Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1553
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1553, 632 aa
  1>>>pF1KE1553 632 - 632 aa - 632 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0577+/-0.00095; mu= 16.1990+/- 0.057
 mean_var=108.6449+/-21.572, 0's: 0 Z-trim(107.4): 130  B-trim: 64 in 1/50
 Lambda= 0.123047
 statistics sampled from 9424 (9567) to 9424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.294), width:  16
 Scan time:  3.750

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3492.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4           ( 632) 4241 764.3       0
CCDS47057.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4          ( 728) 4045 729.5 3.7e-210
CCDS9323.1 LNX2 gene_id:222484|Hs108|chr13         ( 690) 1651 304.5 3.1e-82
CCDS59120.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2037)  743 143.7 2.3e-33
CCDS83342.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2070)  743 143.7 2.3e-33
CCDS617.2 PATJ gene_id:10207|Hs108|chr1            (1801)  383 79.8 3.6e-14
CCDS59119.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2008)  379 79.1 6.4e-14
CCDS47951.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9           (2041)  379 79.1 6.5e-14


>>CCDS3492.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4                (632 aa)
 initn: 4241 init1: 4241 opt: 4241  Z-score: 4075.3  bits: 764.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4241; 100.0% identity (100.0% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MKALLLLVLPWLSPANYIDNVGNLHFLYSELCKGASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKALLLLVLPWLSPANYIDNVGNLHFLYSELCKGASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 ATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAEDGQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAEDGQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 RSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 HLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 SLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 LLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE1 KDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630  
pF1KE1 TSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
              610       620       630  

>>CCDS47057.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4               (728 aa)
 initn: 4039 init1: 4039 opt: 4045  Z-score: 3886.4  bits: 729.5 E(32554): 3.7e-210
Smith-Waterman score: 4045; 96.3% identity (97.9% similar) in 628 aa overlap (5-632:101-728)

                                         10        20        30    
pF1KE1                           MKALLLLVLPWLSPANYIDNVGNLHFLYSELCKG
                                     ::.. :.    . . .  .:.  ..  :::
CCDS47 EKDFCPMDRKPLVLQHCKKSSILVNKLLNKLLVTCPFREHCTQVLQRCDLEHHFQTSCKG
               80        90       100       110       120       130

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE1 ASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLTATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLTATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAED
              140       150       160       170       180       190

          100       110       120       130       140       150    
pF1KE1 GQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGREN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGREN
              200       210       220       230       240       250

          160       170       180       190       200       210    
pF1KE1 SENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDG
              260       270       280       290       300       310

          220       230       240       250       260       270    
pF1KE1 VIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAP
              320       330       340       350       360       370

          280       290       300       310       320       330    
pF1KE1 DAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVL
              380       390       400       410       420       430

          340       350       360       370       380       390    
pF1KE1 AINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGER
              440       450       460       470       480       490

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE1 SNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDG
              500       510       520       530       540       550

          460       470       480       490       500       510    
pF1KE1 RIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSN
              560       570       580       590       600       610

          520       530       540       550       560       570    
pF1KE1 HNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKS
              620       630       640       650       660       670

          580       590       600       610       620       630  
pF1KE1 IVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
              680       690       700       710       720        

>>CCDS9323.1 LNX2 gene_id:222484|Hs108|chr13              (690 aa)
 initn: 1682 init1: 508 opt: 1651  Z-score: 1590.0  bits: 304.5 E(32554): 3.1e-82
Smith-Waterman score: 1651; 50.9% identity (77.7% similar) in 511 aa overlap (131-632:185-690)

              110       120       130       140       150          
pF1KE1 PVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENS--ENT
                                     :. : :.  :.:  .   . : .:   :..
CCDS93 TQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADCLGTGAVPVERHLTSASLSTWSEEPGLDNPAFEES
          160       170       180       190       200       210    

      160       170       180       190       200       210        
pF1KE1 TAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIAR
       .. ..  .   : :.::::.:.:.: .:  .:.: .:::.::::..:.::..::::::::
CCDS93 AGADTTQQPLSL-PEGEITTIEIHRSNPYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIAR
          220        230       240       250       260       270   

      220       230       240       250       260       270        
pF1KE1 DGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYR
       ::::: :: ::.::...:::: ::::  .: :::..: :::.::..: .: .... :.  
CCDS93 DGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYARAVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHS-DSNS
           280       290       300       310       320        330  

      280       290       300       310       320       330        
pF1KE1 PRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAING
       ::.. :.: :.: .  :::::::::..:::::::...:.::.: . :.:  :::::::::
CCDS93 PREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTDEPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAING
            340       350       360       370       380       390  

      340       350       360       370       380         390      
pF1KE1 HDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSW--SPGPG-ERS
       :::.::.:: ::..:::: .::.:...:  . .  . ..::: .:..:   .: :   : 
CCDS93 HDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIARPGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRP
            400       410       420       430       440       450  

