Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0067
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0067, 1447 aa
1>>>pF1KE0067 1447 - 1447 aa - 1447 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1566+/-0.00144; mu= -3.1872+/- 0.086
mean_var=403.2515+/-82.518, 0's: 0 Z-trim(109.5): 178 B-trim: 5 in 1/52
Lambda= 0.063868
statistics sampled from 10789 (10956) to 10789 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 5.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 9662 906.5 0
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 4874 465.3 5.8e-130
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 4470 428.1 9e-119
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 4279 410.5 1.8e-113
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7 (2213) 965 105.3 2.1e-21
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 791 89.2 1.3e-16
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 763 86.4 5.4e-16
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211) 763 86.4 5.4e-16
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304) 763 86.5 5.7e-16
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 732 83.8 5.5e-15
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 721 82.6 8.1e-15
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 721 82.6 8.1e-15
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 721 82.6 8.1e-15
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15 (1250) 691 79.8 5.5e-14
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1115) 686 79.3 7e-14
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171) 671 78.0 1.9e-13
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 671 78.0 1.9e-13
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208) 671 78.0 1.9e-13
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224) 671 78.0 1.9e-13
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1114) 665 77.4 2.7e-13
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 666 77.6 3.1e-13
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 658 76.9 5.2e-13
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 648 75.9 9.2e-13
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 648 75.9 9.3e-13
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 648 75.9 9.8e-13
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 648 75.9 9.8e-13
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 614 72.8 8.1e-12
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 612 72.7 1.2e-11
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 595 71.0 2.5e-11
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 588 70.3 3.4e-11
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 593 70.9 3.5e-11
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 588 70.3 3.6e-11
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150) 586 70.1 4.2e-11
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 588 70.5 5.3e-11
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 587 70.4 5.7e-11
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 584 70.0 5.8e-11
>>CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447 aa)
initn: 9662 init1: 9662 opt: 9662 Z-score: 4831.1 bits: 906.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9662; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 aa overlap (1-1447:1-1447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQCEAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQQDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLHRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLHRQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 YFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRSKKYSLLGGSNLLISNV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSGKPVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 TVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLIVPKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 AIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPAEAKGNIQTFTVFFSREGDNRERALNTT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQAVSTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 PTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYSLRFLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 YNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFITGYKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 RHRKTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RHRKTTRRGEMETLEPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTAETPENDL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 DESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVRVDSKQRY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 YSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDFPTSVPDL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 STPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 STPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASAKYKSEDT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 TSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSLSYTATGLKPNTMYEFSVMVTKNRRSSTWSMTAHATTYEAAPTSAPKDLTVITREGKP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 RAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAVIVSWQPPLEANGKITAYILFYTLDKNIPIDDWIMETISGDRLTHQIMDLNLDTMYYF
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 RIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRSTLNEPPI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 GQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKRATHSAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKRATHSAGK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 RKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPIQSCQDLTPVSHSQSETQLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPIQSCQDLTPVSHSQSETQLGS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 KSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVVSAIPVPTLESAQ
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 YPGILPSPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTTQQPPMLPPSQPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YPGILPSPTCGYPHPQFTLRPVPFPTLSVDRGFGAGRSQSVSEGPTTQQPPMLPPSQPEH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE0 SSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMSAIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFANPLLPPPMSAIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 TASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVSEESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVSEESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 AITGSAF
:::::::
CCDS11 AITGSAF
>>CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461 aa)
initn: 2507 init1: 1480 opt: 4874 Z-score: 2446.7 bits: 465.3 E(32554): 5.8e-130
Smith-Waterman score: 4874; 51.8% identity (78.0% similar) in 1447 aa overlap (28-1443:41-1459)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MENSLRCVWVPKLAFVLFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNV
: : .:..:: . :: :: :....::..:
CCDS10 LSTPSFWLYCLLLLGRRAPGAAAARSGSAPQSPGASIRTFTPFYFLVEPVDTLSVRGSSV
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LLDCSAESDRGVPVIKWKKDGIHLALGMDERKQQLSNGSLLIQNILHSRHHKPDEGLYQC
.:.::: :. . : :.::::: : : :.:.: : .:::.:.:..::.:.::::: :::
CCDS10 ILNCSAYSEPS-PKIEWKKDGTFLNLVSDDRRQLLPDGSLFISNVVHSKHNKPDEGYYQC
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 EASLGDSGSIISRTAKVAVAGPLRFLSQTESVTAFMGDTVLLKCEVIGEPMPTIHWQKNQ
:.. . :.:::::::. ::: :: :: : ... :....:.::: .. .: ..:..:.
