Result of FASTA (omim) for pFN21AE0057
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0057, 1179 aa
  1>>>pF1KE0057 1179 - 1179 aa - 1179 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.4781+/-0.000544; mu= -20.3405+/- 0.034
 mean_var=626.8289+/-133.625, 0's: 0 Z-trim(121.2): 29  B-trim: 552 in 1/57
 Lambda= 0.051227
 statistics sampled from 37437 (37471) to 37437 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.439), width:  16
 Scan time: 18.200

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_056305 (OMIM: 610258) protein transport protein (1179) 8007 608.1  1e-172
NP_001070675 (OMIM: 610257) protein transport prot (1220) 3291 259.6 8.8e-68
NP_001305049 (OMIM: 610257) protein transport prot (1220) 3291 259.6 8.8e-68
NP_001305048 (OMIM: 610257) protein transport prot (1205) 3127 247.5 3.9e-64
NP_001070676 (OMIM: 610257) protein transport prot (1205) 3127 247.5 3.9e-64
NP_001070674 (OMIM: 610257) protein transport prot (1106) 3119 246.8 5.5e-64
NP_001177978 (OMIM: 610257) protein transport prot (1200) 2998 237.9 2.9e-61
NP_057295 (OMIM: 610257) protein transport protein (1181) 2651 212.3 1.5e-53
NP_001287674 (OMIM: 610257) protein transport prot (1166) 2223 180.6 4.9e-44
NP_001287673 (OMIM: 610257) protein transport prot (1067) 2187 178.0 2.9e-43


>>NP_056305 (OMIM: 610258) protein transport protein Sec  (1179 aa)
 initn: 8007 init1: 8007 opt: 8007  Z-score: 3221.8  bits: 608.1 E(85289): 1e-172
Smith-Waterman score: 8007; 100.0% identity (100.0% similar) in 1179 aa overlap (1-1179:1-1179)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFGSGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GVLSALSRFHKLVWGSFGSGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQKH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 TGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 QHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLPV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 IQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 IQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKLP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 TQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSKGQPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSKGQPLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 PLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHLVPQPCPRLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHLVPQPCPRLVF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 ISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKVTLEQDSRMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKVTLEQDSRMK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 FLKLLGYSKDELQKKVATWLKSDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCSQASKHTTKEASAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FLKLLGYSKDELQKKVATWLKSDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCSQASKHTTKEASAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 SAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEERFADAIILAQAGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEERFADAIILAQAGG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 TDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREALALLLTYSGTEKFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREALALLLTYSGTEKFP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 ELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALSPMALQDLMEKVMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALSPMALQDLMEKVMV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 LNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRDCAQPPVQQLRDRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRDCAQPPVQQLRDRL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 FHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPTPSPRPRVFTPQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPTPSPRPRVFTPQSS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 PAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQPQLLGGQRVQVPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQPQLLGGQRVQVPN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSLPETPRLFPLLPLRPLGPGRMVSHTPAPPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSLPETPRLFPLLPLRPLGPGRMVSHTPAPPAS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 FPVPYLPGDPGAPCSSVLPTTGILTPHPGPQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FPVPYLPGDPGAPCSSVLPTTGILTPHPGPQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPIT
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 APVMSLTPELQGILPSQPPVSSVSHAPPGVPGELSLQLQHLPPEKMERKELPPEHQSLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 APVMSLTPELQGILPSQPPVSSVSHAPPGVPGELSLQLQHLPPEKMERKELPPEHQSLKS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE0 SFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEVARCVDAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEVARCVDAGS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170         
pF1KE0 FEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
             1150      1160      1170         

>>NP_001070675 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1220 aa)
 initn: 2122 init1: 1288 opt: 3291  Z-score: 1337.9  bits: 259.6 E(85289): 8.8e-68
Smith-Waterman score: 3629; 47.3% identity (72.1% similar) in 1238 aa overlap (1-1170:1-1211)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
       :::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
NP_001 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
               10        20        30        40        50        60

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
              130       140       150       160        170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_001 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
       :::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
     300       310       320       330       340       350         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
     360       370       380       390       400       410         

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
        :   . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . .  . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
     420       430       440       450       460       470         

