Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1914
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1914, 451 aa
1>>>pF1KE1914 451 - 451 aa - 451 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1852+/-0.000929; mu= 18.6245+/- 0.056
mean_var=68.7391+/-13.815, 0's: 0 Z-trim(104.9): 35 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.154694
statistics sampled from 8102 (8137) to 8102 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 ( 451) 3020 683.2 1.4e-196
CCDS10988.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 450) 2437 553.1 2.1e-157
CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 ( 445) 2434 552.4 3.3e-157
CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 444) 2433 552.2 3.8e-157
CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 ( 445) 2430 551.6 6e-157
CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 ( 444) 2424 550.2 1.5e-156
CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 ( 445) 2416 548.4 5.3e-156
CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 446) 2414 548.0 7.2e-156
CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 ( 444) 2388 542.2 4e-154
CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 378) 2055 467.8 8.3e-132
CCDS78124.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 372) 2047 466.0 2.8e-131
CCDS31792.1 TUBA1B gene_id:10376|Hs108|chr12 ( 451) 1198 276.6 3.6e-74
CCDS2438.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 448) 1191 275.0 1.1e-73
CCDS8781.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 1190 274.8 1.2e-73
CCDS58227.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 1190 274.8 1.2e-73
CCDS8782.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 449) 1186 273.9 2.3e-73
CCDS13751.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 449) 1186 273.9 2.3e-73
CCDS9284.1 TUBA3C gene_id:7278|Hs108|chr13 ( 450) 1179 272.4 6.8e-73
CCDS33290.1 TUBA3D gene_id:113457|Hs108|chr2 ( 450) 1179 272.4 6.8e-73
CCDS76556.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 519) 1179 272.4 7.6e-73
CCDS2158.1 TUBA3E gene_id:112714|Hs108|chr2 ( 450) 1154 266.8 3.2e-71
CCDS63131.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 433) 1135 262.5 5.9e-70
CCDS58226.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 416) 1095 253.6 2.8e-67
CCDS53491.1 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 406) 1047 242.9 4.6e-64
CCDS7066.2 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 446) 1047 242.9 5e-64
CCDS54495.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 383) 1029 238.8 7.1e-63
CCDS11433.1 TUBG1 gene_id:7283|Hs108|chr17 ( 451) 980 228.0 1.6e-59
CCDS32658.1 TUBG2 gene_id:27175|Hs108|chr17 ( 451) 973 226.4 4.7e-59
CCDS5100.1 TUBE1 gene_id:51175|Hs108|chr6 ( 475) 514 124.0 3.4e-28
CCDS77153.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 104) 465 112.6 1.9e-25
CCDS54154.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 396) 457 111.2 2e-24
CCDS11620.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 453) 457 111.2 2.2e-24
CCDS54152.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 351) 436 106.5 4.6e-23
CCDS54153.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 398) 436 106.5 5.1e-23
>>CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 (451 aa)
initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 3642.7 bits: 683.2 E(32554): 1.4e-196
Smith-Waterman score: 3020; 100.0% identity (100.0% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
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CCDS13 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
430 440 450
>>CCDS10988.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 (450 aa)
initn: 2406 init1: 2406 opt: 2437 Z-score: 2939.5 bits: 553.1 E(32554): 2.1e-157
Smith-Waterman score: 2437; 78.2% identity (92.9% similar) in 450 aa overlap (1-450:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
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CCDS10 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPSGNYVGDSDLQLERISVYYNEASSHKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::.:::::::::::.::. .: ::.::.:. :.::::::::::::::::::...::.::
CCDS10 PRAILVDLEPGTMDSVRSGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.: :.::::::::..:::::::::::::::..:.::::::::::.:::.::::::::::
CCDS10 RKECENCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKVREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
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CCDS10 EPYNATLSIHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLATPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.: :::::::::.: :
CCDS10 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
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CCDS10 AACDPRHGRYLTVATVFRGRMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
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CCDS10 LKMSSTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : ::. :. :. : : : .:
CCDS10 EYQQYQDATA--EEEGEMYEDDEEESEAQGPK
430 440 450
>>CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 (445 aa)
initn: 2456 init1: 2406 opt: 2434 Z-score: 2936.0 bits: 552.4 E(32554): 3.3e-157
