FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1799, 843 aa 1>>>pF1KE1799 843 - 843 aa - 843 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3655+/-0.000451; mu= 16.7003+/- 0.028 mean_var=165.8337+/-32.571, 0's: 0 Z-trim(116.1): 246 B-trim: 561 in 3/54 Lambda= 0.099595 statistics sampled from 26674 (27024) to 26674 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16 Scan time: 12.990 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000578 (OMIM: 217070,610102) complement compone ( 843) 5979 872.5 0 NP_000056 (OMIM: 217050,612446) complement compone ( 934) 1086 169.5 6.5e-41 NP_001108603 (OMIM: 217050,612446) complement comp ( 934) 1086 169.5 6.5e-41 XP_005248414 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 943) 1086 169.5 6.5e-41 XP_011512421 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 952) 1045 163.6 3.9e-39 XP_016857724 (OMIM: 120960,613789) PREDICTED: comp ( 591) 785 126.0 5.1e-28 NP_001265472 (OMIM: 120960,613789) complement comp ( 539) 784 125.8 5.3e-28 NP_000057 (OMIM: 120960,613789) complement compone ( 591) 784 125.8 5.6e-28 NP_001265473 (OMIM: 120960,613789) complement comp ( 529) 718 116.3 3.7e-25 NP_000553 (OMIM: 120950,613790) complement compone ( 584) 633 104.1 1.9e-21 XP_016865308 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 814) 533 89.9 4.9e-17 XP_011512417 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 962) 533 90.0 5.5e-17 XP_006714559 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 962) 533 90.0 5.5e-17 XP_011512419 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 962) 533 90.0 5.5e-17 XP_016865307 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 962) 533 90.0 5.5e-17 XP_011512420 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 962) 533 90.0 5.5e-17 XP_011512418 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 962) 533 90.0 5.5e-17 XP_011512416 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 971) 533 90.0 5.5e-17 XP_011512423 (OMIM: 217050,612446) PREDICTED: comp ( 643) 516 87.4 2.3e-16 NP_001728 (OMIM: 120940,613825,615591) complement ( 559) 423 73.9 2.2e-12 XP_011540381 (OMIM: 120950,613790) PREDICTED: comp ( 375) 387 68.5 6.3e-11 XP_016857723 (OMIM: 120950,613790) PREDICTED: comp ( 381) 387 68.6 6.3e-11 XP_016865505 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- ( 917) 279 53.5 5.2e-06 XP_011512461 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1027) 279 53.6 5.6e-06 NP_003957 (OMIM: 609297) semaphorin-5A precursor [ (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_011512458 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_011512459 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_011512457 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_006714570 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_011512460 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_006714569 (OMIM: 609297) PREDICTED: semaphorin- (1074) 279 53.6 5.7e-06 XP_011507508 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) P ( 969) 273 52.7 9.7e-06 NP_001868 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) comp (1033) 273 52.7 1e-05 NP_001006659 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) c (1092) 273 52.7 1.1e-05 NP_001076585 (OMIM: 170280,603553,605027,609135) p ( 555) 249 48.9 7.5e-05 NP_005032 (OMIM: 170280,603553,605027,609135) perf ( 555) 249 48.9 7.5e-05 NP_699197 (OMIM: 611691) sushi, von Willebrand fac (3571) 260 51.5 8.1e-05 XP_016856597 (OMIM: 126700,134370,235400,609814,61 ( 446) 226 45.5 0.00064 NP_001014975 (OMIM: 126700,134370,235400,609814,61 ( 449) 226 45.5 0.00064 NP_758860 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 349) 218 44.2 0.0012 NP_758862 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 362) 218 44.2 0.0012 NP_758863 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 369) 218 44.3 0.0013 XP_016856797 (OMIM: 120920,612922) PREDICTED: memb ( 378) 218 44.3 0.0013 XP_011507865 (OMIM: 120920,612922) PREDICTED: memb ( 385) 218 44.3 0.0013 NP_002380 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 392) 218 44.3 0.0013 NP_758869 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 399) 218 44.3 0.0013 XP_016856798 (OMIM: 120920,612922) PREDICTED: memb ( 363) 215 43.8 0.0017 XP_011507866 (OMIM: 120920,612922) PREDICTED: memb ( 370) 215 43.8 0.0017 NP_758861 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 377) 215 43.8 0.0017 NP_722548 (OMIM: 120920,612922) membrane cofactor ( 384) 215 43.8 0.0017 >>NP_000578 (OMIM: 217070,610102) complement component C (843 aa) initn: 5979 init1: 5979 opt: 5979 Z-score: 4655.6 bits: 872.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5979; 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