             480       490       500           510       520       
pF1KE0 TLEQDSRMKFLKLLGYSKDELQKKVATWLK----SDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCS
       ..:.::: :.:.:::: :..: ::.:  :.    ..:.: .: :   .: . .   :  .
NP_001 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKVDGANVALKDSDQVAQSD-GEESPAAEEQ
     480       490       500       510       520        530        

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE0 QASKHTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEE
         ..:  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...
NP_001 LLGEHIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDN
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pF1KE0 RFADAIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREAL
       :.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
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pF1KE0 ALLLTYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALS
       : .:::.  ..:  :::.::::.:.::.  : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...  
NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
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pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
       :..::::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
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pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
         :: ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.   
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
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pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDY--RAPGPQAIQ--PLPLSPGVRP
           ::: : :  :     :     ..:  . : .     .:: .  :  : :     .:
NP_001 --QMPRVQTQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNAAGQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQP
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pF1KE0 ASSQPQLLGGQRVQVPN-PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSL------PETPRL
       :.  :   ::. .  :. ::. : .   :..:   .  .    :...:        .:  
NP_001 AQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSASSY--TGQSQLYAAQHQASSPTS
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pF1KE0 FPLLPLRPL-GPGRMVSHT-P-APPASFPVPYLPGDPGA-PCSSVLPTTGILTPHPGPQD
        :   . :  . :   .:  : :::.:      ::  :. : .: ::..     . :::.
NP_001 SPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPAASELPAS----QRTGPQN
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pF1KE0 SWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGIL----PSQP-PVSSVS---
       .:.. ::     ...:.::.::::.:::.:.:.   . :. .    :: : :.:: :   
NP_001 GWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQSSFP
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pF1KE0 --HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEKMERKELP
         : :                             ::.: :.   ..: :: .:. .: .:
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pF1KE0 PEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEV
        ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: ...:::..
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pF1KE0 ARCVDAGSFEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
       :: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.:         
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>>NP_001305049 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1220 aa)
 initn: 2122 init1: 1288 opt: 3291  Z-score: 1337.9  bits: 259.6 E(85289): 8.8e-68
Smith-Waterman score: 3629; 47.3% identity (72.1% similar) in 1238 aa overlap (1-1170:1-1211)

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pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
       :::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
NP_001 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
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pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
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pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
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pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
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pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
       :::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
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pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
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pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
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pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
        :   . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . .  . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
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pF1KE0 TLEQDSRMKFLKLLGYSKDELQKKVATWLK----SDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCS
       ..:.::: :.:.:::: :..: ::.:  :.    ..:.: .: :   .: . .   :  .
NP_001 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKVDGANVALKDSDQVAQSD-GEESPAAEEQ
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pF1KE0 QASKHTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEE
         ..:  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...
NP_001 LLGEHIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDN
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pF1KE0 RFADAIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREAL
       :.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
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pF1KE0 ALLLTYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALS
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NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
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pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
       :..::::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
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pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
         :: ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.   
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
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pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDY--RAPGPQAIQ--PLPLSPGVRP
           ::: : :  :     :     ..:  . : .     .:: .  :  : :     .:
NP_001 --QMPRVQTQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNAAGQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQP
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pF1KE0 ASSQPQLLGGQRVQVPN-PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSL------PETPRL
       :.  :   ::. .  :. ::. : .   :..:   .  .    :...:        .:  
NP_001 AQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSASSY--TGQSQLYAAQHQASSPTS
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pF1KE0 FPLLPLRPL-GPGRMVSHT-P-APPASFPVPYLPGDPGA-PCSSVLPTTGILTPHPGPQD
        :   . :  . :   .:  : :::.:      ::  :. : .: ::..     . :::.
NP_001 SPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPAASELPAS----QRTGPQN
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NP_001 GWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQSSFP
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pF1KE0 --HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEKMERKELP
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        ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: ...:::..
NP_001 DEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTITSGLHNI
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       :: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.:         
NP_001 ARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
          1180      1190      1200      1210      1220

