Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6475
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6475, 326 aa
  1>>>pF1KB6475 326 - 326 aa - 326 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9395+/-0.00119; mu= -9.1902+/- 0.068
 mean_var=281.4169+/-67.265, 0's: 0 Z-trim(107.1): 659  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.076454
 statistics sampled from 8601 (9372) to 8601 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.288), width:  16
 Scan time:  2.560

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7            ( 326) 2171 253.5 1.7e-67
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12           ( 303) 1396 167.9 8.9e-42
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297)  879 110.9 1.3e-24
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  867 109.6 3.3e-24
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298)  851 107.8 1.1e-23
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 748)  784 100.8 3.7e-21
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 782)  784 100.8 3.8e-21
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 795)  784 100.8 3.9e-21
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 770)  778 100.1   6e-21
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 779)  778 100.1   6e-21
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 780)  778 100.1   6e-21
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 783)  778 100.1 6.1e-21
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 360)  719 93.3 3.1e-19
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523)  684 89.6 5.9e-18
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523)  684 89.6 5.9e-18
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  668 87.7 1.5e-17
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 292)  665 87.3 1.6e-17
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7           (1452)  673 88.7   3e-17
CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17        (1481)  673 88.8   3e-17
CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17        (1490)  673 88.8   3e-17
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7           (1512)  673 88.8 3.1e-17
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496)  627 83.3 4.4e-16
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502)  627 83.3 4.5e-16
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570)  627 83.3 4.9e-16
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 340)  621 82.5 5.3e-16
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1          ( 474)  624 83.0 5.4e-16
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1           ( 504)  624 83.0 5.6e-16
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 423)  621 82.6 6.2e-16
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7           ( 451)  621 82.6 6.5e-16
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 469)  621 82.6 6.7e-16
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  601 80.3 2.5e-15
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22         ( 360)  600 80.2 2.7e-15
CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9            ( 372)  600 80.2 2.8e-15
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 272)  585 78.5   7e-15
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          ( 960)  593 79.8 9.8e-15
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          (1030)  593 79.8   1e-14
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6          ( 365)  579 77.9 1.4e-14
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2          ( 384)  576 77.6 1.8e-14
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 400)  576 77.6 1.9e-14
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 429)  576 77.6   2e-14
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360)  572 77.1 2.3e-14
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22        ( 367)  571 77.0 2.5e-14
CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14            ( 419)  570 77.0   3e-14
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 583)  573 77.4 3.1e-14
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6             ( 623)  573 77.4 3.3e-14
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 648)  573 77.4 3.4e-14
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17          ( 527)  566 76.6 4.9e-14
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6            ( 632)  564 76.4 6.6e-14
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14          ( 358)  550 74.7 1.2e-13
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360)  548 74.5 1.5e-13


>>CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7                 (326 aa)
 initn: 2171 init1: 2171 opt: 2171  Z-score: 1325.0  bits: 253.5 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 2171; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 EVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALTSVV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 VTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 EDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYF
              250       260       270       280       290       300

              310       320      
pF1KB6 QDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
              310       320      

>>CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12                (303 aa)
 initn: 1370 init1: 1242 opt: 1396  Z-score: 863.5  bits: 167.9 E(32554): 8.9e-42
Smith-Waterman score: 1396; 70.2% identity (88.0% similar) in 299 aa overlap (9-304:2-299)

               10        20        30        40        50          
pF1KB6 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEG---MPLS
               : ..:: ::::: :::: :.::::  ..:.::::: ::: .:  :   .:.:
CCDS89        MATSRYEPVAEIGVGAYGTVYKARD-PHSGHFVALKSVRVPNGGGGGGGLPIS
                      10        20         30        40        50  

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 TIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGV
       :.::::.::.::.:::::::::.:::..:::::: :.::::::::::: :::::.: ::.
CCDS89 TVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGL
             60        70        80        90       100       110  

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 PTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMALT
       :.:::::.: :.::::::::.. .:::::::.::::::.: .::::::::::::.:::::
CCDS89 PAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMALT
            120       130       140       150       160       170  

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 SVVVTLWYRAPEVLLQSSYATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGL
        ::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::: :.:..::::::.:.:::
CCDS89 PVVVTLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGL
            180       190       200       210       220       230  

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 PGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSH
       : :.::::::.::: ::  .. .:... : ...: : .:::. ::::: :::::. ::.:
CCDS89 PPEDDWPRDVSLPRGAFPPRGPRPVQSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQH
            240       250       260       270       280       290  

       300       310       320      
pF1KB6 PYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
        :..  :                      
CCDS89 SYLHKDEGNPE                  
            300                     

