Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0802
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0802, 316 aa
1>>>pF1KE0802 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3877+/-0.000981; mu= 15.1433+/- 0.058
mean_var=76.0347+/-18.583, 0's: 0 Z-trim(104.6): 351 B-trim: 873 in 2/47
Lambda= 0.147085
statistics sampled from 7635 (8004) to 7635 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 597 136.4 3e-32
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 596 136.1 3.4e-32
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 578 132.3 5e-31
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 560 128.5 6.7e-30
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CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 485 112.6 4.3e-25
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CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 406 95.8 4.7e-20
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CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 400 94.5 1.1e-19
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 398 94.1 1.5e-19
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 780 init1: 437 opt: 761 Z-score: 880.8 bits: 171.2 E(32554): 9.7e-43
Smith-Waterman score: 762; 44.9% identity (69.5% similar) in 321 aa overlap (6-305:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKISNNSLGFLPTTFILVGIPGLESEHLWISVPFSLIYIIIFLGNGIILHVIRTDIAL
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CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
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CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDAC-FAQL---FFIH----C-
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CCDS31 --------FSFLESSVLLSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFP
120 130 140 150 160
180 190 200 210
pF1KE0 QCPLTFLLS------AP---QSY--------LSCGNISVNNIYGIFIVTSTFGLDSLLIV
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CCDS31 ---LPFMLKRFPYCGSPVLSHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLIL
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220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ISYGLILHTVLGIATGEGRKKALNTCGSHVCAVLAYYVPMIGLSIVHRLGHRVSPLLQAM
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CCDS31 FSYALILRTVLSIASRAERFKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVV
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280 290 300 310
pF1KE0 MANAYLFFPPVVNPIVYSIKTKEIHGAIVRMLLEKRRRV
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CCDS31 MGFMYLLFPPVMNPIVYSVKTKQIRDRVTHAFCY
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>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKISNNSLGFLPTTFILVGIPGLESEHLWISVPFSLIYIIIFLGNGIILHVIRTDIALHQ
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CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHE
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CCDS31 PMYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACL----IQMFLIH--------
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130 140 150 160 170
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CCDS31 -FFSMMESGILLAMSFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIK
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pF1KE0 QCPL--------TFLLSAPQSYLSCGNISVNNIYGIFIVTSTFGLDSLLIVISYGLILHT
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CCDS31 RLPICRSNVLSHSYCLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRS
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pF1KE0 VLGIATGEGRKKALNTCGSHVCAVLAYYVPMIGLSIVHRLGHRVSPLLQAMMANAYLFFP
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CCDS31 VMATASREERLKALNTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVP
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290 300 310
pF1KE0 PVVNPIVYSIKTKEIHGAIVRMLLEKRRRV
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CCDS31 PVLNPLIYSAKTKEIRRAIFRMFHHIKI
290 300 310
>>CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 (313 aa)
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CCDS31 PMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPEISSNACF----AQEFFIH-GFSVLES
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CCDS31 SVLL-IMSFDRFLAIHN-P-----LRYTSILTTVR-VAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLR
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pF1KE0 --------QCPLTFLLSAPQSYLSCGNISVNNIYGIFIVTSTFGLDSLLIVISYGLILHT
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CCDS31 NLRYCKKNQLSHSYCLHQDVMKLACSDNRIDVIYGFFGALCLM-VDFILIAVSYTLILKT
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pF1KE0 VLGIATGEGRKKALNTCGSHVCAVLAYYVPMIGLSIVHRLGHRVSPLLQAMMANAYLFFP
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CCDS31 VLGIASKKEQLKALNTCVSHICAVIIFYLPIINLAVVHRFARHVSPLINVLMANVLLLVP
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pF1KE0 PVVNPIVYSIKTKEIHGAIVRMLLEKRRRV
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CCDS31 PLTNPIVYCVKTKQIRVRVVAKLCQRKI
290 300 310
>>CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 (342 aa)
initn: 704 init1: 439 opt: 700 Z-score: 810.3 bits: 158.2 E(32554): 8.2e-39
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pF1KE0 MKISNNSLGFLPTTFILVGIPGLESEHLWISVPFSLIYIIIFLGNGII
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CCDS31 LFVVLCERSLHKPMYYFLSMLSATDLSLSLCTLSTTLGVFWFEAREINLNAC----IAQM
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::.: . .: ... .... :: . . : : . . ..:
CCDS31 FFLHGFTFMESGVLLAMAFDRFVAI---CYPLRYTTILTNA--RIAKIGMSMLIRNVAVM
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
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..:. . : ...:: : ::: . .:.: :.: . :: :.: :.
