FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5741, 799 aa 1>>>pF1KB5741 799 - 799 aa - 799 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5301+/-0.0015; mu= 10.8821+/- 0.089 mean_var=216.7396+/-42.399, 0's: 0 Z-trim(106.6): 128 B-trim: 47 in 2/49 Lambda= 0.087117 statistics sampled from 8958 (9077) to 8958 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16 Scan time: 3.530 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 ( 799) 5624 721.1 1.7e-207 CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 ( 788) 3122 406.6 7.9e-113 CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 788) 2746 359.4 1.3e-98 CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 746) 2609 342.1 2e-93 CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 693) 2439 320.7 5.1e-87 CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 ( 798) 2309 304.5 4.6e-82 CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 ( 681) 2050 271.8 2.6e-72 CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 ( 798) 2043 271.0 5.3e-72 CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 ( 769) 1803 240.9 6.3e-63 CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 ( 769) 1629 219.0 2.4e-56 CCDS58599.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1752) 1475 200.0 2.8e-50 CCDS32736.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1805) 1475 200.1 2.8e-50 CCDS11727.1 ITGB4 gene_id:3691|Hs108|chr17 (1822) 1475 200.1 2.8e-50 CCDS61362.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 353) 476 73.7 6e-13 CCDS61361.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 401) 476 73.7 6.6e-13 CCDS73594.1 ITGBL1 gene_id:9358|Hs108|chr13 ( 445) 476 73.8 7e-13 >>CCDS3030.1 ITGB5 gene_id:3693|Hs108|chr3 (799 aa) initn: 5624 init1: 5624 opt: 5624 Z-score: 3838.5 bits: 721.1 E(32554): 1.7e-207 Smith-Waterman score: 5624; 100.0% identity (100.0% similar) in 799 aa overlap (1-799:1-799) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 TSRCDLRANLVKNGCGGEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 TSRCDLRANLVKNGCGGEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 GDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 GDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 SFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 SFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 RNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 RNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQC 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 HLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 HLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEIL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 DGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 DGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 TASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCNGSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 TASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCNGSG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 TYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFESEF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 TYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFESEF 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB5 GKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRDGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 GKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRDGQ 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB5 ICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCHSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 ICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCHSL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB5 CRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNTPNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 CRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNTPNA 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB5 MTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPIST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPIST 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB5 HTVDFTFNKFNKSYNGTVD ::::::::::::::::::: CCDS30 HTVDFTFNKFNKSYNGTVD 790 >>CCDS11511.1 ITGB3 gene_id:3690|Hs108|chr17 (788 aa) initn: 2942 init1: 2122 opt: 3122 Z-score: 2139.1 bits: 406.6 E(32554): 7.9e-113 Smith-Waterman score: 3122; 