Smith-Waterman score: 2434; 79.3% identity (93.3% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
::::::.: :::::::::::::.:..::::: .:. .: : ::::::.:::::: : :::
CCDS70 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::::::::::::::.::. .: .:.::.:: :.::::::::::::::::::...::.::
CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.:.::::::::::..:::::::::::::::..::::::::::::.:::.::::::::::
CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:: :
CCDS70 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
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CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
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CCDS70 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.:.::::::.:::::.:.:.::.:.:::.::::.::::.:::: :: :::.:..::::
CCDS70 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : ::. : :::: :
CCDS70 EYQQYQDATA--EEEGEFEEEAEEEVA
430 440
>>CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 (444 aa)
initn: 2447 init1: 2415 opt: 2433 Z-score: 2934.8 bits: 552.2 E(32554): 3.8e-157
Smith-Waterman score: 2433; 79.1% identity (93.5% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
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CCDS46 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::.:::::::::::.::. .: .:.::.:: :.::::::::::::::::::...::.::
CCDS46 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.:.::::::::::..:::::::::::::::..::::::::::::.:::.::::::::::
CCDS46 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:: :
CCDS46 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: :::::.:::.: :
CCDS46 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
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CCDS46 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.::.:::::.:::::.:.:.::.:.:::.::::.::::.:::: :: :::.:..::::
CCDS46 LKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : ::.:. :::: :
CCDS46 EYQQYQDATA--EEEEDFGEEAEEEA
430 440
>>CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 (445 aa)
initn: 2420 init1: 2420 opt: 2430 Z-score: 2931.1 bits: 551.6 E(32554): 6e-157
Smith-Waterman score: 2430; 79.6% identity (93.0% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
:::::::: :::::::::::::.:..::::: .:: .: : ::::::.:::::: : :::
CCDS44 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEATGNKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::.:::::::::::.::. .: .:.::.:: :.::::::::::::::::::...::.::
CCDS44 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.::::::::::::..:::::::::::::::..::::::::::::.::::::::::::::
CCDS44 RKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:: :
CCDS44 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: ::::::::..: :
CCDS44 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
:::: :.::::::: ::::.:: ::::.:.:.::..::: ::::::::::.:::::::::
CCDS44 AACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.:.::::::.:::::.:.:.::.:.:::.::::.::::.:::: :: :::.:..::::
CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : :. : ::.: :
CCDS44 EYQQYQDATAD-EQGEFEEEEGEDEA
430 440
>>CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 (444 aa)
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Smith-Waterman score: 2424; 79.1% identity (92.8% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
::::::.: :::::::::::::.:..::::: .:. .: : ::::::.:::::: : .::
CCDS12 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGNYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::::::::::::::.::. .: .:.::.:: :.::::::::::::::::::.. ::.::
CCDS12 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.:.::::::::::..:::::::::::::::..:::::.::::::.:::.::::::::::
CCDS12 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:: :
CCDS12 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: :::::::::.: :
CCDS12 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
:::: :.::::::: .:::.:: ::::.:.::::..::: ::::::::::.:::::::::
CCDS12 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLSVQSKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.::::::::.:::::.:.:.::.:.:::.::::.::::.:::: :: :::.:..::::
CCDS12 LKMAATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : :. : :::: :
CCDS12 EYQQYQDATA---EEGEFEEEAEEEVA
430 440
>>CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 (445 aa)
initn: 2406 init1: 2406 opt: 2416 Z-score: 2914.2 bits: 548.4 E(32554): 5.3e-156
Smith-Waterman score: 2416; 79.3% identity (92.8% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
:::::::: :::::::::::::.:..::::: .:: .: : ::::::.:::::: : :::
CCDS44 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::.:::::::::::.::. .: .:.::.:: :.::::::::::::::::::...::.::
CCDS44 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.::::::::::::..:::::::::::::::..::::::::::::.::::::::::::::
CCDS44 RKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::.::.: . ::::::::::::::::::::::::::::: ::::.:: :
CCDS44 EPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: ::::::::..: :
CCDS44 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
:::: :.::::::: ::::.:: ::::.:.:.::..::: ::::::::::.:::::::::