>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10                (297 aa)
 initn: 682 init1: 217 opt: 879  Z-score: 555.4  bits: 110.9 E(32554): 1.3e-24
Smith-Waterman score: 879; 46.3% identity (76.3% similar) in 300 aa overlap (11-304:2-291)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIR
                 ..:  . .::::.:: :.:.:  :. :. ::.:..:... :::.: ..::
CCDS44          MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRH-KTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIR
                        10        20         30        40        50

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 EVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPG--VP
       :...:..:.   :::.: : ::       ....: :.:: ...::  :::..: ::  . 
CCDS44 EISLLKELR---HPNIVSLQDVLM-----QDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIP-PGQYMD
                  60        70             80        90        100 

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB6 TETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMAL-T
       .  .:....:.:.:. : ::.::.::::::::.:. ..: :::::::::: ... . . :
CCDS44 SSLVKSYLYQILQGIVFCHSRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYT
             110       120       130       140       150       160 

       180       190        200       210       220       230      
pF1KB6 SVVVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIG
         :::::::.::::: :. :.::::.::.: ::::.  .::::.:.:..::: .:. ..:
CCDS44 HEVVTLWYRSPEVLLGSARYSTPVDIWSIGTIFAELATKKPLFHGDSEIDQLFRIFRALG
             170       180       190       200       210       220 

        240       250         260       270       280       290    
pF1KB6 LPGEEDWPRDVALP--RQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSA
        :..: ::.  .:   ...: . .   . . : ..:: : ::: : : ..::::::.  :
CCDS44 TPNNEVWPEVESLQDYKNTFPKWKPGSLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMA
             230       240       250       260       270       280 

          300       310       320      
pF1KB6 LSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       :.::::.::.                      
CCDS44 LNHPYFNDLDNQIKKM                
             290                       

>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17               (305 aa)
 initn: 761 init1: 318 opt: 867  Z-score: 548.1  bits: 109.6 E(32554): 3.3e-24
Smith-Waterman score: 928; 48.0% identity (77.0% similar) in 296 aa overlap (13-304:4-290)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIR
                   .. : .::::.:: :.::.. .. :..::::..:..   ::.: ..::
CCDS11          MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKN-RETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIR
                        10        20         30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 EVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTE
       :...:..:.   :::.:::.::     .  : :: :::: ..:::  :.:..:   .: .
CCDS11 EISLLKELK---HPNIVRLLDV-----VHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLH
                  60             70        80        90       100  

              130       140       150       160       170          
pF1KB6 TIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSV
        ::...::::.:..: :::::.::::::::.:..  : :::::::::: ..  . . :  
CCDS11 LIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHE
            110       120       130       140       150       160  

     180       190        200       210       220       230        
pF1KB6 VVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLP
       ::::::::::.:: :. :.: ::.::.:::::::  :: :: :.:..::: .:. ..: :
CCDS11 VVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTP
            170       180       190       200       210       220  

      240       250         260       270       280       290      
pF1KB6 GEEDWPRDVALP--RQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALS
       .:. ::  . ::  . .: . . . .:..: ...  :.:::.. : ..:..::.: .::.
CCDS11 SEDTWPGVTQLPDYKGSFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALA
            230       240       250       260       270       280  

        300       310       320      
pF1KB6 HPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       ::::.. :                      
CCDS11 HPYFSSPEPSPAARQYVLQRFRH       
            290       300            

>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12                (298 aa)
 initn: 780 init1: 321 opt: 851  Z-score: 538.7  bits: 107.8 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 918; 48.5% identity (73.6% similar) in 299 aa overlap (11-305:2-291)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNGGRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIR
                 .... : .::::.:: :.:::. :  :. ::::..:..:  ::.: ..::
CCDS88          MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARN-KLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIR
                        10        20         30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 EVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTE
       :...:..:.   :::.:.:.::        :.:: :::: . :::  ..:     :.:  
CCDS88 EISLLKELN---HPNIVKLLDV-----IHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLP
                  60             70        80        90       100  

              130       140       150       160       170          
pF1KB6 TIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSV
        ::...::::.:: : :::::.::::::::.:... : :::::::::: ..  . . :  
CCDS88 LIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHE
            110       120       130       140       150       160  

     180       190        200       210       220       230        
pF1KB6 VVTLWYRAPEVLLQSSY-ATPVDLWSVGCIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLP
       ::::::::::.::  .: .: ::.::.:::::::  :. :: :.:..::: .:. ..: :
CCDS88 VVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTP
            170       180       190       200       210       220  

