Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8364
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8364, 483 aa
1>>>pF1KB8364 483 - 483 aa - 483 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3068+/-0.000544; mu= -4.5844+/- 0.033
mean_var=358.6767+/-75.416, 0's: 0 Z-trim(116.4): 151 B-trim: 436 in 2/53
Lambda= 0.067721
statistics sampled from 27354 (27509) to 27354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 10.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 2985 306.2 1.4e-82
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 2985 306.2 1.4e-82
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 2985 306.2 1.4e-82
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 1739 184.5 7e-46
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 1715 182.1 3.4e-45
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 1711 181.8 4.5e-45
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 1703 181.0 7.7e-45
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 1696 180.3 1.2e-44
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 1686 179.2 2.1e-44
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 1652 176.0 2.6e-43
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1627 173.4 1.1e-42
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 1595 170.4 1.1e-41
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 1571 168.1 6.4e-41
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 1565 167.5 9.7e-41
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1505 161.6 5e-39
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1506 161.8 5.2e-39
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1498 161.0 8.6e-39
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1498 161.0 8.6e-39
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1485 159.6 1.9e-38
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1485 159.6 1.9e-38
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1474 158.6 4.1e-38
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 1455 156.8 1.5e-37
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1451 156.2 1.7e-37
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1450 156.1 1.7e-37
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1447 155.9 2.5e-37
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1435 154.7 5e-37
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1426 153.9 1e-36
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1421 153.4 1.4e-36
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1388 150.2 1.3e-35
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1362 147.6 7.4e-35
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1362 147.6 7.4e-35
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1362 147.7 8.2e-35
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1360 147.4 8.9e-35
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1357 147.1 1.1e-34
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1349 146.3 1.8e-34
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1249 136.5 1.5e-31
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1249 136.5 1.5e-31
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1111 123.0 1.6e-27
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1083 120.3 1.1e-26
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1078 119.8 1.5e-26
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1042 116.1 1.3e-25
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1005 112.6 1.9e-24
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 997 111.9 3.9e-24
NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295) 887 101.0 4.9e-21
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 862 98.5 2.5e-20
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508) 864 99.0 3.4e-20
NP_006253 (OMIM: 105400,170710) peripherin [Homo s ( 470) 858 98.3 4.8e-20
XP_005269082 (OMIM: 105400,170710) PREDICTED: peri ( 471) 858 98.3 4.8e-20
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 856 98.1 5.5e-20
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 856 98.1 5.5e-20
>>NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele (483 aa)
initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985 Z-score: 1603.7 bits: 306.2 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LPK
:::
NP_001 LPK
>>NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskeletal (483 aa)
initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985 Z-score: 1603.7 bits: 306.2 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LPK
:::
NP_002 LPK
>>NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele (511 aa)
initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985 Z-score: 1603.4 bits: 306.2 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:29-511)
10 20 30
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNGVSWSQDLQEGISAWFGPPASTPASTMSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 EQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_001 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELES
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 KLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSF
430 440 450 460 470 480
460 470 480
pF1KB8 SRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
490 500 510
>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17 (590 aa)
initn: 1352 init1: 1295 opt: 1739 Z-score: 944.7 bits: 184.5 E(85289): 7e-46
Smith-Waterman score: 1739; 62.1% identity (83.4% similar) in 470 aa overlap (1-458:74-536)
10 20 30
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPG
.:: .. :.. . : : .. .. .: :
NP_000 GGFGRVSLAGACGVGGYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFR-NRFGAGAGGGYGFGGGAG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KB8 SRI-----SSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQ
: . ....:. :...: ::.:: . ::: ::::::::.:: :..::.::
NP_000 SGFGFGGGAGGGFGLGGGAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQ
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 AVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDNMFESY
:::.:.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::.: ::.:.:.. .::.:
NP_000 RVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQY
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 INNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVA
::::::::... :. .:..:: ::: ::::::::::::::::: :::::..:::::.:
NP_000 INNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAA
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 YMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEV
::::::::.....: :::::...... :. ..:...:::::::::::.:.::.:::::::
NP_000 YMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEV
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 KAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEG
:::::.::::::.:::: :: ::::::. ::.:::::: :: ::::::: :.::.:::..
