FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2106, 894 aa 1>>>pF1KE2106 894 - 894 aa - 894 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7931+/-0.000658; mu= 14.9005+/- 0.041 mean_var=194.8731+/-37.163, 0's: 0 Z-trim(110.6): 470 B-trim: 50 in 2/53 Lambda= 0.091875 statistics sampled from 18459 (18963) to 18459 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16 Scan time: 10.060 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001094 (OMIM: 102573,612158) alpha-actinin-2 is ( 894) 5919 799.1 0 NP_001265272 (OMIM: 102573,612158) alpha-actinin-2 ( 894) 5880 793.9 0 NP_001095 (OMIM: 102574) alpha-actinin-3 isoform 1 ( 901) 4884 661.9 3.9e-189 NP_001123477 (OMIM: 102575,615193) alpha-actinin-1 ( 887) 4882 661.6 4.6e-189 XP_016877216 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph ( 895) 4856 658.2 5.1e-188 NP_001093 (OMIM: 102575,615193) alpha-actinin-1 is ( 892) 4830 654.7 5.5e-187 NP_001308962 (OMIM: 603278,604638) alpha-actinin-4 ( 906) 4748 643.9 1e-183 XP_005259338 (OMIM: 603278,604638) PREDICTED: alph ( 906) 4744 643.3 1.5e-183 XP_011535570 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph ( 916) 4731 641.6 5e-183 XP_016877217 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph ( 866) 4729 641.3 5.8e-183 XP_006723469 (OMIM: 603278,604638) PREDICTED: alph ( 911) 4725 640.8 8.7e-183 NP_001245300 (OMIM: 102574) alpha-actinin-3 isofor ( 944) 4722 640.4 1.2e-182 NP_004915 (OMIM: 603278,604638) alpha-actinin-4 is ( 911) 4721 640.3 1.2e-182 XP_011535568 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph ( 924) 4705 638.2 5.5e-182 XP_011535569 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph ( 921) 4679 634.7 6e-181 NP_001123476 (OMIM: 102575,615193) alpha-actinin-1 ( 914) 4308 585.5 3.8e-166 XP_016877212 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph (1069) 4309 585.8 3.8e-166 XP_016877211 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph (1077) 4283 582.3 4.2e-165 XP_016882820 (OMIM: 603278,604638) PREDICTED: alph ( 933) 4195 570.6 1.2e-161 NP_001265273 (OMIM: 102573,612158) alpha-actinin-2 ( 686) 4168 566.8 1.2e-160 XP_016877210 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph (1098) 4158 565.8 4.1e-160 XP_016877215 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph (1048) 4156 565.5 4.8e-160 XP_011535567 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph ( 929) 4132 562.2 4e-159 XP_016877209 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph (1106) 4132 562.3 4.5e-159 XP_016877214 (OMIM: 102575,615193) PREDICTED: alph (1056) 4130 562.0 5.2e-159 NP_842565 (OMIM: 182790) spectrin beta chain, non- (2155) 1453 207.6 5.3e-52 XP_005264575 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2351) 1453 207.6 5.6e-52 XP_016860269 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 1453 207.6 5.6e-52 NP_003119 (OMIM: 182790) spectrin beta chain, non- (2364) 1453 207.6 5.6e-52 XP_016860270 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 1453 207.6 5.6e-52 XP_005264574 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 1453 207.6 5.6e-52 XP_016860268 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 1453 207.6 5.6e-52 XP_006712150 (OMIM: 182790) PREDICTED: spectrin be (2364) 1453 207.6 5.6e-52 XP_005274250 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_016873666 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_016873665 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_005274249 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_016873667 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_016873663 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 NP_008877 (OMIM: 600224,604985,615386) spectrin be (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_006718734 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_016873664 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2390) 1411 202.1 2.7e-50 XP_011543519 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (1432) 1405 201.0 3.4e-50 XP_011543518 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (1452) 1405 201.0 3.4e-50 XP_006718732 (OMIM: 600224,604985,615386) PREDICTE (2397) 1405 201.3 4.7e-50 XP_011535407 (OMIM: 182870,616649) PREDICTED: spec (1554) 1384 198.3 2.5e-49 NP_000338 (OMIM: 182870,616649) spectrin beta chai (2137) 1384 198.4 3e-49 XP_016877103 (OMIM: 182870,616649) PREDICTED: spec (2137) 1384 198.4 3e-49 XP_016877102 (OMIM: 182870,616649) PREDICTED: spec (2287) 1384 198.5 3.1e-49 NP_001020029 (OMIM: 182870,616649) spectrin beta c (2328) 1384 198.5 3.2e-49 >>NP_001094 (OMIM: 102573,612158) alpha-actinin-2 isofor (894 aa) initn: 5919 init1: 5919 opt: 5919 Z-score: 4258.0 bits: 799.