Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8364
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8364, 483 aa
1>>>pF1KB8364 483 - 483 aa - 483 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4701+/-0.00122; mu= 5.4374+/- 0.072
mean_var=273.4849+/-55.600, 0's: 0 Z-trim(108.7): 111 B-trim: 85 in 1/53
Lambda= 0.077555
statistics sampled from 10279 (10386) to 10279 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 2985 347.8 1.5e-95
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 2985 347.9 1.5e-95
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 1739 208.5 1.6e-53
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 1715 205.8 9.8e-53
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 1711 205.4 1.3e-52
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 1703 204.5 2.5e-52
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 1696 203.7 4.2e-52
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 1686 202.5 8.3e-52
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 1652 198.8 1.4e-50
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 1595 192.3 1e-48
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 1571 189.8 7.5e-48
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 1565 189.1 1.2e-47
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 1505 182.3 1.1e-45
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1506 182.5 1.2e-45
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 1498 181.6 2.1e-45
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 1485 180.0 5.1e-45
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 1474 178.8 1.3e-44
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 1455 176.7 5.7e-44
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 1447 175.8 9.9e-44
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 1426 173.4 5.1e-43
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 1421 172.9 7.3e-43
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 1388 169.2 9.5e-42
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 1362 166.2 6.9e-41
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 1360 166.1 8.4e-41
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 1357 165.7 1e-40
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 1349 164.8 1.9e-40
CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 410) 1111 138.1 1.8e-32
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 1083 135.0 1.6e-31
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 1078 134.4 2.3e-31
CCDS53795.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 469) 997 125.4 1.3e-28
CCDS73472.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 295) 887 112.8 5e-25
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 858 109.8 6.4e-24
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 856 109.6 7.4e-24
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 832 106.9 4.8e-23
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 803 103.8 5e-22
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 745 97.1 3.9e-20
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 743 96.9 4.5e-20
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 743 96.9 4.6e-20
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 744 97.4 6.8e-20
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 715 93.9 4.4e-19
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 644 85.9 1e-16
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 643 85.8 1.1e-16
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 645 86.1 1.1e-16
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 640 85.4 1.3e-16
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 629 84.2 3.3e-16
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 628 84.5 5.9e-16
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 618 83.0 7.8e-16
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 617 82.8 7.9e-16
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 580 78.8 1.5e-14
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 566 77.1 4.1e-14
>>CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 (483 aa)
initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985 Z-score: 1829.0 bits: 347.8 E(32554): 1.5e-95
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDV
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LPK
:::
CCDS88 LPK
>>CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 (511 aa)
initn: 2985 init1: 2985 opt: 2985 Z-score: 1828.7 bits: 347.9 E(32554): 1.5e-95
Smith-Waterman score: 2985; 99.8% identity (99.8% similar) in 483 aa overlap (1-483:29-511)
10 20 30
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MNGVSWSQDLQEGISAWFGPPASTPASTMSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ISSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 EQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVAYMNKVELES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS58 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELES
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 KLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLLEGEESRLESGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSF
430 440 450 460 470 480
460 470 480
pF1KB8 SRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
490 500 510
>>CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 (590 aa)
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Smith-Waterman score: 1739; 62.1% identity (83.4% similar) in 470 aa overlap (1-458:74-536)
10 20 30
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPG
.:: .. :.. . : : .. .. .: :
CCDS88 GGFGRVSLAGACGVGGYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFR-NRFGAGAGGGYGFGGGAG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KB8 SRI-----SSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQ
: . ....:. :...: ::.:: . ::: ::::::::.:: :..::.::
CCDS88 SGFGFGGGAGGGFGLGGGAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQ
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 AVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDNMFESY
:::.:.:::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::.: ::.:.:.. .::.:
CCDS88 RVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQY
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 INNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDVA
::::::::... :. .:..:: ::: ::::::::::::::::: :::::..:::::.:
CCDS88 INNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAA
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 YMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEV
::::::::.....: :::::...... :. ..:...:::::::::::.:.::.:::::::
CCDS88 YMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEV
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 KAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEG
:::::.::::::.:::: :: ::::::. ::.:::::: :: ::::::: :.::.:::..
