FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2115, 304 aa 1>>>pF1KE2115 304 - 304 aa - 304 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1049+/-0.000744; mu= 12.5621+/- 0.045 mean_var=92.2330+/-18.732, 0's: 0 Z-trim(110.6): 73 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.133546 statistics sampled from 11641 (11721) to 11641 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16 Scan time: 2.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 1856 367.3 9.3e-102 CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1819 360.2 1.3e-99 CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1610 320.0 2.1e-87 CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1595 317.1 1.6e-86 CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1145 230.4 2e-60 CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 1099 221.4 6.2e-58 CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1040 210.1 2.3e-54 CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 948 192.3 4.3e-49 CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 666 138.2 1.6e-32 CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 666 138.2 1.6e-32 CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 640 133.2 5.2e-31 CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 598 125.1 1.4e-28 CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 598 125.1 1.4e-28 CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 596 124.6 1.5e-28 CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 596 124.7 1.9e-28 CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 596 124.7 1.9e-28 CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 560 117.7 1.8e-26 CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 560 117.7 1.9e-26 CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 560 117.7 2.1e-26 CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 558 117.3 2.8e-26 CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 553 116.3 4.7e-26 CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 543 114.4 1.8e-25 CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 539 113.6 3e-25 CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 532 112.3 7.7e-25 CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 532 112.3 8.9e-25 CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 532 112.3 8.9e-25 CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 528 111.5 1.2e-24 CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 528 111.5 1.3e-24 CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 494 104.8 8.2e-23 CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 468 99.8 2.6e-21 CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 445 95.4 5.5e-20 CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 428 92.1 5.6e-19 CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 428 92.1 5.6e-19 CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 399 86.5 2.6e-17 CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 367 80.4 2.1e-15 CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 367 80.6 3.5e-15 CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 338 74.8 9.7e-14 CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 322 71.7 7.2e-13 CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 312 69.7 2.8e-12 CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 312 69.8 2.8e-12 CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 252) 296 66.6 2.2e-11 CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 263) 286 64.7 8.6e-11 CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 267) 286 64.7 8.7e-11 >>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa) initn: 1856 init1: 1856 opt: 1856 Z-score: 1940.4 bits: 367.3 E(32554): 9.3e-102 Smith-Waterman score: 1856; 88.2% identity (94.1% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL :::::. :.::::::::::::.::::::::.:: :: :::::::::::::::: :.:::: CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM ::::::..::::::::::::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::. 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CCDS12 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV 120 130 140 150 160 170 >>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa) initn: 1145 init1: 1145 opt: 1145 Z-score: 1198.5 bits: 230.4 E(32554): 2e-60 Smith-Waterman score: 1436; 77.9% identity (85.1% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV : :::::.:: :: :.:: ::::::::::: CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA :::::.::::: .. .:.:. :::::::::::::.::::::::::::::::::::::: CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PSDPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA ::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::: : CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE : ..: :::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::: CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGIC--------- 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS :::::::::::: . : .::::::.::::.:::::::::::::.:::: .:: CCDS58 --------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS 320 330 340 350 360 370 300 pF1KE2 DEQDHQEVSYA :::: :::.:: CCDS58 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ 380 390 400 410 420 430 >-- initn: 379 init1: 176 opt: 332 Z-score: 351.9 bits: 73.7 E(32554): 2.8e-13 Smith-Waterman score: 332; 44.3% identity (63.1% similar) in 122 aa overlap (1-122:1-117) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL ::: :. :::::::::::::: : . :: . : :. .: : ::: :..:.: CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM ..: . . . : . . .: .::. :. :::::: :: ::: ::::.:: . CCDS58 YKEDRSHVPIF-----HGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT .. CCDS58 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV 120 130 140 150 160 170 >>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa) initn: 1076 init1: 983 opt: 1099 Z-score: 1153.6 bits: 221.4 E(32554): 6.2e-58 Smith-Waterman score: 1099; 61.9% identity (76.6% similar) in 273 aa overlap (1-273:3-270) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHF :: :::.::.:::: :..: . : . :: : :. .: . : :.: :. : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPL :... . : .. . .: :.:. :. :::::: : :::: . ::::.:: CCDS42 TLYKKDGVP-----VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSIN ... ::::::::.:.:::::.:::::::::::.::.:.::::::::::: ::::: ::: CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT ::::::::::::::: ::::::::. .:::::. :::: ::::::::.::::::::: :: CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH : ::::..: ::. : :::: ::::::::: :: CCDS42 GIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL 240 250 260 270 300 pF1KE2 QEVSYA >>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa) initn: 1634 init1: 1040 opt: 1040 Z-score: 1089.5 bits: 210.1 E(32554): 2.3e-54 Smith-Waterman score: 1354; 72.2% identity (84.0% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV :::::::.:: :: :::: ::::::::::: CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV 90 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA ::.::::::: .. :.:.:. ::. :..:.:.::: :.:::::::.::: : ::.::: CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 PSDPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA ::::::.:..::: :::::::::::::::::::::::::: .:.::::::.:: : :: : CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA 210 220 230 240 250 260 