Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9591, 589 aa
  1>>>pF1KB9591 589 - 589 aa - 589 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4046+/-0.0011; mu= 18.4993+/- 0.065
 mean_var=82.2808+/-16.473, 0's: 0 Z-trim(103.3): 166  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.141392
 statistics sampled from 7172 (7347) to 7172 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  3.250

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589) 3962 818.8       0
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516) 3486 721.6 5.8e-208
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589) 3090 640.9 1.3e-183
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609)  957 205.8 1.3e-52
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642)  900 194.2 4.3e-49
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555)  897 193.5 5.9e-49
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587)  897 193.6 6.1e-49
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  887 191.5 2.5e-48
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593)  887 191.5 2.5e-48
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597)  887 191.5 2.5e-48
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568)  876 189.3 1.2e-47
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571)  845 182.9 9.3e-46
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585)  845 182.9 9.5e-46
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  837 181.3 3.1e-45
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574)  817 177.2 4.9e-44
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  809 175.7 2.1e-43
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608)  774 168.5 2.2e-41
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568)  766 166.8 6.6e-41
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709)  766 166.9 7.8e-41
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505)  764 166.4   8e-41
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755)  766 166.9 8.2e-41
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505)  753 164.1 3.8e-40
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620)  737 160.9 4.3e-39
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718)  727 158.9   2e-38
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720)  726 158.7 2.3e-38
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  723 158.1   3e-38
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496)  698 152.9 8.9e-37
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  694 152.1 1.8e-36
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  690 151.3 3.1e-36
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694)  690 151.4 3.6e-36
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  685 150.3 6.3e-36
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  685 150.3 6.5e-36
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748)  673 147.9 4.2e-35
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  627 138.5 2.3e-32
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  627 138.5 2.4e-32
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687)  611 135.3 2.5e-31
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7        ( 623)  600 133.0 1.1e-30
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3         ( 601)  595 132.0 2.2e-30
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11       ( 612)  592 131.4 3.4e-30
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  583 129.5 1.1e-29
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544)  578 128.5 2.2e-29
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427)  539 120.4 4.6e-27
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 616)  540 120.7 5.3e-27
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  539 120.6 6.2e-27
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624)  530 118.7 2.2e-26
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6       ( 634)  513 115.2 2.5e-25
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2        ( 558)  510 114.6 3.4e-25
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX       ( 644)  502 113.0 1.2e-24
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6        ( 620)  492 111.0 4.7e-24
CCDS81621.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11      ( 533)  466 105.6 1.7e-22


>>CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5                 (589 aa)
 initn: 3962 init1: 3962 opt: 3962  Z-score: 4371.0  bits: 818.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3962; 100.0% identity (100.0% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5                (516 aa)
 initn: 3486 init1: 3486 opt: 3486  Z-score: 3847.1  bits: 721.6 E(32554): 5.8e-208
Smith-Waterman score: 3486; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (74-589:1-516)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 LFTDVLLHAGNRTFPCHRAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                               MFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 LYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLK
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 TSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVY
              220       230       240       250       260       270

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 ITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCL
              280       290       300       310       320       330

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 PASPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PASPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQ
              340       350       360       370       380       390

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 CYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
              400       410       420       430       440       450

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB9 VTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVST
              460       470       480       490       500       510

             
pF1KB9 WKHLPS
       ::::::
CCDS58 WKHLPS
             

>>CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15            (589 aa)
 initn: 3252 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3409.7  bits: 640.9 E(32554): 1.3e-183
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
CCDS10 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
CCDS10 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
CCDS10 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
CCDS10 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
CCDS10 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
       :::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
CCDS10 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
CCDS10 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
CCDS10 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
CCDS10 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
CCDS10 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
              550       560       570       580         

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 964 init1: 460 opt: 957  Z-score: 1058.0  bits: 205.8 E(32554): 1.3e-52
Smith-Waterman score: 957; 32.8% identity (65.1% similar) in 542 aa overlap (36-565:58-581)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 HENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCHRAVLA
                                     .::::..: . ::.: .: . .  ::..:.
CCDS13 GDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILS
        30        40        50        60        70        80       

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB9 ACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESLLEAGD
       ::: ::.:::.: : ::...:: . . :  ...:::.:.::.:.. ..: :...:: :. 
CCDS13 ACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRD-IDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAAC
        90       100       110        120       130       140      

