Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0852
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0852, 298 aa
1>>>pF1KE0852 298 - 298 aa - 298 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5944+/-0.00128; mu= 14.0283+/- 0.075
mean_var=144.5845+/-47.172, 0's: 0 Z-trim(103.0): 390 B-trim: 887 in 2/45
Lambda= 0.106663
statistics sampled from 6685 (7209) to 6685 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 1070 177.1 1.5e-44
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 1055 174.8 7.5e-44
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 1037 172.0 5.1e-43
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 1018 169.1 3.9e-42
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 983 163.7 1.6e-40
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 976 162.6 3.4e-40
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 968 161.4 8e-40
CCDS31701.1 OR10S1 gene_id:219873|Hs108|chr11 ( 331) 933 156.0 3.5e-38
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 904 151.5 7.4e-37
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 899 150.8 1.3e-36
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 898 150.6 1.4e-36
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 897 150.5 1.6e-36
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 894 150.0 2.2e-36
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 890 149.4 3.3e-36
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 884 148.4 6.3e-36
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 879 147.7 1.1e-35
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 876 147.3 1.6e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 868 146.0 3.4e-35
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 866 145.7 4.2e-35
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 863 145.2 5.8e-35
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 862 145.1 6.6e-35
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 861 144.9 7.4e-35
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 860 144.7 8.1e-35
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 858 144.4 1e-34
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 855 144.1 1.5e-34
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 854 143.8 1.5e-34
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CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 850 143.2 2.3e-34
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 850 143.2 2.4e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 850 143.2 2.4e-34
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 849 143.0 2.6e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 848 142.9 2.9e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 847 142.7 3.2e-34
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 846 142.6 3.7e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 846 142.6 3.7e-34
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 845 142.4 4e-34
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 845 142.4 4e-34
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 844 142.3 4.4e-34
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 843 142.1 5e-34
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 842 142.0 5.5e-34
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 841 141.8 6.2e-34
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 841 141.8 6.2e-34
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 840 141.7 6.7e-34
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CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 839 141.5 7.5e-34
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 838 141.4 8.5e-34
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 837 141.2 9.4e-34
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 834 140.8 1.3e-33
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 833 140.6 1.5e-33
>>CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 816 init1: 816 opt: 1070 Z-score: 913.2 bits: 177.1 E(32554): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 1070; 51.5% identity (79.3% similar) in 295 aa overlap (1-294:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRNHTMVTEFILLGIPETEGLETALLFLFSSFYLCTLLGNVLILTAIISSTRLHTPMYFF
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CCDS31 MSNATLLTAFILTGLPHAPGLDAPLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 LGNLSIFDLGFSSTTVPKMLFYL-SGNSHAISYAGCVSQLFFYHFLGCTECFLYTVMACD
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pF1KE0 PAVLPLACKDTSLAQRVGFTNVGLLSLICFFLILVSYTCIGISISKIRSAEGRQRAFSTC
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pF1KE0 SAHLTAILCAYGPVIVIYLQPNPSALLGSIIQILNNLVTPMLNPLIYSLRNKDVKSDQP
