Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0578, 207 aa
1>>>pF1KE0578 207 - 207 aa - 207 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9407+/-0.000702; mu= 15.0559+/- 0.043
mean_var=57.8854+/-11.427, 0's: 0 Z-trim(108.2): 36 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.168574
statistics sampled from 10038 (10075) to 10038 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX ( 207) 1420 353.2 6.7e-98
CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 ( 208) 992 249.1 1.4e-66
CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 ( 211) 920 231.6 2.7e-61
CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 ( 208) 413 108.3 3.5e-24
CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 170) 403 105.8 1.6e-23
CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 252) 401 105.4 3.1e-23
CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 247) 398 104.7 5.1e-23
CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 ( 268) 398 104.7 5.5e-23
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 380 100.2 8.7e-22
CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 199) 377 99.5 1.5e-21
CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 226) 376 99.3 1.9e-21
CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 192) 375 99.0 2e-21
CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 245) 376 99.3 2.1e-21
CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 255) 376 99.3 2.1e-21
CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 181) 369 97.6 5.3e-21
CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 243) 369 97.6 6.7e-21
CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 ( 225) 350 93.0 1.5e-19
CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12 ( 208) 347 92.2 2.4e-19
CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11 ( 206) 329 87.9 5e-18
CCDS4275.1 FGF1 gene_id:2246|Hs108|chr5 ( 155) 327 87.3 5.5e-18
CCDS8195.1 FGF3 gene_id:2248|Hs108|chr11 ( 239) 324 86.7 1.3e-17
CCDS34059.1 FGF2 gene_id:2247|Hs108|chr4 ( 288) 269 73.3 1.6e-13
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 204) 245 67.4 6.9e-12
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 215) 245 67.4 7.3e-12
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 233) 245 67.5 7.8e-12
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10 ( 244) 245 67.5 8.1e-12
CCDS74241.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 165) 236 65.2 2.7e-11
>>CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX (207 aa)
initn: 1420 init1: 1420 opt: 1420 Z-score: 1871.1 bits: 353.2 E(32554): 6.7e-98
Smith-Waterman score: 1420; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (1-207:1-207)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRH
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KE0 QKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
190 200
>>CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 (208 aa)
initn: 969 init1: 915 opt: 992 Z-score: 1308.5 bits: 249.1 E(32554): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 992; 71.6% identity (87.0% similar) in 208 aa overlap (1-204:4-205)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPL--ADSPGFLNERLGQIE-GKLQRGSP-TDF
..:::. :. : . .::::. .::: .:...::: : : : :: ::.
CCDS92 MAPLGEVGNYFGVQD------AVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 AHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGL
::::::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.::::.:::::::::
CCDS92 DHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPRE
::::::.::::::.:::.::::::::::::::::.:.:::: :. :.:::::::::.:::
CCDS92 YLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPRE
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE0 GYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
: ::::::::::::::::::.:.: . .:..