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB9 MLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIRKNEDF
       .:.. .:..:: :::...: :.::::.  ..:.:.: .: ... ..   ::: . ..:.:
CCDS13 LLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEF
        150       160       170       180       190       200      

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 LQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLALLPAIY
       . :: .......::.::....:. :..... :..:....:   ::..:: ::: ::   .
CCDS13 MLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKF
        210       220       230       240       250       260      

         250       260       270       280       290          300  
pF1KB9 LMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKT---GHALFLLGG
       :. .:. . :: .... ...:.:: .  : . :.  .. .  .::::    :..:: .::
CCDS13 LVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEA-KNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGG
        270       280       290        300       310       320     

              310       320       330       340            350     
pF1KB9 QTFMC--DKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKV-----YITGGRGSENGVS
           :  : .  :..   .      . :  :.   :..: .:     : .::. . . ..
CCDS13 W---CSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKR--RCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLN
            330       340       350         360       370       380

         360       370        380       390       400       410    
pF1KB9 KDVWVYDTLHEEWSK-AAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQV
       . :  ::   ..::. .::  . : . : : :   ::.:::. ... ::          :
CCDS13 S-VERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVS-CLNI--------V
               390       400       410       420                430

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB9 EHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTV
       :.:::  :::: :: .     ..::.     :.: ::.. . . :  :. :.  :::: .
CCDS13 ERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSD-GTSPLNTVERYNPQENRWHT
              440       450       460        470       480         

          480       490        500       510       520       530   
pF1KB9 PATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGG-DTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHA
        :      .. . ::  ..:. .:: :      :: ..: .: ::. :  .:..: .   
CCDS13 IAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGL
     490       500       510       520       530       540         

           540       550       560       570       580             
pF1KB9 VASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS    
       .. ...:..:::. :    ::.. .::  ..:                            
CCDS13 AVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
     550       560       570       580       590       600         

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 836 init1: 450 opt: 900  Z-score: 994.9  bits: 194.2 E(32554): 4.3e-49
Smith-Waterman score: 900; 30.0% identity (64.9% similar) in 553 aa overlap (25-565:72-604)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB9       MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGN
                                     :  : :. .. .. .::. :. :..::.. 
CCDS30 TRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVA-MSRMRQRGLLCDIVLHVAA
              50        60        70        80         90       100

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB9 RTFPCHRAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINE
       . .  :..:::.:: ::.:::.. ..::....:.. . : :..:. :...::.......:
CCDS30 KEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHD-IDPQALDQLVQFAYTAEIVVGE
              110       120       130        140       150         

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB9 ENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLS
        :...:: :...:... .:::: .:: ..: :.::::.  ..:::.:. : . . :. :.
CCDS30 GNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQ
     160       170       180       190       200       210         

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB9 NFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQ
       .:  . :.:.:. ::  .:..:.::. :.. .:. ::.....:...:.  :  ..:.:..
CCDS30 HFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMK
     220       230       240       250       260       270         

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB9 TVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRK--
        ::: ::   .:. .:  : :. ..   :... ::.. .: . .. ::. .  .:::.  
CCDS30 CVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHL-LPEQRGVLGTSRTRPRRCE
     280       290       300       310        320       330        

             300            310       320       330       340      
pF1KB9 -TGHALFLLGGQTFM-----CDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITG
        .: .:: .:: ...     :.     : .. .    :.. . : . .. :.: ..: .:
CCDS30 GAGPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAY---DTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVG
      340       350       360          370       380       390     

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB9 GRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPAS
       :  . . ..  :  :: . . :.  . : . :   : : :.  :: .::. .:. ::   
CCDS30 GYDGTSDLAT-VESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGAS-CL---
         400        410       420       430       440        450   

        410       420       430       440       450        460     
pF1KB9 PSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGG-TSVSHDKLPKVQCY
            ...:.:::  . :: :: .      . :..   .:.: ::  : ::  :  :. :
CCDS30 -----NSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKY
                   460       470       480       490         500   

         470       480        490       500         510       520  
pF1KB9 DQCENRWTVPATCPQPWRYTAA-AVLGNQIFIMGGDTEFSAC--SAYKFNSETYQWTKVG
       .   : :. :..     : .:. ::: . ... ::. . ..:  :. ... ..  : .:.
CCDS30 EPQVNVWS-PVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGN-DGTSCLNSVERYSPKAGAWESVA
           510        520       530        540       550       560 

