Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0854
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0854, 332 aa
1>>>pF1KE0854 332 - 332 aa - 332 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6272+/-0.000435; mu= 19.7839+/- 0.027
mean_var=91.3366+/-23.156, 0's: 0 Z-trim(110.2): 266 B-trim: 1112 in 1/48
Lambda= 0.134200
statistics sampled from 18108 (18479) to 18108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 6.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 951 194.8 1.9e-49
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 908 186.5 6.3e-47
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 900 185.0 1.8e-46
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 876 180.3 4.6e-45
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 871 179.4 9.2e-45
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 869 179.0 1.2e-44
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 868 178.8 1.3e-44
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 868 178.8 1.3e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 865 178.2 2e-44
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 857 176.6 5.8e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 856 176.5 6.9e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 853 175.9 1e-43
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 849 175.1 1.7e-43
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 840 173.4 5.8e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 830 171.4 2.2e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 826 170.7 3.8e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 826 170.7 3.8e-42
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 826 170.7 3.8e-42
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 799 165.4 1.4e-40
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 709 148.0 2.5e-35
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 576 122.3 1.4e-27
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 543 115.9 1.2e-25
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 208 51.2 4.9e-06
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 186 46.8 8.3e-05
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 186 46.8 8.3e-05
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 188 47.5 8.8e-05
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 185 46.7 0.00011
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 185 46.7 0.00011
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 185 46.8 0.00011
NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 176 45.0 0.00036
NP_001043 (OMIM: 182454) somatostatin receptor typ ( 388) 175 44.7 0.00038
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 175 44.8 0.0004
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 174 44.5 0.0004
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 175 44.8 0.0004
NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 174 44.5 0.00042
XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 174 44.5 0.00042
XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 174 44.5 0.00042
NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 174 44.5 0.00042
XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 174 44.5 0.00042
XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 174 44.5 0.00042
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 175 44.8 0.00042
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 175 44.9 0.00045
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 170 43.7 0.00066
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 171 44.0 0.00072
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 169 43.6 0.00085
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 169 43.6 0.00085
NP_795344 (OMIM: 118445) gastrin/cholecystokinin t ( 447) 167 43.3 0.0012
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 166 43.0 0.0013
XP_005253267 (OMIM: 118445) PREDICTED: gastrin/cho ( 516) 167 43.3 0.0013
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 164 42.5 0.0015
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 951; 44.7% identity (75.7% similar) in 304 aa overlap (26-329:3-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCVI
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NP_001 VGYVLIVVTITASPSLGSPMYLSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMT
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pF1KE0 QLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLFQ
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NP_001 VVILCSLRTHSLEARHKALSTCVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMI
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310 320 330
pF1KE0 TPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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NP_001 TPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLCSRKDISGDK
280 290 300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 908; 46.5% identity (77.4% similar) in 301 aa overlap (25-322:4-304)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHH-PPQLGAPLFLAFLVIYLLT
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60 70 80 90 100 110
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NP_835 LKGNSLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCA
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pF1KE0 IQLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLF
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pF1KE0 QTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSY
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NP_835 QTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSY
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pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDG--VVAVFY
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NP_835 TRIAAAILKIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSY
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300 310 320 330
pF1KE0 TVITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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NP_835 TVVTPMLNPIIYSLRNSEVKNALSRTFHKVLALRNCIP
280 290 300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 922 init1: 779 opt: 900 Z-score: 955.2 bits: 185.0 E(85289): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 900; 43.7% identity (75.8% similar) in 302 aa overlap (26-325:8-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
: .: ..:::::. . :.: . .:.. :..::.:.
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTL
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NP_001 IGNLFIIILSYLDSHLHTPMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMI
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pF1KE0 QLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLFQ
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NP_001 QLYFVLALGTTECVLLVVMSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALH
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pF1KE0 TSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSYG
.::.: .:.:: .::..::..::.:::.:.:: .:::. . ....: ..:::::::
NP_001 SSFTFWVPLCGHRQVDHFFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYG
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pF1KE0 YIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPLDG--VVAVFYT
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NP_001 AIVRAILRMQSTTGLQKVFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYT
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pF1KE0 VITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
:.:: :: .:::: :: ...:..:: :
NP_001 VVTPSLNPLIYTLRNKVVRGAVKRLMGWE
290 300 310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 874 init1: 757 opt: 876 Z-score: 930.1 bits: 180.3 E(85289): 4.6e-45
Smith-Waterman score: 876; 43.9% identity (75.1% similar) in 301 aa overlap (26-323:2-301)
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pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
:.. :..::..:: . :.: . .:: ::..::..
NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAF
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pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCVI
:: :::.. . . :: :: .:: :. .:. . .:.::::. .: . ::..::.
NP_001 LGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMS
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pF1KE0 QLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLFQ
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NP_001 QLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVH
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pF1KE0 TSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTF-ADIGFLALTCFMLILTSY
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NP_001 TALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADIT-LAIGDFILTCISY
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pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPL--DGVVAVFY
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NP_001 GFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALY
220 230 240 250 260 270
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pF1KE0 TVITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
:..:: :: ..:.. :.::.:.....
NP_001 TLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRKVFAFLKH
280 290 300
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 859 init1: 746 opt: 871 Z-score: 924.6 bits: 179.4 E(85289): 9.2e-45
Smith-Waterman score: 871; 42.4% identity (74.9% similar) in 311 aa overlap (18-325:7-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
. . ... ::.:::.:.:.:: . :: ::. :: .:: ::
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCVI
:: ::::.: .: :: :: .:: .:::.:. .: . ::::::. .: .. ::: ::.
XP_011 LGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLT
50 60 70 80 90 100
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pF1KE0 QL-FSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLF
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XP_011 QMYFVFMFVD-MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLL
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pF1KE0 QTSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSY
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XP_011 HTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASY
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pF1KE0 GYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPL--DGVVAVFY
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XP_011 MHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KE0 TVITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
::.::.:: .::.: :. .:.::... :
XP_011 TVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 864 init1: 761 opt: 869 Z-score: 922.7 bits: 179.0 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 869; 44.4% identity (72.4% similar) in 304 aa overlap (26-327:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSGNQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLTV
: ::...:.:.:: .: ::: ::::: :::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCVI
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NP_003 LGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFL
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 QLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLFQ
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NP_003 QMYFFISLATTECILFGLMAYDRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTFADIGFLALTCFMLILTSYG
:: : : :: : . ..::: : ...:.:.:: ..: .. : . ...::.::.
NP_003 TSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYS
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pF1KE0 YIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPL--DGVVAVFYT
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NP_003 YVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYT
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NP_003 VVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
280 290 300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSG-NQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLT
:: ::.:::.:.:.:: . :: ::. :: .:: :
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XP_011 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 859 init1: 746 opt: 868 Z-score: 921.7 bits: 178.8 E(85289): 1.3e-44
Smith-Waterman score: 868; 43.8% identity (75.2% similar) in 306 aa overlap (24-325:2-306)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLEGVEHLLLLLLLTDVNSKELQSG-NQTSVSHFILVGLHHPPQLGAPLFLAFLVIYLLT
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLAT
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NP_036 VLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCL
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pF1KE0 IQL-FSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSL
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NP_036 LHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILAS
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pF1KE0 YGYIVAAILRIPSADGRRNAFSTCAAHLTVVIVYYVPCTFIYLRPCSQEPL--DGVVAVF
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pF1KE0 YTVITPLLNSIIYTLCNKEMKAALQRLGGHKEVQPH
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NP_036 YTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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Smith-Waterman score: 865; 45.9% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (26-327:3-306)
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NP_009 VGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSV
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pF1KE0 QLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLFQ
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NP_009 QIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQ
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NP_009 AVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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Smith-Waterman score: 857; 43.5% identity (74.6% similar) in 299 aa overlap (26-323:5-302)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 SGNGLIILTVLVDIRLHRPMCLFLCHLSFLDMTISCAIVPKMLAGFLLGSRIISFGGCVI
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NP_003 LGNLLLISLVHVDSQLHTPMYFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAA
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pF1KE0 QLFSFHFLGCTECFLYTLMAYDRFLAICKPLHYATIMTHRVCNSLALGTWLGGTIHSLFQ
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100 110 120 130 140 150
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pF1KE0 TSFVFRLPFCGPNRVDYIFCDIPAMLRLACADTAINELVTF-ADIGFLALTCFMLILTSY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]