      240       250         260       270       280       290      
pF1KB6 GEEDWPRDVALP--RQAFHSKSAQPIEKFVTDIDELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALS
        :  ::  ...:  . .: . . : . : :  .:: :..:: . : ..: ::::: .::.
CCDS88 DEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALA
            230       240       250       260       270       280  

        300       310       320      
pF1KB6 HPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA
       ::.:::. .                     
CCDS88 HPFFQDVTKPVPHLRL              
            290                      

>>CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1               (748 aa)
 initn: 496 init1: 220 opt: 784  Z-score: 493.3  bits: 100.8 E(32554): 3.7e-21
Smith-Waterman score: 784; 40.7% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (7-302:385-678)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNG
                                     ::. ....:. .: ::.:: :..:.: :. 
CCDS72 TEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKD-KKT
          360       370       380       390       400       410    

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 GRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTL
        ..:::::....  .::.:....::. ..  :.. .:::.: . .. . :  :   :. .
CCDS72 DEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTI--LKA-QHPNIVTVREIVVGSNMD---KIYI
           420       430       440          450       460          

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 VFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSS
       :...:..:: . .. . .: .: : .: .:.:::::.  ::.. ..::::: .:.:.. .
CCDS72 VMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGE-VKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHA
       470       480       490        500       510       520      

        160       170        180       190        200       210    
pF1KB6 GQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSVVVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFR
       : .:..:::::: :.  . : : :::::::::::.:: .. :.: ::.:::::::.:.. 
CCDS72 GILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLT
        530       540       550       560       570       580      

          220       230       240       250       260           270
pF1KB6 RKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPI----EKFVTDID
       .:::: :.:..::..:..  .: :.:. ::    ::     . : .:     ..: . ..
CCDS72 QKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLS
        590       600       610       620       630       640      

              280       290       300       310       320          
pF1KB6 ELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA    
       . : ::. : ::. :..:::: ..:.: ::..                            
CCDS72 DQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSP
        650       660       670       680       690       700      

CCDS72 RPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
        710       720       730       740        

>>CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1               (782 aa)
 initn: 496 init1: 220 opt: 784  Z-score: 493.1  bits: 100.8 E(32554): 3.8e-21
Smith-Waterman score: 784; 40.7% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (7-302:419-712)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNG
                                     ::. ....:. .: ::.:: :..:.: :. 
CCDS72 TEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKD-KKT
      390       400       410       420       430       440        

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 GRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTL
        ..:::::....  .::.:....::. ..  :.. .:::.: . .. . :  :   :. .
CCDS72 DEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTI--LKA-QHPNIVTVREIVVGSNMD---KIYI
       450       460       470          480       490          500 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 VFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSS
       :...:..:: . .. . .: .: : .: .:.:::::.  ::.. ..::::: .:.:.. .
CCDS72 VMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGE-VKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHA
             510       520        530       540       550       560

        160       170        180       190        200       210    
pF1KB6 GQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSVVVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFR
       : .:..:::::: :.  . : : :::::::::::.:: .. :.: ::.:::::::.:.. 
CCDS72 GILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLT
              570       580       590       600       610       620

          220       230       240       250       260           270
pF1KB6 RKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPI----EKFVTDID
       .:::: :.:..::..:..  .: :.:. ::    ::     . : .:     ..: . ..
CCDS72 QKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLS
              630       640       650       660       670       680

              280       290       300       310       320          
pF1KB6 ELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA    
       . : ::. : ::. :..:::: ..:.: ::..                            
CCDS72 DQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSP
              690       700       710       720       730       740

CCDS72 RPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
              750       760       770       780  

>>CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1               (795 aa)
 initn: 496 init1: 220 opt: 784  Z-score: 493.0  bits: 100.8 E(32554): 3.9e-21
Smith-Waterman score: 784; 40.7% identity (74.5% similar) in 302 aa overlap (7-302:432-725)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNG
                                     ::. ....:. .: ::.:: :..:.: :. 
CCDS72 TEGDYVPDSPALSPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKD-KKT
             410       420       430       440       450        460

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 GRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTL
        ..:::::....  .::.:....::. ..  :.. .:::.: . .. . :  :   :. .
CCDS72 DEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTI--LKA-QHPNIVTVREIVVGSNMD---KIYI
              470       480         490        500       510       

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 VFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSS
       :...:..:: . .. . .: .: : .: .:.:::::.  ::.. ..::::: .:.:.. .
CCDS72 VMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGE-VKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHA
          520       530        540       550       560       570   

        160       170        180       190        200       210    
pF1KB6 GQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSVVVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFR
       : .:..:::::: :.  . : : :::::::::::.:: .. :.: ::.:::::::.:.. 
CCDS72 GILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLT
           580       590       600       610       620       630   

