Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0821
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0821, 270 aa
1>>>pF1KE0821 270 - 270 aa - 270 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8292+/-0.00121; mu= 11.7637+/- 0.072
mean_var=127.5788+/-40.871, 0's: 0 Z-trim(101.3): 369 B-trim: 387 in 1/47
Lambda= 0.113549
statistics sampled from 6016 (6453) to 6016 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 1.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1145 199.7 2.2e-51
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 974 171.7 5.8e-43
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 923 163.4 2e-40
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 904 160.2 1.6e-39
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 855 152.2 4.3e-37
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 839 149.6 2.7e-36
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 837 149.2 3.3e-36
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 819 146.3 2.5e-35
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 814 145.5 4.5e-35
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 809 144.6 7.9e-35
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 799 143.0 2.5e-34
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 792 141.9 5.4e-34
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 771 138.4 5.9e-33
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 756 136.0 3.3e-32
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 744 134.0 1.3e-31
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 736 132.7 3.2e-31
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 731 131.9 5.7e-31
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 729 131.6 7e-31
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 729 131.6 7.4e-31
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 726 131.1 9.9e-31
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 722 130.4 1.5e-30
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 717 129.6 2.7e-30
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 715 129.3 3.5e-30
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 710 128.5 6.5e-30
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 707 128.0 8.6e-30
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 696 126.1 2.9e-29
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 696 126.2 3e-29
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 690 125.2 5.8e-29
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 682 123.8 1.4e-28
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 679 123.4 2e-28
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 677 123.0 2.5e-28
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 673 122.4 4e-28
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 659 120.1 2e-27
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 657 119.8 2.5e-27
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 656 119.6 2.8e-27
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 646 118.0 8.7e-27
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 635 116.1 3e-26
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 596 109.8 2.5e-24
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 589 108.6 5.7e-24
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 577 106.7 2.2e-23
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 577 106.7 2.4e-23
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 569 105.3 5.4e-23
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 556 103.3 2.6e-22
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 541 100.8 1.3e-21
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 538 100.3 1.8e-21
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 538 100.3 1.8e-21
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 533 99.5 3.3e-21
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 503 94.5 9.7e-20
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 492 92.7 3.4e-19
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 489 92.2 4.8e-19
>>CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 (323 aa)
initn: 1144 init1: 903 opt: 1145 Z-score: 1036.1 bits: 199.7 E(32554): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 1145; 65.8% identity (84.6% similar) in 266 aa overlap (14-267:1-266)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFSLHRETPKEGMFGANLTTFHPTLFILLGIPGLEQYHIWLSIPFYLMYITAVLGNGAL