NP_000 KAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDN
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLA
.: : :.:. ::::::::::::.::: ::.::: :::.::::::: :::::::::.:::
NP_000 VKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLA
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430
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::.::::::::::::: :: . : :.:. :.. .:::..: :.::: ::. .:
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:...:.: ::.:: : :::
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10 20 30
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: ..: .: .: . ..: ::: ..: .
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40 50 60 70 80
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10 20 30
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40 50 60 70 80
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pF1KB8 MFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKK
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NP_775 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
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NP_775 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
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pF1KB8 AEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELM
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NP_775 SEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
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>>NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II cytos (564 aa)
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10 20 30
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSS-S
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40 50 60 70 80
pF1KB8 FSRVGSS-NFRGG------LGGGYGGASGMGG----------ITAVTVNQSLLSPLVLEV
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pF1KB8 DPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDN
:: :: ::..:.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::.: ::.:.:..
NP_005 DPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
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pF1KB8 MFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKK
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NP_005 LFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
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pF1KB8 DVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDS
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NP_005 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
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pF1KB8 IIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQ
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NP_005 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
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pF1KB8 AEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELM
.::. .: : :.:.:::::::::::.:.:::. :: :: :::.::::.:: :.::::::
NP_005 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
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pF1KB8 NVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI-HTKTTSGYAGGLSSAYGGL-TSP
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NP_005 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGY-GGASGVGSGLGLGG
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pF1KB8 GLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
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NP_005 GSSYSYGSGLGVGGGFSS----SSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
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pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSR
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pF1KB8 TLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDNMFESYINNLRRQLETL
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NP_004 TLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESI
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160 170 180 190 200 210
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..: .::::...... :. .::.:..::::::::::.:.::.::::::::::::::::::
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280 290 300 310 320 330
pF1KB8 RAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAA
:::::: :: :::::: ::.:::::: :: ::::::: :.::.:::...: : .::..:
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 IADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKL
:::::::::::.::: ::: .:: :::.::::::: :::::::::.:::::.::::::::
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: :.:.:: ::.
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: : :: :::.:. .. ::. ..:::. .:.: : .. ..::
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::::::::::.:: :::::..:::::.:::.:::::.....:.::::::: : : :. :
NP_005 FKNKYEDEINHRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTE
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pF1KB8 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAG
:::::::::::::::::::::.:.::::::::::..:. ::::::. :: :.: ::. ::
NP_005 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAG
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pF1KB8 KHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLS
::::::: :..::::::: :.::::::...:.:::.::::::.::.:::::.::: ::
NP_005 KHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQE
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI
::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: . : :.:.
NP_005 ELEAALQRGKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISV
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pF1KB8 HTKTTSGYAGGLSSAYG-GLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRD
..: :: ::. : ::: : : . ::.:.:: . . .. : :.. ... .::
NP_005 MNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPG-LLKAYSIRTASASRRSARD
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480
pF1KB8 GKLVSESSDVLPK
>>NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II cytos (628 aa)
initn: 1618 init1: 1241 opt: 1652 Z-score: 898.5 bits: 176.0 E(85289): 2.6e-43
Smith-Waterman score: 1652; 60.8% identity (83.3% similar) in 449 aa overlap (16-454:127-566)
10 20 30 40
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSN
: .:.. . .:::. .:..:. :: .
NP_476 FGSGYGGGFGGGFGGGRGMGGGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLG
100 110 120 130 140 150
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pF1KB8 FRGGLG-GGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFAS
::.: ::. : :: ::.:::::.:: .:.::.: :..::.::::::::::::
NP_476 SPGGFGPGGFPG-----GIQEVTINQSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFAS
160 170 180 190 200 210
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pF1KB8 FIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTAR----SNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLK
:::::::::::::.:::::.::::: :. .:.. .::..:: :: :... :. .
NP_476 FIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQGTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB8 LEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDE
:..:: ::. ::::::.:::::::::: ::::: .::::: ::::::::......: ::
NP_476 LDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDE
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 INFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAES
:.::: ::. :. ..::.::::::::::::.::::.:::::::.:::::::.::.::::.
NP_476 IDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVVLSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEA
340 350 360 370 380 390
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