FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1504, 1169 aa 1>>>pF1KE1504 1169 - 1169 aa - 1169 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2709+/-0.000419; mu= 22.5201+/- 0.026 mean_var=72.1339+/-14.387, 0's: 0 Z-trim(111.3): 188 B-trim: 104 in 1/49 Lambda= 0.151010 statistics sampled from 19621 (19821) to 19621 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16 Scan time: 15.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 7755 1699.8 0 NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 7687 1685.0 0 XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 5245 1152.9 0 NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 4979 1095.0 0 NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 4979 1095.0 0 XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: 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