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5919; 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81.1% identity (94.6% similar) in 877 aa overlap (18-894:25-901) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MNQIEPGVQYNYVYDEDEYMIQEEEWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLR ::: :::.:::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MMMVMQPEGLGAGEGRFAGGGGGGEYMEQEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 KAGTQIENIEEDFRNGLKLMLLLEVISGERLPKPDRGKMRFHKIANVNKALDYIASKGVK ::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::.::::::: NP_001 KAGTQIENIEEDFRNGLKLMLLLEVISGERLPRPDKGKMRFHKIANVNKALDFIASKGVK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYRNVNI :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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NP_001 DTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYT 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 TVTMDELRTKWDKVKQLVPIRDQSLQEELARQHANERLRRQFAAQANAIGPWIQNKMEEI :.: .:. :::.:.:::: :::.: :: :::. :::::.::.::::.::::::.::::: NP_001 TITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEI 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 ARSSIQITGALEDQMNQLKQYEHNIINYKNNIDKLEGDHQLIQEALVFDNKHTNYTMEHI .: ::.. :.::::...:.:::..:.::: .::.::::::::::::.::::::::::::: NP_001 GRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 RVGWELLLTTIARTINEVETQILTRDAKGITQEQMNEFRASFNHFDRRKNGLMDHEDFRA ::::: :::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::.:.:.:: .:::: NP_001 RVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRKKTGMMDTDDFRA 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 CLISMGYDLGEAEFARIMTLVDPNGQGTVTFQSFIDFMTRETADTDTAEQVIASFRILAS :::::::..:::::::::..:::: :.::::.:::::.:::::::::.::.:::.:::. 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XP_016 MPSEGRMVSDINNAWGCLEQVEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDAM 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 ------GKEQILLQKDYESASLTEVRALLRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELD ::: .: :::::.:.:.:..:::.:::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 WPSLNPGKEAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELD 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 YHDAVNVNDRCQKICDQWDRLGTLTQKRREALERMEKLLETIDQLHLEFAKRAAPFNNWM :.:. .:: :::::::::: ::.::::::::::: ::::::::::.::.::::::::::: XP_016 YYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWM 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 EGAMEDLQDMFIVHSIEEIQSLITAHEQFKATLPEADGERQSIMAIQNEVEKVIQSYNIR ::::::::: ::::.:::::.: :::::::::::.:: :: .:..:.::: :..:.:.. XP_016 EGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVN 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 ISSSNPYSTVTMDELRTKWDKVKQLVPIRDQSLQEELARQHANERLRRQFAAQANAIGPW ....:::.:.: .:. :::.:.:::: :::.: :: :::. :::::.::.::::.:::: XP_016 MAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPW 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 IQNKMEEIARSSIQITGALEDQMNQLKQYEHNIINYKNNIDKLEGDHQLIQEALVFDNKH ::.:::::.: ::.. :.::::...:.:::..:.::: .::.::::::::::::.::::: XP_016 IQTKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKH 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 TNYTMEHIRVGWELLLTTIARTINEVETQILTRDAKGITQEQMNEFRASFNHFDRRKNGL ::::::::::::: :::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::.:.:. XP_016 TNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRKKTGM 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 MDHEDFRACLISMGYDLGEAEFARIMTLVDPNGQGTVTFQSFIDFMTRETADTDTAEQVI :: .:::::::::::..:::::::::..:::: :.::::.:::::.:::::::::.::. XP_016 MDTDDFRACLISMGYNMGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVM 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 ASFRILASDKPYILAEELRRELPPDQAQYCIKRMPAYSGPGSVPGALDYAAFSSALYGES :::.:::.:: :: .:::::::::::.::: :: :.:: :::::::: .::.:::::: XP_016 ASFKILAGDKNYITMDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDSVPGALDYMSFSTALYGES 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 DL :: XP_016 DL >>NP_001093 (OMIM: 102575,615193) alpha-actinin-1 isofor (892 aa) initn: 4308 init1: 4308 opt: 4830 Z-score: 3478.0 bits: 654.7 E(85289): 5.5e-187 Smith-Waterman