FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1932, 470 aa 1>>>pF1KE1932 470 - 470 aa - 470 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2344+/-0.000912; mu= 18.0935+/- 0.055 mean_var=64.8272+/-13.101, 0's: 0 Z-trim(105.6): 36 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.159293 statistics sampled from 8480 (8515) to 8480 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 2.960 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 ( 470) 3235 752.4 2.3e-217 CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 ( 477) 1690 397.3 1.8e-110 CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 ( 476) 1633 384.2 1.6e-106 CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 1567 369.1 5.7e-102 CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 ( 513) 1528 360.1 3e-99 CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 ( 467) 1526 359.7 3.9e-99 CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 1459 344.3 1.7e-94 CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 ( 483) 1380 326.1 5e-89 CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 ( 267) 817 196.6 2.7e-50 CCDS7752.1 MMP26 gene_id:56547|Hs108|chr11 ( 261) 644 156.8 2.5e-38 CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 660) 628 153.4 6.9e-37 CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 610) 625 152.7 1e-36 CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 508) 607 148.5 1.6e-35 CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 ( 669) 606 148.3 2.3e-35 CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 584) 599 146.7 6.3e-35 CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 ( 488) 538 132.6 9e-31 CCDS31927.1 MMP17 gene_id:4326|Hs108|chr12 ( 603) 526 129.9 7.3e-30 CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 ( 707) 520 128.6 2.2e-29 CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 ( 645) 481 119.6 1e-26 CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 ( 607) 477 118.6 1.8e-26 CCDS76996.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 393) 468 116.5 5.2e-26 CCDS74036.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 520) 468 116.5 6.6e-26 CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 ( 582) 467 116.3 8.5e-26 CCDS10492.1 MMP25 gene_id:64386|Hs108|chr16 ( 562) 412 103.7 5.3e-22 CCDS7647.1 MMP21 gene_id:118856|Hs108|chr10 ( 569) 393 99.3 1.1e-20 CCDS7763.1 HPX gene_id:3263|Hs108|chr11 ( 462) 266 70.1 5.6e-12 CCDS61146.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 305) 251 66.5 4.3e-11 >>CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 (470 aa) initn: 3235 init1: 3235 opt: 3235 Z-score: 4015.9 bits: 752.4 E(32554): 2.3e-217 Smith-Waterman score: 3235; 100.0% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNLM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 KEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRINN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 KEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRINN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 YTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 LAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 KYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 FKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 EPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPKLITK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 EPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPKLITK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 NFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 NFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC 430 440 450 460 470 >>CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 (477 aa) initn: 1514 init1: 807 opt: 1690 Z-score: 2096.9 bits: 397.3 E(32554): 1.8e-110 Smith-Waterman score: 1690; 51.4% identity (77.7% similar) in 479 aa overlap (1-470:1-477) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATA-SGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNL :: : :::: .: .: ::.... : ... . ..:::..: :. . .. : :: . CCDS83 MKSLPILLLLCVAVCSAYPLDGAARGEDTSMNLVQKYLENYYDLKKDVKQFVRRKDSGPV 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 MKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRIN .: ::.:::.::::.:::.::..:::.:. :::::::: ::: .:: : ::: ..:::: CCDS83 