Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0066
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0066, 893 aa
1>>>pF1KE0066 893 - 893 aa - 893 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4220+/-0.00102; mu= 7.9210+/- 0.061
mean_var=170.9733+/-34.268, 0's: 0 Z-trim(110.4): 86 B-trim: 7 in 1/51
Lambda= 0.098087
statistics sampled from 11493 (11577) to 11493 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34791.1 ESYT2 gene_id:57488|Hs108|chr7 ( 893) 5918 850.2 0
CCDS8904.1 ESYT1 gene_id:23344|Hs108|chr12 (1104) 2031 300.2 1.4e-80
CCDS53801.1 ESYT1 gene_id:23344|Hs108|chr12 (1114) 2017 298.2 5.6e-80
CCDS3101.2 ESYT3 gene_id:83850|Hs108|chr3 ( 886) 1766 262.6 2.3e-69
>>CCDS34791.1 ESYT2 gene_id:57488|Hs108|chr7 (893 aa)
initn: 5918 init1: 5918 opt: 5918 Z-score: 4534.2 bits: 850.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5918; 100.0% identity (100.0% similar) in 893 aa overlap (1-893:1-893)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
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CCDS34 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALALLAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALALLAW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVVRLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHMWPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVVRLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHMWPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQIILDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQIILDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPLLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 INWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 INWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 HPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 MPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 KAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 MTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 HMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASPGHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASPGHIS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 VKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQLENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQLENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 ACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRRSGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRRSGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE0 TLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEELAKGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVALASEELAKGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
850 860 870 880 890
>>CCDS8904.1 ESYT1 gene_id:23344|Hs108|chr12 (1104 aa)
initn: 1809 init1: 709 opt: 2031 Z-score: 1560.1 bits: 300.2 E(32554): 1.4e-80
Smith-Waterman score: 2034; 48.1% identity (76.2% similar) in 655 aa overlap (28-678:5-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
:: . : .: . : . : :. :
CCDS89 MERSPGEGPSPSPMDQPSAPSDPTDQPPAAHAKPDPG
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALAL-LA
.:: : .::. . : ..:....: . .:.::: : .::: ..::..::: :.
CCDS89 SGGQ-----PAGPGA--AGEALAVLTSFGRRLLVLIPVYLAGAVGLSVGFVLFGLALYLG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WCRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVV--RLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHM
: :: : : : : ::.:::... : . .::::: :::.:.:::::: : ..
CCDS89 W-RRVRDEKERSLRAARQLLDDEEQLTAKTLYMSHRELPAWVSFPDVEKAEWLNKIVAQV
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WPFICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQII
:::. :..:::. ::. :::::.: ::.::.::.:..:..:::: ::::. . :.::.
CCDS89 WPFLGQYMEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRIIGVKVHP-GQRKEQIL
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LDLQISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKP
:::.::.::. .::.:.:.:::.::::..:.::..::::::::::.:.:::.:.::.:.:
CCDS89 LDLNISYVGDVQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPFVGAVSMFFIRRP
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LLEINWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQ-IAQLRFPVPK
:.:::::.:::::.:::..::::.:.: :. .::::::. :::: ..: .:::: :.:.
CCDS89 TLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLQDVAQLRSPLPR
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEA
:..:::.. :. :..:: :.:::..::::::...:.:.: : :::: :.:.:.:.:.::.
CCDS89 GIIRIHLLAARGLSSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRLGTQTFCSRVIDEELNPQWGETYEV
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLE
.:.: ::::.:.:.::.::::::::: . .:. .: . .::.:: : . .:..:::::
CCDS89 MVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMKLDVGKVLQASVLDDWFPL-QGGQGQVHLRLE
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 WLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQM
::.:. .: .:..:: . . .. : :.:.:..::: :..:: :: ...:::.::.
