Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7015
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7015, 806 aa
1>>>pF1KB7015 806 - 806 aa - 806 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3904+/-0.00116; mu= 1.3655+/- 0.066
mean_var=394.4477+/-91.344, 0's: 0 Z-trim(111.5): 432 B-trim: 1445 in 2/51
Lambda= 0.064577
statistics sampled from 11921 (12453) to 11921 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 5433 521.7 1.9e-147
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 5186 498.7 1.6e-140
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 3457 337.6 5e-92
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 3393 331.6 2.8e-90
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 3390 331.3 3.5e-90
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 3390 331.4 3.8e-90
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 3273 320.5 7.1e-87
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 3273 320.5 7.2e-87
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 3271 320.2 7.6e-87
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 3271 320.3 8.2e-87
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 3271 320.3 8.4e-87
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 3257 318.9 1.9e-86
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 3257 319.0 2e-86
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 3233 316.7 8.7e-86
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 3127 306.9 9e-83
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 3123 306.5 1.1e-82
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 2955 290.8 5.3e-78
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 2955 290.8 5.7e-78
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 2839 279.9 8.8e-75
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 2628 260.3 8e-69
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 2324 232.0 2.7e-60
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 2148 215.6 2.3e-55
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 1819 185.0 4.1e-46
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 1689 172.8 1.8e-42
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 1102 118.4 6.5e-26
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 1102 118.4 6.7e-26
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 851 94.9 6.7e-19
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 852 95.1 6.9e-19
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 851 95.0 7.2e-19
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 851 95.0 7.3e-19
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 764 86.7 1.7e-16
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 762 86.5 1.8e-16
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 762 86.5 1.9e-16
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 756 86.0 2.8e-16
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 783) 748 85.2 4.6e-16
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 748 85.2 4.7e-16
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 748 85.3 4.9e-16
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 739 84.4 8.5e-16
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 735 84.6 2.1e-15
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 723 83.2 3.2e-15
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 721 83.0 3.6e-15
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 694 80.2 1.5e-14
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 693 80.4 2.2e-14
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 693 80.4 2.2e-14
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 689 79.8 2.4e-14
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 976) 689 79.8 2.4e-14
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 692 80.3 2.4e-14
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 692 80.3 2.4e-14
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 686 79.5 2.8e-14
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 670 78.2 9.6e-14
>>CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 (806 aa)
initn: 5433 init1: 5433 opt: 5433 Z-score: 2760.7 bits: 521.7 E(32554): 1.9e-147
Smith-Waterman score: 5433; 99.9% identity (99.9% similar) in 806 aa overlap (1-806:1-806)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YTLDVLERSPHRPILQAGLSANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVLPAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRFPLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRFPLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKPLGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIIN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 VARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLPVKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLPVKW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 MAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 HDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPGGQDTPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPGGQDTPSS
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB7 SSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
790 800
>>CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 (808 aa)
initn: 5106 init1: 2995 opt: 5186 Z-score: 2636.3 bits: 498.7 E(32554): 1.6e-140
Smith-Waterman score: 5186; 95.7% identity (97.7% similar) in 809 aa overlap (1-806:1-808)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFRCPAAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YTLDVLERSPHRPILQAGLSANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 DGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLVVL-P-
::::::::::. ..... ... : : ::. .:.::: : : : :: .... :: : :
CCDS54 DGTPYVTVLKSWISESVEADVR-LRLANVSERDGGEYLCRATNFIGVAEKAFWLSVHGPR
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 -AEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSPTVHKISRF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 PLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWELSRARLTLGKP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 LGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 IINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLVSC
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 AYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 VKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 NCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPGGQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPGGQDT
720 730 740 750 760 770
780 790 800
pF1KB7 PSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
780 790 800
>>CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (819 aa)
initn: 3440 init1: 2032 opt: 3457 Z-score: 1765.7 bits: 337.6 E(32554): 5e-92
Smith-Waterman score: 3569; 68.0% identity (83.9% similar) in 803 aa overlap (10-798:8-805)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGAPACALALCVAVAIVAGAS--SESLGTEQRVVGRAAEVPGP-EPGQQEQLVFGSGDAV
.:..:. .: : :.. . .. . : : . .: : : . :...
