FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1403, 374 aa 1>>>pF1KE1403 374 - 374 aa - 374 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9687+/-0.00134; mu= 12.8077+/- 0.078 mean_var=106.1321+/-28.653, 0's: 0 Z-trim(101.4): 318 B-trim: 914 in 2/45 Lambda= 0.124495 statistics sampled from 5987 (6510) to 5987 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16 Scan time: 2.250 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 2453 452.2 3.5e-127 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 955 183.1 3.4e-46 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 955 183.1 3.4e-46 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 880 169.6 3.8e-42 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 877 169.1 5.4e-42 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 853 164.8 1.1e-40 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 837 161.9 8.1e-40 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 832 161.0 1.5e-39 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 750 146.3 4.1e-35 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 750 146.3 4.5e-35 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 749 146.1 4.5e-35 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 742 144.8 1.1e-34 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 742 144.9 1.1e-34 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 738 144.1 1.8e-34 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 736 143.8 2.3e-34 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 735 143.6 2.7e-34 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 726 142.0 8.4e-34 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 723 141.4 1.1e-33 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 697 136.8 2.9e-32 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 697 136.8 2.9e-32 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 696 136.6 3.3e-32 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 696 136.6 3.5e-32 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 666 131.2 1.4e-30 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 650 128.3 1e-29 CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 636 125.8 5.6e-29 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 632 125.1 9.6e-29 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 632 125.1 1e-28 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 632 125.1 1e-28 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 611 121.3 1.3e-27 CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 551 110.5 2.2e-24 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 520 105.0 1.1e-22 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 515 104.1 2.2e-22 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 508 102.8 4.9e-22 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 506 102.5 6.3e-22 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 500 101.4 1.4e-21 CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 500 101.4 1.4e-21 CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 498 101.0 1.7e-21 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 495 100.5 2.5e-21 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 492 100.0 4e-21 CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 486 98.9 7.6e-21 CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 486 98.9 7.9e-21 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 478 97.4 2.1e-20 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 478 97.5 2.2e-20 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 478 97.5 2.2e-20 CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 478 97.5 2.2e-20 CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 478 97.5 2.2e-20 CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 478 97.5 2.2e-20 CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 478 97.5 2.2e-20 CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 478 97.5 2.3e-20 CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 478 97.5 2.3e-20 >>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa) initn: 2453 init1: 2453 opt: 2453 Z-score: 2396.9 bits: 452.2 E(32554): 3.5e-127 Smith-Waterman score: 2453; 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CCDS77 VFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 WGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMF : :....: .... :. ... . : . ..: .. . . ....::..::. CCDS77 WILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 MIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSC : ::: :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::.. . .: CCDS77 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 QSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSC . : .. . :: :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. .. . :: CCDS77 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSC 300 310 320 330 340 350 350 360 370 pF1KE1 AGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM :. :..: ... .....:. CCDS77 --RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP 360 370 >>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa) initn: 539 init1: 317 opt: 955 Z-score: 942.7 bits: 183.1 E(32554): 3.4e-46 Smith-Waterman score: 955; 42.1% identity (73.0% similar) in 366 aa overlap (13-373:26-377) 10 20 30 40 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEML--LCSLQEVRQFS : : ... ::. :: .. ::: ..::.:. CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT---VDYTLFESLCSKKDVRNFK 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 RLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVS :.:: ::.:: ::::: :::.:. ..:. ..:::.::::.:.:::::.::::::: : CCDS11 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 HATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSK :. .:::. :::. .:: ..: ::::: :::.:::.:::::... : :.:.: :: CCDS11 -AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISK 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 IICLVVWGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGF . :. .: :....: .... :. ... . : . ..: .. . . ....:: CCDS11 LSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGF 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 FIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLG ..::. : ::: :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::.. CCDS11 