Result of FASTA (ccds) for pFN21AE0578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0578, 207 aa
  1>>>pF1KE0578 207 - 207 aa - 207 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9407+/-0.000702; mu= 15.0559+/- 0.043
 mean_var=57.8854+/-11.427, 0's: 0 Z-trim(108.2): 36  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.168574
 statistics sampled from 10038 (10075) to 10038 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  2.080

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX          ( 207) 1420 353.2 6.7e-98
CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13           ( 208)  992 249.1 1.4e-66
CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8          ( 211)  920 231.6 2.7e-61
CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5           ( 208)  413 108.3 3.5e-24
CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19        ( 170)  403 105.8 1.6e-23
CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13          ( 252)  401 105.4 3.1e-23
CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13          ( 247)  398 104.7 5.1e-23
CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4           ( 268)  398 104.7 5.5e-23
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15          ( 194)  380 100.2 8.7e-22
CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 199)  377 99.5 1.5e-21
CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 226)  376 99.3 1.9e-21
CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 192)  375 99.0   2e-21
CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 245)  376 99.3 2.1e-21
CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX          ( 255)  376 99.3 2.1e-21
CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3          ( 181)  369 97.6 5.3e-21
CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3           ( 243)  369 97.6 6.7e-21
CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17         ( 225)  350 93.0 1.5e-19
CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12           ( 208)  347 92.2 2.4e-19
CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11           ( 206)  329 87.9   5e-18
CCDS4275.1 FGF1 gene_id:2246|Hs108|chr5            ( 155)  327 87.3 5.5e-18
CCDS8195.1 FGF3 gene_id:2248|Hs108|chr11           ( 239)  324 86.7 1.3e-17
CCDS34059.1 FGF2 gene_id:2247|Hs108|chr4           ( 288)  269 73.3 1.6e-13
CCDS7518.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 204)  245 67.4 6.9e-12
CCDS7515.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 215)  245 67.4 7.3e-12
CCDS7517.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 233)  245 67.5 7.8e-12
CCDS7516.1 FGF8 gene_id:2253|Hs108|chr10           ( 244)  245 67.5 8.1e-12
CCDS74241.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19        ( 165)  236 65.2 2.7e-11


>>CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX               (207 aa)
 initn: 1420 init1: 1420 opt: 1420  Z-score: 1871.1  bits: 353.2 E(32554): 6.7e-98
Smith-Waterman score: 1420; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (1-207:1-207)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGIL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 RRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNER
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       
pF1KE0 QKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
       :::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
              190       200       

>>CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13                (208 aa)
 initn: 969 init1: 915 opt: 992  Z-score: 1308.5  bits: 249.1 E(32554): 1.4e-66
Smith-Waterman score: 992; 71.6% identity (87.0% similar) in 208 aa overlap (1-204:4-205)

                  10        20          30        40         50    
pF1KE0    MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPL--ADSPGFLNERLGQIE-GKLQRGSP-TDF
          ..:::. :.  :      .  .::::.  .::: .:...::: : : : ::   ::.
CCDS92 MAPLGEVGNYFGVQD------AVPFGNVPVLPVDSPVLLSDHLGQSEAGGLPRGPAVTDL
               10              20        30        40        50    

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE0 AHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGL
        ::::::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.::::.:::::::::
CCDS92 DHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTIQGTRKDHSRFGILEFISIAVGLVSIRGVDSGL
           60        70        80        90       100       110    

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE0 YLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPRE
       ::::::.::::::.:::.::::::::::::::::.:.:::: :. :.:::::::::.:::
CCDS92 YLGMNEKGELYGSEKLTQECVFREQFEENWYNTYSSNLYKHVDTGRRYYVALNKDGTPRE
          120       130       140       150       160       170    

           180       190       200       
pF1KE0 GYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
       : ::::::::::::::::::.:.: . .:..   
CCDS92 GTRTKRHQKFTHFLPRPVDPDKVPELYKDILSQS
          180       190       200        

>>CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8               (211 aa)
 initn: 908 init1: 861 opt: 920  Z-score: 1213.8  bits: 231.6 E(32554): 2.7e-61
Smith-Waterman score: 920; 63.9% identity (86.1% similar) in 208 aa overlap (1-206:4-210)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE0    MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSP--TDFAH
          .::::: ...:.   .  .: .   : .. : .:.:: .  : .  ::.:  ...::
CCDS59 MAPLAEVGGFLGGLEGLGQQVGSHFLLPPAGERPPLLGERRSAAE-RSARGGPGAAQLAH
               10        20        30        40         50         

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE0 LKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYL
       :.::::::::::::::::.:.:.:.:.:::.::: ::::::::.::::.:::::::::::
CCDS59 LHGILRRRQLYCRTGFHLQILPDGSVQGTRQDHSLFGILEFISVAVGLVSIRGVDSGLYL
      60        70        80        90       100       110         