CCDS92 GTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
180 190 200
>>CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 (211 aa)
initn: 908 init1: 861 opt: 920 Z-score: 1213.8 bits: 231.6 E(32554): 2.7e-61
Smith-Waterman score: 920; 63.9% identity (86.1% similar) in 208 aa overlap (1-206:4-210)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSP--TDFAH
.::::: ...:. . .: . : .. : .:.:: . : . ::.: ...::
CCDS59 MAPLAEVGGFLGGLEGLGQQVGSHFLLPPAGERPPLLGERRSAAE-RSARGGPGAAQLAH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYL
:.::::::::::::::::.:.:.:.:.:::.::: ::::::::.::::.:::::::::::
CCDS59 LHGILRRRQLYCRTGFHLQILPDGSVQGTRQDHSLFGILEFISVAVGLVSIRGVDSGLYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 GMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGY
:::..::::::.::: ::.:::::::::::::.:..:::.:. :.:.:::::::.::.:
CCDS59 GMNDKGELYGSEKLTSECIFREQFEENWYNTYSSNIYKHGDTGRRYFVALNKDGTPRDGA
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE0 RTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
:.:::::::::::::::: ..: . .::. :
CCDS59 RSKRHQKFTHFLPRPVDPERVPELYKDLLMYT
180 190 200 210
>>CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 (208 aa)
initn: 405 init1: 298 opt: 413 Z-score: 547.5 bits: 108.3 E(32554): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 413; 43.4% identity (78.7% similar) in 136 aa overlap (53-188:70-203)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 GNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVH
. ::.: .: :.:. : . :.: :: :
CCDS39 LGQDMVSPEATNSSSSSFSSPSSAGRHVRSYNHLQGDVRWRKLFSFTKYFLKIEKNGKVS
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 GTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEEN
::.... ..:::. :. .:........:. ::.::..:.:::::... .: ..:..:::
CCDS39 GTKKENCPYSILEITSVEIGVVAVKAINSNYYLAMNKKGKLYGSKEFNNDCKLKERIEEN
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 WYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRD
:::::: ..:. ::.::::: :.::.: .:.:.. .::::
CCDS39 GYNTYASFNWQHNG--RQMYVALNGKGAPRRGQKTRRKNTSAHFLPMVVHS
160 170 180 190 200
pF1KE0 LFHYR
>>CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 (170 aa)
initn: 390 init1: 305 opt: 403 Z-score: 535.7 bits: 105.8 E(32554): 1.6e-23
Smith-Waterman score: 403; 45.1% identity (76.1% similar) in 142 aa overlap (47-188:28-166)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 GFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIF
:: : .. ::.: .: :.:. : : :..
CCDS12 MRRRLWLGLAWLLLARAPDAAGTPSASRG-PRSYPHLEGDVRWRRLFSSTHFFLRVD
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 PNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFR
:.: :.::: :.. .:::. :. ::.. :..:.::.:..::.::.::::. : .: ::
CCDS12 PGGRVQGTRWRHGQDSILEIRSVHVGVVVIKAVSSGFYVAMNRRGRLYGSRLYTVDCRFR
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKL
:..::: .::::: ... . ...::.. :.:: : ::.:.. .::::
CCDS12 ERIEENGHNTYASQRWRRRG--QPMFLALDRRGGPRPGGRTRRYHLSAHFLPVLVS
120 130 140 150 160 170
200
pF1KE0 PSMSRDLFHYR
>>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (252 aa)
initn: 425 init1: 370 opt: 401 Z-score: 530.5 bits: 105.4 E(32554): 3.1e-23
Smith-Waterman score: 401; 39.2% identity (74.5% similar) in 153 aa overlap (49-199:67-216)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 SSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPN
.::: .::::. : :::: :..:.. :.
CCDS95 PKSMWFLWNIFSKGTHMLQCLCGKSLKKNKNPTD-PQLKGIVTR--LYCRQGYYLQMHPD
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 GTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQ
:.. ::. : . ....: ... ...:.:: .:::..:: .: :: :. .: :: :.:.
CCDS95 GALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSELFTPECKFKES
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 FEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPS--KL
::.: :.: ::....: : ....:::.:. .: :.:. . .::::.:.. . .
CCDS95 VFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFLPKPLEVAMYRE
160 170 180 190 200 210
200
pF1KE0 PSMSRDLFHYR
::.
CCDS95 PSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
220 230 240 250
>>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (247 aa)
initn: 425 init1: 370 opt: 398 Z-score: 526.7 bits: 104.7 E(32554): 5.1e-23
Smith-Waterman score: 398; 37.2% identity (72.6% similar) in 164 aa overlap (38-199:54-211)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 FASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYC
.: . .:.: .: .::::. : :::
CCDS95 PSASRRRSSPSKNRGLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRRLRRQDP----QLKGIVTR--LYC
30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSK
: :..:.. :.:.. ::. : . ....: ... ...:.:: .:::..:: .: :: :.