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE1 NTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGR
       .. : :   .::.:: ....:.: :::::::::: . .  .:::.: :: : : ..::::
CCDS93 SSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLGMTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGR
            460       470       480       490       500       510  

         460       470       480         490         500       510 
pF1KE1 IKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSS--IVLKALEVK--EYEPQEDCSSPAAL
       :: ::.:::..:..::..:.:::::.:: ...:  ..::::::.  :   :.   .:...
CCDS93 IKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLKASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTF
            520       530       540       550       560       570  

             520       530       540       550       560       570 
pF1KE1 DSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFF
       . :.  :   .::::::::: ::  :..:.::::::.  :: :: ::::::: . :.:::
CCDS93 SENEYDA---SWSPSWVMWLGLPSTLHSCHDIVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFF
               580       590       600       610       620         

             580       590       600       610       620       630 
pF1KE1 IKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTF
       ::.:: ::::: :::..:::...:::: :: :: :. :. .::: ....:::.. :::..
CCDS93 IKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTVGMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSL
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pF1KE1 L
       .
CCDS93 V
     690

>>CCDS59120.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9                (2037 aa)
 initn: 731 init1: 209 opt: 743  Z-score: 712.6  bits: 143.7 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 747; 31.9% identity (62.1% similar) in 496 aa overlap (154-626:1570-2037)

           130       140       150       160          170       180
pF1KE1 SFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVF---PRLYHLIPDGEITSIK
                                     :.  ...: .:   :    .::  : :.:.
CCDS59 AAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCE-TTIE
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pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
       :..   . .:::  ::::.: :  :::...:..:.  .::::  :: ::.:::.:. .. 
CCDS59 ISKGRTGLGLSI--VGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKAT
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pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
       :. :. .:::  : . ::..:.         .::   .   :.. . :.:. : . ::..
CCDS59 HDEAINVLRQTPQRVRLTLYRD---------EAPYKEEEVCDTLTIELQKK-PGKGLGLS
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pF1KE1 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
       .: : .. :::. ... ::.:   :.: ..:..: .::.:.: .. :..: :.. :   :
CCDS59 IVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTV
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pF1KE1 HLVVSRQVR------QRSPDIFQEAGWNSNGSWS-PGPG-------ERSNTPKPLHPTIT
        : :.: ..      .: :.  .... .: .:.. :  :       : :.  . :   : 
CCDS59 TLEVGR-IKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQ
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pF1KE1 CHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVD
          ..:...: : .:::...:::..    :.::..  ..: :: ..  ....:: .... 
CCDS59 -GLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTIC
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pF1KE1 GVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALE-----VKEYEPQEDCSSPAALDS-NHNMAPP
       :.    .....:: ::: .:.:: ....      :   . ::  ::  .. . . .    
CCDS59 GTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQ
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pF1KE1 SDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTP
       .: .:        :.:    :.:.:.:.  : ::: :::::   .:. :...:..     
CCDS59 DDLGP--------PQC----KSITLERGPDG-LGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGA
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pF1KE1 AYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
       : .:::.. :: ..::::.:  :. :   . .::. :: .:: ..:      
CCDS59 ASEDGRLKRGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS      
            2000      2010      2020      2030             

>>CCDS83342.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9                (2070 aa)
 initn: 731 init1: 209 opt: 743  Z-score: 712.5  bits: 143.7 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 747; 31.9% identity (62.1% similar) in 496 aa overlap (154-626:1603-2070)

           130       140       150       160          170       180
pF1KE1 SFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVF---PRLYHLIPDGEITSIK
                                     :.  ...: .:   :    .::  : :.:.
CCDS83 AAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCE-TTIE
           1580      1590      1600      1610      1620       1630 

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pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
       :..   . .:::  ::::.: :  :::...:..:.  .::::  :: ::.:::.:. .. 
CCDS83 ISKGRTGLGLSI--VGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKAT
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pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
       :. :. .:::  : . ::..:.         .::   .   :.. . :.:. : . ::..
CCDS83 HDEAINVLRQTPQRVRLTLYRD---------EAPYKEEEVCDTLTIELQKK-PGKGLGLS
    1690      1700      1710               1720      1730          

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pF1KE1 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
       .: : .. :::. ... ::.:   :.: ..:..: .::.:.: .. :..: :.. :   :
CCDS83 IVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTV
    1740      1750      1760      1770      1780      1790         

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pF1KE1 HLVVSRQVR------QRSPDIFQEAGWNSNGSWS-PGPG-------ERSNTPKPLHPTIT
        : :.: ..      .: :.  .... .: .:.. :  :       : :.  . :   : 
CCDS83 TLEVGR-IKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQ
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pF1KE1 CHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVD
          ..:...: : .:::...:::..    :.::..  ..: :: ..  ....:: .... 
CCDS83 -GLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTIC
      1860      1870      1880      1890      1900      1910       