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CCDS11 MRARPR-PRPLWATVLALGALAGVGVGGPNICTTRGVSSCQQCLAVSPMCAWCSDEALPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 GSPRSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQE :::: :::. ::.:..:. : :: :.: .::.. :::.::::... .: :..::. CCDS11 GSPR-----CDLKENLLKDNCAPESIEFPVSEARVLEDRPLSDKGSGDSS-QVTQVSPQR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 IAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTS ::. ::: :. .:..:::::::::::.::::::: :::::: .:..:::::: .:::::: CCDS11 IALRLRPDDSKNFSIQVRQVEDYPVDIYYLMDLSYSMKDDLWSIQNLGTKLATQMRKLTS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NFRLGFGSFVDKDISPFSY-TAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE :.:.:::.:::: .::. : . :. ::: : . .:.: ::..:.: :::.: ::: CCDS11 NLRIGFGAFVDKPVSPYMYISPPEALENPC--YDMKTTCLPMFGYKHVLTLTDQVTRFNE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL ::.:: ::::::::::::::..::.:: ::::::.:: :::::::: ::::::.:.:. CCDS11 EVKKQSVSRNRDAPEGGFDAIMQATVCDEKIGWRNDASHLLVFTTDAKTHIALDGRLAGI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI :::.:::::.. :.:.::. ::::::.:. :::...:::::::::.: ::.:.. :: CCDS11 VQPNDGQCHVGSDNHYSASTTMDYPSLGLMTEKLSQKNINLIFAVTENVVNLYQNYSELI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK ::::: .:. ::.:..:::..::..::::::: : : ::.:.: :.::: .. :: .. CCDS11 PGTTVGVLSMDSSNVLQLIVDAYGKIRSKVELEVRDLPEELSLSFNATCLNNEVIPGLKS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 CEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPN : :::::::.:: . ..:.:: .. :. :...::::.::: : ::..: :.:.. ::: CCDS11 CMGLKIGDTVSFSIEAKVRGCP-QEKEKSFTIKPVGFKDSLIVQVTFDCDCACQAQAEPN 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 SARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCN : ::: :.::. ::.:.:.::.::..:::.. . . :. : ::.:.:: ::.: :. CCDS11 SHRCNNGNGTFECGVCRCGPGWLGSQCECSEEDYRPSQQDECSPREGQPVCSQRGECLCG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 QCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDI :: : :.:::: : .::::.:::.: :: .:::::.: ::.: : . . : :::.: CCDS11 QCVCHSSDFGKITGKYCECDDFSCVRYKGEMCSGHGQCSCGDCLCDSDWTGYYCNCTTRT 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 STCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGK .:: . .: .:: ::.: ::.: : .::..:. :::::::::::. :..:::: . : CCDS11 DTCMSSNGLLCSGRGKCECGSCVCIQPGSYGDTCEKCPTCPDACTFKKECVECKKFDRGA 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 -PDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLR :..::. ::::. . : . ..:: : ::. :::. : : : :::: : :.. CCDS11 LHDENTCNRYCRDEIES-VKELKDTGKDAVNCTYKNEDDCVVRFQYYEDSSGKSILYVVE 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMAS :::: . :. ...::.:.:.:::.::: : :::::.:::::.:::::. ::.::... :. CCDS11 EPECPKGPDILVVLLSVMGAILLIGLAALLIWKLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWDTAN 710 720 730 740 750 760 780 790 pF1KB5 NPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD ::::.. :: : CCDS11 NPLYKEATSTFTNITYRGT 770 780 >>CCDS2212.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (788 aa) initn: 2627 init1: 853 opt: 2746 Z-score: 1883.7 bits: 359.4 E(32554): 1.3e-98 Smith-Waterman score: 2746; 49.5% identity (76.9% similar) in 757 aa overlap (28-780:23-768) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI :. :.: .::.:::: :.::::..:.: : .. CCDS22 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPSGV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB5 TSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLR ::: :::. .:: . ::.:.:. ..:.. ::: : . . :..:..:: . ..:: CCDS22 GERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSV-GRQKNSSDIVQIAPQSLILKLR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 PGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGF :: :.:..:::.:::::::::::::: :: :::..:. ::..:..:: :::::::::: CCDS22 PGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 GSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRV ::::.: .::: :.:. .::: . : :.:.:::.:.::::. .. ::: :..:.. CCDS22 GSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYF--CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQ : : :.:::::::..::::::::::::.:.::::::..: :...:.::.:.: :.:: CCDS22 SANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 CHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEI :::. :::. :. ..::... : .::..::. ::::::... ::.:.. ::::.:: . CCDS22 CHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 LDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIG :. :: ::.::::.::. .::.::: : . : ::: ::: :..:. . :.:: .:.: CCDS22 LQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 DTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCN-G ::::: :... : :...:.. ..:::. :.::. :. .:.: :. .: ::..:. : CCDS22 DTASFSVTVNIPHCE-RRSRHII-IKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 SGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFES .:.. ::.: : ::..: :::: ::.. . . :.:: .: ::::::: :.:: : : CCDS22 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC--GEDM-LSTDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 EFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRD .:.::::.:.::::::.:.::.::.:.:.: :::: :..:. :. :::.:. ..: ..: CCDS22 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSED 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 GQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCH : .:: :: :.::.: ::.::: : ::.:::: : :..::.:.:: : .:. .. : CCDS22 GVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQAREE-CV 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 SLCR--DEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGN . :. .:. . . :: .: : . ..:.. : . ::. . . : .: . CCDS22 DKCKLAGATISEEEDFSKDG--SVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPK 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 TPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRK :: :.:.: .:::.:..:: ::::::..:::.: :::..:::.:... ..::::: CCDS22 PPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRG 710 720 730 740 750 760 780 790 pF1KB5 PISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD :: CCDS22 STSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 770 780 >>CCDS74596.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (746 aa) initn: 2490 init1: 853 opt: 2609 Z-score: 1790.9 bits: 342.1 E(32554): 2e-93 Smith-Waterman score: 2609; 49.1% identity (76.4% similar) in 733 aa overlap (52-780:5-726) 30 40 50 60 70 80 pF1KB5 LAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIE ..: : .. ::: :::. .:: . :: CCDS74 MITYKNFTHPSGVGERCDTPANLLAKGCQLNFIE 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 SPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDL .:.:. ..:.. ::: : . . :..:..:: . ..:::: :.:..:::.::::::: CCDS74 NPVSQVEILKNKPLSV-GRQKNSSDIVQIAPQSLILKLRPGGAQTLQVHVRQTEDYPVDL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 YYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTN ::::::: :: :::..:. ::..:..:: ::::::::::::::.: .::: :.:. .: CCDS74 YYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIAN 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 PCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCK :: . : :.:.:::.:.::::. .. ::: :..:..: : :.:::::::..:::::: CCDS74 PCSSIPYF--CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCK 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 EKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLA ::::::.:.::::::..: :...:.::.:.: :.:: :::. :::. :. ..::... CCDS74 EKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIG 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 LLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRS : .::..::. ::::::... ::.:.. ::::.:: .:. :: ::.::::.::. .:: CCDS74 QLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRS 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 KVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEH .::: : . : ::: ::: :..:. . :.:: .:.:::::: :... : :...: CCDS74 EVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCE-RRSRH 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 pF1KB5 VFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCE .. ..:::. :.::. :. .:.: :. .: ::..:. :.:.. ::.: : ::..: ::: CCDS74 II-IKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCE 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KB5 CQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNK : ::.. . . :.:: .: ::::::: :.:: : : .:.::::.:.::::::.:.: CCDS74 C--GEDM-LSTDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHK 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KB5 GVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPG :.::.:.:.: :::: :..:. :. :::.:. ..: ..:: .:: :: :.::.: ::.:: CCDS74 GLLCGGNGDCDCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPG 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 