CCDS10 VATVESLGTIISRTAKLIVAGLPRFTSQPEPSSVYAGNNAILNCEVNADLVPFVRWEQNR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 QDLTPIPGDSRVVVLPSGALQISRLQPGDIGIYRCSARNPASSRTGNEAEVRILSDPGLH
: :. :.::. :::: : :: :: :.::: ... . . ..:.:...: :: .
CCDS10 Q---PLLLDDRVIKLPSGMLVISNATEGDGGLYRCVVESGGPPKYSDEVELKVLPDPEVI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 RQLYFLQRPSNVVAIEGKDAVLECCVSGYPPPSFTWLRGEEVIQLRS-KKYSLLGGSNLL
.: ::..:: .: . :.:.:: : .:: : :.. :...::... .: .. ::.:..:
CCDS10 SDLVFLKQPSPLVRVIGQDVVLPCVASGLPTPTIKWMKNEEALDTESSERLVLLAGGSLE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ISNVTDDDSGMYTCVVTYKNENISASAELTVLVPPWFLNHPSNLYAYESMDIEFECTVSG
::.::.::.: : :.. ::.: :.::::: . : ::..:.:.::.::::: ::: :.:
CCDS10 ISDVTEDDAGTYFCIADNGNETIEAQAELTVQAQPEFLKQPTNIYAHESMDIVFECEVTG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 KPVPTVNWMKNGDVVIPSDYFQIVGGSNLRILGVVKSDEGFYQCVAENEAGNAQTSAQLI
::.:::.:.::::.:::::::.:: ::..::.::::::::::.:::..::::..::::
CCDS10 KPTPTVKWVKNGDMVIPSDYFKIVKEHNLQVLGLVKSDEGFYQCIAENDVGNAQAGAQLI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 VPKPAIPSSSVLPSAPRDVVPVLVSSRFVRLSWRPPA-EAKGNIQTFTVFFSREGDNRER
. . : ... ::::::::: :::.::..:.:: :: . .:. :..::...:: :::
CCDS10 ILEHAPATTGPLPSAPRDVVASLVSTRFIKLTWRTPASDPHGDNLTYSVFYTKEGIARER
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 ALNTTQPGSLQLTVGNLKPEAMYTFRVVAYNEWGPGESSQPIKVATQPELQVPGPVENLQ
. ::..:: .:.:. :: : ..: :::.: :. : :::: :..: ::::.:.:::. ::.
CCDS10 VENTSHPGEMQVTIQNLMPATVYIFRVMAQNKHGSGESSAPLRVETQPEVQLPGPAPNLR
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 AVSTSPTSILITWEPPAYANGPVQGYRLFCTEVSTGKEQNIEVDGLSYKLEGLKKFTEYS
: ..::::: .::: :. .:: .:.:.:. : .: :::...:.. :: ..::::.::::
CCDS10 AYAASPTSITVTWETPVSGNGEIQNYKLYYMEKGTDKEQDVDVSSHSYTINGLKKYTEYS
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 LRFLAYNRYGPGVSTDDITVVTLSDVPSAPPQNVSLEVVNSRSIKVSWLPPPSGTQNGFI
.: .:::..:::::: :..: :::::::: :::.:::: ::.:: . : :: .:::: :
CCDS10 FRVVAYNKHGPGVSTPDVAVRTLSDVPSAAPQNLSLEVRNSKSIMIHWQPPAPATQNGQI
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 TGYKIRHRKTTRRGEM-ETL-EPNNLWYLFTGLEKGSQYSFQVSAMTVNGTGPPSNWYTA
::::::.::..:.... ::: ..: :. ::..:..:.:.:.:.:.::::: ..: .:
CCDS10 TGYKIRYRKASRKSDVTETLVSGTQLSQLIEGLDRGTEYNFRVAALTINGTGPATDWLSA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 ETPENDLDESQVPDQPSSLHVRPQTNCIIMSWTPPLNPNIVVRGYIIGYGVGSPYAETVR
:: :.::::..::. :::::::: .. :..::::: : ::::::: ::::.:::.:.:..