score: 4830; 80.3% identity (93.4% similar) in 883 aa overlap (17-894:10-892) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MNQIEPGVQYNYVYDEDEYMIQEEEWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIE ..:: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MDHYDSQQTNDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 NIEEDFRNGLKLMLLLEVISGERLPKPDRGKMRFHKIANVNKALDYIASKGVKLVSIGAE :::::::.:::::::::::::::: ::.::::: :::.:::::::.:::::::::::::: NP_001 NIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 EIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYRNVNIQNFHTSW ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: :: NP_001 EIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISW 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 KDGLGLCALIHRHRPDLIDYSKLNKDDPIGNINLAMEIAEKHLDIPKMLDAEDIVNTPKP :::::.:::::::::.::::.:: ::::. :.: :...:::.:::::::::::::.: .: NP_001 KDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLTNLNTAFDVAEKYLDIPKMLDAEDIVGTARP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 DERAIMTYVSCFYHAFAGAEQAETAANRICKVLAVNQENERLMEEYERLASELLEWIRRT ::.::::::: :::::.::..:::::::::::::::::::.:::.::.:::.:::::::: NP_001 DEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLMEDYEKLASDLLEWIRRT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 IPWLENRTPEKTMQAMQKKLEDFRDYRRKHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRISNRPAF :::::::.::.::.:::.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::.:::::: NP_001 IPWLENRVPENTMHAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAF 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 MPSEGKMVSDIAGAWQRLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLEHLAEKFRQKASTHETWAYGK :::::.::::: .:: :::.::::::::::::::::::.::::::::::: ::.:. :: NP_001 MPSEGRMVSDINNAWGCLEQVEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGK 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 EQILLQKDYESASLTEVRALLRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYHDAVNVN : .: :::::.:.:.:..:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:. .:: NP_001 EAMLRQKDYETATLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVN 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 DRCQKICDQWDRLGTLTQKRREALERMEKLLETIDQLHLEFAKRAAPFNNWMEGAMEDLQ :::::::::: ::.::::::::::: ::::::::::.::.::::::::::::::::::: NP_001 ARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQ 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 DMFIVHSIEEIQSLITAHEQFKATLPEADGERQSIMAIQNEVEKVIQSYNIRISSSNPYS : ::::.:::::.: :::::::::::.:: :: .:..:.::: :..:.:.. ....:::. NP_001 DTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHNEVSKIVQTYHVNMAGTNPYT 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 TVTMDELRTKWDKVKQLVPIRDQSLQEELARQHANERLRRQFAAQANAIGPWIQNKMEEI :.: .:. :::.:.:::: :::.: :: :::. :::::.::.::::.::::::.::::: NP_001 TITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQTKMEEI 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 ARSSIQITGALEDQMNQLKQYEHNIINYKNNIDKLEGDHQLIQEALVFDNKHTNYTMEHI .: ::.. :.::::...:.:::..:.::: .::.::::::::::::.::::::::::::: NP_001 GRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHI 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 RVGWELLLTTIARTINEVETQILTRDAKGITQEQMNEFRASFNHFDRRKNGLMDHEDFRA ::::: :::::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::: ..: . :.:.: NP_001 RVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKA 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 pF1KE2 CLISMGYDLG-----EAEFARIMTLVDPNGQGTVTFQSFIDFMTRETADTDTAEQVIASF ::::.:::.: ::::::::..:::: :.::::.:::::.:::::::::.::.::: NP_001 CLISLGYDIGNDPQGEAEFARIMSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASF 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 RILASDKPYILAEELRRELPPDQAQYCIKRMPAYSGPGSVPGALDYAAFSSALYGESDL .:::.:: :: .:::::::::::.::: :: :.:: :::::::: .::.:::::::: NP_001 KILAGDKNYITMDELRRELPPDQAEYCIARMAPYTGPDSVPGALDYMSFSTALYGESDL 840 850 860 870 880 890 >>NP_001308962 (OMIM: 603278,604638) alpha-actinin-4 iso (906 aa) initn: 4748 init1: 4748 opt: 4748 Z-score: 3419.1 bits: 643.9 E(85289): 1e-183 Smith-Waterman score: 4748; 78.7% identity (94.4% similar) in 877 aa overlap (18-894:30-906) 10 20 30 40 pF1KE2 MNQIEPGVQYNYVYDEDEYMIQEEEWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWC .:: ::..::::::::::::::::::::::: NP_001 MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWC 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 