660 670 pF1KB5 AFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCHSLCR--DEVITWVDTIVKDDQ : : ::.:::: : :..::.:.:: : .:. . : . :. .:. . . :: CCDS74 ASGPTCERCPTCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQA-REECVDKCKLAGATISEEEDFSKDG- 570 580 590 600 610 620 680 690 700 710 720 730 pF1KB5 EAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLA .: : . ..:.. : . ::. . . : .: . :: :.:.: .:::.:.. CCDS74 -SVSCSLQGENECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVV 630 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 790 pF1KB5 LLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGT :: ::::::..:::.: :::..:::.:... ..::::: :: CCDS74 LLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLS 690 700 710 720 730 740 pF1KB5 VD CCDS74 TDC >>CCDS74597.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (693 aa) initn: 2378 init1: 853 opt: 2439 Z-score: 1675.8 bits: 320.7 E(32554): 5.1e-87 Smith-Waterman score: 2439; 50.4% identity (77.1% similar) in 663 aa overlap (121-780:21-673) 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 SLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSM : :.:..:::.:::::::::::::: :: CCDS74 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASM 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 210 pF1KB5 KDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPN :::..:. ::..:..:: ::::::::::::::.: .::: :.:. .::: . : CCDS74 DDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGFGSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYF-- 60 70 80 90 100 220 230 240 250 260 270 pF1KB5 CVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDAL :.:.:::.:.::::. .. ::: :..:..: : :.:::::::..::::::::::::.:.: CCDS74 CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKISANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSL 110 120 130 140 150 160 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 HLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENN :::::..: :...:.::.:.: :.:: :::. :::. :. ..::... : .::..:: CCDS74 HLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGLCHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNN 170 180 190 200 210 220 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 INLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQP . ::::::... ::.:.. ::::.:: .:. :: ::.::::.::. .::.::: : . CCDS74 VLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGLLQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDT 230 240 250 260 270 280 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 EDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFR : ::: ::: :..:. . :.:: .:.:::::: :... : :...:.. ..:::. CCDS74 EGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVGDTASFSVTVNIPHCE-RRSRHII-IKPVGLG 290 300 310 320 330 340 460 470 480 490 500 pF1KB5 DSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVY :.::. :. .:.: :. .: ::..:. :.:.. ::.: : ::..: :::: ::.. . CCDS74 DALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHGNGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC--GEDM-LS 350 360 370 380 390 400 510 520 530 540 550 560 pF1KB5 QNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGEC . :.:: .: ::::::: :.:: : : .:.::::.:.::::::.:.::.::.:.:.: CCDS74 TDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLSPYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCGGNGDC 410 420 430 440 450 460 570 580 590 600 610 620 pF1KB5 HCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCP :::: :..:. :. :::.:. ..: ..:: .:: :: :.::.: ::.::: : ::.:: CCDS74 DCGECVCRSGWTGEYCNCTTSTDSCVSEDGVLCSGRGDCVCGKCVCTNPGASGPTCERCP 470 480 490 500 510 520 630 640 650 660 670 680 pF1KB5 TCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTCHSLCR--DEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTA :: : :..::.:.:: : .:. . : . :. .:. . . :: .: : . CCDS74 TCGDPCNSKRSCIECHLSAAGQA-REECVDKCKLAGATISEEEDFSKDG--SVSCSLQGE 530 540 550 560 570 580 690 700 710 720 730 740 pF1KB5 KDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVT ..:.. : . ::. . . : .: . :: :.:.: .:::.:..:: ::::::. CCDS74 NECLITFLITTDNEGKTIIHSINEKDCPKPPNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVS 590 600 610 620 630 640 750 760 770 780 790 pF1KB5 IHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD .:::.: :::..:::.:... ..::::: :: CCDS74 FHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGSTSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 