CCDS31 LPVMLFVKRLSFCS-SMVLSHSYCYHVDLIQLSCTDNRINSILGLFALLSTTGFDCPCIL
180 190 200 210 220
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pF1KE0 ISYGLILHTVLGIATGEGRKKALNTCGSHVCAVLAYYVPMIGLSIVHRLGHRVSPLLQAM
.:: ::...::.::..: :.::.::: ::. :: .:.:.:.::.::: :: . :... .
CCDS31 LSYILIIRSVLSIASSEERRKAFNTCTSHISAVSIFYLPLISLSLVHRYGHSAPPFVHII
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280 290 300 310
pF1KE0 MANAYLFFPPVVNPIVYSIKTKEIHGAIVRMLLEKRRRV
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CCDS31 MANVFLLIPPVLNPIIYSVKIKQIQKAIIKVLIQKHSKSNHQLFLIRDKAIYE
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>>CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 (326 aa)
initn: 711 init1: 449 opt: 697 Z-score: 807.1 bits: 157.6 E(32554): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 697; 39.3% identity (67.9% similar) in 321 aa overlap (1-313:12-323)
10 20 30 40
pF1KE0 MKISNNSLGFLPTTFILVGIPGLESEHLWISVPFSLIYIIIFLGNGIIL
: .:: . : : : :...::::. . :: .:: ..:.. . :: .::
CCDS53 MSVQYSLSPQFMLLSNITQ-FSPI-FYLTSFPGLEGIKHWIFIPFFFMYMVAISGNCFIL
10 20 30 40 50
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CCDS53 IIIKTNPRLHTPMYYLLSLLALTDLGLCVSTLPTTMGIFWFNSHSIYFGACQIQMF--CI
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: : . . .: : : . .: . .: :.: . . . . . ... :
CCDS53 HSFSFME-SSVLLMMSFDRLVAICHPLR-YSVIITGQQVVRAGLIVIFRGPV-ATIPIVL
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. .: .: : .: : :.: .:. ::.::...:. : :: .::..:::
CCDS53 LLKA--FPYCGSVVLSHSFCLHQEVIQLACTDITFNNLYGLMVVVFTVMLDLVLIALSYG
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:::::: :.:. : ...:..:: . .::::...:::.:::.:::.:... : .. .:::.
CCDS53 LILHTVAGLASQEEQRRAFQTCTAPLCAVLVFFVPMMGLSLVHRFGKHAPPAIHLLMANV
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::: ::..:::.::::::::: ::...: :.
CCDS53 YLFVPPMLNPIIYSIKTKEIHRAIIKFLGLKKASK
300 310 320
>>CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 (314 aa)
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CCDS31 PMYYFLSMLALNDLGVSFSTLPTVISTFCFNYNHVAFNACL----VQMFFIHTFSFMESG
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CCDS31 MLNPIIYSVKTKEIRKGILKFFHKSQA
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>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
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CCDS31 PMYYFISILAVNDLGMSLSTLPTMLAVLWLDAPEIQASACYAQLF--FIHTFTFLESSVL
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CCDS31 ALSHA--------------FCLHQDVLRLSCTDARTNSIYGLCVVIATLGVDSIFILLSY
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:::.::: ::. : . :::::: ::.:.:: ..::.::.:.:::.:...::... .::.
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CCDS31 IYLLLPPVLNPIVYSVRTKQIRLGILHKFVLRRRF
290 300 310
>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa)
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CCDS31 MSASNITLTH-PTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHE
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CCDS31 PMYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLA
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CCDS31 -MAFDRYVAICKP--LH-YTKVLTG----SLI-TKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRCFHY
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CCDS31 CRGPVIAHCYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLL
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CCDS31 ASQEARYKAFGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVN
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CCDS31 PIIYGVKTKQIRESILGVFPRKDM
300 310
>>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa)
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CCDS31 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE
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CCDS31 -LSGMESTVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIG-VAAVVRGAALMAPLPVFIK
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CCDS31 QLPFCRSNILSHSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKT
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CCDS31 VLGL-TREAQAKAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVP
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CCDS31 MSIINTSYVEI-TTFFLVGMPGLEYAHIWISIPICSMYLIAILGNGTILFIIKTEPSLHG
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CCDS31 PMYYFLSMLAMSDLGLSLSSLPTVLSIFLFNAPETSSSACF----AQEFFIH-GFSVLES
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CCDS31 SVLL-IMSFDRFLAIHN-P-----LRYTSILTTVR-VAQIGIVFSFKSMLLVLPFPFTLR
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