>>NP_001305048 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1205 aa)
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       :::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
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       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
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       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
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       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
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       :::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
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       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
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pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
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pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
        :   . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . .  . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
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       ..:.::: :.:.:::: :..: ::.:  :.    ..:.: .: :   .: . .   :  .
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         ..:  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...
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       :.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
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NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
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pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
       :..::::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
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pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
         :: ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.   
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
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pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQ
           ::: : :  :       .: :       :..      :.:   :: :::       
NP_001 --QMPRVQTQQYYPH----GENPPPPGFIMHGNVN------PNAAGQLPTSPG-------
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pF1KE0 PQLLGGQRVQVPNPVGFPGTWPL-PGSPLPMACPG--IMRPGSTSLPETPRLFPLLPL--
             ...::: :  .:   :  :..: :..  :  ..:: .   : :   .:  :   
NP_001 -----HMHTQVP-P--YPQPQPYQPAQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYIS
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pF1KE0 ---RPLGPGRMV-------SHTPAPPASFPVP------YLPGDPGAPCSSVLPTTGILTP
             : ...        : : .: .::: :      .  : :::: ::   ..  : :
NP_001 SASSYTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSS---SAYALPP
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          :::..:.. ::     ...:.::.::::.:::.:.:.   . :. .    :: : :.
NP_001 GTTGPQNGWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPL
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pF1KE0 SSVS-----HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEK
       :: :     : :                             ::.: :.   ..: :: .:
NP_001 SSQSSFPQPHLPGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKK
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pF1KE0 MERKELPPEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHV
       . .: .: ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: .
NP_001 ITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTI
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       ..:::..:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.::  :.:: :
NP_001 TSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
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pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
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NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
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pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
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pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
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NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
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       ..:.::: :.:.:::: :..: ::.:  :.    ..:.: .: :   .: . .   :  .
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NP_001 LLGEHIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDN
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pF1KE0 RFADAIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREAL
       :.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
           600       610       620       630       640       650   

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE0 ALLLTYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALS
       : .:::.  ..:  :::.::::.:.::.  : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...  
NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
           660       670       680       690       700       710   

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
       :..::::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
           720       730       740       750       760       770   

       770       780       790       800       810       820       
pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
         :: ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.   
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
           780       790       800                810       820    

       830       840       850       860       870       880       
pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQ
           ::: : :  :       .: :       :..      :.:   :: :::       
NP_001 --QMPRVQTQQYYPH----GENPPPPGFIMHGNVN------PNAAGQLPTSPG-------
               830           840       850             860         

       890       900       910        920         930       940    
pF1KE0 PQLLGGQRVQVPNPVGFPGTWPL-PGSPLPMACPG--IMRPGSTSLPETPRLFPLLPL--
             ...::: :  .:   :  :..: :..  :  ..:: .   : :   .:  :   
NP_001 -----HMHTQVP-P--YPQPQPYQPAQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYIS
                  870         880       890       900       910    

               950              960             970       980      
pF1KE0 ---RPLGPGRMV-------SHTPAPPASFPVP------YLPGDPGAPCSSVLPTTGILTP
             : ...        : : .: .::: :      .  : :::: ::   ..  : :
NP_001 SASSYTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSS---SAYALPP
          920       930       940       950       960          970 

         990      1000      1010      1020      1030           1040
pF1KE0 HP-GPQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGIL----PSQP-PV
          :::..:.. ::     ...:.::.::::.:::.:.:.   . :. .    :: : :.
NP_001 GTTGPQNGWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPL
             980       990      1000      1010      1020      1030 

                                               1050       1060     
pF1KE0 SSVS-----HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEK
       :: :     : :                             ::.: :.   ..: :: .:
NP_001 SSQSSFPQPHLPGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKK
            1040      1050      1060      1070      1080      1090 

        1070      1080      1090      1100      1110      1120     
pF1KE0 MERKELPPEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHV
       . .: .: ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: .
NP_001 ITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTI
            1100      1110      1120      1130      1140      1150 

        1130      1140      1150      1160      1170         
pF1KE0 VAGLHEVARCVDAGSFEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
       ..:::..:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.::  :.:: :
NP_001 TSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
            1160      1170      1180      1190      1200     

>>NP_001070674 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1106 aa)
 initn: 2114 init1: 1288 opt: 3119  Z-score: 1269.8  bits: 246.8 E(85289): 5.5e-64
Smith-Waterman score: 3494; 47.5% identity (71.7% similar) in 1201 aa overlap (1-1179:1-1106)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
       :::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
NP_001 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
               10        20        30        40        50        60

               70         80        90       100       110         
pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
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     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_001 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
       :::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
     300       310       320       330       340       350         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
     360       370       380       390       400       410         

             420       430       440       450       460       470 
pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
        :   . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . .  . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
     420       430       440       450       460       470         