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE0 GMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGY
       :::..::::::.::: ::.:::::::::::::.:..:::.:. :.:.:::::::.::.: 
CCDS59 GMNDKGELYGSEKLTSECIFREQFEENWYNTYSSNIYKHGDTGRRYFVALNKDGTPRDGA
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       
pF1KE0 RTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
       :.:::::::::::::::: ..: . .::. : 
CCDS59 RSKRHQKFTHFLPRPVDPERVPELYKDLLMYT
     180       190       200       210 

>>CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5                (208 aa)
 initn: 405 init1: 298 opt: 413  Z-score: 547.5  bits: 108.3 E(32554): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 413; 43.4% identity (78.7% similar) in 136 aa overlap (53-188:70-203)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KE0 GNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVH
                                     . ::.: .: :.:.  : . :.:  :: : 
CCDS39 LGQDMVSPEATNSSSSSFSSPSSAGRHVRSYNHLQGDVRWRKLFSFTKYFLKIEKNGKVS
      40        50        60        70        80        90         

             90       100       110       120       130       140  
pF1KE0 GTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEEN
       ::....  ..:::. :. .:........:. ::.::..:.:::::... .: ..:..:::
CCDS39 GTKKENCPYSILEITSVEIGVVAVKAINSNYYLAMNKKGKLYGSKEFNNDCKLKERIEEN
     100       110       120       130       140       150         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KE0 WYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRD
        ::::::  ..:.   ::.:::::  :.::.: .:.:..  .::::              
CCDS39 GYNTYASFNWQHNG--RQMYVALNGKGAPRRGQKTRRKNTSAHFLPMVVHS         
     160       170         180       190       200                 

            
pF1KE0 LFHYR

>>CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19             (170 aa)
 initn: 390 init1: 305 opt: 403  Z-score: 535.7  bits: 105.8 E(32554): 1.6e-23
Smith-Waterman score: 403; 45.1% identity (76.1% similar) in 142 aa overlap (47-188:28-166)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KE0 GFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIF
                                     :: : .. ::.: .: :.:.  : : :.. 
CCDS12    MRRRLWLGLAWLLLARAPDAAGTPSASRG-PRSYPHLEGDVRWRRLFSSTHFFLRVD
                  10        20         30        40        50      

         80        90       100       110       120       130      
pF1KE0 PNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFR
       :.: :.:::  :.. .:::. :. ::.. :..:.::.:..::.::.::::.  : .: ::
CCDS12 PGGRVQGTRWRHGQDSILEIRSVHVGVVVIKAVSSGFYVAMNRRGRLYGSRLYTVDCRFR
         60        70        80        90       100       110      

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE0 EQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKL
       :..::: .:::::  ...    . ...::.. :.:: : ::.:..  .::::        
CCDS12 ERIEENGHNTYASQRWRRRG--QPMFLALDRRGGPRPGGRTRRYHLSAHFLPVLVS    
        120       130         140       150       160       170    

        200       
pF1KE0 PSMSRDLFHYR

>>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13               (252 aa)
 initn: 425 init1: 370 opt: 401  Z-score: 530.5  bits: 105.4 E(32554): 3.1e-23
Smith-Waterman score: 401; 39.2% identity (74.5% similar) in 153 aa overlap (49-199:67-216)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE0 SSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPN
                                     .:::  .::::. :  :::: :..:.. :.
CCDS95 PKSMWFLWNIFSKGTHMLQCLCGKSLKKNKNPTD-PQLKGIVTR--LYCRQGYYLQMHPD
         40        50        60        70           80        90   

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE0 GTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQ
       :.. ::. : .   ....: ... ...:.:: .:::..:: .: :: :. .: :: :.:.
CCDS95 GALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSELFTPECKFKES
           100       110       120       130       140       150   

      140       150       160       170       180       190        
pF1KE0 FEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPS--KL
         ::.:  :.: ::....: : ....:::.:.  .: :.:. .  .::::.:.. .  . 
CCDS95 VFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFLPKPLEVAMYRE
           160       170       180       190       200       210   

        200                                   
pF1KE0 PSMSRDLFHYR                            
       ::.                                    
CCDS95 PSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
           220       230       240       250  

>>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13               (247 aa)
 initn: 425 init1: 370 opt: 398  Z-score: 526.7  bits: 104.7 E(32554): 5.1e-23
Smith-Waterman score: 398; 37.2% identity (72.6% similar) in 164 aa overlap (38-199:54-211)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KE0 FASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYC
                                     .:  . .:.: .:    .::::. :  :::
CCDS95 PSASRRRSSPSKNRGLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRRLRRQDP----QLKGIVTR--LYC
            30        40        50        60            70         

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE0 RTGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSK
       : :..:.. :.:.. ::. : .   ....: ... ...:.:: .:::..:: .: :: :.
CCDS95 RQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSE
        80        90       100       110       120       130       

       130       140       150       160       170       180       
pF1KE0 KLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFL
        .: :: :.:.  ::.:  :.: ::....: : ....:::.:.  .: :.:. .  .:::
CCDS95 LFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFL
       140       150       160       170       180       190       