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 KMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYK . .:. : .. . :: :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. .. CCDS11 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 pF1KE1 SSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM . :: :. :..: ... .....:. CCDS11 RQWSSC--RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP 360 370 >>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 887 init1: 367 opt: 880 Z-score: 870.2 bits: 169.6 E(32554): 3.8e-42 Smith-Waterman score: 880; 41.5% identity (74.4% similar) in 328 aa overlap (6-332:1-320) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFG :: .:. :.. : :. ..:: .: :. . .. :..::.: :::. ::: CCDS26 MNPTDIADTTLDE--SIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE1 LLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKL :::: .::... ::. ::::::::::.::.:.:::..::::. .:. :::. . ::. CCDS26 LLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGY-YAADQWVFGLGLCKM 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE1 LKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISS .. .: ..: :.... .:.:::.:::.:. : ::.::: . : :..:...:. : CCDS26 ISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAV--FSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE1 STFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLEL-LFGFFIPLMFMIFCYTFIVK :.:. :. .. :. ::. : ::.: .::. ..:. ::: .:.:::..:.. CCDS26 PGFLFSTCYTERNHTYCKTKYSLNSTT--WKVLS-SLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIR 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 TLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKT :: . .: :..::...:.:::..::. :.:.::.. . .. ..: :. . :. CCDS26 TLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQ 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 VTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQ .::.:::.::::::..: :.:.:::.:.:...: CCDS26 ATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSY 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE1 TSETADNDNASSFTM CCDS26 TQSTMDHDLHDAL 350 360 >>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa) initn: 808 init1: 232 opt: 877 Z-score: 867.5 bits: 169.1 E(32554): 5.4e-42 Smith-Waterman score: 877; 42.5% identity (75.5% similar) in 327 aa overlap (9-331:2-320) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVN-TSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVF :.. : . : ..: :.. .: .. : : :.. ... : :::.:. .. CCDS24 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCML-ETETLNKYVVIIAYALVFLL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCK .:::: ::.... . . .::.:::::::.:.::.::.::::.::.:...: :.:.. :: CCDS24 SLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG-WIFGTFLCK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 LLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIIS ... . .:: :.:::.:::.:::.:::.::... . . . :..:: ::::. .: CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLV---KFVCLGCWGLSMNLS 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 SSTFVFNQKYNTQGSD-VCEPKYQTV-SEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFI :.: : :. ..:. :: :... .. .:.... : :::..::. :.::: : CCDS24 LPFFLFRQAYHPNNSSPVC---YEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFT 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 VKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSCQSEKLIGY ..:: .:. ...:.:.:::.::::.:: : .:.:.:::. : ...::. .. :: CCDS24 LRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENI . .::.:.::: ::::..::::::.::. ::::: CCDS24 ALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVN 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE1 SRQTSETADNDNASSFTM CCDS24 VSSNL 350 >>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa) initn: 602 init1: 236 opt: 853 Z-score: 844.0 bits: 164.8 E(32554): 1.1e-40 Smith-Waterman score: 853; 41.2% identity (73.7% similar) in 335 aa overlap (7-331:3-329) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEM---LL----CSLQEVRQFSRLFVPIAY .:. :: ::.. . . : :: .: . :: : : .... :: : : CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCE-PESLEINKYFVVIIY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 SLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVF .:. ...:::: ::.... . . .::.:::::::.:.::.::.::::.::.:...: :.: CCDS24 ALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG-WIF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 SNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWG .. ::... . .:: :.:::.:::.:::.:::.::... . . :.::: .:: CCDS24 GTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLV---KFICLSIWG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LSVIISSSTFVFNQK-YNTQGSDVCEPKYQTV-SEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMI ::.... ...: . :... : .: :. . .. :..:. : :::..::..:. CCDS24 LSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPAC---YEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIML 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 FCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSCQS ::: : ..:: .:. ...:.:.:::.::::.:: : .:.:.:::. : ....:. CCDS24 FCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCER 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 EKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAG .. : . .::.:..:: ::::..:::::::::. .:::: CCDS24 RNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSF 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE1 RYSENISRQTSETADNDNASSFTM CCDS24 VGSSSGHTSTTL 350 360 >>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa) initn: 774 init1: 341 opt: 837 Z-score: 828.3 bits: 161.9 E(32554): 8.1e-40 Smith-Waterman score: 837; 39.6% identity (69.8% similar) in 331 aa overlap (9-337:19-338) 10 20 30 40 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVN-TSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFV :. .: ::: :. : :..: : ..::::. :. CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDY-VNFNFTDFY--------CEKNNVRQFASHFL 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 PIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATG : : :. . : ::: ::.... . ....:::..:::.::::.::..::::::.. :. CCDS27 PPLYWLVFIVGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIA-AAD 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 AWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICL : :.. ::.....: .:: .::. :::.::::::.:: .. : . : ::..:. CCDS27 QWKFQTFMCKVVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCF 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMF ..: :.. . ....: . .: .: : . .: . : .: :....:::.:.. CCDS27 TIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAICTMVYPS-DESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 MIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRS-C : :::.:..::.::..:..:::..: :.:. ::. :.:.: .::: . . : : : CCDS27 MACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNC 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 QSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSC : ::...::.: :::::::.:.:..:: ..: ::.: :. CCDS27 AVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRR 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 AGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM CCDS27 EGSLKLSSMLLETTSGALSL 350 360 >>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa) initn: 774 init1: 341 opt: 832 Z-score: 823.7 bits: 161.0 E(32554): 1.5e-39 Smith-Waterman score: 837; 39.6% identity (69.8% similar) in 331 aa overlap (9-337:7-326) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVN-TSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVF :. .: ::: :. : :..: : ..::::. :.: : :. . CCDS27 MADDYGSESTSSMEDY-VNFNFTDFY--------CEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIV 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 GLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCK : ::: ::.... . ....:::..:::.::::.::..::::::.. :. : :.. :: CCDS27 GALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIA-AADQWKFQTFMCK 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 LLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIIS .....: .:: .::. :::.::::::.:: .. : . : ::..:...: :.. . CCDS27 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 SSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVK ....: . .: .: : . .: . : .: :....:::.:.. : :::.:.. CCDS27 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPS-DESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIH 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 TLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRS-CQSEKLIGYTK ::.::..:..:::..: :.:. ::. :.:.: .::: . . : : : : CCDS27 TLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICF 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISR ::...::.: :::::::.:.:..:: ..: ::.: :. CCDS27 QVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSML 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KE1 QTSETADNDNASSFTM CCDS27 LETTSGALSL 350 >>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa) initn: 575 init1: 199 opt: 750 Z-score: 743.9 bits: 146.3 E(32554): 4.1e-35 Smith-Waterman score: 750; 37.7% identity (66.9% similar) in 332 aa overlap (7-336:22-338) 10 20 30 40 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFS :::. .: .:. : :: : . .:. CCDS14 MVLEVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPP--------CPQDFSLNFD 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 RLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVS : :.: :::. ..::::: :. .. . : : ::..::..:.:: :.:::::.:::. CCDS14 RAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVD 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 HATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLP-RS :. :::... ::. ... ::: : :::.:::.:::. ::.::. .: : : : CCDS14 AAV-QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYR---RGPPARV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 KIICLVVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFF . ::.:::: .... :.: . .. . .. . .:. : . . :.:. ::. CCDS14 TLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNF---PQVGRTALRVLQLVAGFL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 IPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTA-ANLGK .::. : .::. :. .:. .....: .:.:....::..: : :...:.:: .:: CCDS14 LPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGA 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 MNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKS . :.: :. . .:.:: :...::::::.::::.: :::. . .: : : CCDS14 LARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 SGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM CCDS14 RQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL 350 360 >>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa) initn: 575 init1: 199 opt: 750 Z-score: 743.2 bits: 146.3 E(32554): 4.5e-35 Smith-Waterman score: 750; 37.7% identity (66.9% similar) in 332 aa overlap (7-336:69-385) 10 20 30 pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLC :::. .: .:. : :: : CCDS48 LYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPP--------C 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 SLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFV . .:.: :.: :::. ..::::: :. .. . : : ::..::..:.:: :.: CCDS48 PQDFSLNFDRAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLV 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 LTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRL ::::.:::. :. :::... ::. ... ::: : :::.:::.:::. ::.::. .: CCDS48 LTLPLWAVDAAV-QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYR- 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 RSRTLP-RSKIICLVVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLML : : : . ::.:::: .... :.: . .. . .. . .:. : . . CCDS48 --RGPPARVTLTCLAVWGLCLLFALPDFIFLSAHHDERLNATHCQYNF---PQVGRTALR 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 GLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLL :.:. ::..::. : .::. :. .:. .....: .:.:....::..: : :...:.: CCDS48 VLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVL 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 VTA-ANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDL : .:: . :.: :. . .:.:: :...::::::.::::.: :::. . .: : CCDS48 VDILMDLGALARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRL 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 pF1KE1 WCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM : CCDS48 GCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL 390 400 410 374 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 22:15:46 2016 done: Sun Nov 6 22:15:47 2016 Total Scan time: 2.250 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]