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 DVTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVS
        .. .: .   ::  . ::.:::  : .  .... :.:  . :                 
CCDS30 PMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAV
             570       580       590       600       610       620 

                            
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CCDS58                        MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
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       ::: :: :::.: ..::. ..... . .  ..:  :.:: :.... ..:::.. :: :..
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       .:...:.:. : .::...::::::::.  ..:.: :: : . .  .  ..:  .  .:.:
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       :...:  : :: ..   :... ::.. .:  :..  .. .  ..::   .  ......::
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       :.    . .   : .  .    :..:: : . ..  .. .:: .:: ..   : . : ::
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       : ....:.. : :   :   :.: :.  ::.:::  ..::         : .:: :.   
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           ....::..:..  :: :  .   :.  ..  :  : .:.:..  : .  . : .. 
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       ::::::  :     ... :.:. : :. . :                   
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>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5               (587 aa)
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Smith-Waterman score: 897; 31.6% identity (64.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:40-569)

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pF1KB9 HENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCHRAVLA
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       ::: :: :::.: ..::. ..... . .  ..:  :.:: :.... ..:::.. :: :..
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pF1KB9 MLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIRKNEDF
       .:...:.:. : .::...::::::::.  ..:.: :: : . .  .  ..:  .  .:.:
CCDS41 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
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pF1KB9 LQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLALLPAIY
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pF1KB9 QTFMCDK-LYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWVY
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pF1KB9 DTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPTI
       : ....:.. : :   :   :.: :.  ::.:::  ..::         : .:: :.   
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGNQIFIMGG-DTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNK
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pF1KB9 LYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
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CCDS43             MDEESLDGLLFKDHDFSSDLLRQLNSLRQSRILTDVSICAGAREIPCH
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CCDS43 RNVLASSSPYFRAMFCSSFREKSEAKVQL-KGIDPPTLDQIVSYVYTGEAHIATDNVLPV
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pF1KB9 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
       .::..::.:  . .::. .:...: :.:::::. ::.  .:  : . . .. :..:  . 
CCDS43 MEAASMLQFPKLFEACSSYLQSQLAPSNCLGMIRLSEILSCETLKKKAREVALTSFPEVA
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CCDS43 ASADLKELCALELRDYLGDDGLCGEEEK-VFEALMVWIKHDLQARKRYMQELFKQVRLQY
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pF1KB9 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLC-----ARPRKTGH
       .   .. . .: . :. ..   . :.: : :   ....  :...  :     . ::.. .
CCDS43 IHPAFFHHFIANDALLQSSPACQIILETAKR---QMFSLCGTTVPDCKLLLHVPPRNSYQ
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pF1KB9 A-LFLLGG----QTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGS
         :.::::    :    : : : .... .    : .:.   . :: ..  ..:. :: . 
CCDS43 DFLILLGGRKDSQQTTRDVL-LYSKQTGQWQSLAKLPTRLYKASAITLHRSIYVLGGMAV
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pF1KB9 ENG---VSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASP
        .:   ::..:....   ..:  . ::::::..: :.  :. .. .::   . :      
CCDS43 SSGRSLVSHNVYIFSLKLNQWRLGEPMLVARYSHRSTAHKNFIFSIGG--IGEG------
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pF1KB9 SVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQ
       .  . ..:.::   : :  .: .  :: . ::.    .:. ::: .. .. .  .: :  
CCDS43 QELMGSMERYDSICNVWESMASMPVGVLHPAVAVKDQRLYLFGGEDIMQNPVRLIQVYHI
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pF1KB9 CENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAK
        .: :    :       . :.:::..: :.:: :.        .. .. ...: .:.  .
CCDS43 SRNSWFKMETRMIKNVCAPAVVLGERIVIVGGYTR----RILAYDPQSNKFVKCADMKDR
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pF1KB9 RMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCK-----TLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVS
       ::   :.. ::::::.::      :.     ..:::::  :.:.:   .:..:.  : ..
CCDS43 RMHHGATVMGNKLYVTGGRRLTTDCNIEDSASFDCYDPETDTWTSQGQLPHKLFDHACLT
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           ....::.: .. .:: :  .   :.  ..  :  : .:.:..  : .  . : .. 
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pF1KB9 MLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIRKNEDF
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGNQIFIMGG-DTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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