650 660 670 680 690 >>CCDS7174.1 ITGB1 gene_id:3688|Hs108|chr10 (798 aa) initn: 1444 init1: 468 opt: 2309 Z-score: 1586.8 bits: 304.5 E(32554): 4.6e-82 Smith-Waterman score: 2309; 43.7% identity (71.0% similar) in 775 aa overlap (26-780:25-789) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDF---GSP : : ...: :: ::. :.:.::.. : : : CCDS71 MNLQPIFWIGLISSVCCVFAQTDENRCLKANAKSCGECIQAGPNCGWCTNSTFLQEGMP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSA----GWDVIQMTPQ : .::: : :.:: .::.: .: . .. ......:.: :. :. :: CCDS71 TS--ARCDDLEALKKKGCPPDDIENPRGSKDIKKNKNVTNRSKGTAEKLKPEDITQIQPQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 EIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLT .... :: :. :: :. ...::::.::::::::: ::::::.:..:::: : .:::..: CCDS71 QLVLRLRSGEPQTFTLKFKRAEDYPIDLYYLMDLSYSMKDDLENVKSLGTDLMNEMRRIT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 SNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNE :.::.::::::.: . :. :.: ::: . . ::. :.....: ::.. . ::: CCDS71 SDFRIGFGSFVEKTVMPYISTTPAKLRNPCTSEQ---NCTSPFSYKNVLSLTNKGEVFNE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 EVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGL : :::.: : :.:::::::..:.::: :::: .. .::::.:: :.: ::::::. CCDS71 LVGKQRISGNLDSPEGGFDAIMQVAVCGSLIGWR-NVTRLLVFSTDAGFHFAGDGKLGGI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 VQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALI : :.:::::: : : :: :. .::::.: : .::.::::. :::::.. .::.. :: CCDS71 VLPNDGQCHL-ENNMYTMSHYYDYPSIAHLVQKLSENNIQTIFAVTEEFQPVYKELKNLI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 PGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQ-- : ..: :...:.:.:::::.::::. :.: : : ... . . :..::. :. CCDS71 PKSAVGTLSANSSNVIQLIIDAYNSLSSEVILENGKLSEGVTISYKSYCKNGVNGTGENG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 RKCEGLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGC-SVGL ::: ...::: ..::.:. . .::.. .. : .::.:: . .:: . : : : : : :. CCDS71 RKCSNISIGDEVQFEISITSNKCPKKDSDS-FKIRPLGFTEEVEVILQYICECECQSEGI 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB5 EPNSARCN-GSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGE-NQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGD :.: .:. :.::. :: :.:. : .: .:::. : :. .. ::. ... .::. :. CCDS71 -PESPKCHEGNGTFECGACRCNEGRVGRHCECSTDEVNSEDMDAYCRKENSSEICSNNGE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB5 CSCNQCSCFESE-FGKIY-GPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNC : :.:: : . . ..:: : :::::::.: :..:..:.:.: :.: :.:. .: :. : CCDS71 CVCGQCVCRKRDNTNEIYSGKFCECDNFNCDRSNGLICGGNGVCKCRVCECNPNYTGSAC 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 NCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECL .:: : :::.. .::::. :: : :: :.::.: :. :: : :: .:. ...::.: CCDS71 DCSLDTSTCEASNGQICNGRGICECGVCKCTDPKFQGQTCEMCQTCLGVCAEHKECVQCR 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 LLHSGKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEA-----VLCFYKTAKDCVMMFTYVELP ...:. . :: . : :: :.. : : . : : . :: ..::: CCDS71 AFNKGEKKD-TCTQECSYFNITKVESRDKLPQPVQPDPVSHCKEKDVDDCWFYFTYSVNG 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 SGKSNLTVLREPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSE ... . :...::: . :. . :. .::..:.:.::::: :::::. ::::::::::..: CCDS71 NNEVMVHVVENPECPTGPDIIPIVAGVVAGIVLIGLALLLIWKLLMIIHDRREFAKFEKE 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB5 RSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD . :... . ::.:.. ..: CCDS71 KMNAKWDTGENPIYKSAVTTVVNPKYEGK 770 780 790 >>CCDS63040.1 ITGB6 gene_id:3694|Hs108|chr2 (681 aa) initn: 2139 init1: 879 opt: 2050 Z-score: 1411.7 bits: 271.8 E(32554): 2.6e-72 Smith-Waterman score: 2123; 44.2% identity (67.9% similar) in 756 aa overlap (28-780:23-661) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFGSPRSI :. :.: .::.:::: :.::::..:.: : .. CCDS63 MGIELLCLFFLFLGRNDHVQGGCALGGAETCEDCLLIGPQCAWCAQENFTHPSGV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB5 TSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAVNLR ::: :::. .:: . ::.:.:. ..:.. ::: : . . :..:..:: . ..:: CCDS63 GERCDTPANLLAKGCQLNFIENPVSQVEILKNKPLSV-GRQKNSSDIVQIAPQSLILKLR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 PGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFRLGF :: :.:..:::.:::::::::::::: :: :::..:. ::..:..:: :::::::::: CCDS63 