman score: 884; 45.5% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCL-LILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF
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pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK
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310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
::....:
NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 843 init1: 524 opt: 855 Z-score: 880.6 bits: 171.1 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 855; 44.3% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
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pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCL-FLIIL-SFVFIMAAILRIPSAEGRHK
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XP_011 DVTPLLKLSC---SDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWK
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pF1KE0 TFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKE
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XP_011 AFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRY
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300 310
pF1KE0 LKNAINKNFCRRFCPLSS
::.:..:
XP_011 LKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 843 init1: 524 opt: 855 Z-score: 880.6 bits: 171.1 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 855; 44.3% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQ-HLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
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pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCL-FLIIL-SFVFIMAAILRIPSAEGRHK
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NP_036 DVTPLLKLSC---SDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWK
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pF1KE0 TFSTCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKE
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NP_036 AFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRY
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300 310
pF1KE0 LKNAINKNFCRRFCPLSS
::.:..:
NP_036 LKGALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 843 init1: 524 opt: 855 Z-score: 880.4 bits: 171.1 E(85289): 2.7e-42
Smith-Waterman score: 855; 44.3% identity (73.0% similar) in 307 aa overlap (1-305:11-313)
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pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATV
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pF1KE0 GSNVIHHFLCHVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCL-FLIIL-SFVFIMAAIL
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:.:.::::. ::.:..:
XP_011 PFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 794; 41.0% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (4-305:6-305)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHT
.::. ..:::: :: . :. : ::::..: .. . :.::. .: . :. .:.:
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pF1KE0 PMYLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMV
:::.:: ::. .. . :.:.::...: ..::.. .::.:..: :. :.::.: .
NP_006 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA
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pF1KE0 MGYDHYVTICHPLHYNMLMSPRG-CAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHH
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NP_006 RKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLR
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pF1KE0 NKELKNAINKNFCRRFCPLSS
::..:.: .:
NP_006 NKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 760 init1: 459 opt: 783 Z-score: 807.7 bits: 157.6 E(85289): 3e-38
Smith-Waterman score: 783; 38.4% identity (74.8% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
: .::....::.: :. : .: .:::..:... .:.:::: .. . :. .:::::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGL-ADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPM
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pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
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NP_003 YFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMA
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pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
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NP_003 YDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFC
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NP_003 DSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVN-IVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAF
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NP_003 STCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVK
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NP_003 KALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
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Smith-Waterman score: 783; 39.6% identity (72.7% similar) in 308 aa overlap (1-303:1-306)
10 20 30 40 50
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NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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NP_003 NQEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
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Smith-Waterman score: 781; 38.9% identity (73.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
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XP_011 ELLAVVRLAC-VDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
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310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
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XP_011 GAWQK-LLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 775 init1: 462 opt: 781 Z-score: 805.7 bits: 157.3 E(85289): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 781; 38.9% identity (73.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
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pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
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NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
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NP_036 ELLAVVRLAC-VDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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NP_036 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
.: .: . .: :.:
NP_036 GAWQK-LLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 775 init1: 462 opt: 781 Z-score: 805.7 bits: 157.3 E(85289): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 781; 38.9% identity (73.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MPGQNYSTISEFILSGFSAFPQQLLPVLFLLYLLMFLFTLLGNLLIMATVWIERRLHTPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YLFLCALSISEILFTVAITPRMLADLLFTHRSITFVACAIQMFFSFMFGFTHSFLLMVMG
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDHYVTICHPLHYNMLMSPRGCAHLVAWTWAGGSVMGMMVTMMVFHLTFCGSNVIHHFLC
::.::..: :.:. .: ::.:. .:..: . . . : ..:.: .: .. : :. :
XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HVLSLLKLACGSKTSSVIMGVMLVCVTALIGCLFLIILSFVFIMAAILRIPSAEGRHKTF
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XP_011 ELLAVVRLAC-VDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STCVSHLTVVVMHYSFASLIYLKPKGLHSMYSDALMATTYTVFTPFLSPIIFSLRNKELK
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XP_011 HTCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 NAINKNFCRRFCPLSS
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XP_011 GAWQK-LLWKFSGLTSKLAT
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316 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sat Nov 5 03:39:35 2016 done: Sat Nov 5 03:39:36 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]