          220       230       240       250       260           270
pF1KB6 RKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPI----EKFVTDID
       .:::: :.:..::..:..  .: :.:. ::    ::     . : .:     ..: . ..
CCDS72 QKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLS
           640       650       660       670       680       690   

              280       290       300       310       320          
pF1KB6 ELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA    
       . : ::. : ::. :..:::: ..:.: ::..                            
CCDS72 DQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSP
           700       710       720       730       740       750   

CCDS72 RPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
           760       770       780       790     

>>CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1            (770 aa)
 initn: 498 init1: 222 opt: 778  Z-score: 489.6  bits: 100.1 E(32554): 6e-21
Smith-Waterman score: 778; 40.4% identity (74.2% similar) in 302 aa overlap (7-302:407-700)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNG
                                     ::. ....:. .: ::.:: :..:.: :. 
CCDS44 TEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKD-KKT
        380       390       400       410       420       430      

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 GRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTL
        ..:::::....  .::.:....::. ..  :.. .:::.: . .. . :  :   :. .
CCDS44 DEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTI--LKA-QHPNIVTVREIVVGSNMD---KIYI
         440       450       460          470       480            

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 VFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSS
       :...:..:: . .. . .: .: : .: .:.:::::.  ::.. ..::::: .:.:.. .
CCDS44 VMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGE-VKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHA
     490       500       510        520       530       540        

        160       170        180       190        200       210    
pF1KB6 GQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSVVVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFR
       : .:..:::::: :.  . : : :::: ::::::.:: .. :.: ::.:::::::.:.. 
CCDS44 GILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLT
      550       560       570       580       590       600        

          220       230       240       250       260           270
pF1KB6 RKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPI----EKFVTDID
       .:::: :.:..::..:..  .: :.:. ::    ::     . : .:     ..: . ..
CCDS44 QKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLS
      610       620       630       640       650       660        

              280       290       300       310       320          
pF1KB6 ELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA    
       . : ::. : ::. :..:::: ..:.: ::..                            
CCDS44 DQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSP
      670       680       690       700       710       720        

CCDS44 RPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
      730       740       750       760       770

>>CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1            (779 aa)
 initn: 498 init1: 222 opt: 778  Z-score: 489.5  bits: 100.1 E(32554): 6e-21
Smith-Waterman score: 778; 40.4% identity (74.2% similar) in 302 aa overlap (7-302:416-709)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MEKDGLCRADQQYECVAEIGEGAYGKVFKARDLKNG
                                     ::. ....:. .: ::.:: :..:.: :. 
CCDS81 TEGDYVPDSPALLPIELKQELPKYLPALQGCRSVEEFQCLNRIEEGTYGVVYRAKD-KKT
         390       400       410       420       430       440     

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB6 GRFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETKLTL
        ..:::::....  .::.:....::. ..  :.. .:::.: . .. . :  :   :. .
CCDS81 DEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTI--LKA-QHPNIVTVREIVVGSNMD---KIYI
          450       460       470          480       490           

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB6 VFEHVDQDLTTYLDKVPEPGVPTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQNILVTSS
       :...:..:: . .. . .: .: : .: .:.:::::.  ::.. ..::::: .:.:.. .
CCDS81 VMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGE-VKTLMIQLLRGVKHLHDNWILHRDLKTSNLLLSHA
      500       510       520        530       540       550       

        160       170        180       190        200       210    
pF1KB6 GQIKLADFGLARIYSFQM-ALTSVVVTLWYRAPEVLLQSS-YATPVDLWSVGCIFAEMFR
       : .:..:::::: :.  . : : :::: ::::::.:: .. :.: ::.:::::::.:.. 
CCDS81 GILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVDMWSVGCIFGELLT
       560       570       580       590       600       610       

          220       230       240       250       260           270
pF1KB6 RKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPI----EKFVTDID
       .:::: :.:..::..:..  .: :.:. ::    ::     . : .:     ..: . ..
CCDS81 QKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHPYNNLRKRFGALLS
       620       630       640       650       660       670       

              280       290       300       310       320          
pF1KB6 ELGKDLLLKCLTFNPAKRISAYSALSHPYFQDLERCKENLDSHLPPSQNTSELNTA    
       . : ::. : ::. :..:::: ..:.: ::..                            
CCDS81 DQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPAKSEQQRVKRGTSP
       680       690       700       710       720       730       

CCDS81 RPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF
       740       750       760       770         




326 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 17:19:48 2016 done: Fri Nov  4 17:19:49 2016
 Total Scan time:  2.560 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com