Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2076
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2076, 745 aa
1>>>pF1KE2076 745 - 745 aa - 745 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8706+/-0.00131; mu= -8.9339+/- 0.075
mean_var=362.2135+/-82.154, 0's: 0 Z-trim(106.6): 600 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.067389
statistics sampled from 8445 (9180) to 8445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS7488.1 CHUK gene_id:1147|Hs109|chr10 ( 745) 5011 502.8 7.9e-142
CCDS6128.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8 ( 756) 2489 257.7 5.2e-68
CCDS55228.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8 ( 754) 2367 245.8 1.9e-64
CCDS56535.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8 ( 697) 2221 231.6 3.4e-60
>>CCDS7488.1 CHUK gene_id:1147|Hs109|chr10 (745 aa)
initn: 5011 init1: 5011 opt: 5011 Z-score: 2659.9 bits: 502.8 E(33420): 7.9e-142
Smith-Waterman score: 5011; 99.9% identity (100.0% similar) in 745 aa overlap (1-745:1-745)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MERPPGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCH
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CCDS74 MERPPGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EIQIMKKLNHANVVKACDVPEELNILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EIQIMKKLNHANVVKACDVPEELNILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 ILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 CIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRC
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLVVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 FVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SLDPRKPASQCVLDGVRGCDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLDPRKPASQCVLDGVRGCDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 IQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 EFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHAE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 IMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDHSYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDHSYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 SSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLGHL
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE2 STIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS74 STIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE
730 740
>>CCDS6128.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8 (756 aa)
initn: 2151 init1: 972 opt: 2489 Z-score: 1334.7 bits: 257.7 E(33420): 5.2e-68
Smith-Waterman score: 2489; 51.3% identity (77.6% similar) in 749 aa overlap (1-743:1-742)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MERPPGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCH
: :.: . : :::.::::::::::: ....: .::::.:: ::: .::::::
CCDS61 MSWSPSLTTQTCGAWEMKERLGTGGFGNVIRWHNQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 EIQIMKKLNHANVVKACDVPEEL-NILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKES
:::::..:.: ::: : :::: . :. .:.::::::::.:::::: ::. ::::::.:.
CCDS61 EIQIMRRLTHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 QILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCT
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CCDS61 AILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SFVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDP
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CCDS61 SFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KCIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPR
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CCDS61 VDIVVSEDLNGTVKFSSSLPYPNNLNSVLAERLEKWLQLMLMWHPRQRG--TDPTYGPNG
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 CFVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETG
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CCDS61 CFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 ISLDPRKPASQCVLDGV--RG--CDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSK
..: : :::.::. :: .: : .:.:::.:: .:: .. : . :. :.:. :
CCDS61 LALIPDKPATQCISDGKLNEGHTLDMDLVFLFDNSKITYETQISPRPQPESVSCILQEPK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 IQLPIIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQ
.: ..::::::... : .. :::: .:: :::::::..::: :. :.::::.. : :::
CCDS61 RNLAFFQLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LKAKLEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIM
:::::.::. :::.:::.:::: .::.:.:.: ::.:::. . .. . . : ...:
CCDS61 LKAKLDFFKTSIQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKLLVERMM
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 SLHAEIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDH-SYSDSTEMVKIIVHTV
.:...:..::.::.::.:: ...::..: .::..:...: :. . .:: :::.......