VK-KIREMQKFLGLEVTGKLDSDTLEVMRKPRCGVPDVGHFRTFPGIPKWRKTHLTYRIV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGG :::::. .. :: :..::..:: .:::: ::.. : :::.. :: ::::. ::: :. CCDS83 NYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREHGDFYPFDGPGN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 ILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPT .::::..:: ::.::::::.:: :: . ::::::.:.::::::::: ::.. .:.:.: CCDS83 VLAHAYAPGPGINGDAHFDDDEQWTKDTTGTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANTEALMYPL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 YKYV-DINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLP-------NPDNSEPALCDPNLSFDAV :. . :.. :::: ::: ::::::: : .. . : :. . :: ::: :::::: CCDS83 YHSLTDLTRFRLSQDDINGIQSLYGPPPDSPETPLVPTEPVPPEPGTPANCDPALSFDAV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TTVGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDK .:. ..:..:::: :: : .. . ..::::.::.::::..::::. ... ::.:: .. CCDS83 STLRGEILIFKDRHFWRKSLRKLEPELHLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIFKGNQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 YWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMD .: : . . . .::..::..::: :.:::::. . . .:::::...:::.::.:. :. CCDS83 FWAIRGNEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKRNSME 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 PGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC ::.:: :...: :: :::::: . ..::: ::.:.:.: ...:.:::::::..: CCDS83 PGFPKQIAEDFPGIDSKIDAVF-EEFGFFYFFTGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWLNC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 (476 aa) initn: 1672 init1: 794 opt: 1633 Z-score: 2026.1 bits: 384.2 E(32554): 1.6e-106 Smith-Waterman score: 1633; 49.3% identity (76.4% similar) in 479 aa overlap (1-470:2-476) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYS-GN :.. ...:: . .: ::..... : .: ....::::.:.:: . : ... . .: CCDS83 MMHLAFLVLLCLPVCSAYPLSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKYYNLEKD---VKQFRRKDSN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRI :. .::: ::.::::.:::.:::.:::.:. :::::::: :: .:: : ::: ..:::: CCDS83 LIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKWRKTHLTYRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKG :::::. :. :: ::.::..:: .:::: ::.. : :::.. :: ::::..::: : CCDS83 VNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHGDFYSFDGPG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFP ::::. :: :. :: :::.:: :: ..::::::.:.::.:::::: ::.. .:.:.: CCDS83 HSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKWTEDASGTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTEALMYP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 TYK-YVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLP------NPDNSE-PALCDPNLSFDA :. .... :::: ::. ::::::: : . . : :..:: :: ::: ::::: CCDS83 LYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGPPPASTEEPLVPTKSVPSGSEMPAKCDPALSFDA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VTTVGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDD ..:. .. .:::::.:: . :. .:::..::.::: ..::::...:. ::.:: . CCDS83 ISTLRGEYLFFKDRYFWRRSHWNPEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGN 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 KYWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMM ..: : . . . .::..::..::: ..:::::: . . .::::. ..:::.:: : : CCDS83 EFWAIRGNEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSM 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 DPGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC . :.:.::. .: :. ::.:::. . . ..:::.::.:::.: . .:. ::::::. : CCDS83 EQGFPRLIADDFPGVEPKVDAVLQAFG-FFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 (469 aa) initn: 1389 init1: 738 opt: 1567 Z-score: 1944.2 bits: 369.1 E(32554): 5.7e-102 Smith-Waterman score: 1567; 49.1% identity (75.6% similar) in 468 aa overlap (4-470:7-466) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSG ::.::. ...: ..: .. ....: . ..::::.:.:. . : : . :: CCDS83 MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFP--ATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGRQVEKRRNSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 NLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYR .. ::...::.:.::::::. :. ::..:. :::::::: .: :.: :.. ..::: CCDS83 