CCDS10 ETFESDLDETRVPEVPSSLHVRPLVTSIVVSWTPPENQNIVVRGYAIGYGIGSPHAQTIK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE0 VDSKQRYYSIERLESSSHYVISLKAFNNAGEGVPLYESATTRSITDPTDPVDYYPLLDDF
:: :::::.:: :. ::::::.::::::.:::.::::::.:: :: :. :: . ...
CCDS10 VDYKQRYYTIENLDPSSHYVITLKAFNNVGEGIPLYESAVTRPHTD-TSEVDLF-VINAP
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE0 PTSVPDLSTPMLPPVGVQAVALTHDAVRVSWADNSVPKNQKTSEVRLYTVRWRTSFSASA
: ::: :::.::::::: :.::..:..:::::.::.:: .. : :::::.:.. :..
CCDS10 YTPVPD-PTPMMPPVGVQASILSHDTIRITWADNSLPKHQKITDSRYYTVRWKTNIPANT
850 860 870 880 890 900
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pF1KE0 LDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMANDQGRHGDGGYWPVDTNLIDRS
::: :::.::::::::.::.:. . ::: :. .: : :. : : .
CCDS58 LDTPYYFKIQARNSKGMGPMSEAVQFRTPKA---------SGSGGKGSRLP------DLG
1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE0 TLNEPPIGQMHPPHGSVTPQKNSNLLVIIVVTVGVITVLVVVIVAVICTRRSSAQQRKKR
. .::.. . :::: : .::.:..:.:.:::::..::::.::.::::....:.:::
CCDS58 SDYKPPMSGSNSPHGSPTSPLDSNMLLVIIVSVGVITIVVVVIIAVFCTRRTTSHQKKKR
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE0 AT----HSAGKRKGSQKDLRPPDLWIHHEEMEMKNIEKPSGTDPAGRDSPI-QSCQDLTP
:. ... : ::..::..:::::::::..:.: :.: .: :.:: .. ::.::
CCDS58 AACKSVNGSHKYKGNSKDVKPPDLWIHHERLELKPIDKSPDPNPIMTDTPIPRNSQDITP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE0 VSHSQSETQLGSKSTSHSGQDTEEAGSSMSTLERSLAARRAPRAKLMIPMDAQSNNPAVV
:..:. .... .. .:. :...:. ::::: :.::. : :.:.:.:.: .: :.
CCDS58 VDNSM-DSNIHQRRNSYRGHESED---SMSTL----AGRRGMRPKMMMPFDSQPPQP-VI
1190 1200 1210 1220 1230
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE0 SAIPVPTLESAQY---PGILPSPTCGY-PHPQFTLRPVPFPT-LSV-DRGFGAGRSQSVS
:: :. .:.. .. . : ::. .. :: : :. : .:. :: :. ..::
CCDS58 SAHPIHSLDNPHHHFHSSSLASPARSHLYHPG---SPWPIGTSMSLSDR---ANSTESVR
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1310 1320 1330 1340
pF1KE0 EGPTT---------------QQPPMLPPSQPEHSSSEEAPSRTIPTACVRPTHPLRSFAN
. :.: :.: :. ::.:: ....::: :::.:::.:::
CCDS58 NTPSTDTMPASSSQTCCTDHQDPEGATSSSYLASSQEEDSGQSLPTAHVRPSHPLKSFAV
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE0 PLLPPPMS-AIEPKVPYTPLLSQPGPTLPKTHVKTASLGLAGKARSPLLPVSVPTAPEVS
: .::: . .: .: :::::: . . :::::.: :..: :. :: ::.::::
CCDS58 PAIPPPGPPTYDPALPSTPLLSQQALNHHIHSVKTASIGTLGRSRPPM-PVVVPSAPEV-
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KE0 EESHKPTEDSANVYEQDDLSEQMASLEGLMKQLNAITGSAF
.:. . ::: . :: :.:...:: ::::::.:::::
CCDS58 QETTRMLEDSESSYEPDELTKEMAHLEGLMKDLNAITTA
1420 1430 1440 1450
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: . . : : .. :: ..: . .:: . :...: :.::..: :. ... . . :
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:: ::.:.:..:.: : ::..: : : :.: ... : . : ::: ...