       190         200                                   
pF1KE0 PRPVDPS--KLPSMSRDLFHYR                            
       :.:.. .  . ::.                                    
CCDS95 PKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
       200       210       220       230       240       

>>CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4                (268 aa)
 initn: 376 init1: 254 opt: 398  Z-score: 526.2  bits: 104.7 E(32554): 5.5e-23
Smith-Waterman score: 398; 38.7% identity (71.5% similar) in 186 aa overlap (19-200:51-228)

                           10        20        30        40        
pF1KE0             MAEVGGVFASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRG
                                     ::....   ..::.     ::.  . :...
CCDS34 HGEKRLAPKGQPGPAATDRNPRGSSSRQSSSSAMSSSSASSSPA---ASLGSQGSGLEQS
               30        40        50        60           70       

       50        60        70          80        90       100      
pF1KE0 SPTDFAHLKGILRRRQLYCRTG--FHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISI
       :   :    .  :  .::::.:  :::.:.:.: :.:. :. . ...::..... :...:
CCDS34 S---FQWSPSGRRTGSLYCRVGIGFHLQIYPDGKVNGS-HEANMLSVLEIFAVSQGIVGI
           80        90       100       110        120       130   

        110       120       130       140       150       160      
pF1KE0 RGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALN
       ::: :. .:.:...:.:..: :.: .: :::.:.:: ::::::....   . :..:::::
CCDS34 RGVFSNKFLAMSKKGKLHASAKFTDDCKFRERFQENSYNTYASAIHRTEKTGREWYVALN
           140       150       160       170       180       190   

        170         180       190       200                        
pF1KE0 KDGSPREGY--RTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR                 
       : :. ..:   :.: ..  ::::::    :. : .:                        
CCDS34 KRGKAKRGCSPRVKPQHISTHFLPR-FKQSEQPELSFTVTVPEKKKPPSPIKPKIPLSAP
           200       210        220       230       240       250  

CCDS34 RKNTNSVKYRLKFRFG
            260        

>>CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15               (194 aa)
 initn: 381 init1: 260 opt: 380  Z-score: 504.6  bits: 100.2 E(32554): 8.7e-22
Smith-Waterman score: 380; 43.3% identity (79.1% similar) in 134 aa overlap (58-191:62-193)

        30        40        50        60        70        80       
pF1KE0 ADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCRTGFHLEIFPNGTVHGTRHD
                                     : .: :.:.::: ..:.:   : :.::.. 
CCDS10 CNDMTPEQMATNVNCSSPERHTRSYDYMEGGDIRVRRLFCRTQWYLRIDKRGKVKGTQEM
              40        50        60        70        80        90 

        90       100       110       120       130       140       
pF1KE0 HSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKKLTRECVFREQFEENWYNTY
       .. ..:.:. ..:::...:.::.: .::.::..:.::..:. ...: :.: . :: ::::
CCDS10 KNNYNIMEIRTVAVGIVAIKGVESEFYLAMNKEGKLYAKKECNEDCNFKELILENHYNTY
             100       110       120       130       140       150 

       150       160       170       180       190       200       
pF1KE0 ASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLPRPVDPSKLPSMSRDLFHYR
       ::. . :. .:  ..::::. : : .: .::..:: .::::  .                
CCDS10 ASAKWTHNGGE--MFVALNQKGIPVRGKKTKKEQKTAHFLPMAIT               
             160         170       180       190                   

>>CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX               (199 aa)
 initn: 388 init1: 353 opt: 377  Z-score: 500.5  bits: 99.5 E(32554): 1.5e-21
Smith-Waterman score: 377; 35.3% identity (71.2% similar) in 170 aa overlap (39-206:3-169)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KE0 ASLDWDLHGFSSSLGNVPLADSPGFLNERLGQIEGKLQRGSPTDFAHLKGILRRRQLYCR
                                     :..    .. . .   .::::. .  :: :
CCDS55                             MSGKVTKPKEEKDASKEPQLKGIVTK--LYSR
                                           10        20          30

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE0 TGFHLEIFPNGTVHGTRHDHSRFGILEFISLAVGLISIRGVDSGLYLGMNERGELYGSKK
        :.::..  .::. ::. . : . ....: ... ...:.::.. :::.:: .: :: :. 
CCDS55 QGYHLQLQADGTIDGTKDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSEL
               40        50        60        70        80        90

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE0 LTRECVFREQFEENWYNTYASTLYKHSDSERQYYVALNKDGSPREGYRTKRHQKFTHFLP
       .: :: :.:.  ::.: ::.: .:....: : .:..:::.:   .: ..:...  .::::
CCDS55 FTPECKFKESVFENYYVTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLP
              100       110       120       130       140       150

      190         200                                    
pF1KE0 RPVDPS--KLPSMSRDLFHYR                             
       .:.  .  : ::. .:: ..                              
CCDS55 KPLKVAMYKEPSL-HDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
              160        170       180       190         




207 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Wed Nov  2 22:22:50 2016 done: Wed Nov  2 22:22:51 2016
 Total Scan time:  2.080 Total Display time: -0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com