PGGAQTLQVHVRQTEDYPVDLYYLMDLSASMDDDLNTIKELGSRLSKEMSKLTSNFRLGF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 GSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRKQRV ::::.: .::: :.:. .::: . : :.:.:::.:.::::. .. ::: :..:.. CCDS63 GSFVEKPVSPFVKTTPEEIANPCSSIPYF--CLPTFGFKHILPLTNDAERFNEIVKNQKI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 SRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPHDGQ : : :.:::::::..::::::::::::.:.::::::..: :...:.::.:.: :.:: CCDS63 SANIDTPEGGFDAIMQAAVCKEKIGWRNDSLHLLVFVSDADSHFGMDSKLAGIVIPNDGL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 CHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTTVEI :::. :::. :. ..::... : .::..::. ::::::... ::.:.. ::::.:: . CCDS63 CHLDSKNEYSMSTVLEYPTIGQLIDKLVQNNVLLIFAVTQEQVHLYENYAKLIPGATVGL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 LDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCEGLKIG :. :: ::.::::.::. .::.::: : . : ::: ::: :..:. . :.:: .:.: CCDS63 LQKDSGNILQLIISAYEELRSEVELEVLGDTEGLNLSFTAICNNGTLFQHQKKCSHMKVG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 DTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSARCN-G ::::: :... : :...:.. ..:::. :.::. :. .:.: :. .: ::..:. : CCDS63 DTASFSVTVNIPHCE-RRSRHII-IKPVGLGDALELLVSPECNCDCQKEVEVNSSKCHHG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 SGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQCSCFES .:.. ::.: : ::..: :::: ::.. . . :.:: .: ::::::: :.:: : : CCDS63 NGSFQCGVCACHPGHMGPRCEC--GEDM-LSTDSCKEAPDHPSCSGRGDCYCGQCICHLS 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 EFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNCSTDISTCRGRD .:.::::.:.::::::.:.::.::. :.: .: CCDS63 PYGNIYGPYCQCDNFSCVRHKGLLCG-------------------------DFS----KD 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 GQI-CSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHSGKPDNQTC :.. :: .:. ::: CCDS63 GSVSCSLQGEN----------------------------------ECL------------ 560 570 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 HSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLREPECGNT ::. .. :.: ::. . . : .: . CCDS63 --------ITF---LITTDNE-----------------------GKTIIHSINEKDCPKP 580 590 720 730 740 750 760 770 pF1KB5 PNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEMASNPLYRKP :: :.:.: .:::.:..:: ::::::..:::.: :::..:::.:... ..::::: CCDS63 PNIPMIMLGVSLAILLIGVVLLCIWKLLVSFHDRKEVAKFEAERSKAKWQTGTNPLYRGS 600 610 620 630 640 650 780 790 pF1KB5 ISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD :: CCDS63 TSTFKNVTYKHREKQKVDLSTDC 660 670 680 >>CCDS8849.1 ITGB7 gene_id:3695|Hs108|chr12 (798 aa) initn: 1204 init1: 637 opt: 2043 Z-score: 1406.1 bits: 271.0 E(32554): 5.3e-72 Smith-Waterman score: 2043; 40.2% identity (68.5% similar) in 781 aa overlap (20-789:37-792) 10 20 30 40 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWC :.:. :. : : ::..:.: ::.:::: CCDS88 VLVLLLVLSRGESELDAKIPSTGDATEWRNPHLSMLGSCQ--PAPSCQKCILSHPSCAWC 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 SKEDF-GSPRSITSRCDLRANLVKNGCG-GEIESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVI .. .: .: .. . :: : .:. :: :.: : .. .::.. :::. :. : . CCDS88 KQLNFTASGEAEARRCARREELLARGCPLEELEEPRGQQEVLQDQPLSQ---GARGEGAT 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 QMTPQEIAVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEE :..::.. :.::::. .:.. ..: :::::::::::: ::::::. .:.:: : . CCDS88 QLAPQRVRVTLRPGEPQQLQVRFLRAEGYPVDLYYLMDLSYSMKDDLERVRQLGHALLVR 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 MRKLTSNFRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRV ....: . :.:::::::: . :: :.: .:: . : :.:.:.: :: . CCDS88 LQEVTHSVRIGFGSFVDKTVLPFVSTVPSKLRHPCPTR--LERCQSPFSFHHVLSLTGDA 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 DSFNEEVRKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDG ..:..:: .: :: : :.:::::::.::::.:.:.:::: .. .:::::.::. : : :: CCDS88 QAFEREVGRQSVSGNLDSPEGGFDAILQAALCQEQIGWR-NVSRLLVFTSDDTFHTAGDG 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 KLGGLVQPHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKN ::::. .: ::.:::. . :. :...::::.. ... :. ::. :::::. .:.. CCDS88 KLGGIFMPSDGHCHLDSNGLYSRSTEFDYPSVGQVAQALSAANIQPIFAVTSAALPVYQE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 FTALIPGTTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSY .. ::: ..: :. ::.:..:::..::::. : : : . : ... . . :. . CCDS88 