CCDS34 VLASGGLRIQKLRPEDSGIFQCFASNE-----GGEIQTHTYLDV-TNIAPVFTQRPVDTT
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. .: :.:.: ::: : :..:: : .... ..: .. :: ...: :. : .:.:
CCDS34 VTDGMTAILRCEVSGAPKPAITWKRENHILASGSVRIPRFMLLESGGLQIAPVFIQDAGN
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::: .. . ...::: ::: ... : . . .. ..: .. : .. :
CCDS34 YTCYAANTEGSLNASATLTVWNRTSIVHPPEDHVVIKGTTATLHCGATHDPRVSLRYVWK
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:.. .. ::. .:: :: : : . ..: : :.: .:.:: . :.: : .
CCDS34 KDNVALTPSSTSRIVVEKDGS-LLISQTWSGDIGDYSCEIVSEGGNDSRMARLEVIE---
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:: .:.. : : :. : ::: : .... : . : .:.... . :...
CCDS34 -----LPHSPQNLLVSPNSSHSHAVVLSWVRPFDGNSPILYYIVELSENNSPWKVHLSNV
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: .::..: : : ::: : :: : :. : . :: .: .:. : . .
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::.. :.:: . :: ..:: : . :. : :: ..: : : .:.:
CCDS34 NQSIMVQWQPPPETEHNGVLRGYILRYRLAGLPGEYQQRNITSPEVNYCLVTDLIIWTQY
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.. ::: : :: . .: ::. ::.::::::. :.::: .:. : :::. ::.
CCDS34 EIQVAAYNGAGLGVFSRAVTEYTLQGVPTAPPQNVQTEAVNSTTIQFLWNPPPQQFINGI
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:::. . . . :. :. .. . .:.:.: . : .: .:. : ::::.
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: . : . :. ... : .::.: :: ::. : .. :: :..
CCDS34 PQLVWTQEDKPGAVGHLSFTEILD--TSLKV---------SWQEPLEKNGIITGYQISWE
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: : .. : ..: . :.:. : : . :.:.. : . .: :. .:. .:.. .
CCDS34 VYGRNDSRLTHTLNSTTHEYKIQGLSSLTTYTIDVAAVTAVGTGL-----VTSSTISSGV
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: :.: . .: . : ....: : .. :... .. : ..
CCDS34 PP--------DLPGAPSNLVISNISP---RSATLQF---RPGY-DGKTSISRWIVEGQVG
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.. . . . . ..: ... .: : : :.: . .. : .: .... :
CCDS34 AIGDEEEWVTLYEEENEPDAQM-LEIPNLTPYTHYRFRMKQVNIVGPSPYSPSSRVIQTL
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.: : :: ..:: : .. .. . : : : . ::. . : .. : ...
CCDS34 QAPPDVAPTSVTV--RTASETSLRLRWVPLPDSQYNGNPESVGYRIKYWRSD----LQSS
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pF1KE0 IMETISGDRLTHQ--IMDLNLDTMYYFRIQARNSKGVGPLSDPILFRTLKVEHPDKMAND
. . .::: .. : .:. : ...:: :. :.:: :. . ::
CCDS34 AVAQVVSDRLEREFTIEELEEWMEYELQMQAFNAVGAGPWSEVVRGRTRESVPSAAPENV
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CCDS34 SAEAVSSTQILLTWTSVPEQDQNGLILGYKILFRAKDLDPEPRSHIVRGNHTQSALLAGL
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CCDS43 D-PRPKIVWNKKGKKVS---NQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPR-DEAIYECVAS-NN
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: : . : .. . : .. .:. ...: : . :.: : : : :.
CCDS43 VGEISVSTRLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATML-CAASGNPDPEITWFKD
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. ...:. : : ::::: . . .: : :.: : : :..: . :.
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. . ..: : :.: . : .. . : . : : : :. : : .: .
