FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4905, 352 aa 1>>>pF1KB4905 352 - 352 aa - 352 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9548+/-0.000843; mu= 13.1178+/- 0.050 mean_var=106.0979+/-28.708, 0's: 0 Z-trim(108.6): 280 B-trim: 1299 in 2/48 Lambda= 0.124515 statistics sampled from 9846 (10294) to 9846 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16 Scan time: 3.020 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 2241 413.4 1.5e-115 CCDS9625.2 LTB4R2 gene_id:56413|Hs108|chr14 ( 358) 790 152.7 4.4e-37 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 500 100.6 2.1e-21 CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 480 97.0 2.5e-20 CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 462 93.8 2.4e-19 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 447 91.1 1.7e-18 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 437 89.3 5.5e-18 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 437 89.3 6e-18 CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 435 88.9 6.9e-18 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 420 86.2 4.5e-17 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 420 86.3 4.8e-17 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 420 86.3 4.8e-17 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 417 85.7 6.7e-17 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 417 85.7 6.8e-17 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 415 85.3 8.4e-17 CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 412 84.8 1.2e-16 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 406 83.7 2.6e-16 CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 404 83.4 3.7e-16 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 403 83.2 3.8e-16 CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 402 83.0 4.5e-16 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 401 82.8 4.8e-16 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 400 82.6 5.4e-16 CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 399 82.5 6.3e-16 CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 398 82.3 7.5e-16 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 394 81.6 1.2e-15 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 393 81.4 1.3e-15 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 393 81.4 1.3e-15 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 391 81.0 1.7e-15 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 391 81.0 1.7e-15 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 390 80.9 1.9e-15 CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 389 80.7 2.2e-15 CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 388 80.5 2.4e-15 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 388 80.5 2.4e-15 CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 388 80.5 2.4e-15 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 388 80.5 2.6e-15 CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 384 79.8 4.2e-15 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 383 79.6 4.5e-15 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 383 79.6 4.7e-15 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 381 79.3 6.1e-15 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 381 79.3 6.2e-15 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 380 79.1 6.5e-15 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 380 79.1 6.7e-15 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 379 78.9 7.4e-15 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 379 78.9 7.5e-15 CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 378 78.7 9.2e-15 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 374 78.0 1.4e-14 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 373 77.8 1.5e-14 CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 371 77.4 1.9e-14 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 369 77.1 2.7e-14 CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 368 76.9 2.9e-14 >>CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 (352 aa) initn: 2241 init1: 2241 opt: 2241 Z-score: 2188.0 bits: 413.4 E(32554): 1.5e-115 Smith-Waterman score: 2241; 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CCDS96 TLVLHLALADGAVLLLTPLFVAFLTRQAWPLGQAGCKAVYYVCALSMYASVLLTGLLSLQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 RSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWKTNM-SLCFPRYP : :::.:::.. .::. :.:::.: ..:. ..:::.:. .:: . :. . .:: .: CCDS96 RCLAVTRPFLAPRLRSPALARRLLLAVWLAALLLAVPAAVYRHL--WRDRVCQLC---HP 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 SEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF---RRSRRTGRLVVLIILTF : : : :: .:..:.:.::: ... :: ::.. :. :.. :.:::: :.:.: CCDS96 SPVHAAAHLSLETLTAFVLPFGLMLGCYSVTLARLRGARWGSGRHGARVGRLVSAIVLAF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 AAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGG . .: :::.::: .: ::: ..:. .: . :: ::::.:::::::::. ..: CCDS96 GLLWAPYHAVNLLQAVAALAPPEGALAKLGGAGQAARAGTTALAFFSSSVNPVLYVFTAG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 GLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAALEPGPSESLTASSPLKLNE :: :: :...:.::.: :: ::: :.. : : :. : CCDS96 DLLPRAGPRFLTRLFEGSG-EA----RGG--GRS-REGTMELRTTPQLKVVGQGRGNGDP 300 310 320 330 340 pF1KB4 LN CCDS96 GGGMEKDGPEWDL 350 >>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa) initn: 459 init1: 311 opt: 500 Z-score: 497.6 bits: 100.6 E(32554): 2.1e-21 Smith-Waterman score: 500; 32.1% identity (60.9% similar) in 340 aa overlap (2-331:26-350) 10 20 30 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGN : : . :: :.. ..:. .: .. :.:: :: CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGAR--AVLVPVLYLLVCAAGLGGN 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 SFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYV ..:.. .:. . ..:: ...::::.::. .: ::. : . : :: . ::: . CCDS10 TLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGPVLCRLVMTL 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 CGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYR ::....::. .:.::.:: :::..:. : . : .:. . :. ::::. .. :.:.. CCDS10 DGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSLCMSLPLLVFA 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KB4 TVVPWKT-NMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDI-------GRRL : : : : .:. : : .:. :: ::. :.:.. : : : :. CCDS10 DVQEGGTCNAS--WPE-PVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKVRAAGVRV 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB4 QARRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARN : : :.. :.:....:.::. :::. .::... . :: . :. :: CCDS10 GCVRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYF-------- 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KB4 VLIALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGS-EASSTR-RGGSLGQTAR .. :.. .: .:::::. . .. .: : : .:.:. .:..:. : . : . CCDS10 FVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQS--FQKVLCLRKGSGAKDADATEPRPDRIRQQQE 290 300 310 320 330 340 330 340 350 pF1KB4 SGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN . : : CCDS10 ATPPAHRAAANGLMQTSKL 350 360 >>CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 (350 aa) initn: 399 init1: 225 opt: 480 Z-score: 478.4 bits: 97.0 E(32554): 2.5e-20 Smith-Waterman score: 480; 30.9% identity (62.5% similar) in 333 aa overlap (1-324:22-338) 10 20 30 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFV .:: . . .: : ..::.....:.. ::. ::..: CCDS33 MDSFNYTTPDYGHYDDKDTLDLNTPVDKTSNTLRVP--DILALVIFAVVFLVGVLGNALV 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 VWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAP-FFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCG :: . ::...:. ::::.::. :. : .: .. . : :: :.: . . CCDS33 VW-VTAFEAKRTINAIWFLNLAVADFLSCLALPILFTSIVQHHHWPFGGAACSILPSLIL 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 VSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTV ..::::.::....: :: : : .:. :..: ..: . : : :..::. : . ::.: CCDS33 LNMYASILLLATISADRFLLVFKPIWCQNFRGAGLAWIACAVAWGLALLLTIPSFLYRVV 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 ----VPWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHL-IFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRF : :. :: : . .: . : . : ::: :.:... :. : : .:: CCDS33 REEYFPPKV---LCGVDYSHDKRRERAVAIVRLVLGFLWPLLTLTICYTFILLRTWSRRA 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 RRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIAL :: .: ..:: .. .: :::::.:... . . .. :. :.:. .. ... CCDS33 TRSTKTLKVVVAVVASFFIFWLPYQVTGIMMS---FLEPSSPTFLLLKKLD---SLCVSF 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 AFLSSSVNPVLYACAGGGL---LRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPA :... .::..:. :: :. ::.. . .::... .: : .:.. :. .. CCDS33 AYINCCINPIIYVVAGQGFQGRLRKS----LPSLLRNVLTEESVVRESKSFTRSTVDTMA 290 300 310 320 330 340 340 350 pF1KB4 ALEPGPSESLTASSPLKLNELN CCDS33 QKTQAV 350 >>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa) initn: 253 init1: 180 opt: 462 Z-score: 460.9 bits: 93.8 E(32554): 2.4e-19 Smith-Waterman score: 466; 31.0% identity (64.5% similar) in 290 aa overlap (10-286:25-304) 10 20 30 40 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSILK : .:. .......... .:.:. :::.:. ..: CCDS12 MELAVGNLSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVFGLIFALGVLGNSLVI-TVLA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 RMQK---RSVTALMVLNLALADLAVLL-TAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSM : . ::.: :..:::..:::: :: :: : :: .: :.. :: ::: CCDS12 RSKPGKPRSTTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSM 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 YASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVV-P .:.. ..:::.:: .:... :..::.. : .. ::.::. .:.:: .. . : CCDS12 LVSIFTLAAMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRNALLGVGCIWALSIAMASPVAYHQGLFHP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB4 WKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQAR---RFRRS- .:...:. ..:. :. ... : :.:::.: . :. . .:. . ..: CCDS12 RASNQTFCWEQWPDPRHKKAYVVCTFVFGYLLPLLLICFCYAKVLNHLHKKLKNMSKKSE 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 ---RRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNL-AEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIA ..:.. :......:. :::.:...: :: : .. :.. : : . CCDS12 ASKKKTAQTVLVVVVVFGISWLPHHIIHLWAEFG-VFPLTPASF--------LFRITAHC 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 LAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAAL ::. .:::::..:: CCDS12 LAYSNSSVNPIIYAFLSENFRKAYKQVFKCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV 300 310 320 330 340 >>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa) initn: 510 init1: 319 opt: 447 Z-score: 445.3 bits: 91.1 E(32554): 1.7e-18 Smith-Waterman score: 522; 34.5% identity (62.1% similar) in 293 aa overlap (6-285:32-313) 10 20 30 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPG ::.: :. ..: .. :. .::: : CCDS13 DMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLLG 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 NSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLCHY ::.:.. .:.. . ::: ...::::::: .: ::. : . : :: ::: CCDS13 NSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRLVMA 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 VCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAY : :.....:.. .:.::.:: :::..: : . :: .:: : :..:: : ... ::... CCDS13 VDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVVVF 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 pF1KB4 RTVVPWKTNMSLCFPRYP--SEGHRAFHLIFEAVTGFLLP-------FLAVVASYSDIGR . :: .:: : ..: . . :: .:. :. ::. : .: .:.. . :: CCDS13 -SGVP--RGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGR 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB4 RLQA----RRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKR :. : :: : ::. :.:: .. :. :.:..:.:.... : . : .:: CCDS13 RVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLY--- 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB4 LSLARNVLIALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLG ...:: . .: .::.:: CCDS13 -----FLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEE 300 310 320 330 340 350 >>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa) initn: 347 init1: 220 opt: 437 Z-score: 436.3 bits: 89.3 E(32554): 5.5e-18 Smith-Waterman score: 437; 29.5% identity (61.9% similar) in 336 aa overlap (4-332:39-368) 10 20 30 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGL :: : .....: . : :. . .:: CCDS14 QVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGL 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 PGNSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLC ::. :. .:.: : : ..:.::.:: ..:: :.. : : :: . :.. CCDS14 LGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWA-VDAAVQWVFGSGLCKVA 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 HYVCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLA--GIWVLSFLLATP . ....::..::.. .:.:: : ... ..: : :: .:. ..: : .:.: : CCDS14 GALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVH--ATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALP 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 VLAYRTVV-PWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQA . . .. . : . : .:. :. :.. ... :.:::::.:... :. : : . CCDS14 DFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALR-VLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLV 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 RRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVL : .: :. ::::.....:: : :::.: :.. :.. : . : . :...:..: CCDS14 SRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRES-RVDVAKSVT 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 pF1KB4 IALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKL----LEGTGSEASSTRRGGSLGQTAR .:... .::.::: .: . : .. .: .: . ::.:: .: ..:.. CCDS14 SGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKF-RERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSE 310 320 330 340 350 360 330 340 350 pF1KB4 SGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN .. ..: CCDS14 ASYSGL >>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa) initn: 347 init1: 220 opt: 437 Z-score: 435.6 bits: 89.3 E(32554): 6e-18 Smith-Waterman score: 437; 29.5% identity (61.9% similar) in 336 aa overlap (4-332:86-415) 10 20 30 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGL :: : .....: . : :. . .:: CCDS48 QVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGL 60 70 80 90 100 110 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 PGNSFVVWSILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGTWSFGLAGCRLC ::. :. .:.: : : ..:.::.:: ..:: :.. : : :: . :.. CCDS48 LGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWA-VDAAVQWVFGSGLCKVA 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 HYVCGVSMYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLA--GIWVLSFLLATP . ....::..::.. .:.:: : ... ..: : :: .:. ..: : .:.: : CCDS48 GALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVH--ATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALP 180 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 VLAYRTVV-PWKTNMSLCFPRYPSEGHRAFHLIFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQA . . .. . : . : .:. :. :.. ... :.:::::.:... :. : : . CCDS48 DFIFLSAHHDERLNATHCQYNFPQVGRTALR-VLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLV 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 RRFRRSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVL : .: :. ::::.....:: : :::.: :.. :.. : . : . :...:..: CCDS48 SRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRES-RVDVAKSVT 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 pF1KB4 IALAFLSSSVNPVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKL----LEGTGSEASSTRRGGSLGQTAR .:... .::.::: .: . : .. .: .: . ::.:: .: ..:.. CCDS48 SGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKF-RERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSE 360 370 380 390 400 330 340 350 pF1KB4 SGPAALEPGPSESLTASSPLKLNELN .. ..: CCDS48 ASYSGL 410 >>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 (355 aa) initn: 359 init1: 188 opt: 435 Z-score: 434.6 bits: 88.9 E(32554): 6.9e-18 Smith-Waterman score: 435; 27.9% identity (61.3% similar) in 326 aa overlap (12-327:34-342) 10 20 30 40 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVEFISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVW ::: . ....: .:...:.:::..:.: CCDS23 LEETLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGV--VHWVSLVLYCLAFVLGIPGNAIVIW 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 SILKRMQKRSVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLAQGT-WSFGLAGCRLCHYVCGVS . :..::.: ::::.::. :: :... ..:.. : ::. :. .. .. CCDS23 -FTGFKWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLN 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 MYASVLLITAMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVP :.:::...:..:::. . . .: .:.. :: . :. ::.:. :.. :.: .: .: CCDS23 MFASVFFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVE 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KB4 WKTNMSLCFPRY----PSEGHRAFHLI--FEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQARRFR .. : .::. . :. :.. . . :.:.:.:.. : . ... : . CCDS23 FN-NHTLCYNNFQKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKRSIL 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 RSRRTGRLVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALA : : .......:.. : :::. .. : . . . .: :: . :: CCDS23 ISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSIWELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTG------LA 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 FLSSSVNPVLYACAGGGL---LRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAA ::.: .::.::. . . .::. ::..:. : :.: . :.... :. CCDS23 FLNSCLNPILYVLISKKFQARFRSS----VAEILKYTLWEVSCS---GTVSEQLRNSETK 300 310 320 330 340 340 350 pF1KB4 LEPGPSESLTASSPLKLNELN CCDS23 NLCLLETAQ 350 >>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa) initn: 357 init1: 157 opt: 420 Z-score: 420.0 bits: 86.2 E(32554): 4.5e-17 Smith-Waterman score: 420; 29.5% identity (63.1% similar) in 295 aa overlap (10-294:19-311) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MNTTSSAAPPSLGVE-FISLLAIILLSVALAVGLPGNSFVVWSILKRMQKR :. : . .: .. : :. ..::. :::.:: : :. . CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KB4 SVTALMVLNLALADLAVLLTAPFFLHFLA-QGTWSFGLAGCRLCHYVCGVSMYASVLLIT .:.....:::::::: ::: :.. . : . : :: :.. . ..::::.:.: CCDS31 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 AMSLDRSLAVARPFVSQKLRTKAMARRVLAGIWVLSFLLATPVLAYRTVVPWK-TNMSLC .:.:: ::...:. :. :: .:. . ::.:. : . :.. .:.: . ::...: CCDS31 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 FPRYPSEGHR-AFHL-IFEAVTGFLLPFLAVVASYSDIGRRLQ-ARRFRRSRRTG----R .: :.. . : . . . :::.::: ...::. : . :. : ...... . . CCDS31 AFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDDIFK 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 LVVLIILTFAAFWLPYHVVNLAEAGRALAGQAAGLGLVGKRLSLARNVLIALAFLSSSVN ... :.: : :.:... .. .. : : .. .. : . : .:.... .: CCDS31 IIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQL-GIIRDCR-IADIVDTAMPITICIAYFNNCLN 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 PVLYACAGGGLLRSAGVGFVAKLLEGTGSEASSTRRGGSLGQTARSGPAALEPGPSESLT :..:. : . : CCDS31 PLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSNLSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEV 300 310 320 330 340 350 352 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:07:10 2016 done: Sun Nov 6 22:07:11 2016 Total Scan time: 3.020 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]