CCDS44 AACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.:.::::::.:::::.:.:.::.:.:::.::::.::::.:::: :: :::.:..::::
CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : :. : ::.: :
CCDS44 EYQQYQDATAD-EQGEFEEEEGEDEA
430 440
>>CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 (446 aa)
initn: 2441 init1: 2411 opt: 2414 Z-score: 2911.8 bits: 548.0 E(32554): 7.2e-156
Smith-Waterman score: 2414; 78.4% identity (92.8% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
:::::::: ::::::::.::::.:..::::: ::. : ::::::::.:::::. ..:::
CCDS11 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::.:::::::::::.::. .: ::.::.:. :..:::::::::::::::::.. ::.::
CCDS11 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.: : ::::::::..:::::::::::::::..:::::.::::::.::::::::::::::
CCDS11 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::
CCDS11 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: ::::::::::: :
CCDS11 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
:::: :.::::::: .::: :: ::::.:.:..:..::: ::::::::::::::::::::
CCDS11 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.::.:::::.:::::.:.:.::.:::::.::::.::.:.:::: :: :::.:..::::
CCDS11 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : .. ::. :. : :
CCDS11 EYQQYQDATA--NDGEEAFEDEEEEIDG
430 440
>>CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 (444 aa)
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Smith-Waterman score: 2388; 77.8% identity (92.7% similar) in 441 aa overlap (1-441:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
::::: :::::::::::::::.:..::.:: ::. .: : ::::::.:::::: : .::
CCDS70 MREIVLTQIGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVYYNEASGGRYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
:::::::::::::::.::. .: .:.::.:. :. :::::::::::::::::.:.:..::
CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFIFGQCGAGNNWAKGHYTEGAELMESVMDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
:.:.::::::::::..:::::::::::::::..::::::::::.:.::..::::::::::
CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLLSKIREEYPDRIINTFSILPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
:::::.::.:::::::: :::::::::::: .:::: :::::::::::: ::::.:: :
CCDS70 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSKTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.:::::::::::.: :
CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
:::: :.:::::.: ::::.: .:::.:....: .::: :..:.:::::.:::::::::
CCDS70 AACDPRHGRYLTAAAIFRGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWLPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
:.:.::::::::::::.:.::::.:.:::.::::.::::.:::: :: :::.:..::::
CCDS70 LKMSATFIGNNTAIQELFKRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
::::.::: : ::::: .::
CCDS70 EYQQYQDATAEEEEDEEYAEEEVA
430 440
>>CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 (378 aa)
initn: 2024 init1: 2024 opt: 2055 Z-score: 2479.8 bits: 467.8 E(32554): 8.3e-132
Smith-Waterman score: 2055; 78.0% identity (93.4% similar) in 378 aa overlap (73-450:1-376)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QLERISVYYNEAYGRKYVPRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWA
:::.::. .: ::.::.:. :.::::::::
CCDS56 MDSVRSGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWA
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 KGHYTEGAELIENVLEVVRHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDR
::::::::::...::.:::.: :.::::::::..:::::::::::::::..:.:::::::
CCDS56 KGHYTEGAELVDSVLDVVRKECENCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKVREEYPDR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IMNSFSVMPSPKVSDTVVEPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTY
:::.:::.:::::::::::::::.::::::.::.: .:::::::::::::::::.::::
CCDS56 IMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSIHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLATPTY
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GDLNHLVSLTMSGITTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYR
:::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS56 GDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYR
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ALSVAELTQQMFDARNTMAACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFV
::.: :::::::::.: ::::: :.::::::: .:::.:: ::::.:.:..:..::: ::
CCDS56 ALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGRMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFV
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 EWIPNNVKVAVCDIPPRGLSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEG
:::::::::::::::::::.:..:::::.:::::.:.:.::.:.:::.::::.::::.::
CCDS56 EWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMSSTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450
pF1KE1 MDINEFGEAENNIHDLVSEYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
:: :: :::.:..::::::::.::: : ::. :. :. : : : .:
CCDS56 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA--EEEGEMYEDDEEESEAQGPK
340 350 360 370
451 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:16:12 2016 done: Sun Nov 6 21:16:13 2016
Total Scan time: 2.910 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]