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.: . : ...: . :. ::::. : : :..:: . : . :.. . ::
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. : ::.: :. .. . . .. . : . . :. .. .. ::
CCDS43 ATSITLTWDSGNPEPVSYYIIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVA
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:. : . : ... : .. :::::: ..:: . ..:. : : .:.:: .
CCDS43 VNNIGRGPPSEPVLTQT----SEQAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGY
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:... . .. . .. :.: .::: :. :. .:.:.. : : :. :.: :
CCDS43 RVYYTMDPTQHVNNWMKHNVADSQITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVIT
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::.:.::: . : .:. : . : :.:: .:.. :... ::::::..: .: ::
CCDS43 TSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGLGASTAEISARTMQSKPSAPPQDISCTSPSSTSIL
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::: ::: :::.:: :.:.. . . :. . .. ::. ::: ..: . :
CCDS43 VSWQPPPVEKQNGIITEYSIKYTAVDGEDDKPHEILGIPSDTTKYLLEQLEKWTEYRITV
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.: : : :: : .: :. ::. : ...:. ... . .:: :. ::
CCDS43 TAHTDVGPGPESLSVLIRTNED------VPSGPPRKVEVEAVNSTSVKVSWRSPV-PNKQ
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. :. :.: : : : : : : . : ....: ... ..:
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: . . .. : ... : .. . . . . .::: .. .. : : . ..
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:. . :. . . : .::. :..: :: .: .:::::. : :: :: :
CCDS43 NKVGFGEEMVKEISIPEEVPTGFPQNL---HSEGTTSTSVQLSWQPPVLAERNGIITKYT
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:.: : :::. . . .: : . :. :: : ...:..::: :: : . :::
CCDS43 LLYR-DINIPLLPMEQLIVPADT-TMTLTGLKPDTTYDVKVRAHTSKGPGPYSPSVQFRT
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CCDS43 LPVDQVFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDGRATQKLIV
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pF1KE0 LFGASLFSAHLQVTGFQIKAFTALRFLSEPSDAVTMRGGNVLLDCSAESDRGVPVIKW-K
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CCDS55 QQKQPISVKVISAKSSRERPPTFLTPEGNASNKEELRGNVLSLECIAEG-LPTPIIYWAK
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.::. . . . .: .: :.: . : : ::: :. .. . : .: .:
CCDS55 EDGM-----LPKNRTVYKNFEKTLQ-IIHVS--EADSGNYQCIAK--NALGAIHHTISVR
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: . ... .... :. : :.. :.: : : : : . : : :: . .
CCDS55 VKAAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICRANGNPKPRISWLTNGVPIEIAPDDPSRKI--DG
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.. .: .: . ..:.:.: : . .: : : .:..: : : :.:.. .:
CCDS55 DTIIFSNVQERSSAVYQCNASNEYGYLLAN-AFVNVLAEPP--RIL----TPANTLYQVI
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.. :.:.: : : :.. :..: . :. : : ...: : . :..: ::::.
CCDS55 ANRPALLDCAFFGSPLPTIEWFKGAKGSALHEDIYVLHENGTLEIPVAQKDSTGTYTCVA
450 460 470 480 490 500
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: . ..: . : :....: . .. . ::: :. . :: :.:. .
CCDS55 RNKLGMAKNEVHLEIKDPTWIVKQPEYAVVQRGSMVSFECKVKHDHTLSLTVLWLKD-NR
510 520 530 540 550 560
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.::: : ..: . : .: : : :::.. ....:: : ..: :. .
CCDS55 ELPSDERFTVDKDHLVVADVSDDDSGTYTCVANTTLDSVSASAVLSVVAPTPTPAPVYDV
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CCDS47 THELGPLVD-LKIPANKTRWTLKNLNFSTRYKFYFYAQTSAGSGSQITEEAVTT------
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CCDS45 CQATGDPK-PRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPR----DENVYECV
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CCDS45 RYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAED
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CCDS45 EYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPAS-----APRNVQARMLSATTMIVQWEEPV
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CCDS45 DGPLSDPIQVKTQQ--GVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPRQES--IIKYELLFREGD
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CCDS45 HGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVVRQRTLQSKPSAPPQD
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