             480       490       500           510       520       
pF1KE0 TLEQDSRMKFLKLLGYSKDELQKKVATWLK----SDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCS
       ..:.::: :.:.:::: :..: ::.:  :.    ..:.: .: :   .: . .   :  .
NP_001 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKVDGANVALKDSDQVAQSD-GEESPAAEEQ
     480       490       500       510       520        530        

       530       540       550       560       570       580       
pF1KE0 QASKHTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEE
         ..:  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...
NP_001 LLGEHIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDN
      540       550            560       570       580       590   

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE0 RFADAIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREAL
       :.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
           600       610       620       630       640       650   

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pF1KE0 ALLLTYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALS
       : .:::.  ..:  :::.::::.:.::.  : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...  
NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
           660       670       680       690       700       710   

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
       :..::::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
           720       730       740       750       760       770   

       770       780       790       800       810       820       
pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
         :: ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.   
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
           780       790       800                810       820    

       830       840       850       860       870       880       
pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQ
           ::: : :  :       .: :       :..      :.:   :: :::   ..  
NP_001 --QMPRVQTQQYYPH----GENPPPPGFIMHGNVN------PNAAGQLPTSPGHMHTQVP
               830           840       850             860         

       890       900       910       920       930       940       
pF1KE0 PQLLGGQRVQVPNPVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSLPETPRLFPLLPLRPLG-
       :          :.:    . :  :  :     :   .   . .: .:   :..   ::: 
NP_001 PY---------PQPQRPQNGWNDP--PALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIM--NPLGD
     870                880         890       900       910        

         950             960       970       980       990         
pF1KE0 P-GRMVSHTPAPP------ASFPVPYLPGDPGAPCSSVLPTTGILTPHPGPQDSWKEAPA
       : ..:... :. :      .::: :.:::  : :        :.  :             
NP_001 PQSQMLQQQPSAPVPLSSQSSFPQPHLPG--GQPFH------GVQQP-------------
        920       930       940         950                        

    1000      1010      1020      1030      1040      1050         
pF1KE0 PRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGILPSQPPVSSVSHAPPGVP-GELSLQL
                : .: :::.      .:  :...:               ::.: :.   ..
NP_001 ---------LGQTGMPPS------FS-KPNIEGA--------------PGAPIGNTFQHV
                  960              970                     980     

     1060      1070      1080      1090      1100      1110        
pF1KE0 QHLPPEKMERKELPPEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCE
       : :: .:. .: .: ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: :
NP_001 QSLPTKKITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLRE
         990      1000      1010      1020      1030      1040     

     1120      1130      1140      1150      1160      1170        
pF1KE0 GTLSPHVVAGLHEVARCVDAGSFEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLL
        :::: ...:::..:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.::  :.:: 
NP_001 QTLSPTITSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLG
        1050      1060      1070      1080      1090      1100     

        
pF1KE0 V
       :
NP_001 V
        

>>NP_001177978 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1200 aa)
 initn: 1993 init1: 1159 opt: 2998  Z-score: 1221.0  bits: 237.9 E(85289): 2.9e-61
Smith-Waterman score: 3517; 47.1% identity (71.1% similar) in 1228 aa overlap (27-1179:22-1200)

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                                 ::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
NP_001      MLGESDERCTNAGSGCRRSSPGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
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pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
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pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
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pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_001 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
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pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
       :::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
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pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
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pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
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pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
        :   . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . .  . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
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pF1KE0 TLEQDSRMKFLKLLGYSKDELQKKVATWLK----SDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCS
       ..:.::: :.:.:::: :..: ::.:  :.    ..:.: .: :   .: . .   :  .
NP_001 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKKIALALNKVDGANVALKDSDQVAQSD-GEESPAAEEQ
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pF1KE0 QASKHTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEE
         ..:  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...
NP_001 LLGEHIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDN
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pF1KE0 RFADAIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREAL
       :.::::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::
NP_001 RMADAIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREAL
      590       600       610       620       630       640        