CCDS89 WLSLLSDAEKLEQVL-QWNWGVSSRPDPPSAAILVVYLDRAQDLPL-KKGNKEPNPMVQL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLL
:. .:::: :.:: ::::: : ::...:. :.:.:.:.:... .:: : .::..::
CCDS89 SIQDVTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQVKDDSRALTLGALTLPLARLL
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 TSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKT
:. .. ..: ::::.::::: . ::...:.:.:. :... :.:
CCDS89 TAPELILDQWFQLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLD----------SSEICFPTVPGCPGAW
570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 SIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASP
.. :. .: :.: :: :
CCDS89 DVDSE---NPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKG
620 630 640 650 660 670
>--
initn: 1163 init1: 559 opt: 770 Z-score: 595.8 bits: 121.7 E(32554): 7.3e-27
Smith-Waterman score: 1071; 36.9% identity (65.3% similar) in 528 aa overlap (358-885:648-1098)
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 SNYLVLPNRITVPLVSEVQIAQLRFPVPKGVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPY
::::: .::::: .:: .: ::::::::::
CCDS89 DSENPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKDRFLGGLVKGKSDPY
620 630 640 650 660 670
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 GIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEALVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMID
...... :.:.:..:.:.:.::::.:..: ::::::.:.::.: ::::::: .
CCDS89 VKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVR
680 690 700 710 720 730
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 LIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSS
: : . .::::.::..::.:.:::::: :: :.:..:..:: . . : . :..
CCDS89 LTTVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNSLIQTQKSAELAA
740 750 760 770 780 790
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 ALLILYLDSARNLPSGKKISSNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNP
::: .:.. :..:: .: ... .: . ..:: .....: .:. :::.:. .:.:..:
CCDS89 ALLSIYMERAEDLPL-RKGTKHLSPYATLTVGDSSHKTKTISQTSAPVWDESASFLIRKP
800 810 820 830 840 850
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 KRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVL
. ..::..:: : ::.:..:::.::..... ... : :: :: .... .. : .:
CCDS89 HTESLELQVRGEGTGV-LGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLS-SGQGQVL-LRAQLGIL
860 870 880 890 900 910
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 HLEKRERPPDHQHSAQVKRPSVSKEGRKTSIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPG
. .. :.:: . . :.:.: : ..:.
CCDS89 -VSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEE-------------------------PELSGG----
920 930 940
690 700 710 720 730 740
pF1KE0 MEEKAQPPEAGPQGLHDLGRSSSSLLASPGHISVKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQ
:: ::. . : :::::: .
CCDS89 ------PP----------------------HITSSAP---------------ELRQRLTH
950 960
750 760 770 780 790 800
pF1KE0 LENGTTLGQSPLGQIQLTIRHSSQRNKLIVVVHACRNLIAFSEDGSDPYVRMYLLPDKRR
... .::::..::. . :.. ::. .::.::.: ..: :::: . ::::: :
CCDS89 VDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHGCRSLRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNR
970 980 990 1000 1010 1020
810 820 830 840 850 860
pF1KE0 SGRRKTHVSKKTLNPVFDQSFDFSVSLPEVQRRTLDVAVKNSGGFLSKDKGLLGKVLVAL
. .:.: .:.::.: :.. :.. . : :.::: :::.::....:.:... ::::: . :
CCDS89 GTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLDEAQRRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
870 880 890
pF1KE0 ASEELAKGWTQWYDLTEDGTRPQAMT
: .:..: ..:::: ..
CCDS89 AETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS
1090 1100
>>CCDS53801.1 ESYT1 gene_id:23344|Hs108|chr12 (1114 aa)
initn: 2200 init1: 709 opt: 2017 Z-score: 1549.4 bits: 298.2 E(32554): 5.6e-80
Smith-Waterman score: 2017; 47.4% identity (75.3% similar) in 664 aa overlap (28-678:5-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTPPSRAEAGVRRSRVPSEGRWRGAEPPGISASTQPASAGRAARHCGAMSGARGEGPEAG
:: . : .: . : . : :. :
CCDS53 MERSPGEGPSPSPMDQPSAPSDPTDQPPAAHAKPDPG
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE0 AGGAGGRAAPENPGGVLSVELPGLLAQLARSFALLLPVYALGYLGLSFSWVLLALAL-LA
.:: : .::. . : ..:....: . .:.::: : .::: ..::..::: :.