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE : .::::::.:::::.::::.:::::::: :. ::. :::: :::::: CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS--------- 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS :.:::::::::: :::.:::::::::::..::::.::::::::::::: ::: CCDS12 --------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS 320 330 340 350 360 370 300 pF1KE2 DEQDHQEVSYA :::: :::.:: CCDS12 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV 380 390 400 410 >-- initn: 355 init1: 214 opt: 345 Z-score: 365.9 bits: 76.2 E(32554): 4.7e-14 Smith-Waterman score: 345; 44.3% identity (67.2% similar) in 122 aa overlap (1-122:1-117) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL :::::. :::::::::.: ::. : . :: . : :: .:. . : ::: : . :..: : CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM .: . . : .. . . .: .::. :. :::::: .: :::: ::::.:. . CCDS12 SKEDGMP-----VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVI 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT .. CCDS12 MVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAG 120 130 140 150 160 170 >>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa) initn: 925 init1: 832 opt: 948 Z-score: 994.9 bits: 192.3 E(32554): 4.3e-49 Smith-Waterman score: 1033; 55.9% identity (69.4% similar) in 304 aa overlap (1-304:3-266) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHF :: :::.::.:::: :..: . : . :: : :. .: . : :.: :. : CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPL :... . : .. . .: :.:. :. :::::: : :::: . ::::.:: CCDS42 TLYKKDGVP-----VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSIN ... ::::::::.:.:::::.:::::::::::.::.:.::::::::::: ::::: ::: CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT ::::::::::::::: ::::::::. .:::::. :::: ::::::::.::::::::: :: CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH .::::.:::::.:::: ::::::: CCDS42 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP 240 250 260 300 pF1KE2 QEVSYA :::.:: CCDS42 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS 270 280 290 300 310 320 >>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (631 aa) initn: 993 init1: 392 opt: 666 Z-score: 697.4 bits: 138.2 E(32554): 1.6e-32 Smith-Waterman score: 675; 43.3% identity (69.0% similar) in 284 aa overlap (24-292:220-495) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV :: ::::.:.: : .. ... ::: ::: CCDS33 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV 190 200 210 220 230 240 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLS ...:.:..::. . :. :.. . :.:.:::..::. .: :::::. : . : CCDS33 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 APSDPLDMVIIG-LYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRL :::::::..: : .:. :::::::::: .:::.:: :.::. .: . :..:: :: CCDS33 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHP--- 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 pF1KE2 PA-VRSINGT--FQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSN : .::. :. .::.::..:.: :.:::::.:: . :. : :.:: . :.:. .. CCDS33 PLRLRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGG 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 pF1KE2 SWPSPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSDKKNAAVM : :: : : : :.:.::::.::. . . .::.::: :: ::.... CCDS33 SSLPPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHR-TSDQRKTDF- 430 440 450 460 470 480 280 290 300 pF1KE2 DQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQEVSYA :.::: .. .: CCDS33 -QRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQSPHDEDPQAV 490 500 510 520 530 540 >-- initn: 312 init1: 199 opt: 426 Z-score: 447.5 bits: 91.9 E(32554): 1.3e-18 Smith-Waterman score: 426; 35.2% identity (59.0% similar) in 227 aa overlap (1-218:1-216) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL :. . . :.:. : . : : ::.. : :: ... : . : ... ... : CCDS33 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 HREGK-----FNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPS .::. :: : . .:: ::: : :: :::. .: : :: CCDS33 DKEGSPEPWDRNNPL-------EPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCHY---YSSAGWSEPS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRLPA :::..:. :.:.::.::: :.:.: .: :.:: :.:...: . : .::: :. : : . CCDS33 DPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDS 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSP . .: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: . CCDS33 QQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLT 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSE CCDS33 LQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRS 230 240 250 260 270 280 >>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa) initn: 993 init1: 392 opt: 666 Z-score: 697.4 bits: 138.2 E(32554): 1.6e-32 Smith-Waterman score: 675; 43.3% identity (69.0% similar) in 284 aa overlap (24-292:220-495) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV :: ::::.:.: : .. ... ::: ::: CCDS46 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV 190 200 210 220 230 240 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLS ...:.:..::. . :. :.. . :.:.:::..::. .: :::::. : . : CCDS46 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 APSDPLDMVIIG-LYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRL :::::::..: : .:. :::::::::: .:::.:: :.::. .: . :..:: :: CCDS46 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHP--- 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 pF1KE2 PA-VRSINGT--FQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSN : .::. :. .::.::..:.: :.:::::.:: . :. : :.:: . :.:. .. CCDS46 PLRLRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGG 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 pF1KE2 SWPSPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSDKKNAAVM : :: : : : :.:.::::.::. . . .::.::: :: ::.... CCDS46 SSLPPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHR-TSDQRKTDF- 430 440 450 460 470 480 280 290 300 pF1KE2 DQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQEVSYA :.::: .. .: CCDS46 -QRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQA 490 500 510 520 530 540 >-- initn: 312 init1: 199 opt: 426 Z-score: 447.5 bits: 91.9 E(32554): 1.3e-18 Smith-Waterman score: 426; 35.2% identity (59.0% similar) in 227 aa overlap (1-218:1-216) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL :. . . :.:. : . : : ::.. : :: ... : . : ... ... : CCDS46 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 HREGK-----FNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPS .::. :: : . .:: ::: : :: :::. .: : :: CCDS46 DKEGSPEPWDRNNPL-------EPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCHY---YSSAGWSEPS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 DPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRLPA :::..:. :.:.::.::: :.:.: .: :.:: :.:...: . : .::: :. : : . CCDS46 DPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDS 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSP . .: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: . CCDS46 QQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLT 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSE CCDS46 LQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRS 230 240 250 260 270 280 304 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 21:47:06 2016 done: Sun Nov 6 21:47:07 2016 Total Scan time: 2.690 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]