LSKLIPKSAVGELSEDSSNVVQLIMDAYNSLSSTVTLEHSSLPPGVHISYESQCEGPEKR 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 PGQR----KCEGLKIGDTASFEVSLEARSC-PSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCT :. .:. ..:..:..: :::.: : : :.. :: .:: . : : . : CCDS88 EGKAEDRGQCNHVRINQTVTFWVSLQATHCLP---EPHLLRLRALGFSEELIVELHTLCD 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KB5 CGCSVGLEPNSARC-NGSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQDGENQSV-YQNLCREAEGK- :.:: .:.. .: .:.: ::.: :.:: :: :::. .: .: .. :: .: CCDS88 CNCS-DTQPQAPHCSDGQGHLQCGVCSCAPGRLGRLCECSVAELSSPDLESGCRAPNGTG 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB5 PLCSGRGDCSCNQCSCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAG :::::.: :.:..::: :. : .::::. :: :..:.::.: :.:.:: :.:::. CCDS88 PLCSGKGHCQCGRCSCS----GQSSGHLCECDDASCERHEGILCGGFGRCQCGVCHCHAN 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KB5 YIGDNCNCSTDISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKR : :.:: :...: . .: .:: .:.: :..::: . : .: .:..:: : : .: CCDS88 RTGRACECSGDMDSCISPEGGLCSGHGRCKCNRCQCLD-GYYGALCDQCPGCKTPCERHR 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KB5 DCVECLLLHSGKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVEL ::.:: ...: : .: . : .: . . . :: : .: : ..: :: CCDS88 DCAECGAFRTG-PLATNCSTACAHTNVTLALAPILDDG---WCKERTL-DNQLFFFLVE- 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KB5 PSGKSNLTVLR-EPECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQ . . .::: .:. .. ....:.:. ::.:. :::.:. ..: : :.::::...:. CCDS88 -DDARGTVVLRVRPQEKGADHTQAIVLGCVGGIVAVGLGLVLAYRLSVEIYDRREYSRFE 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 pF1KB5 SERSRARYEMASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD .:... ... :::::.. :.: :.. :.. CCDS88 KEQQQLNWKQDSNPLYKSAITT-TINPRFQEADSPTL 770 780 790 >>CCDS13716.1 ITGB2 gene_id:3689|Hs108|chr21 (769 aa) initn: 1363 init1: 332 opt: 1803 Z-score: 1243.3 bits: 240.9 E(32554): 6.3e-63 Smith-Waterman score: 1930; 38.9% identity (66.7% similar) in 786 aa overlap (7-780:7-760) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDF---GSP :: : :.:: .: :. . ::. ...::.::. : :.::.: .: :.: CCDS13 MLGLRPPLLA-LVGLLSLGCVLS--QECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLNFTGPGDP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEIAV :: ::: : .:. ::... : .:.: : . .:. . :..::.... CCDS13 DSI--RCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTS----LAETQEDHNGGQK------QLSPQKVTL 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 NLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSNFR ::::. ..:.. :... ::.::::::::: :: ::: :...:: : . . ..: . : CCDS13 YLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLGGDLLRALNEITESGR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 LGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEVRK .:::::::: . :: : : ::: . . .: : :.:::.: ::. ..:. :: : CCDS13 IGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKE--KECQPPFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGK 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 QRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQPH : .: : ::::::.::..:.:.: :.:::: .. .::::.::: :.: :::::... :. CCDS13 QLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEIGWR-NVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 DGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPGTT ::.::: : : : ::..::::.. :..:::::::. :::::. :...: .:: .. CCDS13 DGRCHL-EDNLYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 VEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRK--CE : :. ::.:...:: ::::.. :.: :. :. :.. . . :..::.. .: . :. CCDS13 VGELSEDSSNVVHLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDCD 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 GLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSA :..:. .:.:.. : : . :. :..: .:: : . : : .: : : . . CCDS13 GVQINVPITFQVKVTATECIQ---EQSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCR-DQSRDRS 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 RCNGSGTYVCGLCECSPGYLGTRCECQ-DGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQC :.:.: ::.:.:. ::.: :::: .:.... .. ::. ... .::: ::: :.:: CCDS13 LCHGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKDNNSIICSGLGDCVCGQC 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 pF1KB5 SCFESEF-GK-IYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGE--CHCGECKCHAGYIGDNCNCST : :. :: ::: .::::...: : .: .:.: :. : ::.:.:: :. :. :.: CCDS13 LCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCGGPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCER 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KB5 DISTCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHS : . :: ::.: :. :.: . : .:..:: ::. :. .:.::: ... CCDS13 TTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNVCEC-HSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEK 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KB5 GKPDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVL : : ...: . : .. .. :: : . .. : . .: . . : . CCDS13 G-PFGKNCSAACPGLQLS--NNPVKGRT----CKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYV 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 pF1KB5 REP-ECGNTPNAMTILLAVVGSILLVGLALLAIWKLLVTIHDRREFAKFQSERSRARYEM : :: :: .:. ..:..:.:.:. ::.::: :. . : ::. .:..:. ..... CCDS13 DESRECVAGPNIAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWN- 690 700 710 720 730 740 770 780 790 pF1KB5 ASNPLYRKPISTHTVDFTFNKFNKSYNGTVD .:::... .: CCDS13 NDNPLFKSATTTVMNPKFAES 750 760 >>CCDS5370.1 ITGB8 gene_id:3696|Hs108|chr7 (769 aa) initn: 1818 init1: 372 opt: 1629 Z-score: 1125.1 bits: 219.0 E(32554): 2.4e-56 Smith-Waterman score: 1808; 39.5% identity (71.4% similar) in 640 aa overlap (26-661:45-661) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MPRAPAPLYACLLGLCALLPRLAGLNICTSGSATSCEECLLIHPKCAWCSKEDFG : :.:..:.:: .:: . :.:.:: .::: CCDS53 CLQNDRRGPASFLWAAWVFSLVLGLGQGEDNRCASSNAASCARCLALGPECGWCVQEDFI 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 SPRSITSRCDLRANLVKNGCGGE-IESPASSFHVLRSLPLSSKGSGSAGWDVIQMTPQEI : : . :::. .::...::. . :: : : ::. .: .. . :.:: :. CCDS53 SGGSRSERCDIVSNLISKGCSVDSIEYP--SVHVI--IPTENEIN-------TQVTPGEV 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AVNLRPGDKTTFQLQVRQVEDYPVDLYYLMDLSLSMKDDLDNIRSLGTKLAEEMRKLTSN ...:::: ...:.:.:. .. ::::::::.:.: ::....... :.:. :...: .. . CCDS53 SIQLRPGAEANFMLKVHPLKKYPVDLYYLVDVSASMHNNIEKLNSVGNDLSRKMAFFSRD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 FRLGFGSFVDKDISPFSYTAPRYQTNPCIGYKLFPNCVPSFGFRHLLPLTDRVDSFNEEV :::::::.::: .::. :. : : :.: .:.: :. :.: ::. . :.. : CCDS53 FRLGFGSYVDKTVSPYISIHPERIHNQCSDYNL--DCMPPHGYIHVLSLTENITEFEKAV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 RKQRVSRNRDAPEGGFDAVLQAAVCKEKIGWRKDALHLLVFTTDDVPHIALDGKLGGLVQ ..:..: : :.:::::::.::::::. .:::::.: .::. ::.. :.:::.::.:.: CCDS53 HRQKISGNIDTPEGGFDAMLQAAVCESHIGWRKEAKRLLLVMTDQTSHLALDSKLAGIVV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 PHDGQCHLNEANEYTASNQMDYPSLALLGEKLAENNINLIFAVTKNHYMLYKNFTALIPG :.::.::: . : :. :. :..:::. :.::: .::::.:::: ... ::.. :.:: CCDS53 PNDGNCHL-KNNVYVKSTTMEHPSLGQLSEKLIDNNINVIFAVQGKQFHWYKDLLPLLPG 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 TTVEILDGDSKNIIQLIINAYNSIRSKVELSVWDQPEDLNLFFTATCQDGVSYPGQRKCE : . ... . :. .:...::... :.:...: .: . . . .:: : :: ::.. :. CCDS53 TIAGEIESKAANLNNLVVEAYQKLISEVKVQVENQVQGIYFNITAICPDGSRKPGMEGCR 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 GLKIGDTASFEVSLEARSCPSRHTEHVFALRPVGFRDSLEVGVTYNCTCGCSVGLEPNSA .. .: . :.:.. ..: .. ..:.:: .. .. . ::.: : . :.. CCDS53 NVTSNDEVLFNVTVTMKKCDVTGGKNYAIIKPIGFNETAKIHIHRNCSCQCEDNRGPKG- 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 RCNGSGTYVCGLC-ECSPGYLGTRCECQDGENQSVYQNLCREAEGKPLCSGRGDCSCNQC .: :.. . : .:. . .:. :.: .. :. . .:.::::: : :..: CCDS53 KCVDE-TFLDSKCFQCDEN------KCHFDEDQFSSES-CKSHKDQPVCSGRGVCVCGKC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB5 SCFESEFGKIYGPFCECDNFSCARNKGVLCSGHGECHCGECKCHAGYIGDNCNC-STDIS :: . ..::.:: .:: :.::: ..: ::.:::::. :.:.: .:. :: :.: :. . CCDS53 SCHKIKLGKVYGKYCEKDDFSCPYHHGNLCAGHGECEAGRCQCFSGWEGDRCQCPSAAAQ 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB5 TCRGRDGQICSERGHCLCGQCQCTEPGAFGEMCEKCPTCPDACSTKRDCVECLLLHS-GK : . ::.:: :: :.::.:.::.: ..:..::.:::: ::. . .:..:: :. .. CCDS53 HCVNSKGQVCSGRGTCVCGRCECTDPRSIGRFCEHCPTCYTACKENWNCMQCLHPHNLSQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB5 PDNQTCHSLCRDEVITWVDTIVKDDQEAVLCFYKTAKDCVMMFTYVELPSGKSNLTVLRE . :.. : CCDS53 AILDQCKTSCALMEQQHYVDQTSECFSSPSYLRIFFIIFIVTFLIGLLKVLIIRQVILQW 660 670 680 690 700 710 799 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 21:14:34 2016 done: Sat Nov 5 21:14:34 2016 Total Scan time: 3.530 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]