CCDS88 KAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDN
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLA
.: : :.:. ::::::::::::.::: ::.::: :::.::::::: :::::::::.:::
CCDS88 VKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLA
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430
pF1KB8 LDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSIHTKT-TSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSL
::.::::::::::::: :: . : :.:. :.. .:::..: :.::: ::. .:
CCDS88 LDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSG--SGYGG----GLGGGL
470 480 490 500 510
440 450 460 470 480
pF1KB8 GSSFGSG-AGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
:...:.: ::.:: : :::
CCDS88 GGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVK
520 530 540 550 560 570
>>CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 1739 init1: 1284 opt: 1715 Z-score: 1060.2 bits: 205.8 E(32554): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1720; 62.3% identity (81.6% similar) in 478 aa overlap (9-461:67-535)
10 20 30
pF1KB8 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSS-S
: ..: .: .: . ..: ::: ..: .
CCDS41 SVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGG----GSCAISGGYGSRAGGSYG
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KB8 FSRVGSS-NFRGG------LGGGYGGASGMGG----------ITAVTVNQSLLSPLVLEV
:. .::. .: :: :::: : :.:.:: : ::::::::.:: :..
CCDS41 FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130
pF1KB8 DPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQ--KTARSNMDN
::.:: ::..:.:::::::::::::::::::::::::.:::::.:::.: ::.:.:..
CCDS41 DPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
160 170 180 190 200 210
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 MFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKK
.::.:::::::::... :. .:..:: .:: ::::::::::::::::: ::::: .::
CCDS41 LFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
220 230 240 250 260 270
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 DVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDS
:::.::::::::... . ::::::::: ::. :. ..:..::::::::::::.:.::.::
CCDS41 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 IIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQ
::::::::::.::.:::::::: :: :::::: ::.:::::: :: ::.:.:: :.::.
CCDS41 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 AEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELM
.::. .: : :.:.:::::::::::.:.:::. :: :: :::.::::.:: :.::::::
CCDS41 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420 430
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10 20 30
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10 20 30
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40 50 60 70 80
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50 60 70 80 90
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160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260 270
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CCDS88 KSLPEEINFIHSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRS
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280 290 300 310 320 330
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CCDS88 KHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQE
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CCDS88 ELEAALQRGKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISV
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CCDS88 MNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPG-LLKAYSIRTASASRRSARD
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CCDS44 SPGGFGPGGFPG-----GIQEVTINQSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFAS
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CCDS44 FIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQGTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGR
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CCDS44 LDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDE
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CCDS44 IDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVVLSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEA
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CCDS44 LYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQ
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pF1KB8 RGELAIKDANAKLSELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEES
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CCDS44 HGEMALKDANAKLQELQAALQQAKDDLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEY
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pF1KB8 RLE----SGMQNMSIHTKTTSGYAGGLSSAYGGLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSS-FSRT
:. :... . ..:::. ::: ...::: :.. .::..:..:.::.: :.:
CCDS44 RMSGECPSAVSISVVSSSTTSASAGGYGGGYGG----GMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRG
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pF1KB8 SSSRAVVVKKIETRDGKLVSESSDVLPK
CCDS44 GGGGIGGGFGGGSSGFSGGSGFGSISGARYGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYS
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CCDS41 IARQQCVRGGPRGFSCGSAIVGGGKRGAFSSVSMSGGAGRCSSGG---FGSRSLYNLRGN
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pF1KB8 RISSSSF--SRVGS-----SNF-RGGLGGGYGGA-SG----------MGGITAVTVNQSL
. : : :: :. ..: ::.:::.::. :: ::: ::.::::
CCDS41 KSISMSVAGSRQGACFGGAGGFGTGGFGGGFGGSFSGKGGPGFPVCPAGGIQEVTINQSL
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pF1KB8 LSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTA
:.:: .:.::.:: :::.:.:::: ::::::::::::.:::::::.:::::.::::: :.
CCDS41 LTPLHVEIDPEIQKVRTEEREQIKLLNNKFASFIDKVQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTT
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 RS--NMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEME
: :.. .::.:.. ::.::.:::..: .:..:: .:: :::::.:::.:::::: :
CCDS41 TSSKNLEPLFETYLSVLRKQLDTLGNDKGRLQSELKTMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 NEFVLIKKDVDVAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDN
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CCDS41 NDFVVLKKDVDAAYLNKVELEAKVDSLNDEINFLKVLYDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDN
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 SRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEM
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