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pF1KE1 GVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALE-----VKEYEPQEDCSSPAALDS-NHNMAPP
       :.    .....:: ::: .:.:: ....      :   . ::  ::  .. . . .    
CCDS83 GTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQ
      1920      1930      1940      1950      1960      1970       

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pF1KE1 SDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTP
       .: .:        :.:    :.:.:.:.  : ::: :::::   .:. :...:..     
CCDS83 DDLGP--------PQC----KSITLERGPDG-LGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGA
      1980                  1990       2000      2010      2020    

              590       600       610       620       630  
pF1KE1 AYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
       : .:::.. :: ..::::.:  :. :   . .::. :: .:: ..:      
CCDS83 ASEDGRLKRGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS      
         2030      2040      2050      2060      2070      

>>CCDS617.2 PATJ gene_id:10207|Hs108|chr1                 (1801 aa)
 initn: 426 init1: 210 opt: 383  Z-score: 367.9  bits: 79.8 E(32554): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 542; 28.1% identity (59.2% similar) in 488 aa overlap (61-522:1329-1791)

               40        50        60        70        80        90
pF1KE1 LCKGASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLTATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVS
                                     :..: :  :..   : . :. : . :  .:
CCDS61 SHQNASAIIKTAPSKVKLVFIRNEDAVNQMAVTPFPVPSSSP--SSIEDQSGTE-P--IS
     1300      1310      1320      1330      1340        1350      

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pF1KE1 SAEDGQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHA-D
       : :::.     :. : ..  ... :. .. . .. :  ...    ..   . : . :. :
CCDS61 SEEDGS-----VEVGIKQLPESESFKLAVSQMKQQKYPTKVSFSSQEIPLAPASSYHSTD
               1360      1370      1380      1390      1400        

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pF1KE1 QGRENSENTTAP-EVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQ
           .  .  ::  : :    ..:  :.  :.:..   . .:::  :::..:::  :.:.
CCDS61 ADFTGYGGFQAPLSVDPATCPIVPGQEMI-IEISKGRSGLGLSI--VGGKDTPLNAIVIH
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pF1KE1 HIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMR-EQKFRS
       ..:..:. ::::::  :: ::.:::.:. :  :. :.  :::  : . :.:.: : ..:.
CCDS61 EVYEEGAAARDGRLWAGDQILEVNGVDLRNSSHEEAITALRQTPQKVRLVVYRDEAHYRD
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pF1KE1 RNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQL
       ..: .           : : :.:.. .  ::...: : .  :::: ... ::.:   :.:
CCDS61 EENLEI----------FPVDLQKKAGR-GLGLSIVGKRNGSGVFISDIVKGGAADLDGRL
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pF1KE1 EENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSW
        ..:..:..::.:.: .: :..: ... ..  :.: ..: .:  :    . .. ::.:: 
CCDS61 IQGDQILSVNGEDMRNASQETVATILKCAQGLVQLEIGR-LRAGSWTSARTTSQNSQGSQ
         1580      1590      1600      1610       1620      1630   

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pF1KE1 SPG-----PG--------------ERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAG
       . .     :.              .: . :.  .     . ..:.:... ...::...::
CCDS61 QSAHSSCHPSFAPVITGLQNLVGTKRVSDPSQKNSGTDMEPRTVEINRELSDALGISIAG
          1640      1650      1660      1670      1680      1690   

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pF1KE1 GASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSS
       : .    :.:...  .. .:: .:  ..:.:: .....:  :  .:....: ::: . . 
CCDS61 GRGSPLGDIPVFIAMIQASGVAARTQKLKVGDRIVSINGQPLDGLSHADVVNLLKNAYGR
          1700      1710      1720      1730      1740      1750   

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pF1KE1 IVLKAL---EVKEYEPQ-EDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIV
       :.:...   ...    : :. :.   : :      : :                      
CCDS61 IILQVVADTNISAIAAQLENMSTGYHLGSPTAEHHPEDTEEQLQMTAD            
          1760      1770      1780      1790      1800             

          550       560       570       580       590       600    
pF1KE1 LRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGM

>>CCDS59119.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9                (2008 aa)
 initn: 731 init1: 209 opt: 379  Z-score: 363.4  bits: 79.1 E(32554): 6.4e-14
Smith-Waterman score: 730; 31.7% identity (61.4% similar) in 482 aa overlap (154-626:1570-2008)

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       :. :. .:::  : . ::..:..         ::   .   :.. . :.:. : . ::..
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       :::...:::..    :.::..  ..: :: ..  ....:: .... :.    .....:: 
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       ::: .:.:: ....      :   . ::  ::  .. . . .    .: .:        :
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       ::::.:  :. :   . .::. :: .:: ..:      
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       1980      1990      2000              

>>CCDS47951.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9                (2041 aa)
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CCDS47 AAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCE-TTIE
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CCDS47 IVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSL
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       :::...:::..    :.::..  ..: :: ..  ....:: .... :.    .....:: 
CCDS47 SLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMTHTQAVN
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CCDS47 LLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGP--------P
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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