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CCDS53 MSHTNVTIFHPAVFVLPGIPGLEAYHIWLSIPLCLIYITAVLGNSIL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 ILVVLSEHTLHV----FLSMLAGTDILLSTTTVPKALAIFWVHAGEIAFDACITQMFFIH
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CCDS53 IVVIVMERNLHVPMYFFLSMLAVMDILLSTTTVPKALAIFWLQAHNIAFDACVTQGFFVH
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VAFVAESGILLAMAFDSYVAICTPLRYTTILTSMVIGKMTLTIWGQSIGTIFPVIFLLKR
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CCDS53 MMFVGESAILLAMAFDRFVAICAPLRYTTVLTWPVVGRIALAVITRSFCIIFPVIFLLKR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LPYCQTNIIPHSYCEHIGVAQLACADITVNIWYGFSVPMASVLVDVAFIGFSYTLILQAV
::.: :::.:::::::::::.:::::::::::::::::.. :..:: .:. ::.:::.::
CCDS53 LPFCLTNIVPHSYCEHIGVARLACADITVNIWYGFSVPIVMVILDVILIAVSYSLILRAV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KE0 FRLPSQESQHKALNTCGSTLEL--------FSSSSSHHFLLS
::::::...::::.:::: : . : . .:::
CCDS53 FRLPSQDARHKALSTCGSHLCVILMFYVPSFFTLLTHHFGRNIPQHVHILLANLYVAVPP
230 240 250 260 270 280
CCDS53 MLNPIVYGVKTKQIREGVAHRFFDIKTWCCTSPLGS
290 300 310 320
>>CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 764 init1: 764 opt: 974 Z-score: 884.8 bits: 171.7 E(32554): 5.8e-43
Smith-Waterman score: 974; 59.8% identity (82.2% similar) in 241 aa overlap (18-254:11-251)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFSLHRETPKEGMFGANLTTFHPTLFILLGIPGLEQYHIWLSIPFYLMYITAVLGNGAL
::....: :::.:::::::.:.:..::: ..::.::.:: :
CCDS31 MPSASAMIIFNLSSYNPGPFILVGIPGLEQFHVWIGIPFCIIYIVAVVGNCIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ILVVLSEHTLH----VFLSMLAGTDILLSTTTVPKALAIFWVHAGEIAFDACITQMFFIH
. ... ::.:: :::::: ::..:::. :::::.:::. : ::.: .:.:::::.:
CCDS31 LYLIVVEHSLHEPMFFFLSMLAMTDLILSTAGVPKALSIFWLGAREITFPGCLTQMFFLH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VAFVAESGILLAMAFDSYVAICTPLRYTTILTSMVIGKMTLTIWGQSIGTIFPVIFLLKR
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CCDS31 YNFVLDSAILMAMAFDHYVAICSPLRYTTILTPKTIIKSAMGISFRSFCIILPDVFLLTC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LPYCQTNIIPHSYCEHIGVAQLACADITVNIWYGFSVPMASVLVDVAFIGFSYTLILQAV
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CCDS31 LPFCRTRIIPHTYCEHIGVAQLACADISINFWYGFCVPIMTVISDVILIAVSYAHILCAV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KE0 FRLPSQESQHKALNTCGSTLELFSSSSSHHFLLS
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CCDS31 FGLPSQDACQKALGTCGSHVCVILMFYTPAFFSILAHRFGHNVSRTFHIMFANLYIVIPP
240 250 260 270 280 290
>>CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 (335 aa)
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Smith-Waterman score: 923; 60.0% identity (82.6% similar) in 230 aa overlap (29-254:34-262)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFFSLHRETPKEGMFGANLTTFHPTLFILLGIPGLEQYHIWLSIPFYLMYITAVLGNG
: ::::::: :::::::: .:::::. :::
CCDS41 VRALHKIMALFSANSIGAMNNSDTRIAGCFLTGIPGLEQLHIWLSIPFCIMYITALEGNG
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pF1KE0 ALILVVLSEHTLH----VFLSMLAGTDILLSTTTVPKALAIFWVHAGEIAFDACITQMFF
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CCDS41 ILICVILSQAILHEPMYIFLSMLASADVLLSTTTMPKALANLWLGYSLISFDGCLTQMFF
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pF1KE0 IHVAFVAESGILLAMAFDSYVAICTPLRYTTILTSMVIGKMTLTIWGQSIGTIFPVIFLL
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CCDS41 IHFLFI-HSAVLLAMAFDRYVAICSPLRYVTILTSKVIGKIVTAALSHSFIIMFPSIFLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KRLPYCQTNIIPHSYCEHIGVAQLACADITVNIWYGFSVPMASVLVDVAFIGFSYTLILQ
..: ::: ::: :..:::.:.:.:.:.::..:.:::... . :. .:. .: :: :::
CCDS41 EHLHYCQINIIAHTFCEHMGIAHLSCSDISINVWYGLAAALLSTGLDIMLITVSYIHILQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270
pF1KE0 AVFRLPSQESQHKALNTCGSTLELFSSSSSHHFLLS
::::: ::... :::.::::
CCDS41 AVFRLLSQDARSKALSTCGSHICVILLFYVPALFSVFAYRFGGRSVPCYVHILLASLYVV
250 260 270 280 290 300
>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 729 init1: 729 opt: 904 Z-score: 822.8 bits: 160.2 E(32554): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 904; 54.5% identity (80.5% similar) in 246 aa overlap (14-254:1-246)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MFFSLHRETPKEGMFGANLTTFH-PTLFILLGIPGLEQYHIWLSIPFYLMYITAVLGNGA
: .::. : : :.: :::::: :.:..::: ::..:..::.:
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LILVVLSEHTLH----VFLSMLAGTDILLSTTTVPKALAIFWVHAGEIAFDACITQMFFI
::::. ...:: .:: .:. ::. ::.::::: :::.:.:::::.: .:..::: .
CCDS31 LILVIAMDNALHAPMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCV
50 60 70 80 90 100
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pF1KE0 HVAFVAESGILLAMAFDSYVAICTPLRYTTILTSMVIGKMTLTIWGQSIGTIFPVIFLLK
: .. ::.:::::::: :::::.::::::::. :::.. .. .:.. . : ::::.
CCDS31 HSIYALESSILLAMAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RLPYCQTNIIPHSYCEHIGVAQLACADITVNIWYGFSVPMASVLVDVAFIGFSYTLILQA
::::: .. :.::::.:.:.::::.::::: ::..: . .. .: .:..:: .::.:
CCDS31 RLPYCGHRVMTHTYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KE0 VFRLPSQESQHKALNTCGSTLELFSSSSSHHFLLS
::.:::...:::::.::::
CCDS31 VFHLPSHDAQHKALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLV
230 240 250 260 270 280
>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 858 init1: 516 opt: 855 Z-score: 779.4 bits: 152.2 E(32554): 4.3e-37
Smith-Waterman score: 855; 52.2% identity (78.0% similar) in 245 aa overlap (14-254:5-248)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFSLHRETPKEGMFGANLTTFHPTLFILLGIPGLEQYHIWLSIPFYLMYITAVLGNGAL
: .: : :::. :.::::::::. :::...::...:..:.::: ::
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTAL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 ILVVLSEHTLH----VFLSMLAGTDILLSTTTVPKALAIFWVHAGEIAFDACITQMFFIH
..:. .:..:: ::.:: . :. :::.:.:: :.::: .. ::.: .:...:::::
CCDS31 LFVIQTEQSLHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VAFVAESGILLAMAFDSYVAICTPLRYTTILTSMVIGKMTLTIWGQSIGTIFPVIFLLKR
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CCDS31 FFTAMESIVLVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVPLVFLLLR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LPYCQTNIIPHSYCEHIGVAQLACADITVNIWYGFSVPMASVLVDVAFIGFSYTLILQAV
::.: ::::.::::.:.:.::::.: ::: .:.. .. .:.:: .: .::. :: ::
CCDS31 LPFCGHRIIPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLG-NISLLLLDVILIILSYVRILYAV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270
pF1KE0 FRLPSQESQHKALNTCGSTLELFSSSSSHHFLLS
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CCDS31 FCLPSWEARLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPP
240 250 260 270 280 290
>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 (325 aa)
initn: 843 init1: 529 opt: 839 Z-score: 765.2 bits: 149.6 E(32554): 2.7e-36
Smith-Waterman score: 839; 49.4% identity (80.0% similar) in 245 aa overlap (14-254:1-244)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFFSLHRETPKEGMFGANLTTFHPTLFILLGIPGLEQYHIWLSIPFYLMYITAVLGNGAL
:: : : :::. :.:::::::: :::...:: .:. :..:: ..
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 ILVVLSEHTLH----VFLSMLAGTDILLSTTTVPKALAIFWVHAGEIAFDACITQMFFIH
.::. .. .:: ::.::: ::. :::.:.:: :.:::.. : :.::.:::::::
CCDS31 LLVIKTDSSLHQPMFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIH
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VAFVAESGILLAMAFDSYVAICTPLRYTTILTSMVIGKMTLTIWGQSIGTIFPVIFLLKR
. ::..:.:::.:::::::.::.:..:::. :.. . : .. ... ..: :.:. :
CCDS31 NFTLMESAVLVAMAYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLILR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LPYCQTNIIPHSYCEHIGVAQLACADITVNIWYGFSVPMASVLVDVAFIGFSYTLILQAV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]