NSHLRKAGTQIENIEEDFRNGLKLMLLLEVISGERLPKPDRGKMRFHKIANVNKALDYIA ::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.::::: ::: :::::::.:: NP_001 NSHLRKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 SKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPY ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SKGVKLVSIGAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 RNVNIQNFHTSWKDGLGLCALIHRHRPDLIDYSKLNKDDPIGNINLAMEIAEKHLDIPKM .:::.:::: ::::::.. ::::::::.::.:.:: ::::. :.: :.:.:::.:::::: NP_001 KNVNVQNFHISWKDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKM 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LDAEDIVNTPKPDERAIMTYVSCFYHAFAGAEQAETAANRICKVLAVNQENERLMEEYER :::::::.: .:::.:::::::::::::.::..:::::::::::::::::::.:::.::. NP_001 LDAEDIVGTLRPDEKAIMTYVSCFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEK 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 LASELLEWIRRTIPWLENRTPEKTMQAMQKKLEDFRDYRRKHKPPKVQEKCQLEINFNTL :::.:::::::::::::.:.:.::.: ::.:::::::::: ::::::::::::::::::: NP_001 LASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTL 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 QTKLRISNRPAFMPSEGKMVSDIAGAWQRLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLEHLAEKFRQ :::::.::::::::::::::::: ..::.::::::::::::::::::::::.:::::::: NP_001 QTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNGWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQ 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 KASTHETWAYGKEQILLQKDYESASLTEVRALLRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQEL ::: ::.:. ::: .: ..:::.:.:....::.::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETATLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQEL 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 NELDYHDAVNVNDRCQKICDQWDRLGTLTQKRREALERMEKLLETIDQLHLEFAKRAAPF :::::.:. ::: :::::::::: ::.::..::::::. :: ::.:::::::.::::::: NP_001 NELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALEKTEKQLEAIDQLHLEYAKRAAPF 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 NNWMEGAMEDLQDMFIVHSIEEIQSLITAHEQFKATLPEADGERQSIMAIQNEVEKVIQS :::::.::::::::::::.::::..::.::.:::.:::.:: ::..:.::..:.... .: NP_001 NNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADREREAILAIHKEAQRIAES 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 YNIRISSSNPYSTVTMDELRTKWDKVKQLVPIRDQSLQEELARQHANERLRRQFAAQANA .:..:.::::.::: . . .::.::.:::: ::..: :: ..:..::.::::::.:::. 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NP_001 DNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKK 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 KNGLMDHEDFRACLISMGYDLGEAEFARIMTLVDPNGQGTVTFQSFIDFMTRETADTDTA ..: :: .:::: ::: ::.:::::: :::.::::: .: ::::.:::::.:::.::::: NP_001 QTGSMDSDDFRALLISTGYSLGEAEFNRIMSLVDPNHSGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTA 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 EQVIASFRILASDKPYILAEELRRELPPDQAQYCIKRMPAYSGPGSVPGALDYAAFSSAL .::::::..::.:: .: :::::::::::::.::: :: :.:: .::::::: .::.:: NP_001 DQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQGPDAVPGALDYKSFSTAL 850 860 870 880 890 900 890 pF1KE2 YGESDL :::::: NP_001 YGESDL >>XP_005259338 (OMIM: 603278,604638) PREDICTED: alpha-ac (906 aa) initn: 4744 init1: 4744 opt: 4744 Z-score: 3416.3 bits: 643.3 E(85289): 1.5e-183 Smith-Waterman score: 4744; 78.7% identity (94.3% similar) in 877 aa overlap (18-894:30-906) 10 20 30 40 pF1KE2 MNQIEPGVQYNYVYDEDEYMIQEEEWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWC .:: ::..::::::::::::::::::::::: XP_005 MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWC 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 NSHLRKAGTQIENIEEDFRNGLKLMLLLEVISGERLPKPDRGKMRFHKIANVNKALDYIA ::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.::::: ::: :::::::.:: XP_005 NSHLRKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 SKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPY ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 SKGVKLVSIGAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 RNVNIQNFHTSWKDGLGLCALIHRHRPDLIDYSKLNKDDPIGNINLAMEIAEKHLDIPKM .:::.:::: ::::::.. ::::::::.::.:.:: ::::. :.: :.:.:::.:::::: XP_005 KNVNVQNFHISWKDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKM 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LDAEDIVNTPKPDERAIMTYVSCFYHAFAGAEQAETAANRICKVLAVNQENERLMEEYER ::::::::: .:::.::::::: :::::.::..:::::::::::::::::::.:::.::. 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