CCDS53 SGGQ-----PAGPGA--AGEALAVLTSFGRRLLVLIPVYLAGAVGLSVGFVLFGLALYLG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WCRRSRGLKALRLCRALALLEDEERVV--RLGVRACDLPAWVHFPDTERAEWLNKTVKHM
: :: : : : : ::.:::... : . .::::: :::.:.:::::: : ..
CCDS53 W-RRVRDEKERSLRAARQLLDDEEQLTAKTLYMSHRELPAWVSFPDVEKAEWLNKIVAQV
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 WPFICQFIEKLFRETIEPAVRGANTHLSTFSFTKVDVGQQPLRINGVKVYTENVDKRQII
:::. :..:::. ::. :::::.: ::.::.::.:..:..:::: ::::. . :.::.
CCDS53 WPFLGQYMEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRIIGVKVHP-GQRKEQIL
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LDLQISFVGNCEIDLEIKRYFCRAGVKSIQIHGTMRVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKP
:::.::.::. .::.:.:.:::.::::..:.::..::::::::::.:.:::.:.::.:.:
CCDS53 LDLNISYVGDVQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPFVGAVSMFFIRRP
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 LLEINWTGLTNLLDVPGLNGLSDTIILDIISNYLVLPNRITVPLVSEVQ-IAQLRFPVPK
:.:::::.:::::.:::..::::.:.: :. .::::::. :::: ..: .:::: :.:.
CCDS53 TLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLQDVAQLRSPLPR
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 GVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKGLVKGKSDPYGIIRVGNQIFQSRVIKENLSPKWNEVYEA
:..:::.. :. :..:: :.:::..::::::...:.:.: : :::: :.:.:.:.:.::.
CCDS53 GIIRIHLLAARGLSSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRLGTQTFCSRVIDEELNPQWGETYEV
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 LVYEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLE
.:.: ::::.:.:.::.::::::::: . .:. .: . .::.:: : . .:..:::::
CCDS53 MVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMKLDVGKVLQASVLDDWFPL-QGGQGQVHLRLE
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520
pF1KE0 WLTLMPNASNLDKVLTDIKADKDQANDGLSSALLILYLDSARNLP---------SGKKIS
::.:. .: .:..:: . . .. : :.:.:..::: :..:: . :: .
CCDS53 WLSLLSDAEKLEQVL-QWNWGVSSRPDPPSAAILVVYLDRAQDLPMVTSELYPPQLKKGN
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 SNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENFTFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGN
..:::.::.:. .:::: :.:: ::::: : ::...:. :.:.:.:.:... .::
CCDS53 KEPNPMVQLSIQDVTQESKAVYSTNCPVWEEAFRFFLQDPQSQELDVQVKDDSRALTLGA
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 LKVPLSQLLTSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLEKRERPPDHQHSAQVKRP
: .::..:::. .. ..: ::::.::::: . ::...:.:.:. :... :
CCDS53 LTLPLARLLTAPELILDQWFQLSSSGPNSRLYMKLVMRILYLD----------SSEICFP
570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 SVSKEGRKTSIKSHMSGSPGPGGSNTAPSTPVIGGSDKPGMEEKAQPPEAGPQGLHDLGR
.: .. :. .: :.: :: :
CCDS53 TVPGCPGAWDVDSE---NPQRGSSVDAPPRPCHTTPDSQFGTEHVLRIHVLEAQDLIAKD
620 630 640 650 660 670
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 SSSSLLASPGHISVKEPTPSIASDISLPIATQELRQRLRQLENGTTLGQSPLGQIQLTIR
CCDS53 RFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSHVVREDLNPRWNEVFEVIVTSVPGQELEVEVFDK
680 690 700 710 720 730
>--
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