FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2080, 753 aa 1>>>pF1KE2080 753 - 753 aa - 753 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2385+/-0.000402; mu= 16.2063+/- 0.025 mean_var=94.8178+/-19.234, 0's: 0 Z-trim(113.4): 44 B-trim: 378 in 1/52 Lambda= 0.131713 statistics sampled from 22634 (22675) to 22634 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16 Scan time: 10.840 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000430 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroendocr ( 753) 5140 987.6 0 NP_001171346 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroend ( 706) 4734 910.5 0 NP_002561 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 969) 2045 399.6 3.2e-110 NP_612192 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 956) 2039 398.4 7e-110 NP_612196 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 623) 1979 386.9 1.3e-106 NP_612197 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 652) 1979 386.9 1.4e-106 NP_612198 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 664) 1979 386.9 1.4e-106 NP_006191 (OMIM: 600488) proprotein convertase sub ( 913) 1968 384.9 7.8e-106 NP_001177411 (OMIM: 600488) proprotein convertase (1860) 1968 385.1 1.4e-105 XP_011517071 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1886) 1968 385.1 1.4e-105 XP_005252096 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1887) 1968 385.1 1.4e-105 NP_001276753 (OMIM: 136950) furin preproprotein [H ( 794) 1804 353.7 1.7e-96 NP_002560 (OMIM: 136950) furin preproprotein [Homo ( 794) 1804 353.7 1.7e-96 NP_001276752 (OMIM: 136950) furin preproprotein [H ( 794) 1804 353.7 1.7e-96 NP_002585 (OMIM: 162151) neuroendocrine convertase ( 638) 1800 352.9 2.4e-96 XP_011526393 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 658) 1799 352.7 2.8e-96 XP_011526390 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 720) 1799 352.8 3e-96 NP_060043 (OMIM: 600487) proprotein convertase sub ( 755) 1799 352.8 3.1e-96 XP_011526387 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 782) 1799 352.8 3.2e-96 NP_001188457 (OMIM: 162151) neuroendocrine convert ( 619) 1789 350.8 9.8e-96 XP_011526394 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 644) 1777 348.6 4.9e-95 NP_001188458 (OMIM: 162151) neuroendocrine convert ( 603) 1705 334.9 6.1e-91 XP_011526395 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 593) 1618 318.3 5.7e-86 NP_612195 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 487) 1616 317.9 6.3e-86 XP_011526389 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 724) 1618 318.4 6.7e-86 NP_001278238 (OMIM: 167405) proprotein convertase ( 895) 1504 296.8 2.7e-79 XP_011526388 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 773) 1458 288.0 1e-76 NP_004707 (OMIM: 604872) proprotein convertase sub ( 785) 1435 283.6 2.1e-75 XP_005259643 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 567) 1309 259.6 2.6e-68 XP_011526396 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 567) 1309 259.6 2.6e-68 XP_016882386 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 377) 1128 225.1 4.2e-58 XP_016874035 (OMIM: 604872) PREDICTED: proprotein ( 426) 567 118.5 5.7e-26 XP_006719003 (OMIM: 604872) PREDICTED: proprotein ( 426) 567 118.5 5.7e-26 XP_011526398 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 533) 548 115.0 8.4e-25 XP_011526392 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 661) 548 115.0 1e-24 XP_011526391 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 688) 548 115.0 1e-24 XP_016870289 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1450) 424 91.7 2.4e-17 XP_011517072 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1441) 391 85.4 1.8e-15 XP_011526397 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 537) 343 76.0 4.5e-13 >>NP_000430 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroendocrine (753 aa) initn: 5140 init1: 5140 opt: 5140 Z-score: 5279.8 bits: 987.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5140; 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NP_002 QVEVPEDEEDYTAQSTPGSANILQTSVCHPECGDKGCDGPNADQCLNCVHFSLGSVKTSR 670 680 690 700 710 720 >>NP_612192 (OMIM: 167405) proprotein convertase subtili (956 aa) initn: 1869 init1: 1332 opt: 2039 Z-score: 2093.7 bits: 398.4 E(85289): 7e-110 Smith-Waterman score: 2039; 51.4% identity (75.5% similar) in 593 aa overlap (13-600:51-638) 10 20 30 40 pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQ-FVNEWAAEIPG ..:. : : :: : ..:.::... : NP_612 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQVLG 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 GPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQ :: :. .: :: :::::.::..: : :.. .:: :. : : .: : .: NP_612 GPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGV : :.: ::.. : ::::.:...:::. .. . ...: .:..: :::.: NP_612 QEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRC-RSEMNVQAAWKRGYTGKNV 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQAN :.:.::::.: :: :. ::: :::: : ::.:: :::: .::::::::::::.: .:: NP_612 VVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHGTRCAGEVAASAN 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 NHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPG : : ::.:::.:.:::::::: :::..::.:.:. :...:::::::::.::::::.::: NP_612 NSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDDGKTVDGPG 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 RLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSP :::..:::::.:.:::: :::::::::::::.:: :.:::::.::::::.:::...: .: NP_612 RLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTISVSSATENGYKP 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 WYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPN :: :.:.:::::.:::: . ...:...::.. ::. :::::.:::..:::.::::::: . NP_612 WYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPMVAGIIALALEANSQ 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSV :::::.:::.: ::. : . :: :::: :. .::::..:.::: .. . : .: NP_612 LTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASD-WKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEALV--VEAKKWTAV 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 PEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRAC-EGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGD : .. ::. .: .::.. . : :: : ... . :::: ...: . :::: NP_612 PSQHMCVAA-SDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHPRRGD 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 LHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQN :.. :.: .::.. :::.: : : .:: ::.::.:: :::. : :::.: :. ....: NP_612 LQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLEIQDLPSQVRN 560 570 580 590 600 610 590 600 610 620 630 pF1KE2 ---EGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMVDPGEEQPTQENPK .:.. .:.:::.::. .: : NP_612 PEKQGKLKEWSLILYGTAEHPYHTFSAHQSRSRMLELSAPELEPPKAALSPSQVEVPEDE 620 630 640 650 660 670 >>NP_612196 (OMIM: 167405) proprotein convertase subtili (623 aa) initn: 1936 init1: 1332 opt: 1979 Z-score: 2034.8 bits: 386.9 E(85289): 1.3e-106 Smith-Waterman score: 1979; 51.9% identity (75.6% similar) in 570 aa overlap (13-580:51-615) 10 20 30 40 pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQ-FVNEWAAEIPG ..:. : : :: : ..:.::... : NP_612 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQVLG 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 GPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQ :: :. .: :: :::::.::..: : :.. .:: :. : : .: : .: NP_612 GPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGV : :.: ::.. : ::::.:...:::. .. . ...: .:..: :::.: NP_612 QEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRC-RSEMNVQAAWKRGYTGKNV 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQAN :.:.::::.: :: :. ::: :::: : ::.:: :::: .::::::::::::.: .:: NP_612 VVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHGTRCAGEVAASAN 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 NHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPG : : ::.:::.:.:::::::: :::..::.:.:. :...:::::::::.::::::.::: NP_612 NSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDDGKTVDGPG 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 RLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSP :::..:::::.:.:::: :::::::::::::.:: :.:::::.::::::.:::...: .: NP_612 RLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTISVSSATENGYKP 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 WYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPN :: :.:.:::::.:::: . ...:...::.. ::. :::::.:::..:::.::::::: . NP_612 WYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPMVAGIIALALEANSQ 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSV :::::.:::.: ::. : . :: :::: :. .::::..:.::: .. . : .: NP_612 LTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASD-WKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEALV--VEAKKWTAV 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 PEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRAC-EGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGD : .. ::. .: .::.. . : :: : ... . :::: ...: . :::: NP_612 PSQHMCVAA-SDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHPRRGD 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 LHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQN :.. :.: .::.. :::.: : : .:: ::.::.:: :::. : :::.: :. ....: NP_612 LQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLEIQDLPSQVRN 560 570 580 590 600 610 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 EGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMVDPGEEQPTQENPKENT NP_612 PEKQGNLD 620 >>NP_612197 (OMIM: 167405) proprotein convertase subtili (652 aa) initn: 1936 init1: 1332 opt: 1979 Z-score: 2034.5 bits: 386.9 E(85289): 1.4e-106 Smith-Waterman score: 1979; 51.9% identity (75.6% similar) in 570 aa overlap (13-580:51-615) 10 20 30 40 pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQ-FVNEWAAEIPG ..:. : : :: : ..:.::... : NP_612 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQVLG 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 GPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQ :: :. .: :: :::::.::..: : :.. .:: :. : : .: : .: NP_612 GPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGV : :.: ::.. : ::::.:...:::. .. . ...: .:..: :::.: NP_612 QEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRC-RSEMNVQAAWKRGYTGKNV 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQAN :.:.::::.: :: :. ::: :::: : ::.:: :::: .::::::::::::.: .:: NP_612 VVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHGTRCAGEVAASAN 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 NHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPG : : ::.:::.:.:::::::: :::..::.:.:. :...:::::::::.::::::.::: NP_612 NSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDDGKTVDGPG 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 RLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSP :::..:::::.:.:::: :::::::::::::.:: :.:::::.::::::.:::...: .: NP_612 RLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTISVSSATENGYKP 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 WYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPN :: :.:.:::::.:::: . ...:...::.. ::. :::::.:::..:::.::::::: . NP_612 WYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPMVAGIIALALEANSQ 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSV :::::.:::.: ::. : . :: :::: :. .::::..:.::: .. . : .: NP_612 LTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASD-WKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEALV--VEAKKWTAV 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 PEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRAC-EGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGD : .. ::. .: .::.. . : :: : ... . :::: ...: . :::: NP_612 PSQHMCVAA-SDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHPRRGD 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 LHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQN :.. :.: .::.. :::.: : : .:: ::.::.:: :::. : :::.: :. ....: NP_612 LQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLEIQDLPSQVRN 560 570 580 590 600 610 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 EGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMVDPGEEQPTQENPKENT NP_612 PEKQGDLETPVANQLTTEEREPGLKHVFRWQIEQELW 620 630 640 650 >>NP_612198 (OMIM: 167405) proprotein convertase subtili (664 aa) initn: 1936 init1: 1332 opt: 1979 Z-score: 2034.4 bits: 386.9 E(85289): 1.4e-106 Smith-Waterman score: 1979; 51.9% identity (75.6% similar) in 570 aa overlap (13-580:51-615) 10 20 30 40 pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQ-FVNEWAAEIPG ..:. : : :: : ..:.::... : NP_612 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQVLG 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 GPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQ :: :. .: :: :::::.::..: : :.. .:: :. : : .: : .: NP_612 GPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQ 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 QYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGV : :.: ::.. : ::::.:...:::. .. . ...: .:..: :::.: NP_612 QEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRC-RSEMNVQAAWKRGYTGKNV 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQAN :.:.::::.: :: :. ::: :::: : ::.:: :::: .::::::::::::.: .:: NP_612 VVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHGTRCAGEVAASAN 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 NHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPG : : ::.:::.:.:::::::: :::..::.:.:. :...:::::::::.::::::.::: NP_612 NSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDDGKTVDGPG 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 RLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSP :::..:::::.:.:::: :::::::::::::.:: :.:::::.::::::.:::...: .: NP_612 RLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTISVSSATENGYKP 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 WYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPN :: :.:.:::::.:::: . ...:...::.. ::. :::::.:::..:::.::::::: . 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