PVV-EKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRWEQTHLTYR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 INNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGK :.:::::. : :::.::.::::.::::::: :.:.. :.:::.. :.:: : : ::: CCDS83 IENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHRDNSPFDGP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMF :: ::::: :: :::::::::::: ::.. :: .:.::.::::::.::.: :.:. CCDS83 GGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHSTDIGALMY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNK :.: . . .:. ::: :::..:: .. . .:.. : :: .:.:::.::. .. CCDS83 PSYTFS--GDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQT--PKACDSKLTFDAITTIRGE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 IFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISN ..::::::. :.. .:.:: .:: ::.:.:::::. :..: .:: .::: ... CCDS83 VMFFKDRFYMRTNPFYPEVELNFISVFWPQLPNGLEAAYEFADRDEVRFFKGNKYWAVQG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 LRPEPNYPKSIHS-FGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPK .:::.:.: :::: ::.::::. . .::::: :.:::::: .. ::::::: CCDS83 QNVLHGYPKDIYSSFGFPRTVKHIDAALSEENTGKTYFFVANKYWRYDEYKRSMDPGYPK 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 LITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC .:...: ::: :.::::. :. ..:::.:. :...: .:: :.::::.: CCDS83 MIAHDFPGIGHKVDAVFM-KDGFFYFFHGTRQYKFDPKTKRILTLQKANSWFNCRKN 420 430 440 450 460 >>CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 (513 aa) initn: 1071 init1: 390 opt: 1528 Z-score: 1895.2 bits: 360.1 E(32554): 3e-99 Smith-Waterman score: 1528; 48.3% identity (75.0% similar) in 472 aa overlap (2-470:3-465) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNL ..::..:. : :.:.:: : :.: . ... ::..::.:::. ... : . .: CCDS83 MKRLLLLFLFFITFSSAFPLVRMTENEEN-MQLAQAYLNQFYSLEIEGNHLVQSK-NRSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 MKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHF-REMPGGPVWRKHYITYRI . .::.::: :.:: :::.::..:::.:..:::::::: .. .:: :::. .:::: CCDS83 IDDKIREMQAFFGLTVTGKLDSNTLEIMKTPRCGVPDVGQYGYTLPG---WRKYNLTYRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDF-HAFDGK :::::: : :: ::.....:::.::::::.::. :.:::...: .:: . ::: CCDS83 INYTPDMARAAVDEAIQEGLEVWSKVTPLKFTKISKGIADIMIAFRTRVHGRCPRYFDGP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMF :.:.::: :: :.:::.:::::: :: ..: ::::.:.::.::.:::.::.: :.:: CCDS83 LGVLGHAFPPGPGLGGDTHFDEDENWTKDGAGFNLFLVAAHEFGHALGLSHSNDQTALMF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGD-PKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGN :.: .: . :: ::: ::::.:: ::: . .: . : :::.:.:::.:: CCDS83 PNYVSLDPRKYPLSQDDINGIQSIYGGLPKEPAKPKEP--TIPHACDPDLTFDAITTFRR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLIS ...::: : .: . . .::.:.::.::. ..:::: . :.....:::...:.: CCDS83 EVMFFKGRHLWRIYYDITDVEFELIASFWPSLPADLQAAYE-NPRDKILVFKDENFWMIR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 NLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGYPK . :.::::::..:::. :::::::: . .::::: ::.:: : :: :.:. CCDS83 GYAVLPDYPKSIHTLGFPGRVKKIDAAVCDKTTRKTYFFVGIWCWRFDEMTQTMDKGFPQ 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 LITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC ..:.: ::. ..::.: :. ...: .::.:::::. . ::. ...:.:: : CCDS83 RVVKHFPGISIRVDAAFQYKG-FFFFSRGSKQFEYDIKTKNITRIMRTNTWFQCKEPKNS 420 430 440 450 460 470 CCDS83 SFGFDINKEKAHSGGIKILYHKSLSLFIFGIVHLLKNTSIYQ 480 490 500 510 >>CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 (467 aa) initn: 1411 init1: 797 opt: 1526 Z-score: 1893.3 bits: 359.7 E(32554): 3.9e-99 Smith-Waterman score: 1526; 47.6% identity (75.6% similar) in 468 aa overlap (5-470:9-464) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYS ..:::.. : :.:..:. :::. . :::::: : :. :. : . CCDS83 MFSLKTLPFLLLLHVQISKAFPVSSK---EKNTKTV-QDYLEKFYQLPSNQYQSTR-KNG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITY :.. ::..:::.:.::.:::. . ::.::. ::::::: : ::.: :.. .:: CCDS83 TNVIVEKLKEMQRFFGLNVTGKPNEETLDMMKKPRCGVPDSGGFMLTPGNPKWERTNLTY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 RINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDG :: ::::.... .:. ::. ::..:: ..:: :..:. : ::: ..: . ::: ::: CCDS83 RIRNYTPQLSEAEVERAIKDAFELWSVASPLIFTRISQGEADINIAFYQRDHGDNSPFDG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVM .::::::: ::.::::::::: .: ::. :.. ::::.:.::.::::::.::::: :.: CCDS83 PNGILAHAFQPGQGIGGDAHFDAEETWTNTSANYNLFLVAAHEFGHSLGLAHSSDPGALM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FPTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGN .:.: . . ... : ::: :::..:: .. . .:.. .: :::.:.:::.::. . CCDS83 YPNYAFRETSNYSLPQDDIDGIQAIYGLSSNPIQPTGPSTPKP--CDPSLTFDAITTLRG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLIS .:.:::::.:: . . .. .:.:: .::.::.::.:::: :. .:::: ..:: .: CCDS83 EILFFKDRYFWRRHPQLQRVEMNFISLFWPSLPTGIQAAYEDFDRDLIFLFKGNQYWALS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 NLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYR--TYFFVDNQYWRYDERRQMMDPGY . .:::.: ..:::. :. :::::: :: :::::..:.::::..::.:.::: CCDS83 GYDILQGYPKDISNYGFPSSVQAIDAAVF----YRSKTYFFVNDQFWRYDNQRQFMEPGY 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 PKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC :: :. : :: :.:::: ....... :.: . .:.. ::.:.. ..:.:..: CCDS83 PKSISGAFPGIESKVDAVF-QQEHFFHVFSGPRYYAFDLIAQRVTRVARGNKWLNCRYG 410 420 430 440 450 460 >>CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 (471 aa) initn: 1355 init1: 850 opt: 1459 Z-score: 1810.0 bits: 344.3 E(32554): 1.7e-94 Smith-Waterman score: 1459; 47.2% identity (72.4% similar) in 468 aa overlap (7-470:10-471) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSS---TSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMK :.:. : :::: :. .: .... :.::::...: : . : . CCDS83 MHPGVLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYH-PTNLAGILK-E 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 YSGNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYI ... : :...::: :.::.:::.:: .::..:. :::::::: .. .: : : . CCDS83 NAASSMTERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 TYRINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAF :::: ::::::.. .:. :..:::.:::.::::.:.... :.:::.. :. ::::. : CCDS83 TYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 DGKGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKA :: .:.::::: :: . :::::::.:: ::. : : ::::.:.::.:::::: ::.:: : CCDS83 DGPSGLLAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VMFPTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSE-PALCDPNLSFDAVTT .::: : :. . : : ::..::::::: :. ::: . . : :::.::.::.:. CCDS83 LMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDED---PNPKHPKTPDKCDPSLSLDAITS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VGNKIFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYW . .. ..::::::: .. . . : .:.:: ::. :.:::: ... .:.:. :.: CCDS83 LRGETMIFKDRFFWRLHPQQVDAELFLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 LISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQYWRYDERRQMMDPG ... .:::.: .:.:. ::::.::: .: .: :: ::::. ..:: CCDS83 ALNGYDILEGYPKKISELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKD 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 YPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRITKTLKSNSWFGC ::.:: ..: ::: :.::: : :: : :::.: ::::.. .::.... .:: . : CCDS83 YPRLIEEDFPGIGDKVDAV-YEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWSNRIVRVMPANSILWC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 (483 aa) initn: 1224 init1: 856 opt: 1380 Z-score: 1711.8 bits: 326.1 E(32554): 5e-89 Smith-Waterman score: 1380; 43.1% identity (73.1% similar) in 480 aa overlap (3-470:12-483) 10 20 30 40 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFY----GLEINK ::.. : .::. .: . .: .:: ... ::.:.: : .:.. CCDS83 MKVLPASGLAVFLIMALKFSTAAPSL-VAASPRTWRNNYRLAQAYLDKYYTNKEGHQIGE 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 LPVTKMKYSGNLMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGP . . ..: : .::.:.: :.::.:::.:: .:..... :::::::: ..: .:: : CCDS83 M----VARGSNSMIRKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRCGVPDVANYRLFPGEP 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 VWRKHYITYRINNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGA :.:. .::::..:::.:. .:: :.. :.:.::...::.: .::.: :::.. : : CCDS83 KWKKNTLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWSSAVPLSFVRINSGEADIMISFENGD 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 HGDFHAFDGKGGILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLG ::: . ::: : :::::.:: :.:::.:::. : :: ..: ::: .:.::.::.:::. CCDS83 