FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2012, 557 aa 1>>>pF1KE2012 557 - 557 aa - 557 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7752+/-0.000894; mu= -5.7938+/- 0.054 mean_var=279.1865+/-60.867, 0's: 0 Z-trim(115.3): 108 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.076759 statistics sampled from 15790 (15898) to 15790 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.488), width: 16 Scan time: 4.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 557) 3929 448.3 1.1e-125 CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 424) 3031 348.8 7.8e-96 CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 605) 2105 246.3 7.7e-65 CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 591) 2104 246.2 8.2e-65 CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 386) 1529 182.4 8.4e-46 CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 391) 1529 182.4 8.5e-46 CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 366) 1509 180.2 3.7e-45 CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 444) 1374 165.3 1.4e-40 CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 461) 1374 165.3 1.4e-40 CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 727) 613 81.2 4.9e-15 CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 617) 585 78.0 3.7e-14 CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 732) 585 78.1 4.2e-14 CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 271) 517 70.3 3.4e-12 CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 596) 521 70.9 4.8e-12 CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 487) 517 70.4 5.6e-12 CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 625) 517 70.5 6.8e-12 CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 483) 503 68.9 1.6e-11 >>CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (557 aa) initn: 3929 init1: 3929 opt: 3929 Z-score: 2369.7 bits: 448.3 E(32554): 1.1e-125 Smith-Waterman score: 3929; 99.8% identity (100.0% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 TILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 DSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 DSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSR 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 NFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 NFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 FHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 FEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 FEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFK 490 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 EQNDKPYCQNCFLKLFC ::::::::::::::::: CCDS44 EQNDKPYCQNCFLKLFC 550 >>CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (424 aa) initn: 3031 init1: 3031 opt: 3031 Z-score: 1834.0 bits: 348.8 E(32554): 7.8e-96 Smith-Waterman score: 3031; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (134-557:1-424) 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 VGSPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGK 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 TGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 TGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTW 160 170 180 190 200 210 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 HPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 HPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWH 220 230 240 250 260 270 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 PEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 PEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHP 280 290 300 310 320 330 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 ECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPE 340 350 360 370 380 390 530 540 550 pF1KE2 HFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 HFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC 400 410 420 >>CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (605 aa) initn: 2695 init1: 2105 opt: 2105 Z-score: 1277.6 bits: 246.3 E(32554): 7.7e-65 Smith-Waterman score: 3728; 91.7% identity (91.9% similar) in 589 aa overlap (17-557:17-605) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 TILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFK----------------------- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKGSWPLEEVVLLVSISSSVQEGEK 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 pF1KE2 -------------------------FMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLN ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 YPHPCAARHRTPSLRSPDQPPPCPQFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLN 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 KLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 KLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCE 370 380 390 400 410 420 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 KDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 KDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRK 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 DYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 DYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVH 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 YHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 YHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCF 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 LKLFC ::::: CCDS58 LKLFC >>CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (591 aa) initn: 3915 init1: 2103 opt: 2104 Z-score: 1277.1 bits: 246.2 E(32554): 8.2e-65 Smith-Waterman score: 3836; 94.1% identity (94.2% similar) in 589 aa overlap (3-557:3-591) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 TILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFK----------------------- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKIQGLEQRADGERCWAAGWPRDGG 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 pF1KE2 -----------FMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 RSSPGGQDEGGFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGA 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 CKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 CKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYC 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 NGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 NGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCA 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 RAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 RAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQK 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 pF1KE2 PITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 PITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC 550 560 570 580 590 >>CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 (386 aa) initn: 1502 init1: 1460 opt: 1529 Z-score: 935.7 bits: 182.4 E(32554): 8.4e-46 Smith-Waterman score: 1529; 60.8% identity (81.6% similar) in 332 aa overlap (230-556:54-384) 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 EKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPA---ITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTR ::.:: :.: :.. ... ... CCDS79 NPAPLPLDQHSRKETNLDETSEILSIQDNTSPLPAQLVYTTNIQELNVYSEAQEPKESPP 30 40 50 60 70 80 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 ISASSATRELDELMASLSDF--KFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKL : .::. .:::::: :... : ... .:.. : . .: ::::::.:...:. : CCDS79 PSKTSAAAQLDELMAHLTEMQAKVAVRADAGKKHLPDKQDHKAS-LDSMLGGLEQELQDL 90 100 110 120 130 140 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 GVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKD :.::: :: :..:.:::::.:. :.:..:::::::::::.::::: ::::.: :: .: CCDS79 GIATVPKGHCASCQKPIAGKVIHALGQSWHPEHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPND 150 160 170 180 190 200 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 YHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDY ::.:::::: :: .::::::.::...:::::::::..:: :: ::::::: : :::::. CCDS79 YHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDF 210 220 230 240 250 260 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 FDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYH . ::.:::::: : .::::.::..:.:::::::: .::: : .::::: ::.:.::.::: CCDS79 LAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDTVWHPECFVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYH 270 280 290 300 310 320 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLK .:::.:: :: .:::::::.::. ::::::::::::: ::.:: :.::::: ::: :: : CCDS79 HRRGTLCHGCGQPITGRCISAMGYKFHPEHFVCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNK 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 LFC :: CCDS79 LFPL >>CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 (391 aa) initn: 1502 init1: 1460 opt: 1529 Z-score: 935.6 bits: 182.4 E(32554): 8.5e-46 Smith-Waterman score: 1529; 60.8% identity (81.6% similar) in 332 aa overlap (230-556:59-389) 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 EKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPA---ITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTR ::.:: :.: :.. ... ... CCDS53 NPAPLPLDQHSRKETNLDETSEILSIQDNTSPLPAQLVYTTNIQELNVYSEAQEPKESPP 30 40 50 60 70 80 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 ISASSATRELDELMASLSDF--KFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKL : .::. .:::::: :... : ... .:.. : . .: ::::::.:...:. : CCDS53 PSKTSAAAQLDELMAHLTEMQAKVAVRADAGKKHLPDKQDHKAS-LDSMLGGLEQELQDL 90 100 110 120 130 140 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 GVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKD :.::: :: :..:.:::::.:. :.:..:::::::::::.::::: ::::.: :: .: CCDS53 GIATVPKGHCASCQKPIAGKVIHALGQSWHPEHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPND 150 160 170 180 190 200 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 YHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDY ::.:::::: :: .::::::.::...:::::::::..:: :: ::::::: : :::::. CCDS53 YHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDF 210 220 230 240 250 260 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 FDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYH . ::.:::::: : .::::.::..:.:::::::: .::: : .::::: ::.:.::.::: CCDS53 LAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDTVWHPECFVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYH 270 280 290 300 310 320 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLK .:::.:: :: .:::::::.::. ::::::::::::: ::.:: :.::::: ::: :: : CCDS53 HRRGTLCHGCGQPITGRCISAMGYKFHPEHFVCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNK 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 LFC :: CCDS53 LFPL 390 >>CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 (366 aa) initn: 1502 init1: 1460 opt: 1509 Z-score: 924.1 bits: 180.2 E(32554): 3.7e-45 Smith-Waterman score: 1509; 64.8% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (258-556:65-364) 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 VPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDF--KFMAQGKTG : .::. .:::::: :... : ... .: CCDS76 TLMRLRRSFLFRITQVPCREAQEPKESPPPSKTSAAAQLDELMAHLTEMQAKVAVRADAG 40 50 60 70 80 90 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHP .. : . .: ::::::.:...:. ::.::: :: :..:.:::::.:. :.:..::: CCDS76 KKHLPDKQDHKAS-LDSMLGGLEQELQDLGIATVPKGHCASCQKPIAGKVIHALGQSWHP 100 110 120 130 140 150 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 EHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPE ::::::::.::::: ::::.: :: .:::.:::::: :: .::::::.::...::::: CCDS76 EHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPNDYHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPE 160 170 180 190 200 210 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 HFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPEC ::::..:: :: ::::::: : :::::.. ::.:::::: : .::::.::..:.::::: CCDS76 HFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDFLAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDTVWHPEC 220 230 240 250 260 270 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 FVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHF ::: .::: : .::::: ::.:.::.:::.:::.:: :: .:::::::.::. ::::::: CCDS76 FVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYHHRRGTLCHGCGQPITGRCISAMGYKFHPEHF 280 290 300 310 320 330 530 540 550 pF1KE2 VCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC :::::: ::.:: :.::::: ::: :: ::: CCDS76 VCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNKLFPL 340 350 360 >>CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 (444 aa) initn: 1506 init1: 1350 opt: 1374 Z-score: 842.1 bits: 165.3 E(32554): 1.4e-40 Smith-Waterman score: 1498; 46.7% identity (65.9% similar) in 495 aa overlap (80-556:13-443) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 PPPPSSEALNGTILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCS .: . : :: . :: . : . CCDS10 MPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQ--------PQTGSGESSG 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 RVGEEEHVYSFPNKQKSAEPS----PTVMSTS--LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP :...:.:: : .: .:. : :.: ::..: :::::: ::::.: : CCDS10 ASGDKDHLYSTVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNI---- 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE .:: :. : ... .:. .: :: ::. : CCDS10 TDEIMSQFP-------------SSKVASGEQKEDQSEDKKR----------PSLPS---- 100 110 120 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQ-G :: :.. : . ::.::: :::.::::::::. . . CCDS10 ------SPSPGL---------P----------KASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLP 130 140 150 290 300 310 320 330 pF1KE2 KTGSSSPP-------GGP--PKPGSQ--LDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPI .: ..:: :.: :.: .. ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.::: CCDS10 ASGPTQPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPI 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 AGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPIL :::::::.:..:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: :: CCDS10 AGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIR 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 DKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILE :.:::: :::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: ::. CCDS10 HKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILD 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 NYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGR ::::::..::::.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.::: CCDS10 NYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGR 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 pF1KE2 CITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC :..:....:::.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: :::::: CCDS10 CVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG 400 410 420 430 440 >>CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 (461 aa) initn: 1588 init1: 1350 opt: 1374 Z-score: 841.8 bits: 165.3 E(32554): 1.4e-40 Smith-Waterman score: 1510; 44.1% identity (62.0% similar) in 574 aa overlap (1-556:1-460) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG :.::::::.:::.::::. . . : :. :. :::: CCDS42 MEDLDALLSDLETTTSHMPRSGA------PKERPA-----------EPLTPPPS------ 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF . :: ::..: : :. .: :...:.:: CCDS42 ---------------YGHQ-PQTGS---GESSGAS----------------GDKDHLYST 40 50 60 130 140 150 160 170 pF1KE2 PNKQKSAEPS----PTVMSTS--LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLP : .: .:. : :.: ::..: :::::: ::::.: : .:: :. : CCDS42 VCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNI----TDEIMSQFP-- 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPA ... .:. .: :: ::. : :: :. CCDS42 -----------SSKVASGEQKEDQSEDKKR----------PSLPS----------SPSPG 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 ITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQ-GKTGSSSPP--- . : . ::.::: :::.::::::::. . . .: ..:: CCDS42 L---------P----------KASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPTQPPVVS 150 160 170 180 300 310 320 330 340 pF1KE2 ----GGP--PKPGSQ--LDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKT :.: :.: .. ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.::::::::::.:.. CCDS42 STNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALGRA 190 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 WHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTW :::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: :: :.:::: : CCDS42 WHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVTALGTHW 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 HPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWH ::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: ::.::::::..::: CCDS42 HPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSALWH 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 PECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHP :.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.::::..:....::: CCDS42 PDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSALGRRFHP 370 380 390 400 410 420 530 540 550 pF1KE2 EHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC .::.:.:::. :.::.:.:. ::::: :::::: CCDS42 DHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG 430 440 450 460 >>CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 (727 aa) initn: 826 init1: 438 opt: 613 Z-score: 383.4 bits: 81.2 E(32554): 4.9e-15 Smith-Waterman score: 622; 28.7% identity (51.7% similar) in 460 aa overlap (48-494:301-723) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 ISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNGTILDPLDQWQPSGSRFI :. : . : : : . :... CCDS73 QSRSFRILAQMTGTEFMQDPDEEALRRSSTPIEHAPVCTSQATTPLLPASAQPPAAA--- 280 290 300 310 320 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 HQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSV--GSPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPSPTVMS .:...:: ...: ..... . .. .:: . . :: : :. :. : : CCDS73 --SPSAASPPLATAAAHTAIASASTTAPASSPADSPRPQASSYS-PAVAASSAPA-THTS 330 340 350 360 370 380 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 TSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGA-LSPLYGVPETNSPLGGKA : : .. ... : . :.. : ::: :: .: : :: CCDS73 YSEGPAAPAPKPRVVTTASIR--PSVYQPVPASTYSPSPGANYSP---TPYTPSP----- 390 400 410 420 430 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 GPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQ .: .: :: . . .:::.:: : . . .: .. . CCDS73 APAYTPSPA-------PAYTPS------PVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNPAPSVAYSGG 440 450 460 470 480 260 270 280 290 300 pF1KE2 TRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKTGSSS-----PPGGPP-KP-GSQLDSML-GS :: :. :.:. :: : ::. .: : ::: : : :. . :. CCDS73 PAEPASRPPWVTDD---SFSQ-KF-APGKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGT 490 500 510 520 530 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERD .: . :. .:: :.. : : ..:::..::::.:.:..:. ... : :.. CCDS73 VQR--AERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQ 540 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 GQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDG .. :::. :...:.: : :: :. .:. :: .::: : :: : :: :: .:: CCDS73 NNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDG 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 KAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAIL--ENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHD . ::.:::...:. :: :: . ...: ::. :: ::.: : . . . :. . CCDS73 EPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKK 660 670 680 690 700 710 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 GQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQND .: :. : : CCDS73 DRPLCKKHAHTINL 720 557 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:42:17 2016 done: Sun Nov 6 21:42:18 2016 Total Scan time: 4.120 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]