CCDS95 RQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 KLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFL
.: :: :.:. ::.: :.: ::....: : ....:::.:. .: :.:. . .:::
CCDS95 LFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFL
140 150 160 170 180 190
190 200
pF1KE0 PRPVDPS--KLPSMSRDLFHYR
:.:.. . . ::.
CCDS95 PKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
200 210 220 230 240
>>CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 (268 aa)
initn: 376 init1: 254 opt: 398 Z-score: 526.2 bits: 104.7 E(32554): 5.5e-23
Smith-Waterman score: 398; 38.7% identity (71.5% similar) in 186 aa overlap (19-200:51-228)
10 20 30 40
pF1KE0 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRG
::.... ..::. ::. . :...
CCDS34 HGEKRLAPKGQPGPAATDRNPRGSSSRQSSSSAMSSSSASSSPA---ASLGSQGSGLEQS
30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SPTDFAHLKGILRRRQLYCRTG--FHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISI
: : . : .::::.: :::.:.:.: :.:. :. . ...::..... :...:
CCDS34 S---FQWSPSGRRTGSLYCRVGIGFHLQIYPDGKVNGS-HEANMLSVLEIFAVSQGIVGI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 RGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALN
::: :. .:.:...:.:..: :.: .: :::.:.:: ::::::.... . :..:::::
CCDS34 RGVFSNKFLAMSKKGKLHASAKFTDDCKFRERFQENSYNTYASAIHRTEKTGREWYVALN
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200
pF1KE0 KDGSPREGY--RTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
: :. ..: :.: .. :::::: :. : .:
CCDS34 KRGKAKRGCSPRVKPQHISTHFLPR-FKQSEQPELSFTVTVPEKKKPPSPIKPKIPLSAP
200 210 220 230 240 250
CCDS34 RKNTNSVKYRLKFRFG
260
>>CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 (194 aa)
initn: 381 init1: 260 opt: 380 Z-score: 504.6 bits: 100.2 E(32554): 8.7e-22
Smith-Waterman score: 380; 43.3% identity (79.1% similar) in 134 aa overlap (58-191:62-193)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 ADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHD
: .: :.:.::: ..:.: : :.::..
CCDS10 CNDMTPEQMATNVNCSSPERHTRSYDYMEGGDIRVRRLFCRTQWYLRIDKRGKVKGTQEM
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 HSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTY
.. ..:.:. ..:::...:.::.: .::.::..:.::..:. ...: :.: . :: ::::
CCDS10 KNNYNIMEIRTVAVGIVAIKGVESEFYLAMNKEGKLYAKKECNEDCNFKELILENHYNTY
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 ASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
::. . :. .: ..::::. : : .: .::..:: .:::: .
CCDS10 ASAKWTHNGGE--MFVALNQKGIPVRGKKTKKEQKTAHFLPMAIT
160 170 180 190
>>CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (199 aa)
initn: 388 init1: 353 opt: 377 Z-score: 500.5 bits: 99.5 E(32554): 1.5e-21
Smith-Waterman score: 377; 35.3% identity (71.2% similar) in 170 aa overlap (39-206:3-169)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 ASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCR
:.. .. . . .::::. . :: :
CCDS55 MSGKVTKPKEEKDASKEPQLKGIVTK--LYSR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKK
:.::.. .::. ::. . : . ....: ... ...:.::.. :::.:: .: :: :.
CCDS55 QGYHLQLQADGTIDGTKDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSEL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLP
.: :: :.:. ::.: ::.: .:....: : .:..:::.: .: ..:... .::::
CCDS55 FTPECKFKESVFENYYVTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLP
100 110 120 130 140 150
190 200
pF1KE0 RPVDPS--KLPSMSRDLFHYR
.:. . : ::. .:: ..
CCDS55 KPLKVAMYKEPSL-HDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
160 170 180 190
207 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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