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CCDS31 ASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRDALHGVVAVFYTTLTPLFNPVVYTLRNKEVKKALLK
250 260 270 280 290 300
CCDS31 LKNGSVFAQGE
310
>>CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1055; 50.8% identity (79.0% similar) in 295 aa overlap (1-294:1-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRNHTMVTEFILLGIPETEGLETALLFLFSSFYLCTLLGNVLILTAIISSTRLHTPMYFF
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CCDS31 MSNASLVTAFILTGLPHAPGLDALLFGIFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTPMYYF
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pF1KE0 LGNLSIFDLGFSSTTVPKMLFYL-SGNSHAISYAGCVSQLFFYHFLGCTECFLYTVMACD
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pF1KE0 RFVAICFPLRYTVIMNHRVCFMLATGTWMIGCVHAMILTPLTFQLPYCGPNKVGYYFCDI
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CCDS31 RYLAISYPLRYTSMMSGSRCALLATGTWLSGSLHSAVQTILTFHLPYCGPNQIQHYFCDA
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180 190 200 210 220 230
pF1KE0 PAVLPLACKDTSLAQRVGFTNVGLLSLICFFLILVSYTCIGISISKIRSAEGRQRAFSTC
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CCDS31 PPILKLACADTSANVMVIFVDIGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSDGRRRAFQTC
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SAHLTAILCAYGPVIVIYLQPNPSALLGSIIQILNNLVTPMLNPLIYSLRNKDVKSDQP
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CCDS31 ASHCIVVLCFFVPCVVIYLRPGSMDAMDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLK
250 260 270 280 290 300
CCDS31 LRDKVAHPQRK
310
>>CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 (311 aa)
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pF1KE0 MRNHTMVTEFILLGIPETEGLETALLFLFSSFYLCTLLGNVLILTAIISSTRLHTPMYFF
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pF1KE0 LGNLSIFDLGFSSTTVPKMLFYL-SGNSHAISYAGCVSQLFFYHFLGCTECFLYTVMACD
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CCDS31 LTNLSFIDMWFSTVTVPKMLMTLVSPSGRAISFHSCVAQLYFFHFLGSTECFLYTVMSYD
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pF1KE0 RFVAICFPLRYTVIMNHRVCFMLATGTWMIGCVHAMILTPLTFQLPYCGPNKVGYYFCDI
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pF1KE0 PAVLPLACKDTSLAQRVGFTNVGLLSLICFFLILVSYTCIGISISKIRSAEGRQRAFSTC
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CCDS31 ASHCIVVLCFFVPCVFIYLRPGSRDVVDGVVAIFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKAVLK
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CCDS31 LRDKVAHSQGE
310
>>CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 (311 aa)
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CCDS31 MSNASLLTAFILMGLPHAPALDAPLFGVFLVVYVLTVLGNLLILLVIRVDSHLHTTMYYF
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pF1KE0 LGNLSIFDLGFSSTTVPKMLFYLSGNS-HAISYAGCVSQLFFYHFLGCTECFLYTVMACD
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CCDS31 LTNLSFIDMWFSTVTVPKLLMTLVFPSGRAISFHSCMAQLYFFHFLGGTECFLYRVMSCD
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CCDS31 RYLAISYPLRYTSMMTGRSCTLLATSTWLSGSLHSAVQAILTFHLPYCGPNWIQHYLCDA
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CCDS31 PPILKLACADTSAIETVIFVTVGIVASGCFVLIVLSYVSIVCSILRIRTSEGKHRAFQTC
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CCDS31 ASHCIVVLCFFGPGLFIYLRPGSRKAVDGVVAVFYTVLTPLLNPVVYTLRNKEVKKALLK
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CCDS31 LKDKVAHSQSK
310
>>CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 (313 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MRNHTMVTEFILLGIPETEGLETALLFLFSSFYLCTLLGNVLILTAIISSTRLHT-PM
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CCDS32 YIFLGVLSVIDMSISSIIVPRLMMNFTLGVKPIPFGGCVAQLYFYHFLGSTQCFLYTLMA
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pF1KE0 CDRFVAICFPLRYTVIMNHRVCFMLATGTWMIGCVHAMILTPLTFQLPYCGPNKVGYYFC
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CCDS32 YDRYLAICQPLRYPVLMTAKLSALLVAGAWMAGSIHGALQAILTFRLPYCGPNQVDYFFC
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CCDS32 DIPAVLRLACADTTVNELVTFVDIGVVVASCFSLILLSYIQIIQAILRIHTADGRRRAFS
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pF1KE0 TCSAHLTAILCAYGPVIVIYLQPNPSALLGSIIQILNNLVTPMLNPLIYSLRNKDVKSDQ
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CCDS32 TCGAHVTVVTVYYVPCAFIYLRPETNSPLDGAAALVPTAITPFLNPLIYTLRNQEVKLAL
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pF1KE0 P
CCDS32 KRMLRSPRTPSEV
310
>>CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 976; 49.5% identity (79.7% similar) in 291 aa overlap (6-295:12-302)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MRNHTMVTEFILLGIPETEGLETALLFLFSSFYLCTLLGNVLILTAIISSTRLH
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CCDS32 MGKTKNTSLDAVVTDFILLGLSHPPNLRSLLFLVFFIIYILTQLGNLLILLTMWADPKLC
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