CCDS61 ALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTEGDSQEMVRLLLQAI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 QSQDRVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLL
:: .. .. .. .::: . :::: ..:::::: ..: ..: ..::. .: :::::.:.::
CCDS61 QSFEKKVRVIYTQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 KIACTQSSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENL
:::: :..:. :..: .. . . : : . . : . :. .. : ... :
CCDS61 KIAC--SKVRGPVSGSPDSMNASRLSQ---PGQLMSQPSTASNSLPEPAKKSEELVAEAH
660 670 680 690 700 710
720 730 740
pF1KE2 NCLGHLSTIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE
: : . :... .:: .:. ::::::
CCDS61 NLCTLLENAIQDTVREQDQSFTALDWSWLQTEEEEHSCLEQAS
720 730 740 750
>>CCDS55228.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8 (754 aa)
initn: 2042 init1: 972 opt: 2367 Z-score: 1270.6 bits: 245.8 E(33420): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 2367; 51.2% identity (77.9% similar) in 715 aa overlap (35-743:33-740)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PGLRPGAGGPWEMRERLGTGGFGNVCLYQHRELDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCHEIQI
.: .::::.:: ::: .:::::: ::::
CCDS55 SGGCHSPGFGRPSPAFPAPGSPPPAPRPCRQETGEQIAIKQCRQELSPRNRERWCLEIQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MKKLNHANVVKACDVPEEL-NILIHDVPLLAMEYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQILS
:..:.: ::: : :::: . :. .:.::::::::.:::::: ::. ::::::.:. ::.
CCDS55 MRRLTHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAMEYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDVGGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTSFVG
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CCDS55 LLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQGEQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECIAGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPKCIF
:::::::::.:.. ::.:::::::::..::::.:.:::: . :: :: :...:. :
CCDS55 TLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECITGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEVDIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENWLQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRCFVL
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CCDS55 VSEDLNGTVKFSSSLPYPNNLNSVLAERLEKWLQLMLMWHPRQRG--TDPTYGPNGCFKA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLHSLQSRIERETGINTGSQELLSETGISLD
.: :::::.::::::... : .. . ::::.::..::...::: .::::.:.:..:
CCDS55 LDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQSLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE2 PRKPASQCVLDGV--RG--CDSYMVYLFDKSKTVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLP
: :::.::. :: .: : .:.:::.:: .:: .. : . :. :.:. : .:
CCDS55 PDKPATQCISDGKLNEGHTLDMDLVFLFDNSKITYETQISPRPQPESVSCILQEPKRNLA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 IIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAAMLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAK
..::::::... : .. :::: .:: :::::::..::: :. :.::::.. : :::::::
CCDS55 FFQLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAAMMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAK
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAWKEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHA
:.::. :::.:::.:::: .::.:.:.: ::.:::. . .. . . : ...:.:..
CCDS55 LDFFKTSIQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAWREMEQAVELCGRENEVKLLVERMMALQT
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 EIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQLKHRPSDH-SYSDSTEMVKIIVHTVQSQD
.:..::.::.::.:: ...::..: .::..:...: :. . .:: :::.......:: .
CCDS55 DIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRLREKPRDQRTEGDSQEMVRLLLQAIQSFE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALSNIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIAC
. .. .. .::: . :::: ..:::::: ..: ..: ..::. .: :::::.:.::::::
CCDS55 KKVRVIYTQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVSLMNEDEKTVVRLQEKRQKELWNLLKIAC
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 TQSSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEHDHSLSCVVTPQDGETSAQMIEENLNCLG
:..:. :..: .. . . : : . . : . :. .. : ... : :
CCDS55 --SKVRGPVSGSPDSMNASRLSQ---PGQLMSQPSTASNSLPEPAKKSEELVAEAHNLCT
670 680 690 700 710
720 730 740
pF1KE2 HLSTIIHEANEEQGNSMMNLDWSWLTE
: . :... .:: .:. ::::::
CCDS55 LLENAIQDTVREQDQSFTALDWSWLQTEEEEHSCLEQAS
720 730 740 750
>>CCDS56535.1 IKBKB gene_id:3551|Hs109|chr8 (697 aa)
initn: 1883 init1: 972 opt: 2221 Z-score: 1194.4 bits: 231.6 E(33420): 3.4e-60
Smith-Waterman score: 2221; 50.5% identity (77.7% similar) in 683 aa overlap (67-743:8-683)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LDLKIAIKSCRLELSTKNRERWCHEIQIMKKLNHANVVKACDVPEEL-NILIHDVPLLAM
.:.: ::: : :::: . :. .:.:::::
CCDS56 MSSDGTIRLTHPNVVAARDVPEGMQNLAPNDLPLLAM
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 EYCSGGDLRKLLNKPENCCGLKESQILSLLSDIGSGIRYLHENKIIHRDLKPENIVLQDV
:::.:::::: ::. ::::::.:. ::.:::::.:..::::::.::::::::::::::.