CCDS81 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEEPPTKYQISQPEVYVAAPGESL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ELSCPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSER-VLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCR-QRLTQ
:. : .. .. :.:::. : :..: ::.: . ::. .:. .::: :.: .: ..
CCDS81 EVRCLLKDAAVIS---WTKDGVHLGPNNRTVLIG-EYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANT
.: : :::: ::::::: : ::: .. . ::::: :.:.:.: :::::::
CCDS81 SETWYFMVNVTDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVE
:.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.::::::::
CCDS81 VKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLSANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHV
:..::: .:: :::.::::::::::::: :: ..:.:.:::: :::::::::::::.:::
CCDS81 NEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHS
: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: ::
CCDS81 EKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 AWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGS--P
:::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : :
CCDS81 AWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 TVHKIS-RFPLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPKWE
.:::.. :.::.:::: ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: :::::
CCDS81 AVHKLTKRIPLRRQVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKWE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 LSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEM
. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.::::::::::
CCDS81 FPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSEM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPE
::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: . ::
CCDS81 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVPE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 EQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLD
::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:.:
CCDS81 EQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNID
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 YYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS81 YYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKL
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 LKEGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAP
::::::::::::::..:::.::.::::.::::::::::::::::.::.:...:::::: :
CCDS81 LKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLSQP
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770 780 790 800
pF1KB7 FEQYSPGGQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
.:::::. :: :: ::::::::. : .: :
CCDS81 LEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
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::: .. :::::: :.:.:.: ::::::
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::.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.:::::::
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::..::: .:: :::.::::::::::::: :: ..:.:.:::: :::::::::::::.::
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:: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: :
CCDS44 VEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFH
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::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: :
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pF1KB7 PTVHKIS-RFPLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPKW
:.:::.. :.::.:::: ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: ::::
CCDS44 PAVHKLTKRIPLRRQVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKW
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pF1KB7 ELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSE
:. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::::::::::::.:::::::::
CCDS44 EFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSE
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:::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: . :
CCDS44 MEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVP
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pF1KB7 EEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNL
:::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:.
CCDS44 EEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNI
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pF1KB7 DYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS44 DYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFK
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pF1KB7 LLKEGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSA
:::::::::::::::..:::.::.::::.::::::::::::::::.::.:...::::::
CCDS44 LLKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLSQ
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pF1KB7 PFEQYSPGGQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
:.:::::. :: :: ::::::::. : .: :
CCDS44 PLEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
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::::::::::::::.: :::::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..
CCDS73 DAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVT
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: :::... :: : :.:::.. :.::.:::.. ::..::.::::::::. ::::
CCDS73 VILCRMKNTTKKPDFSSQPAVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSST
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.. : ::.::: ::: :::::. : .::::::::::::::::::::.:::::. . :::
CCDS73 ADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTV
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pF1KB7 AVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLRE
::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::
CCDS73 AVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLRE
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.::::::::..::.: . ::::.::::::::.::.::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLV
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pF1KB7 TEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLW
::.:::::::::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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pF1KB7 EIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::.::::.:::::::::::
CCDS73 EIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLV
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pF1KB7 EDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPGGQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSR
:::::.::.:...:::::: :.:::::. :: :: ::::::::. : .: :
CCDS73 EDLDRILTLTTNEEYLDLSQPLEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPH
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pF1KB7 T
CCDS73 INGSVKT
730
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CCDS31 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEEPPTKYQISQPEVYVAAPGESL
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pF1KB7 ELSCPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSER-VLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCR-QRLTQ
:. : .. .. :.:::. : :..: ::.: . ::. .:. .::: :.: .: ..