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pF1KE0 ALLLTYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALS
       : .:::.  ..:  :::.::::.:.::.  : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...  
NP_001 AAVLTYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSH
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pF1KE0 PMALQDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRD
       :..::::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .
NP_001 PLSLQDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDN
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pF1KE0 CAQPPVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPT
         :: ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.   
NP_001 TNQPNIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH---
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pF1KE0 PSPRPRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQ
           ::: : :  :       .: :       :..      :.:   :: :::       
NP_001 --QMPRVQTQQYYPH----GENPPPPGFIMHGNVN------PNAAGQLPTSPG-------
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pF1KE0 PQLLGGQRVQVPNPVGFPGTWPL-PGSPLPMACPG--IMRPGSTSLPETPRLFPLLPL--
             ...::: :  .:   :  :..: :..  :  ..:: .   : :   .:  :   
NP_001 -----HMHTQVP-P--YPQPQPYQPAQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYIS
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pF1KE0 ---RPLGPGRMV-------SHTPAPPASFPVP------YLPGDPGAPCSSVLPTTGILTP
             : ...        : : .: .::: :      .  : :::: ::   ..  : :
NP_001 SASSYTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSS---SAYALPP
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pF1KE0 HP-GPQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGIL----PSQP-PV
          :::..:.. ::     ...:.::.::::.:::.:.:.   . :. .    :: : :.
NP_001 GTTGPQNGWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPL
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pF1KE0 SSVS-----HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEK
       :: :     : :                             ::.: :.   ..: :: .:
NP_001 SSQSSFPQPHLPGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKK
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       . .: .: ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: .
NP_001 ITKKPIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTI
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       ..:::..:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.::  :.:: :
NP_001 TSGLHNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
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>>NP_057295 (OMIM: 610257) protein transport protein Sec  (1181 aa)
 initn: 2971 init1: 1288 opt: 2651  Z-score: 1082.5  bits: 212.3 E(85289): 1.5e-53
Smith-Waterman score: 3565; 46.9% identity (70.7% similar) in 1243 aa overlap (1-1179:1-1181)

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       :::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
NP_057 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
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       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_057 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
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pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_057 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
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       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_057 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
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pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_057 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
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pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_057 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
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pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
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NP_057 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
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pF1KE0 TLEQDSRMKFLKLLGYSKDELQKKVATWLKSDVGLGESPQPKGNDLNSDRQQAFCSQASK
       ..:.::: :.:.:::: :..: ::                                    
NP_057 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKK------------------------------------
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pF1KE0 HTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEERFAD
       :  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...:.::
NP_057 HIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDNRMAD
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pF1KE0 AIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREALALLL
       ::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::: .:
NP_057 AIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREALAAVL
      560       570       580       590       600       610        

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pF1KE0 TYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALSPMAL
       ::.  ..:  :::.::::.:.::.  : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...  :..:
NP_057 TYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSHPLSL
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pF1KE0 QDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRDCAQP
       :::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .  ::
NP_057 QDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDNTNQP
      680       690       700       710       720       730        

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pF1KE0 PVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPTPSPR
        ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.       
NP_057 NIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH-----QM
      740       750       760                770       780         

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pF1KE0 PRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDY--RAPGPQAIQ--PLPLSPGVRPASSQ
       ::: : :  :     :     ..:  . : .     .:: .  :  : :     .::.  
NP_057 PRVQTQQYYPHGENPPPPGFIMHGNVNPNAAGQLPTSPGHMHTQVPPYPQPQPYQPAQPY
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pF1KE0 PQLLGGQRVQVPN-PVGFPGTWPLPGSPLPMACPGIMRPGSTSL------PETPRLFPLL
       :   ::. .  :. ::. : .   :..:   .  .    :...:        .:   :  
NP_057 PFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSASSY--TGQSQLYAAQHQASSPTSSPAT
          850       860       870       880         890       900  

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pF1KE0 PLRPL-GPGRMVSHT-P-APPASFPVPYLPGDPGA-PCSSVLPTTGILTPHPGPQDSWKE
        . :  . :   .:  : :::.:      ::  :. : .: ::.    . . :::..:..
NP_057 SFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSSSAYALPPGTTGTLPAASELPA----SQRTGPQNGWND
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pF1KE0 APAPRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGIL----PSQP-PVSSVS-----HA
        ::     ...:.::.::::.:::.:.:.   . :. .    :: : :.:: :     : 
NP_057 PPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQSSFPQPHL
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pF1KE0 P-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEKMERKELPPEHQ
       :                             ::.: :.   ..: :: .:. .: .: :: 
NP_057 PGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKKITKKPIPDEHL
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pF1KE0 SLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGLHEVARCV
        ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: ...:::..:: .
NP_057 ILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTITSGLHNIARSI
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pF1KE0 DAGSFEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
       .. .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.::  :.:: :
NP_057 ETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
     1140      1150      1160      1170      1180 