CCDS56 EYCQGGDLRKYLNQFENCCGLREGAILTLLSDIASALRYLHENRIIHRDLKPENIVLQQG
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 GGKIIHKIIDLGYAKDVDQGSLCTSFVGTLQYLAPELFENKPYTATVDYWSFGTMVFECI
..:::::::::::..::::::::::::::::::::.:.. ::.:::::::::..::::
CCDS56 EQRLIHKIIDLGYAKELDQGSLCTSFVGTLQYLAPELLEQQKYTVTVDYWSFGTLAFECI
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 AGYRPFLHHLQPFTWHEKIKKKDPKCIFACEEMSGEVRFSSHLPQPNSLCSLIVEPMENW
.:.:::: . :: :: :...:. : . :...: :.::: :: ::.: :...: .:.:
CCDS56 TGFRPFLPNWQPVQWHSKVRQKSEVDIVVSEDLNGTVKFSSSLPYPNNLNSVLAERLEKW
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 LQLMLNWDPQQRGGPVDLTLKQPRCFVLMDHILNLKIVHILNMTSAKIISFLLPPDESLH
::::: : :.::: .: : :: .: :::::.::::::... : .. . ::::.
CCDS56 LQLMLMWHPRQRG--TDPTYGPNGCFKALDDILNLKLVHILNMVTGTIHTYPVTEDESLQ
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SLQSRIERETGINTGSQELLSETGISLDPRKPASQCVLDGV--RG--CDSYMVYLFDKSK
::..::...::: .::::.:.:..: : :::.::. :: .: : .:.:::.::
CCDS56 SLKARIQQDTGIPEEDQELLQEAGLALIPDKPATQCISDGKLNEGHTLDMDLVFLFDNSK
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 TVYEGPFASRSLSDCVNYIVQDSKIQLPIIQLRKVWAEAVHYVSGLKEDYSRLFQGQRAA
.:: .. : . :. :.:. : .: ..::::::... : .. :::: .:: ::::::
CCDS56 ITYETQISPRPQPESVSCILQEPKRNLAFFQLRKVWGQVWHSIQTLKEDCNRLQQGQRAA
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 MLSLLRYNANLTKMKNTLISASQQLKAKLEFFHKSIQLDLERYSEQMTYGISSEKMLKAW
:..::: :. :.::::.. : ::::::::.::. :::.:::.:::: .::.:.:.: ::
CCDS56 MMNLLRNNSCLSKMKNSMASMSQQLKAKLDFFKTSIQIDLEKYSEQTEFGITSDKLLLAW
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 KEMEEKAIHYAEVGVIGYLEDQIMSLHAEIMELQKSPYGRRQGDLMESLEQRAIDLYKQL
.:::. . .. . . : ...:.:...:..::.::.::.:: ...::..: .::..:
CCDS56 REMEQAVELCGRENEVKLLVERMMALQTDIVDLQRSPMGRKQGGTLDDLEEQARELYRRL
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 KHRPSDH-SYSDSTEMVKIIVHTVQSQDRVLKELFGHLSKLLGCKQKIIDLLPKVEVALS
...: :. . .:: :::.......:: .. .. .. .::: . :::: ..:::::: ..:
CCDS56 REKPRDQRTEGDSQEMVRLLLQAIQSFEKKVRVIYTQLSKTVVCKQKALELLPKVEEVVS
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 NIKEADNTVMFMQGKRQKEIWHLLKIACTQSSARSLVGSSLEGAVTPQTSAWLPPTSAEH
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