FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2080, 753 aa 1>>>pF1KE2080 753 - 753 aa - 753 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3961+/-0.000961; mu= 14.9067+/- 0.058 mean_var=86.8652+/-17.273, 0's: 0 Z-trim(106.4): 25 B-trim: 31 in 1/51 Lambda= 0.137610 statistics sampled from 8917 (8935) to 8917 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16 Scan time: 3.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 753) 5140 1030.9 0 CCDS54881.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 706) 4734 950.3 0 CCDS73790.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 969) 2045 416.5 1e-115 CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 956) 2039 415.3 2.3e-115 CCDS73791.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 623) 1979 403.3 6e-112 CCDS73793.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 652) 1979 403.3 6.3e-112 CCDS73792.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 664) 1979 403.3 6.4e-112 CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 ( 913) 1968 401.2 3.8e-111 CCDS55320.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (1860) 1968 401.3 7.2e-111 CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15 ( 794) 1804 368.6 2.1e-101 CCDS13125.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 638) 1800 367.8 3.1e-101 CCDS12069.2 PCSK4 gene_id:54760|Hs108|chr19 ( 755) 1799 367.6 4.1e-101 CCDS56180.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 619) 1789 365.6 1.4e-100 CCDS56179.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 603) 1705 348.9 1.4e-95 CCDS8382.1 PCSK7 gene_id:9159|Hs108|chr11 ( 785) 1435 295.3 2.4e-79 >>CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 (753 aa) initn: 5140 init1: 5140 opt: 5140 Z-score: 5513.6 bits: 1030.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5140; 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CCDS55 VRTSRAGHLNAND-WKTNAAGFKVSHLYGFGLMDAEAMVMEAEK--WTTVPRQHVCV-ES 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 NDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENA-IKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAG .: . .... :. : . .: . : .. :::: . :: . ::::: . ::: .: CCDS55 TDRQIKTIRPNSAVRSIYKASGCSDNPNRHVNYLEHVVVRITITHPRRGDLAIYLTSPSG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 TSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQN---EGRIVNW : . :::.: : : .:::::.::..: ::: : :.:.. : ....: :.. .: CCDS55 TRSQLLANRLFDHSMEGFKNWEFMTIHCWGERAAGDWVLEVYDTPSQLRNFKTPGKLKEW 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 KLILHGTSSQPEHMKQ--PRVYT-SYNTVQN--DRRGVEKMVDPGEEQPTQENPKENTLV .:.:.::: :: . :.: :. :.. : :.: .. : CCDS55 SLVLYGTSVQPYSPTNEFPKVERFRYSRVEDPTDDYGTEDYAGPCDPECSEVGCDGPGPD 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 SKSPSSSSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQSPKKSPSAKLNIPYENFYE CCDS55 HCNDCLHYYYKLKNNTRICVSSCPPGHYHADKKRCRKCAPNCESCFGSHGDQCMSCKYGY 660 670 680 690 700 710 >>CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15 (794 aa) initn: 1955 init1: 1327 opt: 1804 Z-score: 1933.9 bits: 368.6 E(32554): 2.1e-101 Smith-Waterman score: 2002; 45.7% identity (69.2% similar) in 718 aa overlap (1-689:1-695) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQFVNEWAAEIPGGPEAASAIAEELGYDLLGQ :: : : : .: . . : . :.... :.: ::..::::: .:...:.. :. ::: CCDS10 MELRPWLLWVVAATGTLVLLAAD-AQGQKVFTNTWAVRIPGGPAVANSVARKHGFLNLGQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 IGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALNL : . ..: : :.. .:: .::. . .: : ::: :.:.::.. .. . CCDS10 I--FGDYYHFWHRGVTKRSLSPHRPRHSRLQREPQVQWLEQQVAKRRTKRDVYQEPT--- 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 FNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYAN :: . ::::: ... . ::.: .: .: ::.:.:...::::.: :: :. .: CCDS10 --DPKFPQQWYL------SGVTQRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGN 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 YDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRM ::: ::.: ::.: :: ::: :.:.::::::::.: ::: ::::::::...::.:: CCDS10 YDPGASFDVNDQDPDPQPRYTQMNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRM 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKG ::: ::::.:: :.:.::.:. ::::::::.::::::.::.:::..:: ::.::: : : CCDS10 LDGEVTDAVEARSLGLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGGLG 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 SIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDY ::::::::::::. :.:.:::::.::::.:::::.: : :::.: :::::::.::::. CCDS10 SIFVWASGNGGREHDSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQ 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 TDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPL ....:...::.. :::.::::::::::::::.::.:::: :::::::::::: ::. : CCDS10 NEKQIVTTDLRQKCTESHTGTSASAPLAAGIIALTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHL 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 ANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKDNDFEPRALK : : ::.: :. .:.:::.: :.: :: ..: .: ...:.. : ::. . CCDS10 NAND-WATNGVGRKVSHSYGYGLLDAGAMVALA--QNWTTVAPQRKCII-DILTEPKDIG 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 ANGEVIIEIPTRACEGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERE :: . . :: :. : : :::.: . :. :.::::: . :.: :: ..::: : CCDS10 KRLEV--RKTVTACLGEPNHITRLEHAQARLTLSYNRRGDLAIHLVSPMGTRSTLLAARP 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 RDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWKLILHGTSSQPEH .: : .::..: ::..:.: :.: : :.:.: . : . .: : .... :.:.::. :: CCDS10 HDYSADGFNDWAFMTTHSWDEDPSGEWVLEIENTS-EANNYGTLTKFTLVLYGTA--PEG 530 540 550 560 570 610 620 630 640 pF1KE2 MKQPRVYTSYNTVQNDR-------------RGVEKMVDPG------EEQPTQENPKENTL . : .. .:. ... .. . :: . . . :: :. CCDS10 LPVPPESSGCKTLTSSQACVVCEEGFSLHQKSCVQHCPPGFAPQVLDTHYSTENDVETIR 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 pF1KE2 VSK-SPSSSSVGG-RRDELEE--GAPSQAMLRLL------QSAFSKNSPPKQSPKKSPSA .: .: .: . . : . . ::.: : . :: :..:::.:.: . : CCDS10 ASVCAPCHASCATCQGPALTDCLSCPSHASLDPVEQTCSRQSQSSRESPPQQQPPRLPPE 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 KLNIPYENFYEALEKLNKPSQLKDSEDSLYNDYVDVFYNTKPYKHRDDRLLQALVDILNE CCDS10 VEAGQRLRAGLLPSHLPEVVAGLSCAFIVLVFVTVFLVLQLRSGFSFRGVKVYTMDRGLI 700 710 720 730 740 750 753 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:14:06 2016 done: Sun Nov 6 21:14:07 2016 Total Scan time: 3.990 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]