>>NP_001287674 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1166 aa)
 initn: 2971 init1: 1288 opt: 2223  Z-score: 911.6  bits: 180.6 E(85289): 4.9e-44
Smith-Waterman score: 3563; 47.0% identity (70.2% similar) in 1250 aa overlap (1-1179:1-1166)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MKLKELERPAVQAWSPASQYPLYLATGTSAQQLDSSFSTNGTLEIFEVDFRDPSLDLKHR
       :::::..: :.::::::...:.::::::::::::..::::..:::::.:. :::::.:  
NP_001 MKLKEVDRTAMQAWSPAQNHPIYLATGTSAQQLDATFSTNASLEIFELDLSDPSLDMKSC
               10        20        30        40        50        60

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pF1KE0 GVLSALSRFHKLVWGSFG-SGLLESSGVIVGGGDNGMLILYNVTHILSSGKEPVIAQKQK
       ...:.  :.:::.:: .  ..  . :::...::.:: .:::. ..:... :: ::::..:
NP_001 ATFSSSHRYHKLIWGPYKMDSKGDVSGVLIAGGENGNIILYDPSKIIAGDKEVVIAQNDK
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pF1KE0 HTGAVRALDLNPFQGNLLASGASDSEIFIWDLNNLNVPMTLGSKSQQPPEDIKALSWNRQ
       ::: :::::.: :: ::.::::..:::.::::::. .::: :.:.: :::::. ..::::
NP_001 HTGPVRALDVNIFQTNLVASGANESEIYIWDLNNFATPMTPGAKTQ-PPEDISCIAWNRQ
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pF1KE0 AQHILSSAHPSGKAVVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDIATQLVLCSEDDRLP
       .::::.:: :::.:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: :::::::
NP_001 VQHILASASPSGRATVWDLRKNEPIIKVSDHSNRMHCSGLAWHPDVATQMVLASEDDRLP
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pF1KE0 VIQLWDLRFASSPLKVLESHSRGILSVSWSQADAELLLTSAKDSQILCRNLGSSEVVYKL
       :::.::::::::::.:::.:.::::...::.:: ::::. .::..::: : ...::.:.:
NP_001 VIQMWDLRFASSPLRVLENHARGILAIAWSMADPELLLSCGKDAKILCSNPNTGEVLYEL
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pF1KE0 PTQSSWCFDVQWCPRDPSVFSAASFNGWISLYSVMGRSWEVQHMRQADKISSSFSK----
       ::...::::.:::::.:.:.:::::.: ::.::.:: : .  ...:.::.::::..    
NP_001 PTNTQWCFDIQWCPRNPAVLSAASFDGRISVYSIMGGSTDGLRQKQVDKLSSSFGNLDPF
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pF1KE0 --GQPLPPLQVPEQVAQAPLIPPLKKPPKWIRRPTGVSFAFGGKLVTFGLPSTPAHL--V
         ::::::::.:.:.::  .. ::::::::::::.:.::.::::::::     :.:    
NP_001 GTGQPLPPLQIPQQTAQHSIVLPLKKPPKWIRRPVGASFSFGGKLVTFENVRMPSHQGAE
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pF1KE0 PQPCPRLVFISQVTTESEFLMRSAELQEALGSGNLLNYCQNKSQQALLQSEKMLWQFLKV
        :   . ::::::.::.::: :: .::.:. : ...::::.: . .  . :: .:.::::
NP_001 QQQQQHHVFISQVVTEKEFLSRSDQLQQAVQSQGFINYCQKKIDASQTEFEKNVWSFLKV
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       ..:.::: :.:.:::: :..: ::                                    
NP_001 NFEDDSRGKYLELLGYRKEDLGKK------------------------------------
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pF1KE0 HTTKEASASSAFFDELVPQNMTPWEIPITKDIDGLLSQALLLGELGPAVELCLKEERFAD
       :  .:   :     :..:..   ..: .. :::::..:::: :..  ::.:::...:.::
NP_001 HIKEEKEES-----EFLPSSGGTFNISVSGDIDGLITQALLTGNFESAVDLCLHDNRMAD
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pF1KE0 AIILAQAGGTDLLKQTQERYLAKKKTKISSLLACVVQKNWKDVVCTCSLKNWREALALLL