HGDSYPFDGPRGTLAHAFAPGEGLGGDTHFDNAEKWTMGTNGFNLFTVAAHEFGHALGLA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 HSSDPKAVMFPTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKE----NQRLPNPDNSEPA--- ::.::.:.:.::::: . :.: ::..:::.::: :.. . ::. . .:. CCDS83 HSTDPSALMYPTYKYKNPYGFHLPKDDVKGIQALYG-PRKVFLGKPTLPHAPHHKPSIPD 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE1 LCDPNLSFDAVTTVGNKIFFFKDRFFWLK-VSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIE ::: . :::::: .:.....::::.:: . : : . :.: .: : :...::::. CCDS83 LCDSSSSFDAVTMLGKELLLFKDRIFWRRQVHLRTGIRPSTITSSFPQLMSNVDAAYEVA 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 ARNQVFLFKDDKYWLISNLRPEPNYPKSIHSFGFPNFVKKIDAAVFNPRFYRTYFFVDNQ :. ...:: .::. ... . . :..:..:::: :..:::::. . .: ::: .. CCDS83 ERGTAYFFKGPHYWITRGFQMQ-GPPRTIYDFGFPRHVQQIDAAVYLREPQKTLFFVGDE 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 YWRYDERRQMMDPGYPKLITKNFQGIGPKIDAVFYSKNKYYYFFQGSNQFEYDFLLQRIT :. ::::.. :. ::: ..:.:.. .:::. : : :::.: . ..:: . .. CCDS83 YYSYDERKRKMEKDYPKNTEEEFSGVNGQIDAAV-ELNGYIYFFSGPKTYKYDTEKEDVV 420 430 440 450 460 470 460 470 pF1KE1 KTLKSNSWFGC ...::.::.:: CCDS83 SVVKSSSWIGC 480 >>CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 (267 aa) initn: 787 init1: 571 opt: 817 Z-score: 1016.4 bits: 196.6 E(32554): 2.7e-50 Smith-Waterman score: 817; 48.3% identity (75.3% similar) in 259 aa overlap (14-270:15-265) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MKFLLILLLQATASGALPL-NSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGN : :::: . . .. . . .. ::..:: : .. : ..: CCDS83 MRLTVLCAVCLLPGSLALPLPQEAGGMSELQWEQAQDYLKRFY------LYDSETK-NAN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 LMKEKIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRI .. :..:::.:.:: .::.:.. ..:.:. :::::::: .. .:..: : .. .:::: CCDS83 SLEAKLKEMQKFFGLPITGMLNSRVIEIMQKPRCGVPDVAEYSLFPNSPKWTSKVVTYRI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 NNYTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKG .:: :. . :: . ::...:.. ::.: :. : :::.. :::::::: . ::: : CCDS83 VSYTRDLPHITVDRLVSKALNMWGKEIPLHFRKVVWGTADIMIGFARGAHGDSYPFDGPG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GILAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSG-GTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMF . :::::.::.:.:::::::::: :: :. : :.. .:.::.:::::.::::::.:::. CCDS83 NTLAHAFAPGTGLGGDAHFDEDERWTDGSSLGINFLYAATHELGHSLGMGHSSDPNAVMY 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 PTYKYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNK ::: : ..:.:: :::.:::.::: . :.: CCDS83 PTYGNGDPQNFKLSQDDIKGIQKLYGK-RSNSRKK 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 IFFFKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISN >>CCDS7752.1 MMP26 gene_id:56547|Hs108|chr11 (261 aa) initn: 632 init1: 632 opt: 644 Z-score: 801.7 bits: 156.8 E(32554): 2.5e-38 Smith-Waterman score: 646; 46.7% identity (66.5% similar) in 242 aa overlap (32-272:31-261) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 KFLLILLLQATASGALPLNSSTSLEKNNVLFGERYLEKFYGLEINKLPVTKMKYSGNLMK : : :...:. .:: : : : . CCDS77 MQLVILRVTIFLPWCFAVPVPPAADHKGWDFVEGYFHQFF--------LTK-KESPLLTQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 E-KIQEMQHFLGLKVTGQLDTSTLEMMHAPRCGVPDVHHFREMPGGPVWRKHYITYRINN : . : .:.: . : :: . ..: :.::::: :: : :: .:::: : CCDS77 ETQTQLLQQF-HRNGTDLLDMQMHALLHQPHCGVPDGSDTSISPGRCKWNKHTLTYRIIN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 YTPDMNREDVDYAIRKAFQVWSNVTPLKFSKINTGMADILVVFARGAHGDFHAFDGKGGI : ::. : .: .: ..::::::: :.....: ::: : : . :: : ::: ::: CCDS77 YPHDMKPSAVKDSIYNAVSIWSNVTPLIFQQVQNGDADIKVSFWQWAHEDGWPFDGPGGI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 LAHAFGPGSGIGGDAHFDEDEFWTTHSGGTNLFLTAVHEIGHSLGLGHSSDPKAVMFPTY :.::: :.:: : .:::..: :.. . : ::::.:.::::::::: ::.. ...:.::: CCDS77 LGHAFLPNSGNPGVVHFDKNEHWSASDTGYNLFLVATHEIGHSLGLQHSGNQSSIMYPTY 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 KYVDINTFRLSADDIRGIQSLYGDPKENQRLPNPDNSEPALCDPNLSFDAVTTVGNKIFF : : ::.::::::. :: :::. : .. .: CCDS77 WYHDPRTFQLSADDIQRIQHLYGE-KCSSDIP 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 FKDRFFWLKVSERPKTSVNLISSLWPTLPSGIEAAYEIEARNQVFLFKDDKYWLISNLRP 470 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:13:24 2016 done: Sun Nov 6 21:13:24 2016 Total Scan time: 2.960 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]