CCDS31 EVRCLLKDAAVIS---WTKDGVHLGPNNRTVLIG-EYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVD
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pF1KB7 RVLCHFSVRVTDAPSSGDDEDGEDEAED----TGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANT
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CCDS31 SETWYFMVNVTDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANT
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pF1KB7 VRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVE
:.:::::.::: :.. :::::.::. :::::: :.:.:.:::.::::::::.::::::::
CCDS31 VKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVE
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pF1KB7 NKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLSANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHV
:..::: .:: :::.::::::::::::: :: ..:.:.:::: :::::::::::::.:::
CCDS31 NEYGSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHV
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pF1KB7 EVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHS
: :::: :::: ::. :::.::.::::::.::: ..:::::::::::::::::::.: ::
CCDS31 EKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHS
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pF1KB7 AWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGS--P
:::.:::: . : :. : : : .: ::. .:..: :::... :: : :
CCDS31 AWLTVLPAPGREKEIT-ASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTTKKPDFSSQP
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 TVHKIS-RFPLKRQVSL--ESNASMSSNTPLVRIA-RLSS-GEGPTLANVSELELPADPK
.:::.. :.::.:::.. ::..::.::::::::. :::: .. : ::.::: ::: :::
CCDS31 AVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPK
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pF1KB7 WELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVS
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CCDS31 WEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVS
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pF1KB7 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKP
::::::::::::::::::::::: :::::.::::.::::::.::::::::..::.: .
CCDS31 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRV
540 550 560 570 580 590
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pF1KB7 PEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHN
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CCDS31 PEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINN
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pF1KB7 LDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELF
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS31 IDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELF
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pF1KB7 KLLKEGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLS
::::::::::::::::..:::.::.::::.::::::::::::::::.::.:...::::::
CCDS31 KLLKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLS
720 730 740 750 760 770
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pF1KB7 APFEQYSPGGQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
:.:::::. :: :: ::::::::. : .: :
CCDS31 QPLEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
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pF1KB7 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQLVFGSGDAVELS
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CCDS55 MAAVTRDFGEMLLHSGRVLPAEAQ-PWGAPVEVESFLVHPGDLLQLR
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pF1KB7 CPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSC-RQRLTQRVLC
: . :..::. :. :.:. . ....: .. ::: :.: . .
CCDS55 CRLRDD--VQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPADSGLYACVTSSPSGSDTT
50 60 70 80 90 100
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pF1KB7 HFSVRVTDA-PSSGDDEDGEDEA-EDTGVDTG-------APYWTRPERMDKKLLAVPAAN
.::: :.:: ::: ::.: .: . :. .:. ::::: ::.:.::: :::::.
CCDS55 YFSVNVSDALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNRMPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAK
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 TVRFRCPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVV
::.:.::..:.:.:.. :::::.::. .::::: :.:. ::..:.::::::.:::::.:
CCDS55 TVKFKCPSSGTPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIV
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 ENKFGSIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLSANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKH
::..::: .:: :::.::::::::::::: ::.:..:::.::: :::::: :::::::::
CCDS55 ENEYGSINHTYQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKH
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 VEVNGSKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHH
.::::::.:::. ::: .:::::.::::::.::: :.::.::::::::::::::::.:::
CCDS55 IEVNGSKIGPDNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHH
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 SAWLVVLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKG--LGS
::::.:: : :: : .. .: :. : .: ::. .:..: . ...: ::. ..
CCDS55 SAWLTVLEALEER-PAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQ
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 PTVHKISR-FPLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTLANVSELELPADPKWEL
.:::... .::.:::: .:.:::.:.. ::: .::::. : ::.::: ::: ::.:::
CCDS55 MAVHKLAKSIPLRRQVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWEL
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CCDS55 MMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEE
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CCDS55 QLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDY
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CCDS55 YKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLL
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CCDS55 ALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNRMPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPS
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CCDS55 KPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKH
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CCDS55 SCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGR
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CCDS55 LPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDK
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pF1KB7 SRT
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CCDS43 VQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPADSGLYACVTSSPSGSDTTYFSVNVSD
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CCDS43 ALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSG
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pF1KB7 NPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFGSIRQT
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CCDS43 TPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHT
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pF1KB7 YTLDVLERSPHRPILQAGLSANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNGSKVGP
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CCDS43 YQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGP
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CCDS43 DNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEAL
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CCDS43 EER-PAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSI
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CCDS43 PLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLG
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CCDS43 KPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKH
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pF1KB7 KNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKDLV
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CCDS43 KNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLV
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CCDS43 SCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGR
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CCDS43 LPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDK
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pF1KB7 PANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPGGQ
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CCDS43 PSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEYLDLSMPLDQYSPSFP
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pF1KB7 DTPSSS-SSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
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CCDS43 DTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR
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806 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]