       ::::: ::: .:: .::..:.::...::. :.. ::.::::..: .:.::::::::: .:
NP_001 AIILAIAGGQELLARTQKKYFAKSQSKITRLITAVVMKNWKEIVESCDLKNWREALAAVL
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pF1KE0 TYSGTEKFPELCDMLGTRMEQEGSRALTSEARLCYVCSGSVERLVECWAKCHQALSPMAL
       ::.  ..:  :::.::::.:.::.  : ..: :::.:.:.::.:: ::.: ...  :..:
NP_001 TYAKPDEFSALCDLLGTRLENEGDSLLQTQACLCYICAGNVEKLVACWTKAQDGSHPLSL
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pF1KE0 QDLMEKVMVLNRSLEQLRGPHGVSPGPATTYRVTQYANLLAAQGSLATAMSFLPRDCAQP
       :::.:::..: ....  ..    . :   . ...:::::::::::.:.:..::: .  ::
NP_001 QDLIEKVVILRKAVQLTQAMDTSTVGVLLAAKMSQYANLLAAQGSIAAALAFLPDNTNQP
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pF1KE0 PVQQLRDRLFHAQGSAVLGQQSPPFPFPRIVVGATLHSKETSSYRLGSQPSHQVPTPSPR
        ..:::::: .:::  : :..:: .:. .         ..  . : :   .:.       
NP_001 NIMQLRDRLCRAQGEPVAGHESPKIPYEK---------QQLPKGRPGPVAGHH-----QM
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pF1KE0 PRVFTPQSSPAMPLAPSHPSPYQGPRTQNISDYRAPGPQAIQPLPLSPGVRPASSQPQLL
       ::: : :  :       .: :       :..      :.:   :: :::           
NP_001 PRVQTQQYYPH----GENPPPPGFIMHGNVN------PNAAGQLPTSPG-----------
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pF1KE0 GGQRVQVPNPVGFPGTWPL-PGSPLPMACPG--IMRPGSTSLPETPRLFPLLPL-----R
         ...::: :  .:   :  :..: :..  :  ..:: .   : :   .:  :       
NP_001 -HMHTQVP-P--YPQPQPYQPAQPYPFGTGGSAMYRPQQPVAPPTSNAYPNTPYISSASS
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pF1KE0 PLGPGRMV-------SHTPAPPASFPVP------YLPGDPGAPCSSVLPTTGILTPHP-G
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NP_001 YTGQSQLYAAQHQASSPTSSPATSFPPPPSSGASFQHGGPGAPPSS---SAYALPPGTTG
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pF1KE0 PQDSWKEAPAPRGNLQRNKLPETFMPPAPITAPVMSLTPELQGIL----PSQP-PVSSVS
       ::..:.. ::     ...:.::.::::.:::.:.:.   . :. .    :: : :.:: :
NP_001 PQNGWNDPPALNRVPKKKKMPENFMPPVPITSPIMNPLGDPQSQMLQQQPSAPVPLSSQS
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pF1KE0 -----HAP-----------------------------PGVP-GELSLQLQHLPPEKMERK
            : :                             ::.: :.   ..: :: .:. .:
NP_001 SFPQPHLPGGQPFHGVQQPLGQTGMPPSFSKPNIEGAPGAPIGNTFQHVQSLPTKKITKK
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pF1KE0 ELPPEHQSLKSSFEALLQRCSLSATDLKTKRKLEEAAQRLEYLYEKLCEGTLSPHVVAGL
        .: ::  ::..:: :.:::  :::: .:::::..:..:::.::.:: : :::: ...::
NP_001 PIPDEHLILKTTFEDLIQRCLSSATDPQTKRKLDDASKRLEFLYDKLREQTLSPTITSGL
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pF1KE0 HEVARCVDAGSFEQGLAVHAQVAGCSSFSEVSSFMPILKAVLIIAHKLLV
       :..:: ... .. .::..:..... :.:::.:.:::.::.::  :.:: :
NP_001 HNIARSIETRNYSEGLTMHTHIVSTSNFSETSAFMPVLKVVLTQANKLGV
       1120      1130      1140      1150      1160      

>>NP_001287673 (OMIM: 610257) protein transport protein   (1067 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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